Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F92 I0 R1
|
51 |
146.1 |
2193620 |
97.0% |
2127811 |
289.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,186,542 |
A→T |
78.6% |
K398M (AAG→ATG) |
rpoC → |
RNA polymerase, beta prime subunit |
| |
seq id |
position |
change |
freq |
score |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,186,542 | 0 | A→T | 78.6%
| 103.8 ‑1.0 ‑0.1 | 178 | K398M (AAG→ATG) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (74/65): ref base (17/21): total (92/86) |
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.67e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.12e-01 |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
GGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTACCGCTGACGCTGGAAGCCCAGCTGGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCTACCAACAACATCCTGTCCCC > NC_000913/4186249‑4186827
|
aaGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAAGCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCTTCTGCACCAGTTCGGTCTGCCGATGAAAATCGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTCCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAACTggg > 1:987477/1‑300 (MQ=255)
gCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAAACACCGTAGGTCCCTACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCTAAGAAAATGGCACTGGCACTGTTCAAACCGTTCATCTACGCCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTCCCACCATGAAAGCTGCACAGAACATGGTTg > 2:772721/1‑301 (MQ=255)
cGGTAGACGGCCTGAGGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTTCGTTAACCGGTTATAACAAGCGTCCTTTGAAAGCTTTGGCTGACAGGAACAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGGTCGGTAATCGTGTT‑TACGACCCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATGCCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGAACTGGAGCTGTTCAAACCGTGCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTg < 2:11029/300‑1 (MQ=255)
gTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAACGCTGCGATGAAAATGGTTGAgg > 2:125882/1‑300 (MQ=255)
ctgctgGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGaagaag > 1:37958/1‑301 (MQ=255)
atgctgGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCAGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGACAATACCTGCGTCTGCATCAGGGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCGGGAACTGCGTGGTGTTGATACAACCATTAAAGCGGCACAGAAAAGGGTTGAGCGGGaagaag > 2:783809/2‑301 (MQ=255)
ggATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGaagaag > 1:981310/1‑296 (MQ=255)
tcgCGTACGTTCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGGTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGGCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGatat < 1:351409/300‑1 (MQ=255)
gTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGa > 1:182307/1‑301 (MQ=255)
gTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGa > 2:244989/1‑301 (MQ=255)
tCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGAc < 1:287984/301‑1 (MQ=255)
tGCGATCACCGGTTCGAACAAGCTGCCTCTGAAATCGTTGGCCGACAGGATCAAAGGTCAAGAGGTTCGTTTCCGTCAGTACCTGCTCGGTAGGCTACTT‑GAGTCCTCCGGGCGGTCTGCATGCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCTTCAGTGCTGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGAGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGGAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGa < 2:469499/300‑1 (MQ=255)
gATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACATGGTCGGTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGt < 2:971732/300‑1 (MQ=255)
ggTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGTACGAAGTTATCcgcg > 1:65703/1‑301 (MQ=255)
ttCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGaa < 1:887380/301‑1 (MQ=255)
tAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTTTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAaca > 1:729481/1‑300 (MQ=255)
acaaagtgtcacattaaaTCGTTGGCCAAAATGATCAAACGGAAACAGGGTAGGTGCCGGCAGAACCTGCTCGGTAAGCGGGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGGAGGGACAGACCGGCGGCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACAcc < 2:571826/286‑1 (MQ=255)
cGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTa < 1:536259/300‑1 (MQ=255)
cGTCCTCTGAAAACGTGGGCAGAAATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTAAGAACCTGTTCGTTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTAGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCTTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCTTTCATCTACGGCAAGATGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGGGAAGATAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCTTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTAc < 1:927900/301‑1 (MQ=255)
aaaaTCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAAc < 2:37955/300‑1 (MQ=255)
aaaaTCTTTGGCCGACAGGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTTTCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAAc < 2:182303/300‑1 (MQ=255)
aaaaCCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAAc < 2:535432/300‑1 (MQ=255)
aaaTCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAAc < 1:640470/300‑1 (MQ=255)
aaaTCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAAc < 1:427620/300‑1 (MQ=255)
aaaTCTTTGGACGACATGATGAAAGGTAAAACGTGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCGGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACAACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAAc < 2:935783/300‑1 (MQ=255)
ttGGCCGACATGATCCAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCTAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCAc < 1:224340/301‑1 (MQ=255)
ttGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGGCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTACGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCAc < 2:309788/301‑1 (MQ=255)
cccGAAATGATCAAAGGTAATCATGGTCGTTTCCGTCGAAACCTGCTGGGTAAGCGTGTT‑GCCTATGCCGGTCGCTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGa < 2:1089510/300‑1 (MQ=255)
ccGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGAc < 1:123200/301‑1 (MQ=255)
aCATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGActc < 1:36477/300‑1 (MQ=255)
gATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCa > 1:707350/1‑300 (MQ=255)
gATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTCCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGCGCACCGACTCTGCa > 2:361803/1‑300 (MQ=255)
gtCAAAGGTAAACATGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCAc < 2:712649/299‑1 (MQ=255)
gtCAAAGGTAAACAGGGTCGTGTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGGGTT‑GACGACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCAc < 2:1069801/299‑1 (MQ=255)
agcAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCGGTAAGCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCAc < 2:1093840/298‑1 (MQ=255)
aTCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCAc < 1:569538/300‑1 (MQ=255)
aTCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCAc < 1:847184/300‑1 (MQ=255)
aTCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCAc < 1:832492/300‑1 (MQ=255)
aTCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCAc < 1:805471/300‑1 (MQ=255)
aaGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGt > 1:11218/1‑299 (MQ=255)
aGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGt > 1:772120/1‑298 (MQ=255)
ggTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGTAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCCGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTgg > 1:218093/1‑301 (MQ=255)
ggTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGACTAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCGGCGAACACCCGGTACTGCTTAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTgg > 2:825921/1‑301 (MQ=255)
aaaCAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTa > 1:1038985/1‑301 (MQ=255)
aaCAGGGTCGTTTCCGTACGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTTTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCAGCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTAt < 2:729461/301‑1 (MQ=255)
gctggccggagaaaCCGGCCCGGT‑AGGGTGTTGGACTACTCCGGGCGTTCTGTAACCACCGTAGGCCGATACCGGCGTCTGCAACAGGTCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCa < 2:503816/288‑1 (MQ=255)
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cTCGGTAAGCTTTTG‑TCCTACTCCGGTCGTTCTGTAAGCACCGTAGGTCCATACCGGTGTTTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATc < 2:1038935/300‑1 (MQ=255)
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ccaTTAAAGCTGCGATGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGCCTTCGATGGTGACCAGAGGGCTGTTCACGTACCGCTGACGCTGGAAGCCCAGCTGGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCTACCAACAACATCCTGTccc > 1:262034/1‑300 (MQ=255)
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GGAAGCGGTAGACGCCCTGCTGGATAACGGTCGTCGCGGTCGTGCGATCACCGGTTCTAACAAGCGTCCTCTGAAATCTTTGGCCGACATGATCAAAGGTAAACAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCTGCTCGGTAAGCGTGTT‑GACTACTCCGGTCGTTCTGTAATCACCGTAGGTCCATACCTGCGTCTGCATCAGTGCGGTCTGCCGAAGAAAATGGCACTGGAGCTGTTCAAACCGTTCATCTACGGCAAGCTGGAACTGCGTGGTCTTGCTACCACCATTAAAGCTGCGAAGAAAATGGTTGAGCGCGAAGAAGCTGTCGTTTGGGATATCCTGGACGAAGTTATCCGCGAACACCCGGTACTGCTGAACCGTGCACCGACTCTGCACCGTCTGGGTATCCAGGCATTTGAACCGGTACTGATCGAAGGTAAAGCTATCCAGCTGCACCCGCTGGTTTGTGCGGCATATAACGCCGACTTCGATGGTGACCAGATGGCTGTTCACGTACCGCTGACGCTGGAAGCCCAGCTGGAAGCGCGTGCGCTGATGATGTCTACCAACAACATCCTGTCCCC > NC_000913/4186249‑4186827
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
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| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A