Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F27 I0 R1
|
322 |
127.1 |
2757226 |
91.8% |
2531133 |
223.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,011,489 |
A→G |
10.7% |
T139A (ACT→GCT) |
yigM → |
putative inner membrane EamA‑like transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,011,489 | 0 | A | G | 10.7%
| 336.9
/ 5.2
| 126 | T139A (ACT→GCT) | yigM | putative inner membrane EamA‑like transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (51/57); new base G (12/3); total (64/62) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.55e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TGGGCGCGATGCAGCTTGGCGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACGCTGCAATGGGGCATTCTGGTGTTTCTTGGCGTGGTGGCTTCCGGGATTG > NC_000913/4011262‑4011726
|
tggGCGCGATGCAGCTTGGCGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGTCGGTGATTGGGGCCGGGGTTATTCGCTATGACCAGGGCACCGACCCTTTTTGGACTGGCTtgct > 1:1364423/1‑238 (MQ=255)
tggGCGCGATGCAGCTTGGCGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGGTCCGGGATTATTCCCCTTGCTCCGGTCCCCGACACTTTTTGGACTGGCtt > 1:874710/1‑235 (MQ=255)
tggGCGCGATGCAGCTTGGCGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGGGGTTGGGGCCGGGGGTATTTGCCTTAATCCAGTGACCGCGCATTTTTGGACGGGGtttgtg > 2:447589/1‑235 (MQ=255)
ggCGCGGTGCGTGTTGGGGTGAGTTTTATGCTGAGTTTCCGCCATTATCCC‑TACCTGAAGGTTTCCGAGCTGCTTCTGTTCACCGGTCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATGTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTtgct‑gc < 2:1364423/238‑1 (MQ=255)
ggCGCGATGCAGCTTGGCGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGGGCTTGGTGGCGGGGTTATTCCCCTTGTACAGGGCACCGCCCCTTTCTGGGCGGGCCtggt‑gtt > 2:160952/1‑237 (MQ=255)
cgcgATGCAGCTTGGCGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGGGATTGGTGCCGGGGTTATTCGCTATGATCAGGTTACCGCCCATTTCTGGGCTGGCttccgccctg > 1:1032005/1‑231 (MQ=255)
aacTTGGCCGGATTTAAATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAAct < 1:407177/236‑1 (MQ=255)
ggCGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGTGGCCGGGGTTATTCGCTATGTTCAGGGTCCCGACCCTTTCTGGGGCGGGTtgct‑gtggggggactcttccaa > 2:407177/1‑222 (MQ=255)
cGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGTTTGGGGCCGGGCTTATTCGCTATGGTCAGGTCACCGACCATTTTTGGACTGGCTTGCTCGCTGGTGAAAC‑CTCCCata > 1:665453/1‑239 (MQ=255)
aTGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGATAATGGTGCCCGGGTTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCAATTTTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGGGCAACACTCCAatata > 1:340532/1‑236 (MQ=255)
tGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACt > 1:1187606/1‑239 (MQ=255)
tGTATAGTCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCt < 1:1324185/210‑1 (MQ=255)
atGGTGGGTTTCCGGGCTTATCTC‑TCACTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTTCCCGTGGTGACGCCGCTTCACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCCCCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGc < 1:591813/239‑1 (MQ=255)
gCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCa < 1:1186158/239‑1 (MQ=255)
tGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCAtt < 1:203718/239‑1 (MQ=255)
aGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGGGGTTGGGGCCGGGGGTATTCTCTTTGGTCAGGTCACCCACCCTTTCTGGGCTGGCTTGTT‑GTTGGTGCAAACCTCCAAAAAACCATTTGCCATTgg > 2:623874/1‑239 (MQ=255)
gTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGGTTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGGGCAACTCTCCAATATACCTTTTGCCATTGGc > 1:22875/1‑239 (MQ=255)
gTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGGTTATTCGCTATGATCAAGTCACCGACCAATTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGGGGCACTCTCCCCTATCACCTTTTCCAttt > 1:1084936/1‑236 (MQ=255)
ccGCGCTTAGCTCTTCCCTGA‑GGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCCCCGTGCTGACGCCGCTTTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑tg‑g < 1:226948/239‑1 (MQ=255)
ccgccctttttctctccTGCCGTTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGATGATGTATGACATCATGAGGAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑tg‑g < 2:1187606/224‑1 (MQ=255)
ccgtttcccGGGCTTCTGTTTTTCCCCGTGCTTGCCCCGCTCTCCATCCCGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGAt < 2:1269908/232‑1 (MQ=255)
aCGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCCCCGTGCTGACGCCGCTCTTCATCGCGGTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGAt < 1:623874/239‑1 (MQ=255)
aCGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGGTTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATACCTTTTGCCATTGGCA‑TT‑GTGGGTT‑TCAAACGCCTGAt > 1:1303919/1‑239 (MQ=255)
gAGCTGCTGCTGTTCCCCGTGCTGACGCCGCTTTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCg < 1:711424/239‑1 (MQ=255)
cttctgctgTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGcc < 1:1215911/235‑1 (MQ=255)
gctgctgTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGGGGTTGGGGCCGGGGTTATTCGCTATGATCAGGGCCCCCCCCATTTTTGGTCTGGCTTTCT‑TCCTGTGGCACTCTCCCAAATCCCTTTTTCCCTTTGCA‑TG‑GGGGGGT‑AAAAAAGCCCGCTGGgaaacacccccc > 2:1107388/1‑230 (MQ=255)
gcttTTCCCCGGGCTGACGCCGCTCTAAATAACGCTGATTTTTGACAGCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGc < 2:665453/239‑1 (MQ=255)
ctgTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTggg < 1:1167680/206‑1 (MQ=255)
ttttcccccttcTGGCGGCGCTCTACATTCCGTTGATTTATGACATTATGAGTAAGCGCGGGCGGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGGGACTTGCTGGCGGGGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCca < 2:1312075/228‑1 (MQ=255)
ttttCGCCGGGCGGGCGCCGTTTTACAACGCGCTTTTTTAGAACATCATGGGTAAGGGTCGTCTGCGTTGGGGCTAGGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCca < 2:628737/237‑1 (MQ=255)
tttcacgtggcttcggccgtTTTACATCCCGGTGATTTTTGACATCATGATGAAGCCGCGTTTGGGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATGGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGGCCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCcac < 2:160180/224‑1 (MQ=255)
ccGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGGTTGGTGCCGGGATTATTCGCTTTGATCAGGGCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTTCT‑GCTGGTGCCAATCTCCAATATACCTTTTTCCCTTTGAA‑TG‑GTGGGGT‑TCAAACCCCCCATGGTAACACGCCCCA‑GGCcacaaaac > 2:213826/1‑235 (MQ=255)
ccGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTTGACTGGCTTTCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCCGATGGAAACTCCCCCGC‑TGcccaagcct > 1:400072/1‑232 (MQ=255)
ccGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGAGCTTGGTGCCGGGGGTATTCCCTCTGATCAGGGCACCCACCATTTCTGGGCTGGCTTGCG‑GCTCGTGCAACCCTCCACAATCACTTTTTCCCATGGCC‑TG‑GTGGGGT‑TCAAAAGCCCCATTGaaaacccacccatgcaaccacca > 2:437847/1‑219 (MQ=255)
gTGCTGCCGCCGCTTTACATCACGTTGATTTATGACATCATGGGTACGGGCCGTCTGCGCTGGGGCTTTGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATaa < 2:753761/239‑1 (MQ=255)
gTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATaa < 1:749150/239‑1 (MQ=255)
tGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGGATATTCGCTATGATCAGGTCACCCACCATTTCTGGACTGGCTTGAT‑TCTGGTGCAACTTTCCCATAACACTTTTGCCATTGGCT‑TG‑GTGGGTT‑ACGAACTCCCTACTGAAACTCGCCCGA‑TGGCACAGCATaa > 1:128249/1‑238 (MQ=255)
cccctttACCTCCCGCTGATTTATGACAGCATGGGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATTCCTTTAGCCTCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGc < 2:400072/233‑1 (MQ=255)
ccgtctacctccgtcTGTTTTCTGGCATCATGAGTACGCGCCGGCTGCGCGGGGGTTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATGCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCGCCAATATCACTCTGGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑g < 2:795732/225‑1 (MQ=255)
tACATCACGGTGATTTAGGACATCATGAGTAAGCGCCGGCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGtt < 1:155056/239‑1 (MQ=255)
cATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGGCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCg < 1:869288/204‑1 (MQ=255)
ccGCTGTTTTTTGACTTCATGAGTAAGGCCCGGTTGCCGTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCt < 2:1303919/238‑1 (MQ=255)
cGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCCGATGGGAAATCGCCCCC‑TGCCACAGCCTAACGC‑CCTTTC‑GTGGTTTTAt > 1:979104/1‑236 (MQ=255)
aTTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGAGTTTGGGCGGGGTTTTTTTCTATTATCACGGCCCCGACCATTTCTTGGCTTGCCTGCT‑TCTGGGGGAACTCTCCCATATCACTTTTTCCCTTTGGC‑TG‑GTGGGTTGACAAA‑GCCTCATGGGAACTCGCCCTC‑TTCCCCAGCCTAACCC‑Ccttttgggggttacttcttgggc > 2:513507/1‑219 (MQ=255)
tGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCca < 1:1082076/199‑1 (MQ=255)
tcatGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGTTCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGCATGGTGCCGGGGTTTTTCGCCATGATCCTGTTGCCCACCCTTTTTTGGCAGGCTTGCT‑GCTGGTGCAAATCTCCAATAACCCTTTTGCCACTGGCA‑TGTGGGGGTT‑ACAAA‑GCCTTCTGGTAACACGCCCGA‑GTCCCCAGCCTAACGCACTTCGT‑GGGGTTGTTTTTT‑Gg‑cggggtttggtg > 2:799412/1‑229 (MQ=255)
tcatGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTTGTGCCGGGGTTATTTGCTATGATCAGGTCACCGACCCTTTTTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCa > 2:1074091/1‑124 (MQ=255)
tcatGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGGGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGGTCAACTCTCCAATATCACCTTTGCCATTGGCA‑TG‑GGGGGTT‑TCAAAAACCTGATGGAAAACCGCCCGC‑GGCCCCACCGTAAAGC‑CTTTGCGGTGGTT‑TATCTT‑TG‑agcgcgtttgggg > 2:1218237/1‑230 (MQ=255)
tcatGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGGGCCCGGGTTATTCGCTATGATCAGGTCACCGCCCATTTCTGGGCTGGCTTGCT‑GCTGGTGGCACTCTCCAATATCACTTTTGTCCCTTGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAAAGCCCGATGGGGACACTCCCGA‑TGCCCCAGCATAACGC‑CTTTGC‑GGGGGGTTATCTT‑CG‑CGCGTTTCttggg > 2:1074798/1‑235 (MQ=255)
tcatGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGGGGTTGGTGCCGGGGTTATTTGCTATGATCAGGTCACCCACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑TCTGGGGCACCTCTCCAATATCACTTTTTCCATTGGCATTG‑GTGGGTC‑A‑AAACGCCTGATGGAAAATCGCCCCAGTCCCAC‑CCATAAAGC‑CCTTTC‑GGGGTTCCTTCTTGGG‑CGCTTTTTtggg > 2:397798/1‑238 (MQ=255)
gggtagggcccGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCTTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAg < 2:611308/230‑1 (MQ=255)
gTAAGGCCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGt < 1:1085703/238‑1 (MQ=255)
gcCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTg < 1:808723/237‑1 (MQ=255)
gcCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGc < 1:1100874/238‑1 (MQ=255)
cccttttGCGGTGGGGCTTTGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCCATTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCa < 2:1372150/233‑1 (MQ=255)
gggCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGCTGGGAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGGTCTATCTT‑GG‑CGCGGTTCTTGTGGCAGGGATTGCCTGGGTTTTGCttg > 1:1021517/1‑237 (MQ=255)
gCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTTCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTc < 1:436976/230‑1 (MQ=255)
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tATTCCTTTTGCGCTTTTGTGGCGGGTATTGTGGCCGGGGTTATTCGTTATGATCAGTCCCCCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GGTTGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGaa < 2:874710/238‑1 (MQ=255)
aTGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGGCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGGT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTTCTGGGGAAt > 1:444276/1‑239 (MQ=255)
tttAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑TCAAACGCCTGATGGAAAATCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CCTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑GGCGTTTCTGGGGGCAGTGGTTGCATGGGTCTTGTTGGGCAATgggcc > 1:130223/1‑238 (MQ=255)
tAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGGTTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCcac > 1:1292703/1‑158 (MQ=255)
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ccTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCCGGGCACCCACCATTTCTTGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTTTCCAATATCACTTTTGCCATTTGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAAAGCCTGATGGAAACCCGCCCGC‑TGCCACAGCATAAAGC‑CTTTGC‑GTGGGTCTTTCCT‑TG‑GGCGTTTCTTGGGGCAGGGATTTCATGGTTTTTGTTGGGAAATTTGCCGAAAAt > 1:1328316/1‑238 (MQ=255)
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taTTGGTGCCGGGATTGTTCGCTATGATCATGTCACCGGCCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGGTCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACg < 1:508558/237‑1 (MQ=255)
gATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGGTCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATGACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACg < 1:215490/238‑1 (MQ=255)
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ggATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATaa > 2:349684/1‑136 (MQ=255)
ggATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCCTGGTTCTTGCTGGGAAATGGGCGGTAAATG‑CCCCAAACCACGCTGCCATggggg > 2:265834/1‑238 (MQ=255)
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tCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GGGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGCCCGCACCGATTGCCTGGTTCTTCCTGGGAAATGCCCAGAAAATG‑CCCCCACCCCCCCTCCAATGGGGCCTTCCgg > 2:1102580/1‑239 (MQ=255)
ccctttggtCAGGTCCCCGACCATTTCTGGGATGGCTTGGT‑GCTGGTGCAACCCCCCAATATCCCTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACGCTGCAATGGGGCATTCTGgt < 2:1021517/231‑1 (MQ=255)
ccctttGATCAGGTCCCCGGCCTTTTCGGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCCCTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACGCTGCAATGGGGCATTCTGgt < 2:1328316/234‑1 (MQ=255)
tATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATT‑CCGCAAACCACGCTGCAATGGGGCATTCTGGTGtt > 1:1277583/1‑239 (MQ=255)
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tATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGGGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAACCCACGCTGCAATGGGGCATTATGGTGtt > 1:1232515/1‑239 (MQ=255)
tATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGAC‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCCCAGACTAACGC‑CTTTGC‑CTCGTTCTTACTT‑GG‑CCCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTCTTGGGAAAAG‑GCCGAAAAAGACCGCCAACCCCGCCGCAAGGGGGCGTTCGGGGGtt > 2:639558/1‑239 (MQ=255)
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tGAACAGGTCACCGACCATTTCTGGGATGGCGTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATAGCCCTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACGCTGCaa < 1:1241258/220‑1 (MQ=255)
gATCAGGTCCCCGACCATTTTGGGACGGGGTTGCG‑GGTGGGGCAACCTTCCAATTTCCCTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACGCTGCAATGGGGCATTCTGGTGTTTCt < 2:130382/239‑1 (MQ=255)
gTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCCAACAACGCTGCAATGGGGCATTCTGGGGTTTCTTGGCgt > 1:34728/1‑239 (MQ=255)
tCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGt < 2:1269122/168‑1 (MQ=255)
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aCCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCCACCTGCCAGGGGGCATTCTGGGGTTTTTTgggggggg > 2:708013/1‑233 (MQ=255)
aCCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACGCTGCAATGGGGCATTCTGGGGTTTCTTGGCgtggt > 1:976174/1‑239 (MQ=255)
aCCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGCTTCTGGTGGCAGGGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATCCGAGGAAAATG‑CCCCAAACCCCGCTGCAATGGGGCATTCTTgttctcttaaaccacac > 2:1241258/1‑224 (MQ=255)
cGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGTAAATGCGCAGAAAAGG‑CCGCAAACCACCCGGCACTGGGGCCTTTTTGTGTTTTTTGGCGtggtgg > 2:1047073/1‑239 (MQ=255)
aTTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAACCGCCTGATGGAAACTCGCCCGG‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCCGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGTAATTCGCGGAAAATG‑CCGCAAAACACGATGCAATGGGGCATTATGGGGTTTCTTGGGGTGGGGGCTTcc > 2:1160384/1‑239 (MQ=255)
tttCTTGACTGGCTTGCT‑GCTTGTGCAACTCTCCAATTACACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACGCTGCAATGGGGCATTCTGGTGTTTCTTGGCGTGGTGGCTTCCg < 1:160952/239‑1 (MQ=255)
gACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAATTGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACGCTGCAATGGGGCTTTTTGGGGTTTCTTGGCGGGGTGGCTTCCGGGATTg > 2:1025573/1‑239 (MQ=255)
aCTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACGCTGCAATGGGGCATTCTGGTGTTTCTTGGCGTGGTGGCTTCCGGGATTg > 1:341808/1‑238 (MQ=255)
|
TGGGCGCGATGCAGCTTGGCGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTTGCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTT‑ACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCATAACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACGCTGCAATGGGGCATTCTGGTGTTTCTTGGCGTGGTGGCTTCCGGGATTG > NC_000913/4011262‑4011726
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
