Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F9 I0 R1
|
260 |
102.5 |
2178490 |
93.2% |
2030352 |
226.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,838,901 |
C→T |
15.0% |
L219L (CTG→TTG) |
yicL → |
EamA family inner membrane putative transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,838,901 | 0 | C | T | 15.0%
| 330.9
/ 12.2
| 148 | L219L (CTG→TTG) | yicL | EamA family inner membrane putative transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/81); new base T (20/4); total (63/85) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.94e-05 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
GTGACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAATGGATTCCCGTCGCCGC > NC_000913/3838676‑3839134
|
ccGGTTATCCGACGTCTTTTTCGATCTTTCCCGCCCCGTTTTTCTGGAGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGTCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTtggtg < 2:899446/238‑1 (MQ=255)
tCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTTTGCCAGCCAAGGAACAAACTTTTTCGTTAACGGCAGTTTGATTT‑TTGCG‑TTTTTTTTTTTTGTGGTC‑ATTg > 1:503619/1‑239 (MQ=255)
cgccgctaTTTTCGATTTCGCCTTGCGGGTTGGTCTGGGGCCTTGCCTTGGCATTTGC‑TGCTGCCTTTTATCCCACCTAGCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCTGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGt < 2:762651/232‑1 (MQ=255)
ccaccttctttttggtttctcCTGCCGCTTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCGCCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGt < 2:176690/222‑1 (MQ=255)
cGTCATTATCGCTCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTCCCAGTAGTCGGCTGGTGTATGCTGATTGGCGGTCTCGTTCTTGTGCATTTTTATGTCAGCCAAGGAGAAAACCTTTGCGTTATAGGCCGGTGTGTTC‑TGGAG‑GTTTTTTTTTtgtgggtgctgtgcacg > 2:248519/1‑224 (MQ=255)
cGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCCGACAAGGAACAAACTTTTTCGTTAACGGCCGTTTTTTTT‑TTGCG‑TTTTTTTTTTTTGGGGTT‑TTTTGTACg > 2:912156/1‑239 (MQ=255)
cGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGGTTT‑TGGCG‑TTTTTTTTTTTTGTGGGC‑CTTGGttg > 1:143745/1‑236 (MQ=255)
cGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGGCTGATTCTGTTGCCTTTTTATTCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCGGTTTGATTC‑TGGCG‑GTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACg > 1:897659/1‑239 (MQ=255)
tCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAAAAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTCTTGGGG‑TTTTTTTTTTTGG‑GGTC‑ATTGGTACGt > 1:399551/1‑238 (MQ=255)
tttttttgATCCCCCCTGCCGCGTTGTTCTGGGCCCTTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTTCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTcc < 2:212645/232‑1 (MQ=255)
ttttttctctctcTTGCCGCTTTTTTTTGGGGCTTTGCCTCGGCATTTGC‑TTCTGCATTCTATACCTCCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCt < 2:108468/232‑1 (MQ=255)
ttttctgctttcccTGCCGCGTTGTGTTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTTTATACCGCCTTTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTAACAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCt < 2:329592/227‑1 (MQ=255)
ttttccatctttcgcgCCGGGTTGTTCTGGGGTATTCCCTCGGCCTTGGC‑TTCTTCATTTTATACCCCCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGGTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTAATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAATCTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCt < 2:937371/224‑1 (MQ=255)
ttttccatcttcccTGGCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATCCCCCCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCt < 2:626181/227‑1 (MQ=255)
ttAGCGATCTCTCCCGCCGCGTTGTTCTGGGCCATTGCCTGGGCATTTGC‑TTCTGCATTCTATTCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCt < 1:1019759/239‑1 (MQ=255)
ttctctcCTGCCGCGTTTTTTTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑tt < 2:465303/238‑1 (MQ=255)
gtctcccCTGCCGCTTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCTTTTGC‑TGCTTCCTTCTATACCCTCTAACCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTGCCAGGCGTCGGCGGGAGTAGGCTGATTGGCGGTCTGATGCTGTTGCCTTTTTATGCCAGTCAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑tt < 2:129062/238‑1 (MQ=255)
aTCTCGCCTGCCGCTTTTTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑tt < 1:163772/239‑1 (MQ=255)
ctacTGCCCGGTTGTTCTGGGGCAGTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTTCATTCTATACCCCCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCTCGTTACCAGTCGGCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCTGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑t < 1:563191/236‑1 (MQ=255)
tcCTGGGGCGTTGTGTGGGGGCGTGGCCTCGCGTTTTGCGTGC‑GCATTTTAGTCCACCTATCCCTCGACGCTTATTGCCCTGTGGGGCACGTTGCCAGTCGTCGGGTGGGGTATGCTTATTGGCGGTCTGATGCTGGTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGCACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑Tc < 2:944250/239‑1 (MQ=255)
tcCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCCGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTcc < 1:923384/226‑1 (MQ=255)
cTGCCGCGTTTGTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATTCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTg < 1:542544/239‑1 (MQ=255)
ccGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGGACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGGTTT‑TGGCG‑TTTTTTTTTTTTGTGGGC‑TTTGGGACGGCCCCGCGA‑TTTAG‑TCTTTa > 2:1035990/1‑238 (MQ=255)
ccGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCCGTTTGTTTT‑TGGCG‑GTTTTTTTTTTTGGGGGC‑ATTTTTAGGTCCCCGAcccgtttctttaaa > 2:549399/1‑226 (MQ=255)
ttgttCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTTGTTT‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑CTTGGTAAGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTAccctaa > 1:387426/1‑235 (MQ=255)
gtgttCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCACTATGGCACGTTAACAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGCACAGGAACAAACTTTGGCGGTAACGGCATCTTTGTTT‑TGGGG‑GTTTTTTATTTGTGGGTC‑ACTTGAACTTCCCTTAAA‑tttgatttgggcctgag > 2:431526/2‑225 (MQ=255)
agtCTGGGGCATTGCCTCTGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGaaa < 1:82304/236‑1 (MQ=255)
ttGGGGCCTTTCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATCCCACCTAGCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑g < 2:36812/238‑1 (MQ=255)
gggcaaTTGCCTGTGCTTTTGT‑TGCTTCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTCCCAGTCGTCGGCCGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑ca < 1:803232/234‑1 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCCGGTTGCTTC‑TGGGG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑CTTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAT‑TCTGTATC‑TGAAAGGA‑G‑CCCaa‑tta > 1:105242/1‑239 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTACGTTGCCTTTTTATTCCCGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCCGTTTTGTTC‑TTGGG‑GTTTTTTTTTTGGTGGGT‑CTTGGTTCTTCCCCGCCA‑TTTAGTTCTGT‑CC‑TCAAAGAA‑G‑GACaa‑ata > 2:535573/1‑239 (MQ=255)
gCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTTACGGCAGCTTGGTTC‑TGGCG‑TTTTTTTTTTTTGGGGTA‑CTTGGTACATCCCTGACA‑ATTTG‑TTTGTACC‑TTAAAGGA‑G‑GAAaa‑tattt > 2:82304/1‑235 (MQ=255)
tCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCt < 2:1058039/200‑1 (MQ=255)
tgc‑tgctgcATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCCGGTTGTTTC‑TGGCG‑GTTTTTTTTTTTGTGGGC‑CTTGGTACGTTCCCGACC‑TTTAG‑TCTTTTCC‑TGAAAAGA‑G‑CACAA‑TAAA‑TTGGGGGTGCaa > 2:493963/1‑239 (MQ=255)
tgcATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑t < 1:10649/150‑1 (MQ=255)
tgcATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑t > 2:10649/1‑150 (MQ=255)
ctcatttttttccaccTATCCCTCAACGCTTATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGGCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCa < 2:143745/228‑1 (MQ=255)
gcTATCCCCCCTTTCCCTCAACGTTTATTGCCCGCTTTGGCACGTTTCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCAtt < 2:82322/238‑1 (MQ=255)
tcccccTATCCCCTAACCCTAATTGCCCGGTTTGGCCCGTTACCCGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 2:684809/235‑1 (MQ=255)
ccccccTTTCCCTTAACGGTAATTGCCCGGTTTGGCACGTTACCAGTTGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 2:250986/235‑1 (MQ=255)
ccccccTTTCCCTAAACGTTAATTGCCCGCTTTGGCCCGTTGCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 2:205761/235‑1 (MQ=255)
accaccTATCCCTTAACGCTAATTGCCCGTTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 1:1035990/239‑1 (MQ=255)
ccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACCTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGGCCAAAAACCCGCATTTTTAGCtgt > 1:205761/1‑239 (MQ=255)
ccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑GTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTTGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTAGCGGTCCCAAAGCCAACCATTTGAGCttg > 1:89977/1‑237 (MQ=255)
ccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGACTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGTTTT‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTTCCTGAAA‑TTTAG‑TATTTACC‑TTATAGGG‑GCCACAT‑TTAT‑TTGCGGGTCCacaaccactctttttacctgt > 1:573213/1‑222 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTTTGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCCGTTTTATTC‑TGGCG‑TTTTTTTTTTTAGTGGGCAATTGGAAC‑TCCCCGGCC‑TTTAG‑TCTTTACC‑TTTAAGGG‑A‑CAAAA‑CTAATTTGGCGGCCCAAAACCCacacttttagcggaggg > 2:1087372/1‑223 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TTGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCCGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGG‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCCGCCATTTTAACTGTGCa > 1:1076498/1‑239 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTTGTGGTC‑CTTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCCGTACC‑TTAAAAGA‑G‑CCCAA‑TTAA‑TTTGCGGTCCAAAAGCCAGCACTTTTACCTGTGCa > 1:120272/1‑239 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTTGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGGCC‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTTGCGGTCCAAAAACCAGCCTTTTTAGCtgtg > 1:82322/1‑237 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGGCGTTAACGGCAGTTTGTTTT‑TTGCGTTTTTTTTTTTTGGTGTCC‑ATT‑GTATGTCCCCTACA‑ATTTG‑TCTTGACCATTAAAGG‑‑G‑CACAATTTAA‑TTGGAGGTCAaaaaccaacaaattagaggcggca > 2:876622/1‑219 (MQ=255)
tCCCTCAACGGTAATTGCCCGCTATGGCCCGTTACCAGTCGTTGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAg < 2:355909/239‑1 (MQ=255)
tCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAg < 1:912156/239‑1 (MQ=255)
tCCCTAAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTGCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTT‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAg < 1:272515/239‑1 (MQ=255)
tCCCCCAACGCTAATTGCCCGTTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAg < 1:216586/239‑1 (MQ=255)
ccccTTAACGCTTATTGGCCGGTTTGGCACGTTTCCAGTCGTCGGCTGGGGTAAGCTTATTGGCGGTTTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAg < 2:49453/238‑1 (MQ=255)
cccTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACCTTGTCGTTAACGGCAGTTTTGTTT‑TGGGG‑GTTTTTTTTTTTGTGTTC‑ATTGGTCTGTCCCTGCAC‑TTTAG‑TCGTTACC‑TTAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑ATTGCGCGCCCAAAACCCGCACTTTTGGCtggtcaaa > 2:30342/1‑233 (MQ=255)
cAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGGTTT‑TGGCG‑TTTTTTTGTTTGGTGGGC‑CTTGGTAAGCCCCTGCCATTTTAG‑T‑TTTACC‑TTTAAGGAGG‑CACAT‑TAAT‑TTGGGGGCCCAAAACCACACATTTTgtattggcagaacaa > 2:463102/1‑225 (MQ=255)
atttGCCCCTTTTGGCACGGTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTa < 2:169315/237‑1 (MQ=255)
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aaTTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 2:846391/219‑1 (MQ=255)
ttccctgtttGGAACGTTATCAGGCGGCGGGTGGAGTTTGCTGGTTGACTGTCTGCTTCTGTTGCCTTTGTCGGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATGC‑TGGCG‑TGTTGTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑GGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAgcg < 2:938098/230‑1 (MQ=255)
tgccccgtttGGCACGTTACCATTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTTATTCTGTTGCCTTTTTAGGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAgcg < 2:64895/230‑1 (MQ=255)
cccGTTTTGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCCGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAgcgcg < 1:876622/239‑1 (MQ=255)
ccGCTATGGCACGTTTCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAgcgcg < 1:685743/238‑1 (MQ=255)
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cTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTTATTC‑TGGCG‑TTTTTTTAATTTGCGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTTTACC‑TGTAAGGA‑T‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGGTCCAAAGCCAACCTTTTGAACTGTGCAGAACCATTAAGTatcccccta > 1:796547/1‑230 (MQ=255)
cACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTTA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCCTTGCCGAACCATTAAGTAACGCGGTActctcct > 1:707296/1‑237 (MQ=255)
tACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTTATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTttgct < 1:22776/238‑1 (MQ=255)
tACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGTTTT‑TGGGG‑GTTTTTTTTTTGGTGGGC‑ATTTGTACGTCCCTGACA‑TTTCT‑GTTTTTCC‑TTTAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTTGCGGGCCAAAAACCCGCATTTTTGGCTGTGCTAAACCATTAAATaagccactaaccccttttctt > 2:180502/1‑219 (MQ=255)
tACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TTGCG‑TTTTTTTATTTTGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTTG‑TCTGTACC‑TGAAAGGG‑A‑CCCAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAACCCGCACTTTGAGCTGTGCAGAAACATTTAGTAGCGCGCCACTCTCttt > 1:434687/1‑235 (MQ=255)
tACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCa < 2:721493/189‑1 (MQ=255)
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gAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGT‑GCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCa < 1:461642/172‑1 (MQ=255)
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tGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTTGCGGTCCCAAAGCCAGCATTTTGAGCTTTGCAGAACCCTTAAGTAGCCCGCTACTCTCTTTGCTTTTTCTGGGGGGCACGtttcca > 1:340926/1‑235 (MQ=255)
tGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAg < 1:728140/175‑1 (MQ=255)
taTTGGCGGTTTTTTTTTTTTGCCTTTTTTTTCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGGAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTAc < 2:399551/238‑1 (MQ=255)
aTTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGGTTGTTTT‑TGGCG‑TTTTTTTTTTTTGTGGGC‑CTTGGTACGTCCCTGACA‑TTTTG‑TCTTTACC‑TGAAAGGA‑G‑AACAA‑TTAA‑TTGGCGGGCCAAAAGCCCGCGCTTTTGGTGGTGGGGAACCATTAAGTATGGCGGCACACTCTTTTTTGTTGTTGGGGGTCACCTTTCCATAAcc > 2:893141/1‑239 (MQ=255)
tgCGGTTTGTTTTTGTTGTCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTTGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGa < 2:120272/238‑1 (MQ=255)
gcggttttgttcttttttcttttttAT‑CCAGTCAAGGAAACAACTTTGTCGTTAGCGGCAGTTTGATGC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTTGACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TGGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGCACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTTGTTGCTGTTGTTGGGGATCACGTTCACATTACCGGAc < 2:958431/219‑1 (MQ=255)
tctttgtcttttttAGGCCAGACAAGGAAAAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTGGGTTC‑GGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGaa < 2:105242/230‑1 (MQ=255)
tCTGTTGCCTTTTTATGCCAGGAAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGaa < 1:965349/239‑1 (MQ=255)
tCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGaa < 1:45228/239‑1 (MQ=255)
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ttGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAg > 1:699663/1‑163 (MQ=255)
ttccTTTTTTTTCCAGACAAGGAAAAAACTTTGTCGTTAACGGCATTTTGATTT‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACgctg < 2:675308/237‑1 (MQ=255)
tGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGGACTGTGCAGAACCATTAAGTAGCCCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGCCCGGCTGGGAAcaccg > 1:675308/1‑235 (MQ=255)
gCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGGCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACgctgc < 1:180502/239‑1 (MQ=255)
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gCCAGACAAGGAACAAGTTTGTTCTTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTc < 2:910962/239‑1 (MQ=255)
cAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGt < 1:843771/239‑1 (MQ=255)
aaCAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGtgatt < 1:893141/238‑1 (MQ=255)
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aaCTTTGGCGTTAACGGCATTTTGATTC‑TGGAG‑TTTTTTTATTATGTGGTC‑ATTGGCACGTCCCTGTCA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGATACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGtgattttgat < 1:492671/239‑1 (MQ=255)
ttttCGTTAACGGCAGTTTTATTT‑TGGGG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCa < 2:763381/236‑1 (MQ=255)
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tGATTC‑TGGCT‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAATGGATTCCCGTcgccgc < 1:332880/239‑1 (MQ=255)
|
GTGACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGC‑TGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTC‑TGGCG‑TTTTTTTATTTGGTGGTC‑ATTGGTACGTCCCTGACA‑TTTAG‑TCTGTACC‑TGAAAGGA‑G‑CACAA‑TTAA‑TTGGCGGTCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAATGGATTCCCGTCGCCGC > NC_000913/3838676‑3839134
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
