Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A13 F63 I0 R1
|
31 |
53.1 |
1128482 |
96.8% |
1092370 |
140.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
1,474,639 |
C→G |
100% |
A9129P (GCA→CCA) |
ebh ← |
extracellular matrix binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 1,474,639 | 0 | C | G | 100.0%
| 252.0
/ ‑6.5
| 74 | A9129P (GCA→CCA) | ebh | extracellular matrix binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (33/39); minor base T (1/1); total (34/40) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
ACCTTTAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGCTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCATT > CP000730/1474505‑1474774
|
aCCTTTAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATc < 1:428897/141‑1 (MQ=255)
cTTTAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTCCCCTTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCa < 1:106216/141‑1 (MQ=255)
ttAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGGTGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACt < 2:30674/141‑1 (MQ=255)
ttAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACt > 1:316673/1‑141 (MQ=255)
tAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGTTCTATGTCATGTTTAACATTTGTTTTAGCAAGTGCTACTCGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACtt < 2:496998/141‑1 (MQ=255)
tAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACtt < 2:447941/141‑1 (MQ=255)
ataTCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACttg < 2:531618/139‑1 (MQ=255)
aaTCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACttgt < 1:394471/141‑1 (MQ=255)
aTCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTGCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACttgtt > 2:430089/1‑141 (MQ=255)
tCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACttgttg > 2:174343/1‑141 (MQ=255)
ccATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGc < 2:268708/141‑1 (MQ=255)
tgttgAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTc < 2:282232/141‑1 (MQ=255)
ttgctcgttGTTTAATTCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCGTTTGTTTTGGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGc < 2:534733/134‑1 (MQ=255)
ttgAGCATTGTTTTATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGc < 2:526788/141‑1 (MQ=255)
ggCATTGTTCAATGCATTCAAGTGGTCGCTGTCATGTTTATCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAACGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCAtt < 1:260/140‑1 (MQ=255)
ttGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGt < 2:174249/141‑1 (MQ=255)
ttGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGt > 2:97219/1‑141 (MQ=255)
tgattaaaataTTCAAGTGGTCGATGCGATTGGTTCCAGTGGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGtt < 1:405481/131‑1 (MQ=255)
tGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGtt > 2:200232/1‑141 (MQ=255)
tttGATGCATTCAAGTTGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTc < 2:182880/141‑1 (MQ=255)
tttAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTc < 2:269983/141‑1 (MQ=255)
gtGCGTTCAATTGTTCGAGGTCAGGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTCGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATa > 2:328627/2‑141 (MQ=255)
aTGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCAGTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCCCCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTCAAAGATTTTGAAGTGGTTGATCGACTTGTTGCTTATTAGCCTTTTGtttaattc > 2:328931/1‑136 (MQ=255)
aTTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACAtt > 2:248585/1‑141 (MQ=255)
aTTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACAtt > 1:237939/1‑141 (MQ=255)
ttCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACAttt < 1:459362/141‑1 (MQ=255)
ttGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCACGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCTTTTTGTTTCAATACATTTtcagc > 2:96913/1‑141 (MQ=255)
tGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcagca < 2:64335/141‑1 (MQ=255)
aagcGATGCCAAGCTAACCACTTGTATAAGCAAGGACTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcagcat < 1:159568/138‑1 (MQ=255)
aTGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTGCACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTACATTTAGAATATTTTGAAGTGTTGAATCCACTTTGTGCTTCTTTGGATTTTGTTTGAACACATTTtaagcaccgtcc > 2:133908/1‑135 (MQ=255)
aTGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcagcatcagca > 1:390412/1‑141 (MQ=255)
tGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCaa < 1:444594/141‑1 (MQ=255)
tCATGTTTACCATTTTTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATa < 2:263533/141‑1 (MQ=255)
tGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCTCTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCt < 1:376456/141‑1 (MQ=255)
aTTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTCATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTtata > 2:422293/1‑141 (MQ=255)
aTTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTtata < 1:359683/141‑1 (MQ=255)
tttGTTTTTTCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATaa < 2:243531/141‑1 (MQ=255)
tttGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATaa > 1:418457/1‑141 (MQ=255)
tttGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTATGACTTGTCGAGATTTGTAAGCGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATaa < 1:105804/141‑1 (MQ=255)
tGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCCGCAATAACTTATTTTTaatc > 2:385142/1‑139 (MQ=255)
tGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGc < 2:316673/141‑1 (MQ=255)
tGTTTTAGCAAGTGCTACACATTAATCACCATTTAATGCGTGTTCTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCTCTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACCTTGTCAGCATCAGCAATGGCTTGTTTATAAGc > 2:306567/1‑141 (MQ=255)
gTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAGTATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCa > 2:388504/1‑141 (MQ=255)
tttCGCCAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATGCACAATTGGTTTCAACACATTGTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCAtt < 1:217545/141‑1 (MQ=255)
tAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGCTTATAAGCAtttt > 2:506138/1‑141 (MQ=255)
gCAAGTACTACACGTTCATCACTATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCAGTTGTTGCTTATTCGCGATTTGTTTCAATACATTTTGTGTATCATCAAGAGCTTGCTTATAAGCATTTTGt > 2:89548/1‑141 (MQ=255)
aGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGAATTGTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGTTTGATTATAAGCATTTTGTTTa > 2:94255/1‑141 (MQ=255)
gTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTAt > 1:91314/1‑141 (MQ=255)
gTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTAt > 1:137292/1‑141 (MQ=255)
gCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCt > 2:476881/1‑141 (MQ=255)
cGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCt > 2:107637/1‑141 (MQ=255)
tcatcaCCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCt > 1:20181/1‑141 (MQ=255)
ttcaCCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTATAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTtg < 1:206388/140‑1 (MQ=255)
cATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAACTATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTCTTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTgtgtgt > 1:392290/1‑141 (MQ=255)
aaTGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGTATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTCTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCt > 1:343197/1‑141 (MQ=255)
tGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTAc < 1:366614/141‑1 (MQ=255)
cTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAg > 2:372200/1‑141 (MQ=255)
cTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAg > 2:2685/1‑141 (MQ=255)
ttGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGt < 2:390412/141‑1 (MQ=255)
gTTTTTCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGttt < 2:13485/141‑1 (MQ=255)
tttGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTCTAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGc < 1:385142/141‑1 (MQ=255)
ttAAACTATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTACTCAACGt > 1:157795/1‑141 (MQ=255)
ttAAAATATTTGGACGTCGTTGGTCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCATCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGt < 2:105652/141‑1 (MQ=255)
ttAAAATAGTTTGAGGTGGTTTATCCACTTGTTGCTTATTCGCTTTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGt < 2:82736/141‑1 (MQ=255)
tAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGtt < 2:466929/141‑1 (MQ=255)
tAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGtt > 1:76555/1‑141 (MQ=255)
aaaTATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAg < 1:97219/141‑1 (MQ=255)
aaTATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGc < 2:210451/141‑1 (MQ=255)
tatTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCAt < 1:2685/141‑1 (MQ=255)
ttttGAAGTGGTTGATCCAGTTGTTCCTTATTCGCATTTTGTTTGAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGt > 1:307850/1‑141 (MQ=255)
gAAGTGGTTGGTCCACTTTTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCAGCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCACTTTGTGTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCAt < 2:364001/141‑1 (MQ=255)
gAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTCGCATGTTCAt > 2:103719/1‑141 (MQ=255)
gAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCAt > 2:261315/1‑141 (MQ=255)
aaGTGTTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCAtt < 2:465964/141‑1 (MQ=255)
|
ACCTTTAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGCTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCATT > CP000730/1474505‑1474774
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
