Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,766,247 |
A→C |
K1355N (AAA→AAC) |
rhsA → |
Rhs protein with putative toxin 55 domain; putative polysaccharide synthesis/export protein; putative neighboring cell growth inhibitor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,766,247 | 0 | A | C | 98.8%
| 591.3
/ ‑4.8
| 171 | K1355N (AAA→AAC) | rhsA | Rhs protein with putative toxin 55 domain; putative polysaccharide synthesis/export protein; putative neighboring cell growth inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base C (99/68); total (99/72) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
GACATAATAAATGACAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAAAGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATGTCAA > NC_000913/3766152‑3766343
|
gACATAATAAATGACAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATg < 1:2803133/100‑1 (MQ=255)
cATAATAAATGACAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGCTATTAGTGCTAACGATGCa > 2:2204248/1‑100 (MQ=255)
aataaATGACAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCaaaa > 2:3079773/1‑100 (MQ=255)
aataaATGACAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCaaaa < 1:4065692/100‑1 (MQ=255)
aaaTGACAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGc < 2:2159683/100‑1 (MQ=255)
aTGACAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGCGCTAACGATGCAAAAAGcac < 1:3179166/100‑1 (MQ=255)
gACAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGcacac < 1:1061414/100‑1 (MQ=255)
gACAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGcacac > 2:3643706/1‑100 (MQ=255)
gACAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGcacac < 1:2450758/100‑1 (MQ=255)
gACAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGcacac < 1:415162/100‑1 (MQ=255)
gACAGATTCTGAAGTAATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGcacac < 2:1078515/100‑1 (MQ=255)
aCAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGcacaca > 1:2203956/1‑100 (MQ=255)
aCAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGcacaca > 1:3162731/1‑100 (MQ=255)
cAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAg > 1:597567/1‑100 (MQ=255)
aGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGa > 1:3444038/1‑100 (MQ=255)
gATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGaa > 2:1889782/1‑100 (MQ=255)
ggAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTg > 1:1788180/1‑100 (MQ=255)
gaaGTGATGGGAATAAGCCCGACAGATGTGATGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAAAAATAAAAAAAGCACACAGAAAGCCTg < 2:3140304/98‑1 (MQ=255)
gTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGaa > 1:2625152/1‑100 (MQ=255)
gTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGaa > 1:998383/1‑100 (MQ=255)
tGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAAt > 1:4060074/1‑100 (MQ=255)
tGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAAt < 1:756068/100‑1 (MQ=255)
gATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAAtt > 1:1377972/1‑100 (MQ=255)
aTGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTg < 1:1000975/100‑1 (MQ=255)
tGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTgt > 1:1057672/1‑100 (MQ=255)
gggAAAAAACCCGACAGATGTGGCGTACTCCAGGCGCGAAGTGATTGCGCAGATATTAGTGCTAACGCTGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTggc > 2:1741344/1‑98 (MQ=255)
gggAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTgtc > 2:1012389/1‑100 (MQ=255)
gggAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTgtc > 2:1883464/1‑100 (MQ=255)
gggAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTgtc > 2:2307827/1‑100 (MQ=255)
gggAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTgtc > 1:1149066/1‑100 (MQ=255)
ggAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTgtcg < 2:1070218/100‑1 (MQ=255)
ggAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTgtcg < 1:1758238/100‑1 (MQ=255)
ggAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTgtcg > 1:3892893/1‑100 (MQ=255)
ggAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTgtcg > 1:3524732/1‑100 (MQ=255)
agAAAAAACCCAACAGATGTGACGTACCGCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTgtcg < 2:1580069/99‑1 (MQ=255)
aaaaaaCCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTgtcgtc < 1:2801182/100‑1 (MQ=255)
aaaaaaCCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTgtcgtc < 1:3176315/100‑1 (MQ=255)
aaaCCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAGGCCTGGAATTGTCGTCACt > 1:3902960/1‑100 (MQ=255)
aCCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTcc < 2:3599783/100‑1 (MQ=255)
aCCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTcc < 2:79905/100‑1 (MQ=255)
cccGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCa < 2:522948/100‑1 (MQ=255)
cccGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCa > 2:1614455/1‑100 (MQ=255)
ccGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAg < 1:3692014/100‑1 (MQ=255)
ccGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAg < 1:1036911/100‑1 (MQ=255)
cGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGa > 1:689753/1‑100 (MQ=255)
cGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACGAATTGATTGTGGTGATATTATTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGa > 2:3802479/1‑100 (MQ=255)
gACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGAc < 2:3860816/100‑1 (MQ=255)
gATGTGACGTACTTCAAGAACTAATTGGTTGGGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTc > 2:696006/1‑100 (MQ=255)
tgtgACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCaa > 2:1218633/1‑100 (MQ=255)
tgtgACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCaa > 1:2556265/1‑100 (MQ=255)
gtgACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCaaa > 1:1611696/1‑100 (MQ=255)
cGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAt > 1:2374103/1‑100 (MQ=255)
gTACTTTAGAAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGTAAGCCTGGAATTGTCGCCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑a < 2:3412938/100‑1 (MQ=255)
tACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑aa > 1:960376/1‑100 (MQ=255)
tACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑aa > 2:3950869/1‑100 (MQ=255)
cTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑aaaa > 2:2584924/1‑100 (MQ=255)
ttCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑aaaaa < 2:2517068/100‑1 (MQ=255)
attaaCTAATTGATTGTGGTGATATTAGTTCTAACGATGTAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCTAGACAGTCAAACTAT‑AAAAAAAg < 2:2849371/97‑1 (MQ=255)
aaCTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATa < 1:3706302/100‑1 (MQ=255)
aaCTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATa < 2:2034326/100‑1 (MQ=255)
aCTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAg < 2:1100693/100‑1 (MQ=255)
cTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGc < 1:2537766/100‑1 (MQ=255)
aaTTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGccc > 1:2911459/1‑100 (MQ=255)
attgattgTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCt > 1:2709729/1‑100 (MQ=255)
tgattgTGGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTtg < 1:1843861/100‑1 (MQ=255)
tgtgGTGATATTAGTGCTAATGATGCAAAAAGCATACAGAAAGCTTGGAATTGTCGTTACTCCAGACAGTAAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGa < 2:215845/100‑1 (MQ=255)
tgtgGTGATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGa < 2:539390/100‑1 (MQ=255)
gtggtgATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAg > 2:3631291/1‑100 (MQ=255)
gtggtgATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAg < 1:1302618/100‑1 (MQ=255)
gtggtgATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAg > 2:1641164/1‑100 (MQ=255)
tggtgATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAgg > 2:1174037/1‑100 (MQ=255)
ggtgATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGt < 2:3358841/100‑1 (MQ=255)
ggtgATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGt > 1:1535073/1‑100 (MQ=255)
gtgATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGtt > 2:585696/1‑100 (MQ=255)
tgATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTc > 1:1789478/1‑100 (MQ=255)
tatatTAGTGCAAACGATGCAAAAATCACACAGAAAGACTTGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTcc < 2:3275513/99‑1 (MQ=37)
gATATTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTcc < 1:2948633/100‑1 (MQ=255)
tatTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTg < 1:1483531/100‑1 (MQ=255)
tatTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTg < 1:1943676/100‑1 (MQ=255)
tatTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTg > 1:1434881/1‑100 (MQ=255)
tatTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTg > 1:1468308/1‑100 (MQ=255)
atTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCGCTCCAGACAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTg < 2:1230150/100‑1 (MQ=255)
atTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGc < 2:1443020/100‑1 (MQ=255)
atTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGc < 2:1442744/100‑1 (MQ=255)
atTAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGc > 1:1604846/1‑100 (MQ=255)
ttAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCa > 1:3830796/1‑100 (MQ=255)
ttAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCa > 1:393248/1‑100 (MQ=255)
tAGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCaa < 2:1323049/100‑1 (MQ=255)
aGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAAt < 1:552185/100‑1 (MQ=255)
aGTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAAt > 1:4030097/1‑100 (MQ=255)
gTGCTAACGATGCGAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATg < 1:1557175/100‑1 (MQ=255)
gTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATg > 2:497647/1‑100 (MQ=255)
gTGCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATg > 2:498174/1‑100 (MQ=255)
gCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATGTc > 1:1692883/1‑100 (MQ=255)
gCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATGTc > 1:1066431/1‑100 (MQ=255)
gCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATGTc < 1:2047415/100‑1 (MQ=255)
gCTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATGTc < 1:20896/100‑1 (MQ=255)
cTAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATGTCa < 1:2813275/100‑1 (MQ=255)
tAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATGTCaa < 1:1942284/100‑1 (MQ=255)
tAACGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATGTCaa > 2:1806568/1‑100 (MQ=255)
|
GACATAATAAATGACAGATTCTGGAGTGATGGGAAAAAACCCGACAGATGTGACGTACTTCAGGAACTAATTGATTGTGGTGATATTAGTGCTAAAGATGCAAAAAGCACACAGAAAGCCTGGAATTGTCGTCACTCCAGACAGTCAAACGAT‑AAAAAAAGATAGCCCTTGTGGAGGTTCCTGCAATGTCAA > NC_000913/3766152‑3766343
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
