Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,393,985 |
A→C |
P758P (CCT→CCG) |
yhdP ← |
DUF3971‑AsmA2 domains protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,393,985 | 0 | A | C | 100.0%
| 213.6
/ NA
| 59 | P758P (CCT→CCG) | yhdP | DUF3971‑AsmA2 domains protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (34/25); total (34/25) |
TCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCAGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTGGTTTGATAAACAGACTGTTATTACGCAGCGTCA > NC_000913/3393776‑3394214
|
tCAATGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTg < 2:90844/236‑1 (MQ=255)
ttGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCAAGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTAcc > 2:365933/1‑236 (MQ=255)
tGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGTTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCg < 1:228256/236‑1 (MQ=255)
aTTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGa > 1:123385/1‑236 (MQ=255)
tGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAg > 1:429257/1‑235 (MQ=255)
cATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCg > 1:733252/1‑227 (MQ=255)
cATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCg < 2:733252/227‑1 (MQ=255)
aaCCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCg < 1:705274/236‑1 (MQ=255)
tACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAgg > 2:750563/1‑236 (MQ=255)
cccGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCttt > 1:492865/1‑236 (MQ=255)
cAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCACCTTCTTttgtg > 1:495917/1‑236 (MQ=255)
tAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCa < 1:581415/236‑1 (MQ=255)
tAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCa < 1:46334/236‑1 (MQ=255)
aaGGTAAGTCACTGATCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTC‑‑TGTTAGTGGTCGCCCCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACgg < 2:240517/236‑1 (MQ=255)
ggTAAGTGCCTGCTAACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTAAAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACgg < 2:123385/236‑1 (MQ=255)
gCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCCGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTTCCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTCCAATGGCAGATTtaa > 2:359316/1‑234 (MQ=255)
caTTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCtt < 1:750563/236‑1 (MQ=255)
gCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACg > 1:359856/1‑115 (MQ=255)
gCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACg < 2:359856/115‑1 (MQ=255)
cGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTgg > 1:656543/1‑232 (MQ=255)
cGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTgg > 2:546893/1‑232 (MQ=255)
tATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAg > 1:651547/1‑234 (MQ=255)
aatatgtaGGTCCCCCCAGCATGATAAGGCAGGTCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGAt < 1:199840/229‑1 (MQ=255)
taGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTAtt > 2:145287/1‑236 (MQ=255)
tCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATa < 2:651547/236‑1 (MQ=255)
cGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGAt > 2:163229/1‑234 (MQ=255)
cGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGAt > 1:262678/1‑234 (MQ=255)
cGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGAt > 1:269443/1‑234 (MQ=255)
cACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGt > 1:269156/1‑209 (MQ=255)
cACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGt < 2:269156/209‑1 (MQ=255)
cACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGAt > 2:436375/1‑232 (MQ=255)
cACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCACTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTCGAAAAATCTACGCTCAACGGCCGCTTAAACCAGCTTTCTGTCCGTGGTTCACTTTGCAGaatcctatctac > 2:359224/1‑221 (MQ=255)
ggCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGc < 1:365933/235‑1 (MQ=255)
aTCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAAt > 1:488436/1‑236 (MQ=255)
aTCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAAt > 1:273736/1‑236 (MQ=255)
aTCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAAt > 2:656343/1‑236 (MQ=255)
aTCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCAATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAAt > 2:190065/1‑236 (MQ=255)
aTGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAAttttt < 1:546893/236‑1 (MQ=255)
tGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGTTAAAACTGAATTTACCGCTCAAATTTTTc > 2:328399/1‑236 (MQ=255)
gCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGt < 1:350737/177‑1 (MQ=255)
gCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGt > 2:350737/1‑177 (MQ=255)
aCTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACAAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATAGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCat > 1:383911/1‑232 (MQ=255)
ccacgccccgCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTg < 1:306947/236‑1 (MQ=255)
cacgccacgcTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTgg > 2:508173/1‑236 (MQ=255)
cgccacgcTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAAGTTTTAAGGGAGCTTTCGAGTGGtt > 2:514300/1‑236 (MQ=255)
gccacgcTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTGGttt < 2:492865/236‑1 (MQ=255)
cTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTGGTTTGATaaa < 1:145287/236‑1 (MQ=255)
cTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTGGTTTGATaaa > 1:9841/1‑236 (MQ=255)
cTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTGGTTTGATaaa < 1:190065/236‑1 (MQ=255)
ggcACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGGCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTGCCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTGGTTTGATAAACa < 1:359316/234‑1 (MQ=255)
cACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTGGTTTGATAAACAGa < 2:273736/236‑1 (MQ=255)
aCTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTGGTTTGATAAACAGAc < 1:508173/236‑1 (MQ=255)
tGCTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTGGTTTGATAAACAGACTGttat > 2:20903/1‑236 (MQ=255)
cTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTg < 1:602041/56‑1 (MQ=255)
cTTCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTg > 2:602041/1‑56 (MQ=255)
tCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCa < 2:414936/196‑1 (MQ=255)
tCGTTCACCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCa > 1:414936/1‑196 (MQ=255)
aCCGCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTGGTTTGATAAACAGACTGTTATTACGCAGc > 1:40529/1‑234 (MQ=255)
gCTTCCGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTGGTTTGATAAACAGACTGTTATTACGCAGCGTCa > 1:72427/1‑235 (MQ=255)
|
TCAAAGCTGTTGAGATTGCCATCAACCTTAACGTTTACCGCTAGTGGTTCACCCGCAGGTTTGGCTAACGGTGAAGGTAAGTGACTGCTCACATTCTTTAGATCGCCGTTCAGCTCTATGTTATAGGTCGCACCAGCATGATAAGGCAGATCAATGCCCACTTTACCATCCCACGCCACGCTGCCACTCAATGCTTCGTTCACCGCTTCAGGCAGAACGCCGGTTTTCGCCGGTTGCCAGTTACCGTTGAGGTTTACCGCTACCTGGTAGGCTTTTGCCCCTTCTTTGGTGGAAAAATCCACGTTCAACGGCTGATTAAACCAGCTTGCTGTCAGTGGTTCACTTTGCAGATCGCTATTGATAAAGCTGAATTTACCGCTCAAATTTTTCAGGGTGCTGTCGAGTGGTTTGATAAACAGACTGTTATTACGCAGCGTCA > NC_000913/3393776‑3394214
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
