Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F58 I1 R1
|
60 |
66.0 |
2910360 |
98.3% |
2860883 |
145.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_002947_CJ‑RC |
5,396,064 |
A→G |
V231A (GTA→GCA) |
tphBII ← |
4‑hydroxythreonine‑4‑phosphate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_002947_CJ‑RC | 5,396,064 | 0 | A | G | 99.2%
| 428.3
/ NA
| 120 | V231A (GTA→GCA) | tphBII | 4‑hydroxythreonine‑4‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (60/59); minor base C (1/0); total (61/59) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
ACCCTGCCACCGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTACTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGGTGCATG > NC_002947_CJ‑RC/5395920‑5396205
|
ccTGCCACCGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAgg > 6:351184/1‑148 (MQ=255)
ccTGCCACCGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGc > 7:65958/1‑149 (MQ=255)
gCCACCGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCcg > 4:157770/1‑148 (MQ=255)
aCCGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCt > 8:77294/1‑149 (MQ=255)
cGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCtt > 6:98401/1‑148 (MQ=255)
cGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTg > 7:181368/1‑149 (MQ=255)
atagTGCGCTGGCTCCGGTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAg < 1:156925/148‑1 (MQ=255)
tagTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAgtg > 7:332851/1‑149 (MQ=255)
tagTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAgt > 4:334683/1‑148 (MQ=255)
tagTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAgt > 5:79650/1‑148 (MQ=255)
gTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAgtgt < 4:15724/148‑1 (MQ=255)
gTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAgtg < 3:173458/147‑1 (MQ=255)
tGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGTCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGtc < 2:121690/148‑1 (MQ=255)
cgcTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGtct < 5:94364/147‑1 (MQ=255)
gcTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGa < 7:200893/149‑1 (MQ=255)
cTCCGTTAGGTGCCAGGAGGTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGAGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGc < 4:241010/148‑1 (MQ=255)
cTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGc < 3:1916/148‑1 (MQ=255)
tCCTTTAGGTGCCAGCAGCTAGATGGGTATATGGCCCTGATAGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCTCTGTGACAGAACCATGTCAGCTCACATGGGGCCGTCTACTCATAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCgg > 8:188007/1‑149 (MQ=255)
tCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCgg > 7:212244/1‑149 (MQ=255)
gTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGa < 6:185613/148‑1 (MQ=255)
aGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAAc < 1:125544/147‑1 (MQ=255)
ggTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGTATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCGATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACgg < 3:7188/148‑1 (MQ=255)
tGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGt > 6:21392/1‑147 (MQ=255)
cagcagCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGAAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATc > 2:149917/1‑148 (MQ=255)
gcagcTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTgg < 7:112152/149‑1 (MQ=255)
gcagcTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTg > 4:248438/1‑148 (MQ=255)
gcagcTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTg < 5:352035/148‑1 (MQ=255)
gcagcTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTg < 6:274385/148‑1 (MQ=255)
cagcTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTgg > 3:186833/1‑148 (MQ=255)
ttGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGATCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGt > 3:297466/1‑148 (MQ=255)
aTGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGtcct < 4:115801/148‑1 (MQ=255)
tGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGAt > 8:128953/1‑136 (MQ=255)
tGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGAt < 7:128953/136‑1 (MQ=255)
tGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGtcct < 4:30024/147‑1 (MQ=255)
ggggATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGtcctc > 3:67209/1‑147 (MQ=255)
gATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAgg < 2:121334/148‑1 (MQ=255)
gATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAgg < 1:298583/148‑1 (MQ=255)
atGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGa > 7:69411/1‑135 (MQ=255)
atGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGa < 8:69411/135‑1 (MQ=255)
tGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCAATGTGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGa < 3:257022/148‑1 (MQ=255)
ggCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGc > 8:205318/1‑144 (MQ=255)
gCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTggg < 2:315202/131‑1 (MQ=255)
gCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTggg > 1:315202/1‑131 (MQ=255)
cccTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGaaca < 5:81806/148‑1 (MQ=255)
cTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGaacaac > 2:45503/1‑148 (MQ=255)
cTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACt < 8:329927/149‑1 (MQ=255)
tgttCGTGCAGGATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGGTAGGCCGCGATTGTGCAGTGTCTGGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGTGTCCTCCAGGCCGAACAACt < 6:354579/145‑1 (MQ=255)
aTCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTg < 1:257245/147‑1 (MQ=255)
aTCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGt > 1:116432/1‑148 (MQ=255)
aTCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTG‑CAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTc > 1:102371/1‑148 (MQ=255)
tCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTc > 3:349643/1‑148 (MQ=255)
tGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGGGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTTGGAGTCCTCCAGGCCGCACAACTGTCCtt > 7:105687/1‑148 (MQ=255)
tGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCgg > 8:66275/1‑106 (MQ=255)
tGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCgg < 7:66275/106‑1 (MQ=255)
cagcaTGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCa < 8:332851/148‑1 (MQ=255)
aTGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATg > 6:175841/1‑148 (MQ=255)
ggCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACAGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTAAGATGCa > 3:161778/1‑148 (MQ=255)
gCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCACCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCAt < 2:257905/148‑1 (MQ=255)
cTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCAt > 7:262235/1‑147 (MQ=255)
tacatacaGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCAt > 5:160926/1‑146 (MQ=255)
catacaGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAg < 1:149917/147‑1 (MQ=255)
atacaGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACGGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAggg > 3:82444/1‑148 (MQ=255)
atacaGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAggg < 4:67209/148‑1 (MQ=255)
tacaGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGtt > 7:96806/1‑149 (MQ=255)
caGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGtt > 2:19916/1‑147 (MQ=255)
tCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATccc < 7:364480/149‑1 (MQ=255)
tCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATcc < 6:160926/148‑1 (MQ=255)
tCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTACCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATcc > 2:57349/1‑148 (MQ=255)
tGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCg > 3:78980/1‑147 (MQ=255)
cgcTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACa < 6:79650/147‑1 (MQ=255)
gcTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGACTCCTCCAGGCCGAACAAAACTCCTTCAGAAGAATGAGGGTTGATCCCGAATACAGc > 7:186489/1‑148 (MQ=255)
tgtgCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGa > 4:314164/1‑148 (MQ=255)
gtgCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGAc > 2:278245/1‑148 (MQ=255)
gCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACtt > 3:313147/1‑148 (MQ=255)
ccAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACtttt > 7:174577/1‑149 (MQ=255)
cAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGAAttat > 6:211306/1‑146 (MQ=255)
cAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCAACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACAGTCCATCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACtttt > 2:128324/1‑148 (MQ=255)
aGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTgg > 7:342835/1‑149 (MQ=255)
aGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTg > 2:208547/1‑148 (MQ=255)
gAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGt > 8:67563/1‑149 (MQ=255)
aCCATGTCAGCTCCCATGGGGACGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTTTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGTAGTCCTCCAGGACGAACAAATGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGtt > 4:147070/1‑148 (MQ=255)
ccATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGttt < 3:246380/148‑1 (MQ=255)
ccATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGttt < 4:349643/148‑1 (MQ=255)
aTGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAg < 4:339726/148‑1 (MQ=255)
aTGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAg > 2:213582/1‑148 (MQ=255)
aTGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAg < 3:243250/148‑1 (MQ=255)
aTGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAg < 4:297466/148‑1 (MQ=255)
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AGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCG < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21508:13860:19460/151‑1 (MQ=60)
AGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCG < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11610:16220:17923/151‑1 (MQ=60)
CCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAG < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11508:24783:9755/149‑1 (MQ=60)
GGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGGT < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11405:15813:7774/150‑1 (MQ=60)
GCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGGTGCAT > NB501016:282:H2V7GAFX2:1:11302:10285:8236/1‑151 (MQ=60)
ACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGGTGCATGTCTGCA < NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21304:7289:9696/151‑1 (MQ=60)
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ACCACCCTGCCACCGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTACTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGGTGCATGTCTGCACGG > NC_002947_CJ‑RC/5395917‑5396214
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
