Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,904,306 |
T→G |
intergenic (+932/+441) |
ygcE → / ← queE |
putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,904,306 | 0 | T | G | 98.7%
| 768.5
/ 0.3
| 225 | intergenic (+932/+441) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base G (114/106); total (116/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.12e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.53e-01 |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG > NC_000913/2904212‑2904402
|
gcgcGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGc < 2:2064943/100‑1 (MQ=255)
cgcgGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCa < 1:1936198/100‑1 (MQ=255)
cgcgGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCa > 1:575374/1‑100 (MQ=255)
gcgGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCaa > 1:4048540/1‑100 (MQ=255)
cgGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCaaa > 2:3597285/1‑100 (MQ=255)
cgGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCaaa > 1:194584/1‑100 (MQ=255)
cgGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCaaa > 1:1697353/1‑100 (MQ=255)
cgGGGAACACTGACTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCaaa < 1:1731829/100‑1 (MQ=255)
ggggAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAac < 1:2984007/100‑1 (MQ=255)
acacTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAgg < 1:3819822/100‑1 (MQ=255)
acacTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAgg < 2:2789292/100‑1 (MQ=255)
cacTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGt < 2:601003/100‑1 (MQ=255)
acTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGtt < 1:2050128/100‑1 (MQ=255)
cTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGttt > 1:702247/1‑100 (MQ=255)
cTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGttt > 1:766833/1‑100 (MQ=255)
tGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTa > 2:2859191/1‑100 (MQ=255)
ggCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTAt < 1:2812427/100‑1 (MQ=255)
ggCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTAt < 2:3196533/100‑1 (MQ=255)
ggCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGCTTTAt > 2:2832222/1‑100 (MQ=255)
ctctGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATcc > 1:1856959/1‑100 (MQ=255)
ctctGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATcc < 1:1057172/100‑1 (MQ=255)
ctctGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATcc > 1:3330426/1‑100 (MQ=255)
tctGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATccc < 1:1892198/100‑1 (MQ=255)
tctGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATccc < 1:3065046/100‑1 (MQ=255)
ctGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATcccc > 1:2028134/1‑100 (MQ=255)
ctGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATcccc > 2:3103658/1‑100 (MQ=255)
ctGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATcccc > 2:226512/1‑100 (MQ=255)
tGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACCCGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCg > 2:2553976/1‑100 (MQ=255)
tGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCg < 2:2966951/100‑1 (MQ=255)
tGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCg > 2:1139494/1‑100 (MQ=255)
tGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCg < 1:747858/100‑1 (MQ=255)
tGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCg > 1:1460780/1‑100 (MQ=255)
cAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCt > 1:3034217/1‑100 (MQ=255)
aaCAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTg > 1:2682573/1‑100 (MQ=255)
cagcagCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGgc > 1:3631394/1‑100 (MQ=255)
gcagcaCCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGgcgc > 2:3702958/1‑100 (MQ=255)
gcagcaCCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGgcgc > 2:2344316/1‑100 (MQ=255)
cagcaCCATTGACCACGTCGGTTTACCACGGCTGGCGCGTGGACCGCG‑AATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgg < 2:3466483/100‑1 (MQ=255)
gcaCCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCggg < 1:3808494/100‑1 (MQ=255)
cccATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGaa > 1:2486251/1‑100 (MQ=255)
cATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAaca > 2:2425118/1‑100 (MQ=255)
aCCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAtt > 2:1178086/1‑100 (MQ=255)
cACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTAc > 2:1776877/1‑100 (MQ=255)
cACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTAc < 1:1254373/100‑1 (MQ=255)
aCGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACg < 1:2535389/100‑1 (MQ=255)
aCGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACg < 1:1775963/100‑1 (MQ=255)
gTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGcc < 2:1927248/100‑1 (MQ=255)
gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCtttt > 1:212023/1‑100 (MQ=255)
gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTAAGCAtttt > 2:3988660/1‑100 (MQ=39)
tttATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCTCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCttttt < 1:3271911/100‑1 (MQ=255)
ttATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTg > 2:2636565/1‑100 (MQ=255)
tATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGc < 1:3686359/100‑1 (MQ=255)
tATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGc < 1:3008630/100‑1 (MQ=255)
tATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGc < 1:842003/100‑1 (MQ=255)
aTCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCg < 1:3920719/100‑1 (MQ=255)
ccccGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGAt > 1:1318407/1‑100 (MQ=255)
ccccGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGAt > 1:2161568/1‑100 (MQ=255)
cccGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGAtt < 1:2238378/100‑1 (MQ=255)
ggCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCgg < 2:1908630/100‑1 (MQ=255)
ggCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCgg < 1:3084606/100‑1 (MQ=255)
cgcgGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGtt > 2:842143/1‑100 (MQ=255)
cgcgGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGtt > 2:2736351/1‑100 (MQ=255)
cgGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGtttt > 1:1652047/1‑100 (MQ=255)
gggAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAGCACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTg < 2:2769421/100‑1 (MQ=255)
gggAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTg > 1:3158879/1‑100 (MQ=255)
gggAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTg < 2:2395659/100‑1 (MQ=255)
ggAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGc < 1:1013532/100‑1 (MQ=255)
ggAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGc < 2:100632/100‑1 (MQ=255)
gAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGcc < 1:1705997/100‑1 (MQ=255)
acacGAAATGTTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCgg < 1:1595727/100‑1 (MQ=255)
acacGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCgg < 1:2728285/100‑1 (MQ=255)
acacGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCgg < 1:660576/100‑1 (MQ=255)
acacGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCgg < 1:496685/100‑1 (MQ=255)
cacGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTGTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGt < 1:3648113/100‑1 (MQ=255)
acGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGtt < 2:2582823/100‑1 (MQ=255)
cGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGttt > 1:868833/1‑100 (MQ=255)
cGAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGttt > 1:374946/1‑100 (MQ=255)
gAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTa < 2:1566730/100‑1 (MQ=255)
gAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTa < 1:2911201/100‑1 (MQ=255)
gAAATGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTa < 1:3449431/100‑1 (MQ=255)
aaaTGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGATTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTAt > 1:2146864/1‑100 (MQ=255)
aTGCTGGTGCGCGTTAAGGCCGCGAACACAGGTTTATCCCCGTTGGCGCGGGGACCACATTACGCCTTTCTGCGATTGCCCGGTGTTTGCCGGTTTATcc < 1:3553251/100‑1 (MQ=255)
tGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATccc > 2:2243987/1‑100 (MQ=255)
tGCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATccc < 2:1294394/100‑1 (MQ=255)
gCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATcccc < 2:138851/100‑1 (MQ=255)
gCTGGTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATcccc > 1:1042984/1‑100 (MQ=255)
ggTGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCt < 1:1122349/100‑1 (MQ=255)
tGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTgg > 1:2110951/1‑100 (MQ=255)
tGAGCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTgg > 1:967652/1‑100 (MQ=255)
gCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGgcgc > 2:1261354/1‑100 (MQ=255)
gCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGgcgc > 2:1851127/1‑100 (MQ=255)
gCGTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGgcgc < 2:1683650/100‑1 (MQ=255)
gTTAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgg > 1:3125120/1‑100 (MQ=255)
ttAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCggg < 1:2789637/100‑1 (MQ=255)
ttAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCggg > 2:1435988/1‑100 (MQ=255)
ttAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCggg < 2:3778591/100‑1 (MQ=255)
ttAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCggg < 2:1783153/100‑1 (MQ=255)
tAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCTGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgggg > 1:1417541/1‑100 (MQ=255)
tAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgggg > 1:236508/1‑100 (MQ=255)
tAAGGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgggg < 2:3012556/100‑1 (MQ=255)
|
GCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG > NC_000913/2904212‑2904402
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
