Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F67 I1 R1
|
9 |
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150.5 |
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BRESEQ :: Evidence
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| |
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/ NA
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 426 total aligned reads displayed.
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|
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tATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGc < 7:664924/150‑1 (MQ=255)
aTCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCAc > 8:324041/1‑151 (MQ=255)
cACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTg < 7:1621724/151‑1 (MQ=255)
cGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGaa > 3:1085811/1‑150 (MQ=255)
gAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGaaa > 4:1140509/1‑150 (MQ=255)
aaGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAAt > 5:238517/1‑151 (MQ=255)
aGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATc < 4:451925/151‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGAt < 3:1585501/151‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGAt < 3:847013/151‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGAt < 4:977647/151‑1 (MQ=255)
ggTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGGCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATg < 6:1295626/151‑1 (MQ=255)
tttGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCt < 4:1609755/150‑1 (MQ=255)
ttGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTc < 5:760002/150‑1 (MQ=255)
gTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAgg < 6:167216/151‑1 (MQ=255)
gTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAgg > 7:879016/1‑151 (MQ=255)
aCGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGt > 4:1032344/1‑151 (MQ=255)
aCGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGt > 1:1623612/1‑151 (MQ=255)
ttACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAac < 8:1025022/149‑1 (MQ=255)
aCTGACATGATCTACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGTTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAacgac < 1:1106281/150‑1 (MQ=255)
gACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGt < 2:2189/149‑1 (MQ=255)
gACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCACAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTc > 1:1325135/1‑151 (MQ=255)
aCATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCt > 7:551498/1‑151 (MQ=255)
cATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTg > 2:484543/1‑151 (MQ=255)
tCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATccc > 2:274291/1‑151 (MQ=255)
cGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATccc > 4:756957/1‑150 (MQ=255)
cGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCa < 8:38518/151‑1 (MQ=255)
gACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAg < 7:1439072/151‑1 (MQ=255)
ccAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTAcc > 1:728123/1‑151 (MQ=255)
ccAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGGCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTAcc < 1:484732/151‑1 (MQ=255)
aGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGCCGTTCTGATCCCAGGTACCg > 6:327988/1‑150 (MQ=255)
gACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGat > 2:60363/1‑151 (MQ=255)
ccATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGatat < 1:1238454/151‑1 (MQ=255)
cATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATg < 4:88449/151‑1 (MQ=255)
aTTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGATCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACAGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTATGATCCCAGGTAACGATATGc > 2:1394699/1‑151 (MQ=255)
tACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGcc > 3:1231121/1‑150 (MQ=255)
aCGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGTTGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGca > 6:417399/1‑148 (MQ=255)
cgcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAgc < 7:1031354/151‑1 (MQ=255)
cgcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAgc < 3:791806/151‑1 (MQ=255)
cgcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAgc < 7:3473/151‑1 (MQ=255)
cgcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTCGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCCgc > 4:318451/1‑151 (MQ=255)
gcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAgcg < 5:1332553/151‑1 (MQ=255)
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tCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTGGGGTGTTGGTTGTGGATGCCGCAGAACTTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCGGGACAGGAAATTCTTTGTTGAAAAGGGTACCGAGGTTCGGAGCCCCGGTACCGATATGCCTgcgc > 6:790378/1‑149 (MQ=255)
cAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGt > 6:1094423/1‑151 (MQ=255)
aGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTa < 5:383145/151‑1 (MQ=255)
acgaACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCt < 3:217517/151‑1 (MQ=255)
gaACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATACCAGGTACCGATATGCCGGCGCAGTACTTCCTGc > 4:58623/1‑151 (MQ=255)
aaCTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGcc > 3:1185775/1‑151 (MQ=255)
aaCTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGc < 2:1239132/150‑1 (MQ=255)
aCTGACGTGTGTGTTTTCGCTGGTGGTTGTGGATTCGGGAGAAGGTACCGCAGGTGGTATAGATCTGAGTCCGGCACTGAATATCGTTGATGCTCAGGGTAACGAGGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGGAGTACTTCCTGCCg < 7:128078/151‑1 (MQ=255)
cTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCgg > 7:738665/1‑151 (MQ=255)
gACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGt < 7:1115754/151‑1 (MQ=255)
gACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCACAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGt < 3:911322/151‑1 (MQ=255)
aCCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGt > 3:509665/1‑150 (MQ=255)
aCCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTa < 5:706160/151‑1 (MQ=255)
ctgtctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAcgcg > 2:842136/1‑150 (MQ=255)
gtctTCGCTGGAGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCCGCACTGAAAATCGTAGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGAAAAGCGAtt > 5:1037031/1‑151 (MQ=255)
ctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGt > 2:1477655/1‑151 (MQ=255)
ggCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTATCGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAATGCGATTGTGCa < 6:742701/150‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAg < 2:377416/151‑1 (MQ=255)
tggtggTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCt > 2:731908/1‑151 (MQ=255)
ggtggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTg > 2:1335167/1‑151 (MQ=255)
ggtggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTg > 8:602375/1‑151 (MQ=255)
gtggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTgg < 4:146236/151‑1 (MQ=255)
gtggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTgg < 6:1510148/151‑1 (MQ=255)
ggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGa > 6:1319892/1‑150 (MQ=255)
ggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATACCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGaa < 8:1355901/151‑1 (MQ=255)
tCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGa < 7:1388993/150‑1 (MQ=255)
tGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATgg > 6:1193015/1‑151 (MQ=255)
ggATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGAt < 3:1468212/148‑1 (MQ=255)
ggATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATgg < 8:858283/150‑1 (MQ=255)
ggATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGc > 3:414763/1‑151 (MQ=255)
ttCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGt > 7:1544203/1‑150 (MQ=255)
ccGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTAc < 1:648754/150‑1 (MQ=255)
ccGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTAc < 6:525134/150‑1 (MQ=255)
ccGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTAc < 4:1293125/150‑1 (MQ=255)
gCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTAc > 5:1608069/1‑148 (MQ=255)
gCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGAGCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTGGATGCTCCGGGTAACGACGTGCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGa < 6:598373/151‑1 (MQ=255)
cAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGAt < 2:954034/151‑1 (MQ=255)
aGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTCCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATc < 8:224244/151‑1 (MQ=255)
aCCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTg > 5:1469714/1‑151 (MQ=255)
aCCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTg < 5:1185702/151‑1 (MQ=255)
aCCGCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTg > 2:1584575/1‑151 (MQ=255)
gCAGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTg < 2:1057265/151‑1 (MQ=255)
aGGTGGTAAAGATCTGAGTCCGCCACTGAAAATCCTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTCTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGa > 6:1544739/1‑150 (MQ=255)
gtAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTTGTGACACCCt < 2:1018851/151‑1 (MQ=255)
gtAAAGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCt < 8:1089258/151‑1 (MQ=255)
aaaGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTgg > 7:250759/1‑151 (MQ=255)
aaaGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTgg < 1:310586/151‑1 (MQ=255)
aaaGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTgg < 1:1563453/151‑1 (MQ=255)
aaaGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTgg < 1:1004052/151‑1 (MQ=255)
aaGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACATATCAGCTCTGGTGACACCCAGgc > 8:1544740/1‑151 (MQ=255)
aaGATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGgc < 5:608526/151‑1 (MQ=255)
gATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGgcgc > 3:597616/1‑151 (MQ=255)
gATCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGgcgc > 1:601446/1‑151 (MQ=255)
tCTGAGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGt > 4:1354668/1‑151 (MQ=255)
|
GCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGT > NC_000913/4188424‑4188718
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
