Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F92 I7 R1
|
17 |
117.3 |
2470152 |
74.3% |
1835322 |
300.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,186,542 |
A→T |
K398M (AAG→ATG) |
rpoC → |
RNA polymerase, beta prime subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,186,542 | 0 | A | T | 99.0%
| 320.6
/ NA
| 96 | K398M (AAG→ATG) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (47/47); minor base C (1/0); total (49/47) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
AAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTACCGCTGACGCTGGAAGCCCAGCTGGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCTACCAACAACATCCTGTCCCCGGCGAACGGCGA > NC_000913/4186251‑4186839
|
acgctcttccgatcttgctgGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGt < 2:432434/286‑1 (MQ=255)
cGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTg < 2:403774/300‑1 (MQ=255)
aGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAgcg > 2:417201/1‑300 (MQ=255)
aCGCCCTGCTGGATAACGGTCGGCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGcgcg < 2:425926/300‑1 (MQ=255)
cccTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCgaaga < 1:826584/301‑1 (MQ=255)
tgctgGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGc < 1:90924/301‑1 (MQ=255)
tgctgGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTAGATCG‑gaagagcaa > 1:432441/1‑297 (MQ=255)
aTAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGt < 1:591376/301‑1 (MQ=255)
tAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGtt < 1:1072929/301‑1 (MQ=255)
gtcgtcGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTggg < 1:937028/300‑1 (MQ=255)
tcgCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGatat > 1:1130228/1‑300 (MQ=255)
cttccgatctgATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGAGGTCTGCCGAAGAAAATGGAACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCt < 1:329311/291‑1 (MQ=255)
cgGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATc > 2:252136/1‑298 (MQ=255)
cGAGCACCGGTTCTAACAATCGACCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGGCTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGt < 2:823629/301‑1 (MQ=255)
gATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGtt > 1:673552/1‑301 (MQ=255)
gATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGAGGTCTGCCGAAGAAAATGGAACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTAGAccggaag > 2:329307/1‑295 (MQ=255)
aCCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATc > 2:477085/1‑300 (MQ=255)
ggTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCcgcg > 1:798608/1‑301 (MQ=255)
tCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAac < 2:239461/301‑1 (MQ=255)
aaCAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAacac > 2:699815/1‑300 (MQ=255)
aCAAGCGTCCTCTGAAAGCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCATGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGAAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACAccc < 2:1130212/301‑1 (MQ=255)
tctTAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACCGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGTACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTActgctg < 1:775996/301‑1 (MQ=255)
gAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGTTACTGCTGaa > 2:17676/1‑300 (MQ=255)
gAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGAGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGCAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGaa > 1:1201334/1‑300 (MQ=255)
aaaTCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAAc < 1:699822/300‑1 (MQ=255)
aaaTCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTACGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACTGCAAGATGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACAATCAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGCCGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAAc > 2:377858/1‑300 (MQ=255)
ttGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCa > 1:790744/1‑300 (MQ=255)
ggCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCACTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTTGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCAcc > 2:378541/1‑300 (MQ=255)
cgacgctcttccgatctaaCAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGAct < 2:1053828/284‑1 (MQ=255)
aCATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGActct < 1:252139/301‑1 (MQ=255)
cATGATCAAGGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCGGTAATTACCGTAGGCCCGACCCTGCGTCTGCACCAGTGCGGTCTGCCTAAGAAGATGGCTCTGGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTTCGGCAAGCTGGAAATGCGTGGTCTCGCGACCACCATCAAAGCCGCCAAGAAAATGGTCGAGCGCGAACTGCCAGAGGTTTGGGACGTTCTCGCTGAAGTCATCCGTGAACACCCGGTTCTCCTCAACCGTGCACCGAccctt > 1:921594/1‑300 (MQ=255)
tGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTCCTGCTGAACCGTGCACCGActcttc > 2:747850/1‑298 (MQ=255)
tAAACATGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGGTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGACGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGt < 2:798600/301‑1 (MQ=255)
tAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTggg < 1:477092/300‑1 (MQ=255)
aaCAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGActagatcggaagagcaca > 1:1053842/1‑284 (MQ=255)
gTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTGAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGACCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCAGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTACATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAgg < 1:802823/300‑1 (MQ=255)
tttCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCAttt < 2:381299/301‑1 (MQ=255)
tttCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGATCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCAGCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCAtt < 1:24713/300‑1 (MQ=255)
cTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTTTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTTTGGGTTATCAGGAATTTCAACTGGTAcgta > 1:421902/1‑298 (MQ=255)
tCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGa > 1:15450/1‑301 (MQ=255)
acgtgtgctcttccgatctCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGaa < 1:117696/283‑1 (MQ=255)
tgctcttccgatcttctCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAgg < 1:165532/285‑1 (MQ=255)
aGCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCTCCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTaa > 2:918147/1‑301 (MQ=255)
gCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTaaa > 1:1111149/1‑301 (MQ=255)
gCGTGTTGACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTaaa > 1:834432/1‑301 (MQ=255)
tactCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGc < 1:382397/301‑1 (MQ=255)
actCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAggagatcggaagagcgg > 2:165531/1‑286 (MQ=255)
ctCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCGGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTg < 2:113981/301‑1 (MQ=255)
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|
| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A