Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F84 I10 R1
|
267 |
426.1 |
13521957 |
97.0% |
13116298 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,103,891 |
G→A |
P207S (CCA→TCA) |
wbbK ← |
lipopolysaccharide biosynthesis protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,103,891 | 0 | G | A | 96.7%
| 1611.9
/ 28.1
| 483 | P207S (CCA→TCA) | wbbK | lipopolysaccharide biosynthesis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (8/8); new base A (231/233); total (240/243) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.01e-01 |
Only 100 of 485 total aligned reads displayed.
ACATTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTCTTGATAAATTTTTCTT > NC_000913/2103743‑2104037
|
aCATTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGaaa < 6:681981/151‑1 (MQ=255)
aaTTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAAc < 4:1037852/150‑1 (MQ=255)
aTTATACAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATATTAAGAAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAAca < 5:509260/151‑1 (MQ=255)
tATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAAcagc > 8:1076509/1‑151 (MQ=255)
aTCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAAcagca < 6:258769/151‑1 (MQ=255)
aTCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAAcagc < 6:1528108/150‑1 (MQ=255)
tCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAAcagc > 2:1343151/1‑149 (MQ=255)
tCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAAcagc > 1:753745/1‑149 (MQ=255)
aGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGt > 3:1189865/1‑151 (MQ=255)
ttCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAat > 3:916080/1‑151 (MQ=255)
tctggtagtcttataataTATTTTGCATACTCATTTTCTGTACGAGTGATAGTAAGATGATTTTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGGTGCACTAATGATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAat < 6:1120752/138‑1 (MQ=255)
tCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAat < 8:1580945/150‑1 (MQ=255)
cTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAatat > 6:1639648/1‑151 (MQ=255)
tGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATAtt > 1:1239280/1‑151 (MQ=255)
ggaaGACTTATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACGACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAata < 4:1642228/146‑1 (MQ=255)
gCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAatat < 5:85376/149‑1 (MQ=255)
cAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGt < 5:67341/151‑1 (MQ=255)
aaGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTc < 3:1120749/151‑1 (MQ=255)
gACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCaa < 2:468189/151‑1 (MQ=255)
atGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACt < 6:814736/150‑1 (MQ=255)
gATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTc < 2:606827/150‑1 (MQ=255)
gATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTc < 7:881472/150‑1 (MQ=255)
ataataTATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCa < 5:1265318/150‑1 (MQ=255)
ataataTATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCa < 8:533038/150‑1 (MQ=255)
atatTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAgg < 7:504073/150‑1 (MQ=255)
atTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGt < 4:940974/150‑1 (MQ=255)
ttGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTAtt > 7:992619/1‑151 (MQ=255)
cATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCtt < 2:356024/151‑1 (MQ=255)
cATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTAGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAAAATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCtt > 3:962454/1‑151 (MQ=255)
aCGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCATAAGGGTTATTCTTaa > 1:1515029/1‑150 (MQ=255)
aCGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTaa < 2:1101685/150‑1 (MQ=255)
aCGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTaa < 4:624848/150‑1 (MQ=255)
cATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTg > 3:838014/1‑151 (MQ=255)
aTTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTga < 8:1222478/151‑1 (MQ=255)
aTTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTga < 2:1267442/151‑1 (MQ=255)
tttCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTgag < 7:43093/150‑1 (MQ=255)
tttCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTg > 5:19866/1‑148 (MQ=255)
tACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAatcat > 3:1362410/1‑150 (MQ=255)
cTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAatcatcatc > 8:1464626/1‑149 (MQ=255)
gTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGtt > 8:844001/1‑151 (MQ=255)
tAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTg > 5:1578818/1‑151 (MQ=255)
gCAGAAATTTAATATTTGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCt < 1:1382236/151‑1 (MQ=255)
cAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCtt > 5:1137913/1‑151 (MQ=255)
cAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCt < 4:842393/150‑1 (MQ=255)
gAAATTTAATATTGGTTTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCtttt > 7:301215/1‑151 (MQ=255)
gAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCtttt > 4:240887/1‑151 (MQ=255)
ttAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATc > 8:1287311/1‑149 (MQ=255)
tAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATc > 3:1586416/1‑148 (MQ=255)
aaTATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATc > 4:1301144/1‑147 (MQ=255)
aaTATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATc > 4:1553052/1‑147 (MQ=255)
aaTATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGa < 3:770860/150‑1 (MQ=255)
aaTATTGGATTGTTCTTTAAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGa < 1:1338996/150‑1 (MQ=255)
aTTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGAtaatttaat > 4:713887/1‑151 (MQ=255)
aTTGTTCTTTCAATTTCCTTGATGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGAtaatttaa < 6:738494/150‑1 (MQ=255)
tCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTg > 5:278542/1‑151 (MQ=255)
tttCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGc > 8:234497/1‑151 (MQ=255)
tCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTTAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTTTTCTTAAATTGAGAATCATCTTCAGTAAGTTGTCTTTTATCTGATAATTTAATTTCTGGcc < 2:1590332/150‑1 (MQ=255)
tCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGcc < 6:345305/150‑1 (MQ=255)
tCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGcc < 5:1683126/150‑1 (MQ=255)
cAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCg > 6:410164/1‑150 (MQ=255)
aTTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACt > 1:964723/1‑151 (MQ=255)
aTTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACt > 2:750389/1‑151 (MQ=255)
ttCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTg > 1:1103153/1‑150 (MQ=255)
ttCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTAAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTg > 3:644518/1‑150 (MQ=255)
ccTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGAc < 6:945979/150‑1 (MQ=255)
ccTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACa < 7:1534182/151‑1 (MQ=255)
cTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACa > 1:556120/1‑150 (MQ=255)
gcACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGt < 4:1184086/151‑1 (MQ=255)
ataataataaGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGttat < 4:512893/150‑1 (MQ=255)
taataataaGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGttatt > 6:1067034/1‑151 (MQ=255)
aataataaGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGttat < 1:1001351/149‑1 (MQ=255)
aataaGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGttatttat < 5:1486179/150‑1 (MQ=255)
aataaGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTtata < 1:677984/151‑1 (MQ=255)
aataaGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTtata < 3:424204/151‑1 (MQ=255)
taaGCTCGT‑ATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGa > 7:1319813/1‑150 (MQ=255)
aaGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGa > 5:13120/1‑150 (MQ=255)
aaGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGa > 2:264355/1‑150 (MQ=255)
cGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAatat < 3:185790/149‑1 (MQ=255)
cGTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATAttt > 5:773563/1‑151 (MQ=255)
gTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTc > 8:918046/1‑151 (MQ=255)
gTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTc < 2:182200/151‑1 (MQ=255)
gTAATTTTTAAATACTCGTGAAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTATGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATAttt > 4:366942/1‑150 (MQ=255)
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|
ACATTATCCAGTCCTTCTGCAAGACTGATAATATATTTTGCATACGCATTTTCTGTACCACTGATAGTAAGCAGAAATTTAATATTGGATTGTTCTTTCAATTTCCTTGCTGCACTAATAATAAGCTCGTAATTTTTAAATACTCGTGGAACAGCAGGGTAAAATATTGTCAACTCAGAAGGGTTATTCTTAAATTGAGAATCATCATCAGTAAGTTGGCTTTTATCAGATAATTTAATTTCTGGCCGACTGACAATGATGTTATTTATAGAATATTTCTTGATAAATTTTTCTT > NC_000913/2103743‑2104037
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
