Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A13 F191 I0 R1
|
49 |
68.0 |
1456600 |
97.2% |
1415815 |
140.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
1,474,639 |
C→G |
100% |
A9129P (GCA→CCA) |
ebh ← |
extracellular matrix binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 1,474,639 | 0 | C | G | 100.0%
| 242.2
/ ‑6.5
| 75 | A9129P (GCA→CCA) | ebh | extracellular matrix binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base G (26/45); minor base T (1/1); total (28/47) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
CTTTAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGCTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCAT > CP000730/1474507‑1474773
|
cTTTTAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATcc < 2:97461/140‑1 (MQ=255)
cTTTAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATcc < 1:644304/140‑1 (MQ=255)
ttAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCAc > 2:174324/1‑140 (MQ=255)
aaaTCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATTTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACtt < 1:278931/140‑1 (MQ=255)
aTCCATCTTGTTGTGCATTGTTTAATGCATTCATTTGGTCGATGTCTTGTTTATCATTTGTTTTTGCAAGTGCTACACGTTTATCACCATTTAATGTTTGTTTTGCTTTTTAATTATTTTGTGGTGGTTGTTCCTTttgt > 2:248209/1‑140 (MQ=255)
ttgttgAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTAt > 2:367050/1‑140 (MQ=255)
tgAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGTTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGc < 2:401632/140‑1 (MQ=255)
tgAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCga < 2:188286/140‑2 (MQ=255)
tgAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGc < 1:116714/140‑1 (MQ=255)
gAGCATTGTTTAATTCATTCAATTGTGCTATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCa < 1:442602/140‑1 (MQ=255)
gAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCa < 1:671128/140‑1 (MQ=255)
gAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCa < 1:227202/140‑1 (MQ=255)
aGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCAt < 2:657479/140‑1 (MQ=255)
cATTGTCTTACGCATTCAAGTGGTCGGTGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATGTAATTCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCAttt < 2:679868/140‑1 (MQ=255)
atggTTTAATGCATTTCTTTTGTCGATTTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCAtttt < 2:552863/137‑1 (MQ=255)
tttAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGttt > 2:462834/1‑140 (MQ=255)
tctAAGGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGttt < 1:609191/138‑1 (MQ=255)
aTGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCTCATTTTGTTTCAAt < 2:492921/140‑1 (MQ=255)
aTGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAAt < 1:543937/140‑1 (MQ=255)
tGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTTTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATa > 1:702322/1‑140 (MQ=255)
tGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATa > 1:645451/1‑140 (MQ=255)
aaTTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtc < 1:244022/140‑1 (MQ=255)
aTTGGTCGATGTCATGTTTACTATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtca < 2:675694/140‑1 (MQ=255)
tGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcagc > 1:212530/1‑140 (MQ=255)
cGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTAAACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTAGCATTTTGTTTCAACACATTTtccgcataa > 2:339250/1‑138 (MQ=255)
gATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCCTCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcagcatcag < 2:440679/140‑1 (MQ=255)
gATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAAGGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcagcatcag < 2:276207/140‑1 (MQ=255)
aTGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTAGACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCGTTTAAAATATTTTGAAGTGTTTGATCCACTTGTTGCTTTTTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcaagattggc > 2:437042/1‑132 (MQ=255)
aTGTCATGTTTACCATTTGTTATAGAAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATACCCTTGTTGATTATTCGCATTTTGTATCAATACATTTtcagcatccgg > 2:437031/1‑137 (MQ=255)
tggcATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCAGTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcagcatcagca > 2:552245/4‑140 (MQ=255)
aTGTTTCCCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAg < 1:573859/140‑1 (MQ=255)
aTGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAg < 2:192504/140‑1 (MQ=255)
gTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTATCCGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAGATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTAGTCCCAGTTCATTTTCAGCATCAGCAATAGCt < 1:172460/140‑1 (MQ=255)
gTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCt < 2:338394/140‑1 (MQ=255)
ttACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGAAATAGCTTg > 1:673010/1‑140 (MQ=255)
ccATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTTTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGttt < 1:618656/140‑1 (MQ=255)
tttGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTtata < 1:643949/140‑1 (MQ=255)
tGTTTTAGCCAGTGCTCCACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAg < 2:35576/140‑1 (MQ=255)
tGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAg < 2:482280/140‑1 (MQ=255)
tttAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAATGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTTGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATAAGCAATAGCTTGTTTATAAGCAt > 1:200398/1‑140 (MQ=255)
tAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCAttt < 1:689228/140‑1 (MQ=255)
gCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCAttttt > 2:644129/1‑139 (MQ=255)
gCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTg > 1:660141/1‑140 (MQ=255)
gCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCGTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTg > 1:112022/1‑140 (MQ=255)
aaGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGtt < 2:261531/140‑1 (MQ=255)
gTGCTCCCCCTTCATCACCATTTTAGTAATGTTGTGCATTTCAAATATTGTGAAGTGGCTGCTCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTa < 1:694197/140‑1 (MQ=255)
gTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGTTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTa < 1:161872/140‑1 (MQ=255)
gTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTa < 1:417089/140‑1 (MQ=255)
gCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGTTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATc < 1:240890/140‑1 (MQ=255)
gCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATc < 1:367835/140‑1 (MQ=255)
acGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAAt < 1:373210/140‑1 (MQ=255)
ttCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTg < 1:409422/140‑1 (MQ=255)
catcaCCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCt > 2:65181/1‑140 (MQ=255)
atcaCCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCtt > 1:564507/1‑140 (MQ=255)
caCCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTtgt > 1:392387/1‑140 (MQ=255)
cATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTtgtgtg > 2:523052/1‑140 (MQ=255)
cATTTAATGCTTGTTTGGCATTTAAAAGATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCCGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATATGCTagtgtg > 2:681885/1‑140 (MQ=255)
aaTGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATc < 1:10323/140‑1 (MQ=255)
gCTTGTCTTTCATTTAAAATATTTTGAAATGACTGATTCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTAGCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTAc > 1:533606/1‑140 (MQ=255)
cTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTCCa > 2:102163/1‑140 (MQ=255)
ttGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAg > 1:572825/1‑140 (MQ=255)
ttGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAg > 1:19595/1‑140 (MQ=255)
ttGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAg > 1:38043/1‑140 (MQ=255)
tGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGt > 1:478114/1‑140 (MQ=255)
ttttGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCAGCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGttt < 2:299450/140‑1 (MQ=255)
ttGCAAATAAAATATTTTGAAGTGGCACATCCACTTGTTGCTTAATCCTATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGc < 1:248209/140‑1 (MQ=255)
gCATTTAAAATATTTTGAAGTGTTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTc < 1:255075/140‑1 (MQ=255)
cATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCa > 1:492833/1‑140 (MQ=255)
tttAAAATATTTTTAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATGCCTATTGTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAAc < 1:378408/140‑1 (MQ=255)
tAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGt < 1:247573/140‑1 (MQ=255)
aaaaTATTTTGATGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGtt < 1:320253/140‑1 (MQ=255)
aaTATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAg < 2:196495/140‑1 (MQ=255)
tcaaGTGCATGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCCTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTc < 1:722354/138‑1 (MQ=255)
aaGTGGTTTATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCAt < 2:702322/140‑1 (MQ=255)
aaGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCAt < 2:645451/140‑1 (MQ=255)
|
CTTTAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGCTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCAT > CP000730/1474507‑1474773
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
