Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F61 I8 R1
|
12 |
458.9 |
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14233181 |
150.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
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|
| |
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product |
| * | NC_000913 | 4,188,572 | 0 | C | A | 99.8%
| 1820.8
/ NA
| 476 | R1075S (CGT→AGT) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 476 total aligned reads displayed.
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|
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aCCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTg > 3:1414206/1‑150 (MQ=255)
ccGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGaa < 5:736117/151‑1 (MQ=255)
gAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGaaa > 1:1337780/1‑150 (MQ=255)
aaGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGtt < 6:422823/151‑1 (MQ=255)
aaGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGtt < 3:765509/151‑1 (MQ=255)
aaGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGtt < 2:1437025/151‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGAt < 8:69890/151‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGAt < 2:588744/151‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGAt < 2:1526221/151‑1 (MQ=255)
ggTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATg < 3:991095/151‑1 (MQ=255)
ttGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTc < 1:1500141/150‑1 (MQ=255)
ccGCTTTACTGACATGAGCGCCGGCCAGACCATTACGCGGCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGGGGTTCTGGCGTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGt < 2:1645095/150‑1 (MQ=255)
aCGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGt < 7:545525/151‑1 (MQ=255)
aCGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGt < 5:803825/151‑1 (MQ=255)
cGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTa < 7:1578741/151‑1 (MQ=255)
gCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTaa < 5:1397007/151‑1 (MQ=255)
gCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTa > 5:1000623/1‑150 (MQ=255)
ttACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAac < 5:387499/149‑1 (MQ=255)
gtcATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTc < 6:552229/149‑1 (MQ=255)
gACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGtt < 8:295090/150‑1 (MQ=255)
gACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGtt < 7:1141904/150‑1 (MQ=255)
gACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGtt < 6:85337/150‑1 (MQ=255)
gACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGt < 1:582689/149‑1 (MQ=255)
gACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTc > 3:1606692/1‑151 (MQ=255)
cATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTg > 4:1709832/1‑151 (MQ=255)
aTGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGCCCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGAACTGAAAATCGTTTATGCTCAGGGTAACGACGTTCTg > 2:676421/1‑150 (MQ=255)
gATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATc > 2:996058/1‑151 (MQ=255)
cGACGGCCAGAGCATTACGGGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCa < 3:21832/151‑1 (MQ=255)
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gACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATccc > 3:36197/1‑149 (MQ=255)
gCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTAc < 5:1574438/151‑1 (MQ=255)
gCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTAc > 5:912449/1‑151 (MQ=255)
ccAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTAcc < 7:1824950/151‑1 (MQ=255)
cAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAATATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCg > 1:1086408/1‑151 (MQ=255)
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aGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCg > 1:1699325/1‑150 (MQ=255)
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cgcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAgc > 2:1791649/1‑151 (MQ=255)
gggTCAGACCGACGAACTGACGGGTGTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGGAGAAGGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAgcg < 3:1561656/149‑1 (MQ=255)
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gTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAgcgc > 4:54057/1‑150 (MQ=255)
aGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGt > 8:1522567/1‑150 (MQ=255)
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gacgaACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTcc < 2:109841/151‑1 (MQ=255)
gaACTGTCGGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGc < 7:880120/151‑1 (MQ=255)
gaACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGc < 3:530374/151‑1 (MQ=255)
tGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCggg > 2:1256631/1‑151 (MQ=255)
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aCCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGt > 4:783161/1‑150 (MQ=255)
ccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTaa < 3:588774/151‑1 (MQ=255)
cGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTaa > 1:431178/1‑150 (MQ=255)
gtctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGAt < 8:1130521/150‑1 (MQ=255)
tctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTg > 4:1435558/1‑151 (MQ=255)
tCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGtt < 2:1047752/150‑1 (MQ=255)
cGCTGGTGGTGCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGGTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCa < 1:988854/151‑1 (MQ=255)
tggtggTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCt > 6:1188470/1‑151 (MQ=255)
tggtggTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCt > 6:1610493/1‑151 (MQ=255)
ggtggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTg < 7:1466183/151‑1 (MQ=255)
gtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGaat > 2:362674/1‑150 (MQ=255)
gtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAg < 3:1119495/151‑1 (MQ=255)
ggATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTTGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGTGTATCGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATgg < 7:305033/150‑1 (MQ=255)
gATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCg < 7:749853/151‑1 (MQ=255)
aTTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGt < 5:1253868/151‑1 (MQ=255)
aTTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGt > 4:720575/1‑151 (MQ=255)
ccGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTAc < 1:865522/150‑1 (MQ=255)
ccGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACa < 1:1611712/151‑1 (MQ=255)
cGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTAc > 1:200185/1‑149 (MQ=255)
ggaGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGa < 5:266197/149‑1 (MQ=255)
cAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGAt < 4:1088338/151‑1 (MQ=255)
aGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTAc > 8:1697664/1‑146 (MQ=255)
gAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATc > 8:426666/1‑150 (MQ=255)
gAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCa < 2:23015/151‑1 (MQ=255)
aaCGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTATAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAg < 1:1259980/151‑1 (MQ=255)
aaCGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAg < 3:1466213/151‑1 (MQ=255)
gTACCGCAGGTTGTAAAGATCTGAGTGCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGctc < 4:44664/151‑1 (MQ=255)
aCCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGCTCAGCTCTg > 7:660061/1‑151 (MQ=255)
ccGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTgg < 4:234945/151‑1 (MQ=255)
ccGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTgg < 8:511716/151‑1 (MQ=255)
cGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGt > 4:654514/1‑151 (MQ=255)
gCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTg < 1:1745487/151‑1 (MQ=255)
cAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGa < 1:297597/151‑1 (MQ=255)
gtggtAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGCGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGacac > 7:1399986/1‑151 (MQ=255)
gtAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCt < 5:598003/151‑1 (MQ=255)
aaaGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTgg > 7:418454/1‑151 (MQ=255)
aaaGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTgg > 2:39656/1‑151 (MQ=255)
aaaGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTgg > 4:370544/1‑151 (MQ=255)
aaaGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTgg < 4:1518179/151‑1 (MQ=255)
aaaGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTg < 2:80678/150‑1 (MQ=255)
aTCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGAAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGcgcg > 6:1692031/1‑151 (MQ=255)
|
GCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGT > NC_000913/4188424‑4188718
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
