Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F9 I0 R1
|
142 |
103.7 |
2603848 |
81.8% |
2129947 |
227.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,838,901 |
C→T |
12.2% |
L219L (CTG→TTG) |
yicL → |
EamA family inner membrane putative transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,838,901 | 0 | C | T | 12.2%
| 354.7
/ 6.7
| 146 | L219L (CTG→TTG) | yicL | EamA family inner membrane putative transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/83); new base T (18/2); total (61/85) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.98e-06 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TTATTGGTGACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAATGGATT > NC_000913/3838670‑3839123
|
ttttttgTGACCCACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCCCCCTCCCCGTTGTTCTGGGGCATTGGCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGtt < 1:1068244/233‑1 (MQ=255)
ttGGTGACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGGCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTT‑ATTTT‑GGCGttttt > 2:1209672/1‑239 (MQ=255)
gTGACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATCCTGCTTGAC‑GGTCCTATTCTTTTGCCTTTTT‑ACGCACGGCACGTACCCAACCTTGTCGTTTAC‑TGCAG‑TTTG‑TTTTT‑TGTGTTTTTTTa > 1:380006/1‑239 (MQ=255)
ggTAATCCGACGTCATTAGCGATTGCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTTGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTt‑ggtg < 2:388351/237‑1 (MQ=255)
tCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTTT‑GGGGTTTTTTTTTTT‑TGTGGTCCttt > 2:1133416/1‑238 (MQ=255)
cccGACCTCCTTACCGATCTCTCCTGCCCCGTTGTTCTGGCGCATTGACTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACATATCCATCAACGCTAATTGCCCGCTATGGAACGTTTCCAGTCGCTGGCTGTAGTCGGCTGATGGGC‑GGACTGGCTCGTCTGACTTTGA‑CTGCCAGGCACGGACCAAAATTTGACTTTTAA‑CGAAG‑TGTGTTTTTT‑GGCGTTTTTTT‑CTT‑GGTGGGTATTg > 1:410389/2‑239 (MQ=255)
cggcGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCCTTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGTTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGt < 2:166408/236‑1 (MQ=255)
cGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGt < 2:1150518/239‑1 (MQ=255)
gggtgctttttggtttcttccgtccGGGTTGGTTTGGGGCAATTCCTCGGAGTTTGCTACGGCATGTGATACCGCCTCTCCCTCAACTGTAATTGCCCGCGATGGCATGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑AGGCCAGACATGGAACAAACTTGGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTGTTATTT‑GGTGGTCATTGGTa < 1:46065/216‑1 (MQ=255)
cGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGGTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTTT‑GGGGTTTTTTTTTTT‑TGGGGGTATTGGTAc > 2:1181006/1‑238 (MQ=255)
cGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGCTTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGCCAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGAAGTTTTT‑TTTCT‑GGCG‑TTTTTTATTT‑TTGGGTCATTTGtgtg > 1:518404/1‑236 (MQ=255)
cGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTCCTTCGGTTGCCTTTTTCTTCCCAGAC‑GGGTACAACCCTTTGCGTTAAC‑GGCAG‑CTGT‑TTTCT‑GCATGTTTTTTATTt‑tgtggctgaatggccc > 1:388351/1‑228 (MQ=255)
ttatctgttctctcCGCCCGC‑TTGTTCCGGGGCATTGCCTTGGCATTTGCTGCGGCATTTTATTCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCGTATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCt < 1:57843/231‑1 (MQ=255)
aTTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGGCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCGG‑TTTT‑TTTTT‑TGGGTTTTTTTATTT‑TTTGGTCGtttttaagtc > 1:232345/1‑229 (MQ=255)
ttATCGATCCCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGTGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTAACCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCt < 2:821386/239‑1 (MQ=255)
tATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑GTTG‑ATTCT‑GTGGTTTTTTTATTT‑GGGGGTCATTTGTACGTCCCt > 2:147376/1‑238 (MQ=255)
aTCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGCCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGCCAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCCG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTTTTT‑GGTGGTCAtttggactgcccctcactt > 2:707185/1‑222 (MQ=255)
aTCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTGTCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑tt < 2:40912/239‑1 (MQ=255)
ctcCTGCCGCGTTGGTCGGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGt < 2:384966/239‑1 (MQ=255)
cttgcgggttgttCTGGGGCATTGCCGCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTg < 2:896613/232‑1 (MQ=255)
cttccGGGTTTTTCTTGGGCATTGGCTCGGCATTTGCTGCTGCCTTGTATCCCACCTACCCCTGAACGCTAATTGCCCGCTTTGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGATTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTCATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTg < 1:17704/236‑1 (MQ=255)
ccctccggtttttCTTGGGCTTTGCCCCGGCATTTGCTGCTGCCTTCCATACCCCCCATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTg < 1:1069804/232‑1 (MQ=255)
cTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCTTCAAGCCTATTTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGCCGTCGGCTGGGGAATGC‑GGTTGGCGGGTCTGATTTTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGAAAAGGACCAAACTTTTCCTTTAAC‑GGCAG‑TTTT‑TTTTT‑GGGGTTTTTTTTTTT‑GGGGGTCATTGGTACGTCCCTGCAA‑TTTAGTCtt > 2:1069804/1‑238 (MQ=255)
cTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATCCCAGAAAAGGAACAAACTTTGTTGTTAAC‑GGCAG‑GTTT‑GTTCTCGGGGTTTTTTTTTTT‑TGT‑GTCATTGTTaactccatcgcttttattttg > 1:20464/1‑219 (MQ=255)
ttgttCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGGGTTTTTTTTTTT‑GGGGGGCATTGGTAAGTCCCTGACA‑TTTTGtttttaacctaa > 2:125589/1‑228 (MQ=255)
tgttCTGGGGCATTTCCTGGGCATTTGCTGCTTCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGaa < 2:1205455/238‑1 (MQ=255)
tgttCGGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGaa < 2:1071678/238‑1 (MQ=255)
gttCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAg < 2:232345/239‑1 (MQ=255)
tttgggctttcgcctcgcttttGCTGGTGATTTCTATCCCCCCTTACACTCAGCTGTTATTGACCGAGATGGCACGTTACCAGTAGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTTCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTTGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAg < 1:706260/220‑1 (MQ=255)
ggggCTTTGCCTAGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTTTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTTCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGca < 2:46352/239‑1 (MQ=255)
ggggCATTGCCTCGGCATTTTCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGGTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGca < 2:1103918/239‑1 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATTCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTTT‑GGCGTTTTTTTTTTT‑GGTGGGCATTGGTACGTCCCTGGCA‑TTTTGTCTGT‑AACTGAAATAAGCACa‑atta > 2:105142/1‑239 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCCG‑GTTG‑ATTTT‑GGCGGTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTTGGACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTTT‑ATCCGACAGGAGccacatta > 2:39314/1‑232 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑GTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GTGGGGCATTGGTAAGTCCCTGCCT‑TTTTG‑CTGTGACCTTAAAGGGGCCCa‑atta > 2:173448/1‑239 (MQ=255)
tCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCCG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTTTTT‑GGTGGGCATTGGTACGCCCCTGACA‑TTTTGTCTTT‑AACCGAAAAGAGCACa‑atttatttg > 2:1107033/1‑237 (MQ=255)
ccGGCTTTTGCTGCTGCATTCTAGCCCCCCTTTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTAAGCTGATTTGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTgg < 1:1209672/238‑1 (MQ=255)
ggCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCg < 2:1278065/239‑1 (MQ=255)
tgctgctgcATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTTAAAGGGGCCCA‑ATTAATTGGGGGGCCaa > 2:287159/1‑239 (MQ=255)
gctgctgcATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGGATGATTTTGTTGCCTTTTT‑TTGCCAGACAAGGAACCACCTTTTTCGGTTAA‑GGCCG‑TTTG‑AATCT‑GGGGTTTTTTTTTTT‑TTGGGCCATTGGTACGGCCCTTACA‑TTTTGCCTTT‑TCCCTAAAAGGGCACA‑ATTAATTgtggttcccaa > 1:1147050/1‑229 (MQ=255)
gctctttccttCTATCCCCCCTATCCCTCAACTCTAATTGCCCGTTATGGCCCGTTACCAGTCGTCGGCGGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGTCTTTTT‑ATGCCATACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCaaa < 1:1047057/230‑1 (MQ=255)
ttcATTCTATACCCACTATCCCGCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCa < 2:101749/237‑1 (MQ=255)
tgcATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCa < 2:778165/239‑1 (MQ=255)
ttCTATCCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTgg < 2:1262053/221‑1 (MQ=255)
ttCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCt < 2:163145/182‑1 (MQ=255)
taCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTAT‑GGCGGTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑ATTAGTCTTT‑ACCTGCAAAGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAACCacccatttta > 2:153019/1‑230 (MQ=255)
ccccccTAGCCCTAAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 2:101617/235‑1 (MQ=255)
caccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑GTTCT‑GGCGGTTTTTTATTT‑GGGGGTCATTGGGACGTCCCTGAAA‑TTTAGTCTTT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑CTTAATTGGCGGGCCAAAAACCCGCATTTTGAGCt > 2:1202735/1‑239 (MQ=255)
tcTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTAttt < 1:349967/150‑1 (MQ=255)
ccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGCGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCTGACAAGGAAAAACATTTCTCGTTAACGGGCGT‑TTTT‑TTTTT‑GTCGTTTTTTT‑TTT‑TGTGTGCATTGGTAAGTCCCTGCCATTTTGGTTTTG‑CCCTGAAAGAGGCAGA‑TTTAATTGGGGTCCCaaaaagtgctttttttacca > 1:1262053/1‑222 (MQ=255)
ccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑GTTTT‑GGGGTTTTTTTATTT‑GGGGGTCATTGGTACGTCCCTTACA‑TTTTGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTTAGCtgt > 2:1127373/1‑239 (MQ=255)
ccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTTT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGGCATTGGTACGTCCCTGACC‑TTTAGGCTTT‑ACCTGAAAAGAGCCCC‑ATTAATTTGCGGGCCAAAAGCCCGGATTTTTGGCtgt > 2:952991/1‑239 (MQ=255)
ccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTAttt > 2:349967/1‑151 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTCCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTTTTGCCTTTTT‑ATGCCAGCCAAGGAAAAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑TTTCT‑GGGTGTTATTTATTT‑GGTGGGTCTTGGGACGGCCCTGGCC‑TTTTGTCCTG‑ACCTGTAAGGAGGCCA‑ACTAACAGTTGGTCCCAAAAGCAACAATTTTAGCtgtgag > 1:1025014/1‑237 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGCGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑TGGGTTTTTTTATTT‑TGGGGTCATTGGTACGTCCCTTGCA‑TTTTAGCTTT‑TCCTGTAAGGAACACA‑ATTAATTGGGGGTCCAAAAACCCGCCTTTTGAACTGTGcc > 2:527666/1‑238 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCCGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTTTCGTTAAT‑GGCAG‑TTTG‑GTTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGTGCCTTGTTCCGTTCCTGCAA‑TTTAGTCTGT‑CCCTGAAAGGGACACA‑CATATATTGTGGTCCAAAAGCCACCAtttttgaccttggc > 2:356421/1‑229 (MQ=255)
tCCCTCAACGGTAATTGCCCTCTATGGCACGTTACCAGTCGTAGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAg < 2:552289/239‑1 (MQ=255)
tCCCTCAACGATAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAg < 2:553253/239‑1 (MQ=255)
tAATTGCCCGCTATGGCACGTTTCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAg < 2:213900/238‑1 (MQ=255)
aaTTGCCCCGTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGGGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTa < 2:410389/239‑1 (MQ=255)
aTTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTTATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAAATTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑GTTG‑GTTCT‑GGCGGTTTTTTATTT‑GGAGGGCATTGGTACGTACCCTACA‑TTTAGTCTGT‑ACCCTGAAGGAGCACC‑ATTGAATTTCGGTCCAAAAACCAGCATTTTTAGCTGTGCAAAACCCTTAAGTa > 2:778043/1‑238 (MQ=255)
aTTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGGCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTTGCGGGGCCAAAACCAGCATTTTTAGCTTTGCAGAACCATTaaatga > 2:64331/1‑235 (MQ=255)
tGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAg < 2:212652/224‑1 (MQ=255)
cGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGCGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCt < 2:1030181/239‑1 (MQ=255)
cTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACTTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTTGCGGTCCAAAAGCCAGCCTTTTTAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAgagcgcca > 2:184474/1‑236 (MQ=255)
cTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAc < 2:20464/239‑1 (MQ=255)
ggCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCCG‑TTTT‑TTTTT‑GGCGTTTTTTTTTTTGGGTGGTCTTTGGAACCTCCTTG‑CA‑TTTGGTTTGT‑ACATGTAAGGGGCACACTTTATTTGGGTGTCCAAAA‑CCCGCAATTTTAGTCGTGCAAAAcacataaagctgacccttataaa > 1:212652/1‑217 (MQ=255)
tccccgttgtcgGCTGGAGTATGTTGATTGGG‑GTTCTGGTTCTGTTGCTGTTTT‑ATTCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGGTAAC‑GGCCG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTttgctg < 1:962340/231‑1 (MQ=255)
tACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 1:1286198/199‑1 (MQ=255)
tACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg > 2:1286198/1‑199 (MQ=255)
tACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGGCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTTGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCACAAGCCAGCAATTTGGTCTGTGAAGAAACATTAAGTatagcggcccacgctttggtg > 2:1020604/1‑219 (MQ=255)
gccAGTCTGCTGCTGGGGTATTCTGAGTGGC‑GGTCTGATTTTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACCAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTttgctgt < 1:147376/238‑1 (MQ=255)
cgGCTGGAGTATGCTGATTGGG‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑AGGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGa < 2:476888/239‑1 (MQ=255)
ggatgttgtcgtgtGGC‑GGTCGGATTCTTGTGTCTTTTT‑ATGCCAGTCAAGGAACGTACTTTGGCATTAAT‑GGGAG‑TGTG‑ATATG‑GGCGTTTGTTTATTT‑GGAGGTCATTGGGACGTCCCTTACA‑GTTAGTCTGG‑ACCTGAAAGGAGGACA‑ATTAATGGGCGGTACAAAAGCCATCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTATCGCGCTAC‑TCGCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACg < 1:1061717/226‑1 (MQ=255)
ggAGTATGCTTGTTTGC‑GGTTTTTTTCTTTGTCTTTTTT‑ATGCCAGTCAAGGATAAACCTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGAGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTTACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACg < 1:527666/239‑1 (MQ=255)
gAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 1:538061/183‑1 (MQ=255)
gTATGATGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGtt < 2:516285/238‑1 (MQ=255)
atgttttttGGG‑GGTGTTATTCTGTTGCATTTTT‑TTTCCATATAAGGAACAAATCTTGGCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑GTTCG‑TGCGTTTTTTTATTT‑GTGGGGCATTTGTACGGCCCTGACA‑TTTAGTCGGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGAGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑TCGTTct < 1:278765/231‑2 (MQ=255)
aTGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTca < 2:861566/238‑1 (MQ=255)
tGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTcaca < 2:838617/239‑1 (MQ=255)
ttGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTT‑ATTTT‑GGGGTTTTTTTATTT‑GGTTGTCACTTGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGG‑TCCTTAAAGGAGAACA‑ATTTATTTGCGGTCCCAAAACCCGCATTTTTCGCTGTGCAGTACCCATTAGTAACGCGCTAC‑TCCCCTTGCTTGTGCTtgggggacaagtccaaataaag > 1:167352/1‑221 (MQ=255)
ggC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTCACATTACCGGa < 2:885716/239‑1 (MQ=255)
ggC‑GGTCTGATGCTGTTGCCTTGTT‑ATGCCAGAAAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTCACATTACCGGa < 2:331881/239‑1 (MQ=255)
tggtgtttgtttcttgtGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCG‑GGGGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTCACATTACCGGa < 1:184474/223‑1 (MQ=255)
tgcgtttttaTTGTGTTGTTTTTTT‑TTTCAAGACAAGGAAAAAATGTTGTCTTTACC‑GGCAG‑TTTT‑ATTCT‑GGAGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTTCGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGACCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAGCCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTCACATTACCGGa < 1:153019/230‑1 (MQ=255)
ggtgttttgtttttGTTGCTTTTTT‑TTGCCAGACAAGGATCAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTCACATTACCGGa < 1:1181006/226‑1 (MQ=255)
tCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCC‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTca < 2:1242721/224‑1 (MQ=255)
tGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTca < 2:683313/222‑1 (MQ=255)
ttGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCAtt < 1:268409/170‑1 (MQ=255)
ttGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCAtt > 2:268409/1‑170 (MQ=255)
ttGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑CCGTTCCCATTACCGGCCTGGCTGGGAAccc > 2:607824/1‑236 (MQ=255)
ttGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTCT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCCAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTATCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTTCTGGGGATC‑ACGTTCACATTACCCGACTGGCTGGGacc > 2:519008/1‑234 (MQ=255)
gtGCCTTTTT‑ATGCCAGAGAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTT‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATAT‑GGTGGTCATTGGGACGTCCCTGACC‑TTTAGTCTCT‑ACCTGAAAGAAGCACA‑GTTAATTGGTGGTCCGAAAGCCCGCATTTTTAGCACTGCGGAACCATTAAGTAGCGTGCTAA‑CCTCTTTGCTGTTGCCGGGGGAC‑GCGTTTCCATTACCggcccaggcttttatac > 1:1242721/2‑223 (MQ=255)
gCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGGGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAACCAACATTTTGAGCTGTGGAGGAACCTTTAGTAGCGCGATCC‑TCCCTTTGCTGTTTTTGGGGCGC‑ACGTTTCCAATACCgagcctgttctttataaaca > 1:683313/1‑220 (MQ=255)
aTGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCATTACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTTAAAGGAGAACA‑ATTAATTGGCGGTCCCACATCCCACACTTTGAGCTGTGACGACACATTAAGTAGCGCGCTAA‑TCCCCTTGCTCTTGCTGGGGATC‑ACGTTTACATAACCGGAATCGGTGGGAACgctgcctatttta > 1:219883/1‑231 (MQ=255)
aTGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTA‑GGTAGTTATTTGTACGTCCCTGGCA‑TTTTAGGTTT‑GACTGTCAGGGGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCACAAACCAGCATTTTTAGCTGCGCAGAACCATTAAGTAGAGCCCTACATCACTTTG‑TTCTGTCGGGGATCAACGTCCACA‑TACCGCCCTGGCTGTGacacgcgtctgagtac > 1:833639/1‑224 (MQ=255)
aCAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGGCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTATCGAGCTAC‑TCTCATTGCTGTTTCTGGGGATC‑ACGTTcaca > 2:517158/1‑199 (MQ=255)
aCAAATTTTGTCGTTAAC‑GGTGG‑TTGT‑ATTCT‑GGCGTGTTTTTAGTT‑GGGTGGAATTGGTACGGCCCTGACA‑TTGAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTCACATTGCCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGtgatttt < 1:39314/239‑1 (MQ=255)
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gTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTTGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTTATCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCAAC‑TCTCTTTGCTGTTGTTGGGGATC‑ACGTTCACATTTCCGACCCGGCCGGGGAACCTTCTGATTCTGTCATAGGgggttttttttttaaa > 1:949252/1‑230 (MQ=255)
aaC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGGATCTGTCTTCGGGGAGTTTGATTTCAATGGAtt > 2:621525/1‑238 (MQ=255)
|
TTATTGGTGACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGC‑GGTCTGATTCTGTTGCCTTTTT‑ATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAAC‑GGCAG‑TTTG‑ATTCT‑GGCGTTTTTTTATTT‑GGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAGTCTGT‑ACCTGAAAGGAGCACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTAC‑TCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATC‑ACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAATGGATT > NC_000913/3838670‑3839123
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
