Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,408,510 |
A→C |
T302P (ACC→CCC) |
panF → |
pantothenate:sodium symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,408,510 | 0 | A | C | 100.0%
| 159.7
/ NA
| 47 | T302P (ACC→CCC) | panF | pantothenate:sodium symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (26/21); total (26/21) |
ATTCTGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGATCAAATGCAAAACGAGACGCGTCTGAAGCGGATGTCGGCGGTAATTACGTTAGTTCTCGG > NC_000913/3408303‑3408739
|
atTCTGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGtt < 1:228693/236‑1 (MQ=255)
atTCTGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGtt < 1:40286/236‑1 (MQ=255)
gTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATgg > 1:116632/1‑236 (MQ=255)
cctgcctTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTaaa > 2:103088/1‑236 (MQ=255)
gtcgtTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCg > 1:644979/1‑235 (MQ=255)
gtcgtTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCg > 1:572775/1‑235 (MQ=255)
tGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTGCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGAt > 2:455836/1‑235 (MQ=255)
tGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTACAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGAt > 1:289524/1‑235 (MQ=255)
gATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCg < 1:103088/235‑1 (MQ=255)
aTTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTTTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGa < 1:739581/235‑1 (MQ=255)
aTTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGa < 1:23690/235‑1 (MQ=255)
ccGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACCTTAATGGGAAAAGTGCTGCCACCGCTTGCTTCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGAt > 2:628610/1‑236 (MQ=255)
cGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATc < 1:154215/236‑1 (MQ=255)
tACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATg > 1:121424/1‑235 (MQ=255)
gTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAGGCCGTCCATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAAt < 1:305156/236‑1 (MQ=255)
tGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAAtt > 2:158861/1‑236 (MQ=255)
cgcTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTATGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGATGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGCTGGCTGCGATCATGTCGCCAATTa > 2:714441/1‑235 (MQ=255)
cgcTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTa > 2:569641/1‑235 (MQ=255)
tGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGc > 1:184496/1‑236 (MQ=255)
aaaGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACtgctgcc > 1:616021/1‑235 (MQ=255)
aaaGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGACATTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAAGTCCTAACTGCTGCa > 2:334413/1‑236 (MQ=255)
gCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGtt < 1:158861/229‑1 (MQ=255)
gcATCGGGGGATCGTCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCCCCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGAt < 1:683181/233‑1 (MQ=255)
aCATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACg < 1:408300/232‑1 (MQ=255)
cATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCAt > 1:57074/1‑236 (MQ=255)
cGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAAATGCGGCAAAGTTCCGCTACGACAATTaa > 2:324062/1‑236 (MQ=255)
tcatcatcGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGAtct < 2:121424/235‑1 (MQ=255)
catcGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTAt < 1:334413/235‑1 (MQ=255)
tcGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGACAATTAAAGATCTCTATCTg > 2:543474/1‑236 (MQ=255)
aTTTTGGTCCCAAGTCTGATGTTCGGTATGCCCCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCCGTGATCCCCGATCCCCCCGTTCCGGTCCGGGTAATCCAAACGTTAATGGTAAAAGGGCTGCCACCGTTTGCGGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAGCGCCTGTCTGCTGCAAAGTTCCGCTACAATCAGGAAAGATCTCTATCTGAatagaca < 2:116632/236‑5 (MQ=255)
tgGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCCCCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATAtccgtcc < 1:648313/235‑1 (MQ=255)
gTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGCCAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTCAAGATCTCTATCGGAATATCCTCCCGGa > 2:419642/1‑236 (MQ=255)
gTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACg > 1:529579/1‑201 (MQ=255)
gTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACg < 2:529579/201‑1 (MQ=255)
gTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGa > 2:395553/1‑236 (MQ=255)
tGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGATCAAATGCaa > 1:333961/1‑236 (MQ=255)
ttCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGATCAAATGCAAAACga > 1:205423/1‑236 (MQ=255)
gCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGATCAAATGCAAAACGAGACGCGt < 2:644979/235‑1 (MQ=255)
gCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGATCAAATGCAAAACGAGACGCGt < 1:395553/235‑1 (MQ=255)
cACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACg < 2:363415/177‑1 (MQ=255)
cACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACg > 1:363415/1‑177 (MQ=255)
gCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGATCAAATGCAAAACGAGACGCGTCTGAAGCg > 1:199849/1‑236 (MQ=255)
aGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGATCAAATGCAAAACGAGACGCGTCTGAAGCGGATGt > 2:397087/1‑236 (MQ=255)
aGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGATCAAATGCAAAACGAGACGCGTCTGAAGCGGATGt > 2:378403/1‑236 (MQ=255)
ttgggCGTTGATCCCCGATCTACCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGATCAAATGCAAAACGAGACGCGTCTGAAGCGGATGTCGGCGGTaa < 2:199849/234‑1 (MQ=255)
cGGTGATCCCCGATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGATCAAATGCAAAACGAGACGCGTCTGAAGCGGATGTCGGCGGTAATTACg < 1:419642/236‑1 (MQ=255)
gATCTCCCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGATCAAATGCAAAACGAGACGCGTCTGAAGCGGATGTCGGCGGTAATTACGTTAGTTCTCgg < 1:455836/236‑1 (MQ=255)
|
ATTCTGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCTGAATATCCGTCCGGATCAAATGCAAAACGAGACGCGTCTGAAGCGGATGTCGGCGGTAATTACGTTAGTTCTCGG > NC_000913/3408303‑3408739
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
