Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,904,306 |
T→G |
intergenic (+932/+441) |
ygcE → / ← queE |
putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,904,306 | 0 | T | G | 97.6%
| 1129.3
/ 4.1
| 330 | intergenic (+932/+441) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/5); new base G (168/152); total (172/158) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.87e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
CTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG > NC_000913/2904209‑2904402
|
ggCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCg > 1:1659646/1‑100 (MQ=255)
ctctgggAACACCGGCTCCTCAACAGCATCACCCAGGACCACGTCTTTTTATCCCCGCTGGCGCGGTGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCa < 2:2194209/96‑1 (MQ=255)
gcgGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCaa > 1:1106929/1‑100 (MQ=255)
gcgGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCaa > 2:540430/1‑100 (MQ=255)
gcgGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCaa > 2:3733555/1‑100 (MQ=255)
ggggAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAac < 2:1973246/100‑1 (MQ=255)
ggggAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAac < 1:775994/100‑1 (MQ=255)
gggAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCATCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGTGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAaca < 1:4828137/100‑1 (MQ=39)
ggAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAccac < 1:4287841/100‑1 (MQ=255)
aaCACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAg < 1:4000583/100‑1 (MQ=255)
acacTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAgg < 2:4201186/100‑1 (MQ=255)
acacTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAgg < 2:4450165/100‑1 (MQ=255)
cacTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGt < 2:812386/100‑1 (MQ=255)
cacTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGt < 1:1895810/100‑1 (MQ=255)
cacTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGt > 1:3590882/1‑100 (MQ=255)
acTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGtt < 2:2290410/100‑1 (MQ=255)
ctaactctGCAACACAAGCACACATGACCACGTCAGATCATCCCCCCTGGAGCGGGGAACACGAAATGTATGTGAGCGTTAAAACCGCAAACACAGGatt > 2:3610094/5‑100 (MQ=255)
cTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGttt > 1:3384317/1‑100 (MQ=255)
tGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTa > 1:5516824/1‑100 (MQ=255)
ggCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTAt < 2:5045874/100‑1 (MQ=255)
ggCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTAt > 1:3205038/1‑100 (MQ=255)
ctGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATcccc > 1:4246758/1‑100 (MQ=255)
gCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGc > 2:4024628/1‑100 (MQ=255)
cAACAGCAGCACCCATGCCCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCt < 1:4958636/100‑1 (MQ=255)
cAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCt > 1:2822360/1‑100 (MQ=255)
cAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCt > 2:3190647/1‑100 (MQ=255)
aaCAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTg > 1:1342155/1‑100 (MQ=255)
aaCAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTg > 1:3829203/1‑100 (MQ=255)
aCAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTgg > 1:3670189/1‑100 (MQ=255)
gcagcaCCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGgcgc > 2:2684299/1‑100 (MQ=255)
gcagcaCCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGgcgc > 1:928281/1‑100 (MQ=255)
agcaCCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCgg > 1:1783438/1‑100 (MQ=255)
agcaCCCATGACCACGTCGGTCTATCACCGCTGGCGCGGCGAACAAGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCTCAAATACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCgg < 1:5197223/100‑1 (MQ=255)
gcaCCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCggg < 2:608400/100‑1 (MQ=255)
caCCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCgggg < 1:1210480/100‑1 (MQ=255)
ccccATGGCCACGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCAGCGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTCTATCCCCGCTTGTGCggggc < 2:5065597/99‑2 (MQ=255)
aCCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGGGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGa > 1:1770067/1‑100 (MQ=255)
aCCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCAGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGa < 2:3493877/100‑1 (MQ=255)
cccATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGaa > 1:5232844/1‑100 (MQ=255)
ccATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAac < 2:5436230/100‑1 (MQ=255)
cATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAaca > 2:731234/1‑100 (MQ=255)
cATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAaca < 2:3357555/100‑1 (MQ=255)
aTGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGCGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAacac > 2:1635697/1‑100 (MQ=255)
aTGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAacac > 1:5224898/1‑100 (MQ=255)
aTGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAacac > 2:1107073/1‑100 (MQ=255)
tGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAAcaca < 2:1783057/100‑1 (MQ=255)
tGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAAcaca < 1:2529396/100‑1 (MQ=255)
gACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAt < 1:4318237/100‑1 (MQ=255)
gACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAt < 1:2140134/100‑1 (MQ=255)
ccACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTa > 1:4599384/1‑100 (MQ=255)
ccACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTa > 1:1471623/1‑100 (MQ=255)
aCGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACg > 1:1486797/1‑100 (MQ=255)
cGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGc > 2:2897513/1‑100 (MQ=255)
cGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGc > 2:4534372/1‑100 (MQ=255)
gTCGTTTTAGCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAAGACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGcc < 2:4227665/100‑1 (MQ=38)
gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGGTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCtttt < 1:4079912/100‑1 (MQ=255)
tATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGc < 2:2964236/100‑1 (MQ=255)
tATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGc > 1:1570718/1‑100 (MQ=255)
aTCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCg < 1:2595598/100‑1 (MQ=255)
aTCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCg > 2:4095223/1‑100 (MQ=255)
aTCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCg < 2:2455383/100‑1 (MQ=255)
tCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCTCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGa > 1:612822/1‑100 (MQ=255)
tCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGa > 2:2092391/1‑100 (MQ=255)
ccccGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGAt < 1:2425496/100‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTg > 1:5571578/1‑100 (MQ=255)
ggCGCGGGGAACACGAGCTGCTGGTCAGCGTTACTGCCGCAAACACTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCgg < 2:4711528/100‑1 (MQ=38)
cgcgGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGtt < 1:2713847/100‑1 (MQ=255)
gcgGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGttt < 2:4764935/100‑1 (MQ=255)
cgGGGAACTCGAAATGCTGGTGAGAGTTAACGCGTCATACTCTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGtttt < 2:4472183/100‑1 (MQ=37)
cgGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGtttt > 1:294741/1‑100 (MQ=255)
ggggAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGttttt < 2:3573638/100‑1 (MQ=255)
gggAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCGAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTg < 2:2520582/100‑1 (MQ=255)
ggAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGc > 1:1046836/1‑100 (MQ=255)
ggAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGc < 1:446171/100‑1 (MQ=255)
aaCACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCg > 1:301149/1‑100 (MQ=255)
acacGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACATATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCgg < 1:3082999/100‑1 (MQ=255)
acacGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGCCCGCAAACACATGTTTATCCGCGCTGGCGCGGGGAACACTTTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCgg < 1:5175331/100‑1 (MQ=255)
cacGGAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAGACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGt < 2:89494/100‑1 (MQ=255)
cacGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGt > 2:2385708/1‑100 (MQ=255)
acGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGtt < 2:5241608/100‑1 (MQ=255)
acGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGtt > 2:5125356/1‑100 (MQ=255)
cGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGttt < 1:500625/100‑1 (MQ=255)
cGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGttt > 1:2455431/1‑100 (MQ=255)
gAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTa < 1:1265392/100‑1 (MQ=255)
gAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTa < 1:4871455/100‑1 (MQ=255)
aTGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATcc < 2:1372599/100‑1 (MQ=255)
aTGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATcc > 1:3451132/1‑100 (MQ=255)
cTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGTTTTATCCCCg > 2:1512461/1‑100 (MQ=255)
cTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCg < 1:508862/100‑1 (MQ=255)
ggTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCt < 2:3794104/100‑1 (MQ=255)
ggTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCt < 1:161339/100‑1 (MQ=255)
ggTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCt < 2:1415258/100‑1 (MQ=255)
ggTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCt > 2:1861920/1‑100 (MQ=255)
tGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTgg < 1:1989439/100‑1 (MQ=255)
aGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGgcg > 1:2241399/1‑100 (MQ=255)
cGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGTCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGGTTGCCCGGATCTTGCCGGCTTATCCCCGCTGGcgcg > 1:537712/1‑100 (MQ=255)
cGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGcgcg > 1:513790/1‑100 (MQ=255)
gTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgg < 1:2262053/100‑1 (MQ=255)
ttAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCggg < 1:2335974/100‑1 (MQ=255)
tAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATGACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgggn < 2:4827069/100‑2 (MQ=255)
|
CTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG > NC_000913/2904209‑2904402
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
