Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,052,652 |
T→G |
Q289H (CAA→CAC) |
ubiH ← |
2‑octaprenyl‑6‑methoxyphenol hydroxylase, FAD/NAD(P)‑binding |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,052,652 | 0 | T | G | 96.8%
| 197.2
/ ‑1.9
| 62 | Q289H (CAA→CAC) | ubiH | 2‑octaprenyl‑6‑methoxyphenol hydroxylase, FAD/NAD(P)‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base G (28/32); total (29/33) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.06e-01 |
GTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTTTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACACCAGACCAGCGAACAGCGTCCGTCAGACATCGGC > NC_000913/3052421‑3052880
|
gTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTgcg < 1:385360/236‑1 (MQ=255)
gcgcCTGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGcgcc < 2:494498/235‑1 (MQ=255)
cgcCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCTGGTGCAGAGTGTGagccgc > 2:271615/1‑236 (MQ=255)
cgcCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGcgccg > 1:479328/1‑235 (MQ=255)
cccGACAACCAGCAGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGCTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCa < 2:429466/235‑1 (MQ=255)
aaCCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCCCATCTCGCATCCCTAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGGTGGCCGCATTGccc > 2:155938/1‑235 (MQ=255)
aCCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCccac < 1:254081/236‑1 (MQ=255)
cAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCccacca < 1:284333/236‑1 (MQ=255)
gTGACCAACGGTGGTCAAAACGTTGTAAAAGGACGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATAAGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATAACATCTCGCATACCGAGGTTAAAACCTTGAAAGGAAAGAGGGGGAAGAGGGGGCGCCGCAGTGCCCACCAGAACg < 1:715615/236‑1 (MQ=255)
cccAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTa > 1:561811/1‑236 (MQ=255)
ccAACGGTTGGCAAAAAGTTGTTACAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTa < 2:300358/235‑1 (MQ=255)
aaCGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACg < 1:696733/235‑1 (MQ=255)
atggTTCGCAAAAGGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGAt < 2:311057/234‑1 (MQ=255)
agggTTGGCAAAAATATCGACAAGTCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGa < 2:503416/233‑1 (MQ=255)
ggTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATgg < 1:83290/236‑1 (MQ=255)
ggCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTaa > 2:293544/1‑236 (MQ=255)
aTGTACACGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATACCGGCACAATCCGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTgg < 1:285838/236‑1 (MQ=255)
tCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTTTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGAt > 2:318051/1‑208 (MQ=255)
tCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTTTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGAt < 1:318051/208‑1 (MQ=255)
tCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTa > 2:63391/1‑235 (MQ=255)
tCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTa > 2:735731/1‑235 (MQ=255)
gACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGCTGGCGttaacccacgcc < 1:395104/236‑12 (MQ=255)
accccAATGGTGCCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCATCCATGTCTTCTCCGCGCCCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAg < 2:431147/233‑1 (MQ=255)
gCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAAGGCCAGCGGGTAAGCaat > 2:97579/1‑234 (MQ=255)
cTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACt < 1:242299/235‑1 (MQ=255)
cgATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGGAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGttt > 1:533456/1‑236 (MQ=255)
aTCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTa > 1:385285/1‑235 (MQ=255)
ctctGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGc < 2:479328/236‑1 (MQ=255)
tgATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTcc > 1:203052/1‑235 (MQ=255)
cacaATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCgcca > 1:738133/1‑236 (MQ=255)
cacaATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGCTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGTTAAGAACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTccccaagtgcca > 2:234045/1‑227 (MQ=255)
cGTAATCCCCCATGTCTTCGCCGCGCTCCTGCGCCTGATTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCCCATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGcc < 1:358381/236‑1 (MQ=255)
aaTCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTGCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGAc > 1:22359/1‑236 (MQ=255)
cATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTa < 1:550026/130‑1 (MQ=255)
cATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTa > 2:550026/1‑130 (MQ=255)
cATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGtt > 1:262098/1‑236 (MQ=255)
tGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCACCGGATAAGCACTGCGTTTACAAGCGTGGGGAATTTTCCCAAATAGCCAGCCCAAGGCCGCCTGGAGGTcc > 2:740040/1‑235 (MQ=255)
cttctCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACgg > 1:20203/1‑236 (MQ=255)
ctcCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGGACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGGTCACGGc > 2:764814/1‑234 (MQ=255)
cgcgCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCaaa > 1:439958/1‑234 (MQ=255)
tGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGt < 1:97579/235‑1 (MQ=255)
cgcCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCa < 1:392265/157‑1 (MQ=255)
cgcCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCa > 2:392265/1‑157 (MQ=255)
cgcCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCAc < 2:385285/236‑1 (MQ=255)
ggTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGacaac > 2:296565/1‑235 (MQ=255)
tCCGCAAGCCTCATCCCCTCTCGCATTCCGATGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCCCCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGacaaca < 2:20203/232‑1 (MQ=255)
tCCGCAAGACTCAGCACATCTCGCATACCGAGGTTAACCCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAaca‑c < 1:271615/233‑1 (MQ=255)
cGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑Cctct > 2:463212/1‑235 (MQ=255)
aGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTcgcg < 1:296565/236‑1 (MQ=255)
aCTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCgcgc < 1:293544/235‑1 (MQ=255)
cTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGAAATTTTCCCAAGTGGCAGGCCAAAGGCCGCCTGGAGTTCACGGAAAAACTTTCCGTCACTCCAC‑ACCACACCCTCTTCTGGCCg > 1:170852/1‑236 (MQ=255)
atcaCATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGT‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCg < 1:354367/233‑1 (MQ=255)
atcaCATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGT‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCg > 2:354367/1‑233 (MQ=255)
cATACCGAGTTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGa < 2:213086/232‑1 (MQ=255)
cATACCGAGGTTAAGCCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGAt < 1:740040/233‑1 (MQ=255)
cATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGa > 1:213086/1‑232 (MQ=255)
gAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACaccaga < 2:203052/236‑1 (MQ=255)
gAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACaccaga < 1:63391/236‑1 (MQ=255)
aGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACaccaga > 2:499164/1‑235 (MQ=255)
ttGCCCGGAAATCGGGTGCAGGGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTACCGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACACCAGACCAGCGAACAGc < 1:721974/236‑1 (MQ=255)
cAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACACCAGACCAGCGAACAGCGTCCGTCCGACATCGGc > 1:618015/1‑235 (MQ=255)
cAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACACCAGACCAGCGAACAGCGTCCGTCAGACATCGGc < 1:499164/235‑1 (MQ=255)
|
GTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTTTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACACCAGACCAGCGAACAGCGTCCGTCAGACATCGGC > NC_000913/3052421‑3052880
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
