Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F27 I0 R1
|
322 |
127.1 |
2757226 |
91.8% |
2531133 |
223.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,838,897 |
G→T |
10.3% |
L217F (TTG→TTT) |
yicL → |
EamA family inner membrane putative transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,838,897 | 0 | G | T | 10.3%
| 457.6
/ 2.1
| 153 | L217F (TTG→TTT) | yicL | EamA family inner membrane putative transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/85); new base T (16/4); total (64/89) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.84e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
GTGACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTG‑CCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAAT > NC_000913/3838676‑3839118
|
gTGACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTG‑CCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTTTCGTTAACGGCA‑G‑GTTGA‑TTTTGGCGtttttttt > 1:39876/1‑238 (MQ=255)
cccccgtttgtCCGACGTCATTATTGATCTCTCCTG‑CCGCGTTGTTCTGGGGTATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTtg < 2:182995/229‑1 (MQ=255)
cccgTAATCCGACGTCATTAACGATCTCTCCTG‑CCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTtggt‑g < 1:618949/236‑1 (MQ=255)
acggttaccgggcGTCTTTAGCGATCCCTCCTG‑CCCGGTTGTTCTGGGGCATTGGCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCCCCTATCCCTCAACGGTAATTGCCCGCTAAGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTtggt‑g < 2:1245252/227‑1 (MQ=255)
ggTAATCCCACGTCATTTTCGATCTCTCCTGCCCGGGTTG‑TCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCCCCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTggt‑ggt < 2:268452/239‑1 (MQ=255)
tAATCCCGCGTTATTATCCATCTCTCCTT‑CCCCGTTGTTCCGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTc < 1:242817/238‑1 (MQ=255)
aTCCGACGTTATTATCGATCTCCCCGG‑CCGCTTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCCCCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCa < 1:305038/237‑1 (MQ=255)
tCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTG‑CCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCCCGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGCCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGGCAAAACTTTGTCGTTTACGGCA‑C‑TTTGA‑TTTTGGGGTTTTTTTTTTtgtggtgagttg > 2:286753/1‑229 (MQ=255)
gcccttaTTATCTGTCTCTCCTC‑CCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTGGCTCCTGCATTCTAGTCCGCCTATCCCTTAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTa < 2:1001122/233‑1 (MQ=255)
gACGTCATTATCGATCTCTCCTG‑CCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTa < 1:763384/239‑1 (MQ=255)
cGTCATTATCGATCTCTCCTG‑CCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTTTGCCAGATAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGT‑TTTTGGGCTTTTTTTTTTTGTG‑GGTCCTTggacga > 1:770223/1‑235 (MQ=255)
tCATTATCGATCTCTCCTG‑CCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGCTTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACCAGGAACAAACATTTTCGTTAAAGGCA‑G‑TTCTG‑TTCTGGGGGTTTGTTTTTTGGT‑GGGCATTGGTACGt > 1:826927/1‑238 (MQ=255)
cATTATCGTTCTTTCCGG‑CAGCGTTGGTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCGCCTATCCCTCAACGGTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTcc < 1:530560/239‑1 (MQ=255)
cATTATCGATCTCTCCTG‑CCGGGTTGGTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTcc < 1:1263424/239‑1 (MQ=255)
tttgcGATCCCTCCTG‑CCGGTTTTTTCGGGGGCATTGCCTCGGGATTTGGTGACGCATTCTATACCACCTATCCCGCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCt < 2:746816/235‑1 (MQ=255)
ttcCTG‑CCCCGTTTTTCCGGGGCATGGCCTGCGCATTTGCTGATGCATTCTATACCGCCTATCCCGCAACGTTAATTGCCCGTTATGGCACGTTACCAGGCGGCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCTGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTGTTTTATATGGT‑GGTCATTGGTACTTCCCTT‑ACATTTAGt < 2:826927/238‑1 (MQ=255)
cgccTG‑TCGTGTTGTTCTGGGGCATTTCCTTGGCATTTGCCGGTGCATTCTATGCCATCTAGCCCTCAACGCTAATTGCCCGCGTTGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGt < 2:245347/237‑1 (MQ=255)
tcCTG‑CCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTTTTTTGCCTTTTTATGCCCGACAAGGAACAAACTTTTTCGTTAACGGAC‑G‑TTTTT‑TTTTTGGGTTTTTTTTTTTTGTGGGTGTTTGGTAAGACCCT‑‑ACATTTattg > 2:1000455/1‑236 (MQ=255)
cTG‑CCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑Tg < 1:364264/239‑1 (MQ=255)
cttccGCGTTGTTCTAGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑Tg < 1:1094940/236‑1 (MQ=255)
ccGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTTCCTTTTTATGCCAGAAAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTTGT‑TTTTGGGGTTTTTTTTTTTGG‑‑GGTGAATTGTAAGTCCCCG‑ACATTTAGTC‑TGTa > 2:425434/1‑238 (MQ=255)
cgTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑GTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGGCATTGGTACGTCCCCT‑ACAtttttgcttttcctg > 1:1151336/1‑227 (MQ=255)
tgttCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCCCCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGaa < 1:609023/238‑1 (MQ=255)
cTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAg < 1:298910/239‑1 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCC‑G‑GTTTA‑TTTTGGGGTTTTTTTATTTTGT‑GGTCATTTGTCCGTCCCTG‑GCATTTATTC‑TTTACC‑TGAAAAGAGCACaataa > 2:564960/1‑237 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTTG‑TTCTGGCGTTTTTTTTTTTTGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACaatta > 1:828687/1‑239 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGTG‑GGGCATTGGTACGGTCCTG‑GCATTTAGTC‑TGTACC‑TGAaagaagacaaatta > 1:938150/1‑231 (MQ=255)
tCGGCATTTGCTGGTGCATTCTATACCACCTGTCCCTCAACGGTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTgg < 1:100681/239‑1 (MQ=255)
tCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTTTCGTTAACGGCC‑G‑TTTGT‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCTTTGGTACGTCCCGT‑GCCTTTAGGT‑TTTACC‑TTAACGAAGCTCaattaatttg > 1:677482/1‑237 (MQ=255)
ctgggtttttCTGCTTCATTCTATTCCCCCTTGCCCCCAACGATAATTGCCCGCAATGGCCAGTTTCCAGGCTTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTgg < 2:198516/233‑1 (MQ=255)
ctgcATTCTATACCGCCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTtg < 1:861362/167‑1 (MQ=255)
tataCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGt < 1:1129201/171‑1 (MQ=255)
tataCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCt < 1:54890/179‑1 (MQ=255)
tataCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACAt < 1:1060741/184‑1 (MQ=255)
tataCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGt < 1:1026388/189‑1 (MQ=255)
tccccttATCCCCTAACGTTAATTGCCCGTTATGGCCCGTTACCAGTCGGCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTTTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 2:1146696/233‑1 (MQ=255)
cccccagttCCCGCAACGCTAATTGCCCGGTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 1:1277527/231‑1 (MQ=255)
accaccTATCCCCCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGGCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGGTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 1:747298/239‑1 (MQ=255)
caccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGGTTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTTACGGCC‑G‑GTTGATTTTTGGGGTTTTTTTTTTTGGA‑GGTC‑TTGGGCAGAGCCTG‑ACATTTAGTG‑TGTTCC‑CTAAAAGAGCACCATTAATTGgggggacccaaaacccaaatttttagt > 2:40754/1‑216 (MQ=255)
caccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGGACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGG‑TTTGT‑TCTTGGGGTTTTTTTTTTTGGG‑GGGCTTTGG‑ACGGCCCCGCCCTTTTTGTT‑TTAACT‑TGAAA‑GAGCACAATAAAATGGCGGGCCAAAAAACAGCAATTTggagg > 2:622540/1‑235 (MQ=255)
caccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTTTGGCGGTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGGCCCTG‑GCATTTAGTC‑TTTACC‑TGAAAGGAGACCAATTAATTGGCGGTCCAAAAACCCGCATTTTgtcgt > 1:1353552/1‑235 (MQ=255)
ccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTTA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGG‑GGTCATTGGTACGTTCCTG‑GCATTTTATC‑TGTAAC‑TGTAAGGGGGACAAATAATTTGCGGGCCAAAAACCAACAATTTGAGCtgt > 2:307160/1‑239 (MQ=255)
ccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACGTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTTG‑TTTTTGCGGTTTTTTTTTTGGT‑TGGTATTGGGACGTCCCCG‑CCAATTTTTCTTTTTCC‑TCAAAGG‑GCACCATTAATTGGCGGCGCCAAAACAAACATTTTGatatgt > 2:93508/1‑234 (MQ=255)
ctttCCCTTAACCTTTATTTCCCGCTATTGCACTTTACCTGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTGGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCtgtg < 2:368573/236‑1 (MQ=255)
cgaTCCCTAAAGCCTAATTGCCCGCTGGGGCACGTTACCCGTCGTCGGCTGGAATAGGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCTGACAAGGAACCAACTTTGTCTTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGGCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCtgtg < 2:302843/237‑1 (MQ=255)
ttCCCTCAACGCTTATTCGCCGTTATGGCACGTTTCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑Ca < 2:1039521/238‑1 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTTG‑TTTTGGGGGTTTTTTTTTTTGG‑GGTCATTTGGTCGTCCCCG‑CCATTTTTGT‑TTTACC‑TTAAAGGGGCCCAATTAAATGGGGGGCCcaaaacacccgattttgaggggtga > 2:1249318/1‑218 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTTA‑TTCTGGCGGTTTTTTATTTGGT‑GGGCATTTGTACGTCCCTG‑ACCTTTTGTC‑TTTACC‑TGAAAGGAGCACCATTAATTGGCCGTCCCAAAACCCACATTTTTAGcgtggcc > 1:1065493/1‑233 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTTTGGCGGTTTTTTTTTTTTG‑GGTCCTTGGTACGTCCCTG‑GCATTTTGGC‑TGTACCTTGAAAGGGGC‑CAATTTATTGGGGGTCCCAAAACCCACATTTTTAGCTGTG‑cg > 2:1277527/1‑238 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACCTTTAGTC‑TTTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCACCATTTTTAGCTGTG‑Ca > 1:1115347/1‑239 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTATTC‑TGTACC‑TGAAAGGGGCACAATTAATTGGCGGTCCCAAAGCCCGCAATTTTTGCTGTG‑Ca > 1:311306/1‑239 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTTTG‑cc > 1:791701/1‑238 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGGCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTTGTC‑TGTCCC‑TTAAATGAGCACCATTAATTTGCGGTCCCAAAACCAGCATTTTTAGCTGTG‑Ca > 1:594211/1‑239 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGAAAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTTA‑TTCTGGCGGTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTAACGCCCCG‑CCATTTCATC‑TGTCCC‑TGCAAAGGGCCCAAATAATTTGCGGGCCAAAAGCCAGCATTTTTAGCTGTG‑cc > 1:1350170/1‑238 (MQ=255)
tCCCTCACCCCTTATTTCCCGCTTTTGCCCGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAg < 2:1115347/239‑1 (MQ=255)
tCCCTCAACGCTTATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAg < 1:1232041/239‑1 (MQ=255)
tCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCGGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAg < 1:1301359/239‑1 (MQ=255)
tCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGt < 1:268734/160‑1 (MQ=255)
cccTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTCGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCCAAAACCAGCCtttttatgtggtccga > 1:319084/1‑227 (MQ=255)
aCGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTTT‑TTTTGGGGGTTTTTTTTTTTGT‑GGGTCTTGGTACGTCCCTG‑ACCTTTTGGC‑TTTACC‑TTAAAAGAGCCCAATTAAATTGCGGGCCAAAAACCACAAttttttagtgtgccaaaaaaat > 2:462923/1‑221 (MQ=255)
aCGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCCAAAGCCAGCATTTTGAg > 1:1008835/1‑224 (MQ=255)
aCGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 2:1008835/224‑1 (MQ=255)
aTTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGCTTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGG‑TTCTGGCGGTTTTTTTTTTTGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑CCATTTATTC‑TGTACC‑TTAAAGGAGCACAATTTATTGGCGGGCCCAAAACCCGCCTTTTTAGCGTTT‑CAGGACCCTTAA‑Gtg > 1:274560/1‑237 (MQ=255)
ccctctttggtccGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAgcgcg < 2:1151336/227‑1 (MQ=255)
catctttGGCCCGTTCCCGGTTGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTAGGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑CGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAgcgcg < 2:518034/232‑1 (MQ=255)
gttttgggccGTTTCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑a < 2:828687/230‑1 (MQ=255)
ctttGGCTCTTTATCATTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGGTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAACCTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑Ac < 2:454053/236‑1 (MQ=255)
cTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGGTAACGGCA‑G‑GTTGA‑TTCTGGCGGTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGGTGGTCCCCT‑ACATTTGTGC‑TTTTCC‑CTAAAGGGCGCCAATTAAATTGCGGGCCAAAAACCACCATTTTTGGCTGTG‑CAAAAAAATTaaaaaagaggcaa > 2:718101/1‑227 (MQ=255)
gTTTCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTttgc < 1:718101/239‑1 (MQ=255)
tttccAGTCTTCGGCTGGGGTATGCTGTTTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGGCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTttgct < 2:629786/236‑1 (MQ=255)
tACCAGTTGGCGGATGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGGCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGGTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTttgctg < 1:121747/239‑1 (MQ=255)
tACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGCTTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACCAGGCACATACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCCTTTTTTTATTTGGT‑TGTCATTGGTACTTCCCCT‑CCATTTAGTC‑TTTTCC‑TTAAAGGAGGCCAATTAATTGGCCGTTCAAAAGCCATCATTTTTAGCTGTG‑CCGAACCAATAACGTCGCGCGC‑‑ACTCTCctt > 1:562359/1‑235 (MQ=255)
tACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACCATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTTAGCTGTG‑CAGAACCCTTAA‑GTAGCGCGCT‑CCCCCCtttttgt > 1:518034/1‑235 (MQ=255)
tACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAgcgcg < 2:1078345/224‑1 (MQ=255)
cAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTTGT‑GGTCATTGGGACTTCCCTG‑ACATTTAGGC‑TTTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCCAAAGCCAGCATTTTTAGTCGTG‑CAGAACCATTAA‑GAAAGGCCGT‑ACCCCCTttcctgttg > 1:489139/1‑239 (MQ=255)
ctttggCTTGGGTTTGTTGTTTGGCGGTCTGTTTTTTTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTgg < 2:489139/235‑1 (MQ=255)
cTGGGGTTTGCGTATTGGCGGTTGTGTTTTTTTGCCTTTTTATGCCAAGCAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATc < 2:1192982/238‑1 (MQ=255)
ttGCTTATTGTCGGTTTGTTTATGTTTCCTTTTTATGCCAGAAAAGGATAAAGTTTTTTCGTTAACGGCA‑G‑TTTTA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTca < 2:677482/237‑1 (MQ=255)
ttGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTca < 1:1127059/237‑1 (MQ=255)
tGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCa < 1:799472/161‑1 (MQ=255)
aTTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGGGCT‑ACTCTCTTTTCTTTTGCTGGGGGTCACGTTTCCATTTcc > 1:1347492/1‑239 (MQ=255)
ggCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGa < 1:1329680/239‑1 (MQ=255)
ggCGGTCTGATTCTGTGTCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGa < 1:462923/239‑1 (MQ=255)
gCGGTTTAATTCTGGTGCCTTTTGATGCCAGACAAGTAACAAACGTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCGGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGa < 1:790890/238‑1 (MQ=255)
cGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGGTTTTTTTTTTTGT‑GGGCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGGCCAAAAACCAGCCTTTTGAGCTGTG‑GCGAACCCTTAA‑TTAG‑GCGGTCACTTCTTTTTCTGTTTCTGGGGGACACGTTTACCATACCGGAca > 2:505845/1‑238 (MQ=255)
cTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGGCGGTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGActggct < 1:93508/239‑1 (MQ=255)
tGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTTGG‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑GCATTTAGTC‑TGTACC‑TTAAAGGAGCCCAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTTAGCTGTG‑CAGAAACATTAA‑GTAACGCGCC‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTTGGGATCCAGGTTACATTACCGGActgggtg > 1:465518/1‑239 (MQ=255)
tttGTTGCTTTTTGACGCCAGACAAGGAATAATCTTTGGCGTTAACAGCA‑A‑GTTTA‑ATCTGGCCTTTTTTTATTTGGT‑GGGCATTGGTACGTCCCTG‑ACAGTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTGCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTGTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTGCCGGACTGGCTGGGat < 2:938738/237‑2 (MQ=255)
ttGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCC‑G‑TTTGT‑TTCTTGCGTTTTTTTATTTGGG‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACTTTTTGTC‑TGTAAC‑TTAAAGGAGCACAATTAATTTGCCGTCACAACACCGACATTTTCAGCCGTGCCAGAA‑CAATAA‑GTCGCGGGCA‑AATCCCTTTCTTCTTTCTGGGGGTACCGTTCCAATTACCAGACTGGAAGGGAAGgca > 2:896584/1‑238 (MQ=255)
ttGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGCACCATTAA‑GGAGCGCGCT‑ACTCCCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGGCTGGCCGGGAAAgcg > 1:624992/1‑238 (MQ=255)
gCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTTTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTT‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAACCAGCATTTTGAGCTGTG‑AAGAACCCTTAA‑GTAGGGGGCT‑ACTCTCTTTGCGTTTTCCGGGGGTCACGTTCAACTTACCGGAACGGCGGGGGAcgccgc > 2:1103681/1‑239 (MQ=255)
aCAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCCG‑GCATTTAGTC‑TGTACC‑TTGAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAACATTTTTAGCTGAG‑CAGAACCCTTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTTTTGCTGGGGCGCACGGTCACATTACCGGACCGGCTGGGAACCCTGCTGATGCTGTCACCgg > 2:591321/1‑239 (MQ=255)
ggAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGtgat > 1:1015171/1‑239 (MQ=255)
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ttCGTTAACGGGT‑G‑TTTTA‑TTTTGGGTTTTTTTTTTTTGGG‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAAt < 2:1013051/238‑1 (MQ=255)
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gTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑ATa > 2:1348824/1‑142 (MQ=255)
tttGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑Ac > 1:1168934/1‑137 (MQ=255)
|
GTGACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTG‑CCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑G‑TTTGA‑TTCTGGCGTTTTTTTATTTGGT‑GGTCATTGGTACGTCCCTG‑ACATTTAGTC‑TGTACC‑TGAAAGGAGCACAATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTG‑CAGAACCATTAA‑GTAGCGCGCT‑ACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAAT > NC_000913/3838676‑3839118
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
