Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F61 I1 R1
|
63 |
66.6 |
2847048 |
98.6% |
2807189 |
146.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_002947_CJ‑RC |
5,396,064 |
A→G |
V231A (GTA→GCA) |
tphBII ← |
4‑hydroxythreonine‑4‑phosphate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_002947_CJ‑RC | 5,396,064 | 0 | A | G | 100.0%
| 386.3
/ NA
| 107 | V231A (GTA→GCA) | tphBII | 4‑hydroxythreonine‑4‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (51/56); total (51/56) |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CCTGCCACCGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTACTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGGTGCATGTCTG > NC_002947_CJ‑RC/5395922‑5396209
|
ccTGCCACCGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGc > 5:97135/1‑149 (MQ=255)
ccTGCCACCGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGc > 1:62659/1‑149 (MQ=255)
aCCGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCt > 1:94677/1‑149 (MQ=255)
ccGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCtt < 2:94677/149‑1 (MQ=255)
gatagataGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTgc > 1:267833/1‑149 (MQ=255)
atagatagTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTgcg > 5:49078/1‑149 (MQ=255)
tagatagTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTgcg < 7:20978/148‑1 (MQ=255)
gatagTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAg < 5:296252/149‑1 (MQ=255)
atagTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCa < 7:144687/147‑1 (MQ=255)
tagTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGAGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAgtg > 1:129984/1‑149 (MQ=255)
gTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAgtgt < 6:105330/148‑1 (MQ=255)
tGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGCGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGtc < 7:216398/148‑1 (MQ=255)
cgcTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGtctc < 3:137582/148‑1 (MQ=255)
gcTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGa > 1:321380/1‑149 (MQ=255)
gcTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGa > 3:290226/1‑149 (MQ=255)
gcTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGa > 5:183563/1‑149 (MQ=255)
tGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGTGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACa > 3:286911/1‑149 (MQ=255)
tGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGa > 3:292716/1‑147 (MQ=255)
cTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCg < 3:92552/149‑1 (MQ=255)
tCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCg < 7:299915/148‑1 (MQ=255)
cGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCgg < 5:223912/147‑1 (MQ=255)
ttAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAAc < 6:49078/149‑1 (MQ=255)
ggTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGt < 5:263088/149‑1 (MQ=255)
gTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGt < 7:97466/148‑1 (MQ=255)
ccAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATc > 4:46443/1‑149 (MQ=255)
cagcagCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCt > 6:70445/1‑149 (MQ=255)
agcagcTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTg > 4:77175/1‑149 (MQ=255)
gcagcTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTgg > 2:7707/1‑149 (MQ=255)
gcagcTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTg < 7:322859/148‑1 (MQ=255)
agcTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTgg > 6:86984/1‑147 (MQ=255)
gcTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGa < 8:125538/148‑1 (MQ=255)
cTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAg > 8:311557/1‑148 (MQ=255)
tatGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGc > 7:56520/1‑147 (MQ=255)
atGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGcc > 7:356175/1‑147 (MQ=255)
ccTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGtctc > 4:172764/1‑106 (MQ=255)
ccTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGtctc < 3:172764/106‑1 (MQ=255)
ccTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGGGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGTGAGTCCTCCAGGCCGaacaac > 2:347088/1‑149 (MQ=255)
cTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACt < 4:31485/149‑1 (MQ=255)
gATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTg > 7:145734/1‑148 (MQ=255)
aTCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTg < 3:300867/147‑1 (MQ=255)
aTCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTCTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGt < 3:78401/148‑1 (MQ=255)
gTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCtt > 6:67175/1‑149 (MQ=255)
tGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCtt < 8:280044/148‑1 (MQ=255)
tGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCtt > 1:147644/1‑148 (MQ=255)
tGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGAGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGCAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCtt > 6:13387/1‑148 (MQ=255)
tGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGATTGAGCTGTGCCAGAACAATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCTCGCTTGCGAAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCAAGTCCGAACAACTGTCAtt > 2:288218/1‑148 (MQ=255)
gcagcaTGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCtt > 4:295556/1‑147 (MQ=255)
cagcaTGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCa < 3:314460/148‑1 (MQ=255)
agcaTGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCtt > 5:217752/1‑145 (MQ=255)
agcaTGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGa < 1:137255/149‑1 (MQ=255)
caTGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATg > 5:343359/1‑149 (MQ=255)
aTGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCTGTGTCTCGACTGCGTGAACGGTGATCTGGGAGTCATCCAGGCCGAACATCTGTCCTTCTGTTGc < 6:37011/149‑1 (MQ=255)
cTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCa > 8:138929/1‑146 (MQ=255)
acatacaGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAgg > 2:307661/1‑149 (MQ=255)
atacaGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGt > 2:235019/1‑149 (MQ=255)
atacaGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGt < 2:267833/149‑1 (MQ=255)
atacaGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGt > 1:222265/1‑149 (MQ=255)
acaGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGtt > 2:137333/1‑148 (MQ=255)
acaGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACAGTCCTTCAGATGCATGAGGGtt > 2:329510/1‑148 (MQ=255)
aGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTg > 7:15462/1‑147 (MQ=255)
ggTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGAt > 8:15666/1‑148 (MQ=255)
ggTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATc > 3:41132/1‑149 (MQ=255)
ggTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATc < 5:243627/149‑1 (MQ=255)
gTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATcc > 6:290368/1‑149 (MQ=255)
gTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATcc > 2:227225/1‑149 (MQ=255)
tCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATccc < 6:153193/149‑1 (MQ=255)
tCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATccc < 5:178/149‑1 (MQ=255)
tGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGaa < 4:197591/149‑1 (MQ=255)
tGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGaa < 1:180715/149‑1 (MQ=255)
tGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGaa < 2:95165/149‑1 (MQ=255)
cTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATa < 2:158751/149‑1 (MQ=255)
cTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATa > 2:150382/1‑149 (MQ=255)
cTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATa < 1:17068/149‑1 (MQ=255)
ttGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATa > 4:93015/1‑148 (MQ=255)
gcgcTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATAc < 1:331839/147‑1 (MQ=255)
gcgcTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACa < 1:307661/148‑1 (MQ=255)
cgcTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGc < 3:128184/149‑1 (MQ=255)
gcTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGc > 2:58938/1‑148 (MQ=255)
cAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTg > 3:162907/1‑149 (MQ=255)
cAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTg < 4:45394/149‑1 (MQ=255)
cAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTg < 2:321380/149‑1 (MQ=255)
aGAACCATGACAGCTCCCAAGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTATgg > 4:247448/1‑149 (MQ=255)
gAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGt < 2:53420/149‑1 (MQ=255)
ccATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTa < 1:238749/149‑1 (MQ=255)
tCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCa < 1:137333/148‑1 (MQ=255)
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cTCCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTc > 7:307964/1‑147 (MQ=255)
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CCCATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGT > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11505:3007:6678/1‑150 (MQ=60)
CATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAG < NB501016:282:H2V7GAFX2:1:11102:8679:9588/151‑1 (MQ=60)
CATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTA > NB501016:282:H2V7GAFX2:1:11304:12155:7195/1‑149 (MQ=60)
ATGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGG < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11506:17102:11189/151‑1 (MQ=60)
TGGGGCCGTCTACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGGT > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11602:21084:5727/1‑151 (MQ=60)
TACTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCAAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGGTGCATGTCTGC > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11202:26421:6173/1‑151 (MQ=60)
CTGCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGGTGCATGTCTGCAC > NB501016:282:H2V7GAFX2:1:11102:3758:10946/1‑151 (MQ=60)
GCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGGTGCATGTCTGCACGG > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11305:11935:7554/1‑151 (MQ=60)
GCTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGGTGCATGTCTGCAC < NB501016:282:H2V7GAFX2:4:11403:17799:18277/149‑1 (MQ=60)
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CCCTGCCACCGATAGATAGTGCGCTGGCTCCGTTAGGTGCCAGCAGCTTGATGGGGATATGGCCCTGATCGTGCAGCATGGCTACATACAGGTCGTGCTTGCGCTGTGCCAGAACCATGTCAGCTCCCATGGGGCCGTCTACTACTAGGCCGCGCTTGCGCAGTGTCTCGACAGCGGGAACGGTGATCTGGGAGTCCTCCAGGCCGAACAACTGTCCTTCAGATGCATGAGGGTTGATCCCGAATACAGCGACTTTTGGTTTAGGCACTCCGAGTAAGGTGCATGTCTGCACGG > NC_002947_CJ‑RC/5395921‑5396214
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
