Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A18 F25 I40 R1
|
4 |
120.6 |
3921210 |
96.6% |
3787888 |
148.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,985,002 |
G→T |
D126Y (GAT→TAT) |
ygeG → |
SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,985,002 | 0 | G | T | 99.0%
| 353.5
/ NA
| 104 | D126Y (GAT→TAT) | ygeG | SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (53/50); minor base A (1/0); total (54/50) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
TAAAAGATTTTGCATCAGTATGTCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCGATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTG > CP009273/2984856‑2985147
|
tAAAAGATTTTGCATCAGTATGTCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTAt > 1:1554552/1‑149 (MQ=255)
tAAAAGATTTTGCATCAGTATGTCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTAt > 1:813311/1‑149 (MQ=255)
aaaaGATTTTGCATCAGTATGTCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTGACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCtata > 1:1530905/1‑149 (MQ=255)
aaaGATTTTGCATCAGTATGTCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATaa > 2:356826/1‑149 (MQ=255)
cATCAGTATGTCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACgcaatgcaa < 1:978048/149‑1 (MQ=255)
aTCAGTATGTCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACgcaatgcaat > 1:329024/1‑149 (MQ=255)
tCAGTATGTCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGcaatgcaatg > 2:1588138/1‑149 (MQ=255)
cAGTATGTCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGt > 1:333323/1‑149 (MQ=255)
gTATGTCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGttt > 2:804069/1‑149 (MQ=255)
taacAGACCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGATCTTTACAAACTAAGTTACGATTACTTCCCGTATGGTGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTa < 2:204324/146‑1 (MQ=255)
gTCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATACGACCTTTACAAACTAAGTTACAAGTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTAt < 1:934814/149‑1 (MQ=255)
tCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATc > 2:1903773/1‑149 (MQ=255)
aGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTGTGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCGATcac > 1:168030/1‑149 (MQ=255)
gCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATcaca < 2:816676/149‑1 (MQ=255)
gCCCAAAAAGAAATAATAACAAGCATATGACCTCTACAAACTAAGTTACCATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATcaca < 1:1609863/149‑1 (MQ=255)
aaaGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACAttatta > 2:29173/1‑149 (MQ=255)
atatCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAAtt < 2:1610203/149‑1 (MQ=255)
atCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCCATGTTTCTATCACCTTATTAACAATtgt > 2:1087700/1‑149 (MQ=255)
tCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATtgtt > 1:726418/1‑148 (MQ=255)
tCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATtgtg > 1:119289/1‑149 (MQ=255)
tCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATtgtg < 2:46074/149‑1 (MQ=255)
aacaaGCATATGACCTTTACAAACTAAGCTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTAACGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAg > 1:1188464/1‑149 (MQ=255)
acaaGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAgg > 1:1612898/1‑149 (MQ=255)
aaGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGtat > 2:1154363/1‑149 (MQ=255)
aaGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGgat < 2:1948141/149‑1 (MQ=255)
aaGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGgat < 1:1775511/149‑1 (MQ=255)
gCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGgatga > 2:643788/1‑149 (MQ=255)
gACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCGGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAgtgt > 1:911306/1‑149 (MQ=255)
ccTTTACTAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTa < 2:887205/149‑1 (MQ=255)
ccTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTa > 1:657390/1‑149 (MQ=255)
cTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTaa < 1:990639/149‑1 (MQ=255)
ttACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAaga > 1:442929/1‑149 (MQ=255)
ttACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAaga < 2:813311/149‑1 (MQ=255)
ttACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGACGAATAAACATTTATGTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAaga < 1:857429/149‑1 (MQ=255)
tACAAACTCAGTTACAAGTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAagag < 1:1576000/149‑1 (MQ=255)
aCAATCTAAGTTACTATGACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGt < 2:1912045/149‑1 (MQ=255)
aCAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTTTCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGt > 2:505764/1‑149 (MQ=255)
cAAACGAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTa < 1:1685735/149‑1 (MQ=255)
aaCTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTaga > 1:1407141/1‑147 (MQ=255)
aaCTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTaaa < 2:1330752/149‑1 (MQ=255)
aGTCACAATTACTTCGCGTAGGATGACTATTCAGTTATTCATCGTATGGGGCAATGTAAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCa < 2:568229/149‑1 (MQ=255)
ttACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTACGAGTAAAGCGCAgg > 1:251976/1‑149 (MQ=255)
ttACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAgg > 1:1893273/1‑149 (MQ=255)
ttACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAgg > 1:922670/1‑149 (MQ=255)
aaTTACTTCCCGTATGATGAATACTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCata > 2:436201/1‑149 (MQ=255)
aTTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCatat < 2:7953/149‑1 (MQ=255)
aCTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATGGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATATATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGCTGATAGTGTTAAAAGTAAACCGCAGGCATATAtt > 2:17678/1‑149 (MQ=255)
aCTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATAtt < 2:79175/149‑1 (MQ=255)
cTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGCTGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTg < 2:1188464/149‑1 (MQ=255)
cTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTg < 2:434378/149‑1 (MQ=255)
cTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTg < 1:432928/149‑1 (MQ=255)
cTTACCGGATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTAAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTg < 1:742175/149‑1 (MQ=255)
tCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAGGCGCCGGAATATCTTGaa > 1:847358/1‑149 (MQ=255)
gTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAActct > 1:1537651/1‑149 (MQ=255)
tATGATGACTATTCAGTTAATTATCTTATGGGCCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCtt < 1:302819/149‑1 (MQ=255)
atgaCTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAAc > 1:1635146/1‑149 (MQ=255)
atgaCTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAAc > 2:146529/1‑149 (MQ=255)
tgaCTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACg < 1:1901311/149‑1 (MQ=255)
tgaCTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCAATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACg > 2:117946/1‑149 (MQ=255)
gaCTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAATAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGa > 1:1214205/1‑149 (MQ=255)
cTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATa > 2:770693/1‑149 (MQ=255)
cTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATa > 2:770811/1‑149 (MQ=255)
tCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTc > 1:882557/1‑149 (MQ=255)
aGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTAAACTCTTAAACGATAATTctg > 2:746884/1‑147 (MQ=255)
gTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCATGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCaga < 2:1084813/149‑1 (MQ=255)
gTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCaga < 1:720736/149‑1 (MQ=255)
gTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGAAGTCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCaga < 2:1887509/149‑1 (MQ=255)
ttatttatTGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGGTAAAAATTTCTAGAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCagaa < 1:1066207/149‑1 (MQ=255)
ttatttatCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCagaa > 1:1145487/1‑149 (MQ=255)
ttatttatCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCagaa > 1:1165165/1‑149 (MQ=255)
ttatttatCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCagaa < 1:1468773/149‑1 (MQ=255)
ttatttatCGTATGGGTCAATGTCAGATCGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCagaa > 1:1051608/1‑149 (MQ=255)
tgatttatCGGATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAGCGCAATGCAATGTTTCTAGCACATTATTAACAATTGTGAGGGTGATAGTGTTAAGAGTAACGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAGCGATAATTCagaa < 2:1202413/147‑1 (MQ=255)
atCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCTCATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAActc < 2:605889/125‑1 (MQ=255)
atCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAActc > 1:605889/1‑125 (MQ=255)
atCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAActc > 1:605898/1‑125 (MQ=255)
atCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAActc < 2:605898/125‑1 (MQ=255)
acGTAAGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATg < 1:845780/148‑1 (MQ=255)
gggTCAATGTCAGGTTGGGGGTAAAAATATCTATAAACCAATGCAATGGTTCTATCACATTATTAACGATTATGAGGAGGATAGTGTTGAGTGGAGAGCGTAGGCATATATTGAACTCTTAAATGATAATTCATAGTATAATGGTTaat > 2:1736421/1‑148 (MQ=255)
gggTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAg < 1:787464/149‑1 (MQ=255)
gggcAATGGCAGATGGGGGCTAAAAATATCTATAACGACATGCATTGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCGGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATTATGGCTAAGc < 2:360833/146‑1 (MQ=255)
gTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTCAGCa < 1:306685/149‑1 (MQ=255)
tCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAACAGCTAATGCAGAAGATAATGGCTAAGCAt > 2:1864879/1‑149 (MQ=255)
cAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCAtt < 2:1603249/149‑1 (MQ=255)
cAGATTTGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATc < 2:1155553/149‑1 (MQ=255)
gATTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCAt > 2:1754997/1‑149 (MQ=255)
aTTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCAtt < 2:1063909/149‑1 (MQ=255)
aTTGGGGCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCAtt < 2:1554552/149‑1 (MQ=255)
tGGGGCTAAAAATATTTATAACGCAATGCAATGTTTCTTTCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTg < 1:1382442/149‑1 (MQ=255)
gggCTAAAAATATCTATAACGGAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGt < 2:1729280/149‑1 (MQ=255)
gCTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTa > 2:246127/1‑149 (MQ=255)
cTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTaa > 2:67035/1‑149 (MQ=255)
cTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTaa > 2:540147/1‑149 (MQ=255)
cTAAAAATATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTaa > 1:776970/1‑149 (MQ=255)
aaaaTATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAAtt > 2:658652/1‑149 (MQ=255)
aaaaTATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAAtt > 2:1627215/1‑149 (MQ=255)
aaTATCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAAGTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTg < 2:329024/149‑1 (MQ=255)
atatCTATATCGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAAGATGATCGTGTTAAGTGCAAAGCGCGGGTATATATTGAACTTTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTGAGCTTTACAATCATTTGGTTAAATTTGc < 1:1470115/149‑1 (MQ=255)
atCTATAACGCAGTGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTg < 2:1415111/149‑1 (MQ=255)
atCTATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTg < 1:1718126/149‑1 (MQ=255)
|
TAAAAGATTTTGCATCAGTATGTCAGCCCAAAAAGAAATATCAACAAGCATATGACCTTTACAAACTAAGTTACAATTACTTCCCGTATGATGACTATTCAGTTATTTATCGTATGGGTCAATGTCAGATTGGGGCTAAAAATATCGATAACGCAATGCAATGTTTCTATCACATTATTAACAATTGTGAGGATGATAGTGTTAAGAGTAAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTG > CP009273/2984856‑2985147
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
