Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,540,754 |
T→G |
I116M (ATT→ATG) |
feoB → |
ferrous iron transporter protein B and GTP‑binding protein; membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,540,754 | 0 | T | G | 96.8%
| 216.1
/ ‑0.8
| 63 | I116M (ATT→ATG) | feoB | ferrous iron transporter protein B and GTP‑binding protein; membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base G (27/34); total (28/35) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.01e-01 |
TAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCC > NC_000913/3540526‑3540984
|
tAAAGAAGGGCAATTCCCCACCCCCGTTCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCCCCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCa < 2:720758/235‑1 (MQ=255)
gaatGGCAATTCTCCCCCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGGGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCa < 2:396162/231‑1 (MQ=255)
cAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGa < 2:226666/229‑1 (MQ=255)
cAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGa > 1:226666/1‑229 (MQ=255)
ccGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCa > 1:33370/1‑212 (MQ=255)
ccGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCa < 2:33370/212‑1 (MQ=255)
atcatcAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAg > 1:225307/1‑236 (MQ=255)
cGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATAtt < 1:246786/233‑1 (MQ=255)
cGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCCAGCAGCAAAATATTCgg > 2:265089/1‑235 (MQ=255)
gCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTa > 2:209974/1‑236 (MQ=255)
gCTGGTCGCCCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGCCCTCGCTCGATGGGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTa < 2:563291/236‑1 (MQ=255)
gtggACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGa < 1:665299/236‑1 (MQ=255)
gtggACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGa > 2:522268/1‑236 (MQ=255)
gCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATg < 1:598156/236‑1 (MQ=255)
tattccacgACCACCATCTCGTCGCGAGCCTCGCTCGATGAGCAAATCCCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGCCGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg < 2:225307/227‑1 (MQ=255)
tATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg < 1:209974/235‑1 (MQ=255)
tATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg < 1:173590/235‑1 (MQ=255)
accaccATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGaa > 2:412046/1‑170 (MQ=255)
accaccATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGaa < 1:412046/170‑1 (MQ=255)
caTCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAACATATTCGGATTTAAATTGATGCTCTTTCGGACCGTCTGGGCTGTc > 2:147548/1‑236 (MQ=255)
caTCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTc > 1:181422/1‑236 (MQ=255)
cAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGAt > 1:724598/1‑233 (MQ=255)
gACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGc < 1:530427/236‑1 (MQ=255)
gACCTCGCTCAATGAGCAAATCGCATGTCACTACATTTTGAGGTGAGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGTTGCGTCTAACCTTGCGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGc < 2:265907/236‑1 (MQ=255)
aCCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGCGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGTGGCGCCTGGGCGGTCCGCGGATCCCGCt > 2:80814/1‑236 (MQ=255)
aTGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCG‑‑GCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAAccc > 2:588911/1‑235 (MQ=255)
aaTCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGt < 1:714658/235‑1 (MQ=255)
aaTCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGt < 1:147548/235‑1 (MQ=255)
aTCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTggg < 2:583680/200‑1 (MQ=255)
aTCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTggg > 1:583680/1‑200 (MQ=255)
tCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTcg < 1:640447/235‑1 (MQ=255)
tCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTcg < 1:522268/235‑1 (MQ=255)
cTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGTTCGCggaa > 2:743551/1‑234 (MQ=255)
tCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTg < 1:617004/236‑1 (MQ=255)
cATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCACGGTATTGAAgcgc > 2:12422/1‑236 (MQ=255)
tGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCTCGGTATTGATgcgcg > 1:290470/1‑231 (MQ=255)
cGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGAt < 1:80814/235‑1 (MQ=255)
gctgATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCtata < 2:724598/236‑1 (MQ=255)
gctgATTAACGTGATGGATGCATCTACCCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCtata < 2:152124/236‑1 (MQ=255)
tAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTa > 1:500845/1‑236 (MQ=255)
aCGGGGTGGAGTCGTCTAACCTTGAGCGAAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAAc < 2:181422/236‑1 (MQ=255)
tggATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGc > 2:605730/1‑165 (MQ=255)
tggATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGc < 1:605730/165‑1 (MQ=255)
gATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAAtgt > 2:16673/1‑236 (MQ=255)
tAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg < 2:760333/128‑1 (MQ=255)
tAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg > 1:760333/1‑128 (MQ=255)
tAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACt > 1:740531/1‑234 (MQ=255)
gAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg > 2:88566/1‑121 (MQ=255)
gAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg < 1:88566/121‑1 (MQ=255)
aGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGTGGCATTaa > 2:342348/1‑235 (MQ=255)
tggTACCAGACGCTACAACTGCTGGAACTGGGCATTCCCTGAATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGc < 2:500845/233‑1 (MQ=255)
cTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGc < 1:12422/235‑1 (MQ=255)
cTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGc < 1:265089/235‑1 (MQ=255)
gTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGcaca > 2:298169/1‑231 (MQ=255)
aCCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCgctg < 1:514502/236‑1 (MQ=255)
aCGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGGGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGGTCaa > 1:179366/1‑236 (MQ=255)
aCGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCaa > 2:209941/1‑236 (MQ=255)
cGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAAc < 1:342348/236‑1 (MQ=255)
tACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGGGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGaa > 1:201348/1‑236 (MQ=255)
ctgGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTggg < 2:234136/101‑1 (MQ=255)
ctgGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTggg > 1:234136/1‑101 (MQ=255)
ccTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATg < 1:298169/236‑1 (MQ=255)
tGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTGCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGcc < 2:151600/236‑1 (MQ=255)
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TAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCC > NC_000913/3540526‑3540984
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
