Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F9 I0 R1
|
105 |
139.1 |
2894862 |
97.5% |
2822490 |
224.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,813,071 |
A→C |
21.1% |
T114T (ACA→ACC) |
dfp → |
fused 4'‑phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenoylcysteine synthetase, FMN‑binding |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,813,071 | 0 | A | C | 21.1%
| 154.3
/ 5.5
| 90 | T114T (ACA→ACC) | dfp | fused 4'‑phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenoylcysteine synthetase, FMN‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/23); new base C (2/21); total (44/46) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-06 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCGTAGCCATGACCGAAGCGGCAAAAGCCTTTATCACCCCACTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTA > NC_000913/3812836‑3813303
|
gcgTAGCCATGACCGAAGCGGCAAAAGCCTTTATCACCCCACTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCt < 1:531886/239‑1 (MQ=255)
gcgTAGCCATGACCGAAGCGGCAAAAGCCTTTATCACCCCACTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCt < 1:901067/239‑1 (MQ=255)
tagggccGAATCGGCAAAACCCTTTATCTCCCCGCTTAGCTTGCATGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTTTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTg < 2:49139/234‑1 (MQ=255)
tGACCGAAGCGGCAAAAGCCTTTATCACCCCACTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGGAGCCGCTATGGGCCAAATTGAGCTTGGGAAATGGGCTGATTTTGTGATTTCCCCCCCTGCCACCGCCGATTTTATTTCCCGGGTTGCCGCCGGCATGGGGGATTAACTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTTGCTCCCCCTGCGGCTGTa > 2:349284/1‑239 (MQ=255)
aaGCGGCAAAAGCCTTTATCACCCCACTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGt > 1:448779/1‑238 (MQ=255)
aGCGGCAAAAGCCTTTATCACCCCACTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTTATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATTGCGAATGACCTGG‑TATCGCCGATTTGT‑CTTGCTTCCCCTGCCCCTGTAGCCgg > 1:656998/1‑236 (MQ=255)
cAAAAGCCTTTATCACCCCACTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGTACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGGTTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGCCGCTTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCCGTAGCCGTGCTccc > 1:1083180/1‑238 (MQ=255)
cTTTATCACCCCACTTAGCGTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCACGCCAt < 1:604249/237‑1 (MQ=255)
ttattccccccACTAAGCTTGCGGGCGTTTTCTGGTTACCCCTTTTCCGAC‑ATTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGCGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTCCCCGTGTTGCTGCCGGAATGCCGAATGCCCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CGGGCTACCCCTGCGCTGGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGaa < 2:656998/232‑1 (MQ=255)
ttacACCCCCCTTGGCTTGCGGGCGGTTGGTGGTTACCCCGTTCCGGAC‑AGGCGGCGGTCCCCGGCGGCCGAGCCCGCTATGGGCCATATTGAGCGGGGAAAAGGGGCGGAGTTAGTGTTTCTCGCCCCGGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCGGGAATGGCGATGGACCGGG‑TACCGACGATTTGT‑CGGGCTACCCCGGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAAcc < 2:1083180/236‑1 (MQ=255)
tATCACCCCACTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGGC‑AGTCTGCTGGACCCCGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTTAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGGAAGACCTGG‑GGTCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAAc > 1:654967/1‑238 (MQ=255)
tATCACCCCACTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTTGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGTTTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCCTGAAcc > 1:1429524/1‑239 (MQ=255)
tATCACCCCACTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGGTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCCGGGGAAATGGGCTGATTTAATGGTTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTTT‑CTGGCTACACCTGCGCCCGGACCCGTGCTCCCCGCCCTGAAc > 2:78291/1‑238 (MQ=255)
tCACCCCACTTAGCTTGCAGGCGTTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCTAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACcag < 1:1311167/239‑1 (MQ=255)
cccACTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCCGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCCGCAGa > 1:525816/1‑239 (MQ=255)
cTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGGCCCGGCAGCCGAAGCCCCTTTGGGCCATATTGGGCTGGGGAAATTGGCTGATTTTGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCCGATTTGACTTCCCGTGTTGCTGCCGGGATGGCGGATGACCCGG‑GATCGCCCTTTTGT‑TTGGCTACACCTGCGCCCGTAGCCGGGCTCCCCCCCATGGACCAGCTGAAGt > 2:114964/1‑238 (MQ=255)
aGCTTGCAGGCGGTTTCTGGGTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGGTTTGATTGCCCGTGTTTCTGCCGGGATGGCGCACGACCTGG‑GATCGGCGATTTTT‑CTTGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCCTGAACcacccgctgttacg > 2:270839/1‑227 (MQ=255)
cTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTTAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGt > 1:476210/1‑238 (MQ=255)
gCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGCC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCAAATTGAGCTGGGGAAATGGGCTGGTTTTGTGATTCTCGCCCCCGCCACGGCCGGTTTGATTGCCCCGGTTGCTGCCGGAATGGCGGATGACCTGG‑TATCGACGCTTTTG‑TTGGCTACACCTCGGCCTGTAGCCGTGCCCCCCGCCCTGGAcccaccgacggacccgtcc > 2:1251356/1‑221 (MQ=255)
gCAGGCGGTTTCTGGGTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCCTATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGGTTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGGAGATTTGATTGCCCGGGTTGCTGCCGGAATGGCGGATGACCTGG‑TATCGACGGTTTGT‑CTTGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCCGATGTACCGTGcc > 1:466426/1‑238 (MQ=255)
gTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACCATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGcccc > 1:230900/1‑237 (MQ=255)
gTTTCTGGTTATCCCGTTCCCGAC‑GTTCGGGTGGACCCGGCGGGAGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGGTGGTTAAATGGGAGGATTTAGGGATTCGCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATGGCCCGTGTTGCGGCCGGAATGGCAAATGCCCGGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACCCCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCa < 2:455801/238‑1 (MQ=255)
tttCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCGGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACg < 1:1084954/239‑1 (MQ=255)
ttCTGGTCTTCGCGTTCCCGAC‑AGCCGCCTGAGCCGGGCGGCGGAAGCATATAGGGGCATTATGGAGCGGGTTAAAGGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTCCCCGTGTTGCGGCCGGAATGGCGAATGCCCTGT‑CATCGACGATTGGT‑CTGGTTACCCCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACg < 2:256226/238‑1 (MQ=255)
tcatgttattgcgctgtCCGAC‑AGGCTGCCGAGCCCGGGAGTGGAAGCCGGTTTTGGCCATATGGAGGGGGGAAAATGGTCTTATTTAATGGTGCTCGCCCGGGCCACGGCAGCTTTGATTCCCGGTGTTGCGGCCAGAATGCGGAATGCGCGGG‑TAGGAACGATTTGT‑TTGGCAACCCCTGAGCGTTTCGCGGGGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCCGACACg < 2:1275581/222‑1 (MQ=255)
gtttATCCCGTTCCCGAC‑AGTCGGCTGGCCCGGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACgcagca < 1:611839/237‑1 (MQ=255)
ggTTACCCCGTTTCCGAC‑AGTCGGCTGGACCCGGCAGCGGAAGCCGTTATGGGCCATATGGGGCGGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAAGGGCAAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCGGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACgcagca < 1:349284/239‑1 (MQ=255)
tttttccctttCCGACTAGTCGGGTGGACCAGGCGGCAGAAGCCGTCATGAGCCTTATTGAGCTGGGGAAGTGGGGTGATTGAGGGTCTATGCCCCCGGCCCAGCGAGATTTGATGGCCCGTGTTGCTGCCGGAAGGGCGAAGGACCTGG‑TACCGACGATTTTT‑CGGGCTACACCTGCGCCTTTAGCCCTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACgcagca < 2:872467/230‑1 (MQ=255)
tCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑TTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGCTGTACCGTGTCGCTGCCACGCAGCATAAtt > 1:807971/1‑239 (MQ=255)
ctttcccgaggggctgctgGCCCGGGAAGCCGAGCCCGCTGTGGGCCTATTTGGGCGGGGTAATTGGCCTGATTTGGTGTTTCGCCCCCCTGCCCGGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGCCCGGG‑TATCGACG‑TTTGTGCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTag < 2:3477/226‑1 (MQ=255)
tCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGt > 2:626982/1‑239 (MQ=255)
tCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGtgcttgct > 2:375083/1‑238 (MQ=255)
tgctgGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTc > 1:614554/1‑238 (MQ=255)
ggCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGACCCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGttt > 1:129542/1‑237 (MQ=255)
gAACCCGTTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTg < 1:146430/239‑1 (MQ=255)
tgCTATGGCCCATATGGCGGTGGAAAAGGGGGTTGTTTTGGGGATTCTCGCCCCTCCCCCGGCAGTTTTGATTCCCCGGGTCGCTCCCGGAAGGGCAAAGGCCCTGG‑TATCGACGATTGGT‑CTGGCTACCCCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTggggg < 2:351181/237‑1 (MQ=255)
cgcttggggCCATATTGGGCTGGGAAAATGGGCTGATTTAGTGTTTCCCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGc < 1:663036/233‑1 (MQ=255)
aTGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGa < 1:375083/239‑1 (MQ=255)
ccATATTGGGCTGGGTAAAGGGGTTGATTTGGTGGTTCCCGCCCCGGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTTTTTCGGCCGGAATGGCAAATGACTTGT‑TAGCGACGATTTGT‑CTGGCGCCCCCGGCGCCTGTAGCGGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGt < 2:448779/238‑1 (MQ=255)
cATATTGAGCGGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGCCCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACCCCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTg < 1:1126814/238‑1 (MQ=255)
tatTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACTGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGAGCTCCCCGCCATGAACCAGCGGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGATGTGCTAACTTCCCTTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCATTCAGTggaa > 2:1288507/1‑237 (MQ=255)
atTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACg < 1:1440987/177‑1 (MQ=255)
atTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACg > 2:1440987/1‑177 (MQ=255)
atTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTagag > 1:1004690/1‑192 (MQ=255)
ttGAGCTGGTTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTCCACCTGCGCCTGTAGCCGTGCCCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGt < 1:202124/239‑1 (MQ=255)
tggAGCTGGGAAAAGGGGCTGTTTTGGTGATTCCCCCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTGGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTCCCCCGGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGt < 2:476210/237‑1 (MQ=255)
aGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAg > 1:509673/1‑239 (MQ=255)
ggTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGCCAGTGGCAGTCACGCTtg > 2:1210753/1‑239 (MQ=255)
ggTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTtg > 1:1328389/1‑239 (MQ=255)
ggTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTtg > 2:721328/1‑239 (MQ=255)
ggTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTtg > 1:233826/1‑239 (MQ=255)
ggTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTtg > 1:4276/1‑239 (MQ=255)
aagtgtcTGGTTTGGTGCTTTCCGCCCCTGCCACGGCGGATTTGAGTGCCGGTGTTGCTGCCGGAAGGGCGAATGACCTGG‑TACCGACGATTTGT‑CTGGCTACCCCTGCGCCTGTGGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTgtggt < 2:233826/233‑1 (MQ=255)
cTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACgcagca < 2:326565/163‑1 (MQ=255)
cTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACgcagca > 1:326565/1‑163 (MQ=255)
cTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATc > 1:963837/1‑239 (MQ=255)
cTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGGGGCCGTCAGGCTTGGGGTGatata > 2:622738/1‑238 (MQ=255)
aTTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑gg > 1:707168/1‑238 (MQ=255)
tGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTTTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCCGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGACAGGCTTGTGGTGCTATC‑GGTCCgggg > 2:923841/1‑239 (MQ=255)
tctcGCCCCTGCCACGGCAGCTTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGaa > 1:285409/1‑239 (MQ=255)
tctcGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACg > 2:325302/1‑145 (MQ=255)
tctcGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACg < 1:325302/145‑1 (MQ=255)
tctcGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGaa > 1:139415/1‑239 (MQ=255)
tctcGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGaa > 1:343503/1‑239 (MQ=255)
ccccCGCCACGCCTGATTTATTTGCCTGTGTTGCCCGTGAAGTGGAGAAGGCCGTGG‑CACCGACGATTGGT‑CTGGCTCCCCCCGGGCGGGTGCCCGGGCCCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTc < 2:525816/239‑1 (MQ=255)
ccgtgcgccggctgattttttgccccTTGTTGCGCCGGGAACTGCGAATG‑CCTGGTTATCGACGATGTTC‑CTGTCCACCCCCCCCCCTGCAGCCGGCCGCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCg < 2:614554/216‑1 (MQ=255)
cccTGCCGCGTCAGTTTTGATTGCCGGGTTTGCTGCCGGAAGGGCGAATGCCGGGG‑TATCGACGATTTTT‑CTGGCTACCCCTGCGCCTGTAGCCGTGCCCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCg < 2:199159/239‑1 (MQ=255)
ttccACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATAACTTGG‑TATCGCCGACTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGACCCAGCCGACGTACCGTGCCGCTGCTACGCATCATACTTTACAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCTTCTGGGGGCCGTACAGCGGAAGGCAGGCTTCGGGTGA‑ATCGGGTCGTGAGCGAATgacagagc > 2:1085374/3‑232 (MQ=255)
tGCCGCGGCAGATTTGTTCGCGCGTGTTGCTGCCGGAACGGCGAATGACCTGG‑TATCACCGATTTGT‑CTGGCTCCACCTGCGCCTTGAGCCTTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGC‑‑‑ATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCT‑GGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGtt < 2:466426/239‑1 (MQ=255)
tGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGAt > 2:820232/1‑238 (MQ=255)
ggtggtttagagtGCCTGTGTTGCTGCCGAAAAGGCGAATGCCCGGG‑TCTGGATGTTTTTT‑TTGGCTACCCCGGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTaa < 2:963837/227‑1 (MQ=255)
ggCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TACCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTaa < 1:270839/239‑1 (MQ=255)
gCATATTGGATTGCCCGGGTTGCTGCCGGAATGTGAAATGACCTGT‑TATGGACGATTTGT‑CTGGCTACCCCTGCCCCTGTAGCCGTGCCCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTaa < 1:919082/238‑1 (MQ=255)
cgtttttagttGCGCGTGTTGCTGCCGTAGCGGGGAATGACCGGG‑TAACGACGATTGTT‑CTGCCTCCGCCTGCGCCTGTGCCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAAc < 2:824768/229‑1 (MQ=255)
ttGCCCGTTTTGCTGCCGTAATGGCGAATGCCCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGa < 1:1404044/238‑1 (MQ=255)
gcCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGGAggc > 2:831792/1‑235 (MQ=255)
gcCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGAAAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCgggtggg > 2:963601/1‑232 (MQ=255)
gcCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGCACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGCGATGGCgggcggcga > 2:171755/1‑232 (MQ=255)
tGGCGAATGACCTGT‑TACCGGCGATTTGT‑CTGGCTACACCGGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCg < 1:413213/239‑1 (MQ=255)
cTGG‑TTTCAACGATTTGT‑CGGCCTACCACGGCCCCTGTAGCGGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGa < 1:519251/239‑1 (MQ=255)
acggccgaTTTGT‑CTGGCTCCCCCTGCGCCTGTAGCGGTCCCCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGa < 2:1328389/234‑1 (MQ=255)
accggcgaTTTGT‑CGGGTAACATCTGCGCCGGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGa < 1:116446/234‑1 (MQ=255)
accggcgaTTTGT‑CGGCCTCACCCGGCGCCTGTAGCCGTCCTCTCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGa < 2:614961/234‑1 (MQ=255)
accgacgaTTTTT‑CTGGCTGCCCCACCGCCTGGAGCCGTGCCCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGGCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGa < 1:1085374/237‑1 (MQ=255)
aTCGACGTTTTGT‑CTGGCTCCGCCGGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGa < 1:269259/239‑1 (MQ=255)
acgaTTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGGGGGGCATTTTTTGGCCCTCCACGcccctgaa > 2:776718/1‑232 (MQ=255)
tttttgcTGGCTACCCGTGGGCCTTGGGCGGTGCTCGCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCt < 2:1413503/233‑1 (MQ=255)
tttGT‑CTGGCTACCCCGGCCCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTg < 1:776718/239‑1 (MQ=255)
ttGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGGAGAGCGTTTTTTCCCCGGCAAAGACCCGCAACATCTgc > 2:861164/1‑238 (MQ=255)
gCTACACCGGCGCCTGTAGCGTGGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTa < 2:230900/238‑1 (MQ=255)
|
GCGTAGCCATGACCGAAGCGGCAAAAGCCTTTATCACCCCACTTAGCTTGCAGGCGGTTTCTGGTTATCCCGTTTCCGAC‑AGTCTGCTGGACCCGGCAGCCGAAGCCGCTATGGGCCATATTGAGCTGGGTAAATGGGCTGATTTAGTGATTCTCGCCCCTGCCACGGCAGATTTGATTGCCCGTGTTGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGG‑TATCGACGATTTGT‑CTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATC‑GGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTA > NC_000913/3812836‑3813303
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
