Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,476,115 |
A→C |
N227H (AAT→CAT) |
yjgL → |
SopA‑central‑domain‑like hexapeptide repeat protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,476,115 | 0 | A | C | 98.8%
| 569.9
/ ‑5.9
| 162 | N227H (AAT→CAT) | yjgL | SopA‑central‑domain‑like hexapeptide repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base C (89/71); total (89/73) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.02e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
TCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAA > NC_000913/4476018‑4476211
|
cTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCAtt < 1:1735842/100‑1 (MQ=255)
tACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCAttt > 1:3854779/1‑100 (MQ=255)
tACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCAttt > 1:630842/1‑100 (MQ=255)
aCAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTa < 1:2799353/100‑1 (MQ=255)
aCAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTa < 1:2083298/100‑1 (MQ=255)
cAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTaa > 1:2450695/1‑100 (MQ=255)
aGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTaaa > 1:837541/1‑100 (MQ=255)
gAAATTAAATAATCTACAGCAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACCGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAAt > 2:3687899/1‑100 (MQ=38)
gAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAAt > 2:827478/1‑100 (MQ=255)
aTTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGAt < 2:193454/100‑1 (MQ=255)
tAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATtc > 1:1598737/1‑100 (MQ=255)
aataatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATtctc > 2:3445636/1‑100 (MQ=255)
aataatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATtctc > 2:1029479/1‑100 (MQ=255)
ataatCGACAGAAGTTAAATAAACTACTGAATGTAAATAATATACTTGTGTTAAATAATCCGCAAGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCa < 2:819937/100‑1 (MQ=255)
taatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAg < 1:2568096/100‑1 (MQ=255)
aatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAgg > 2:656278/1‑100 (MQ=255)
tCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAg < 2:1847892/100‑1 (MQ=255)
gcTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATATTATCCAGGGGTGAAATAATCCTCAGGAGTTATAGGATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAg < 2:243209/99‑1 (MQ=255)
cTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGt < 2:2709457/100‑1 (MQ=255)
tACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGtt > 1:599532/1‑100 (MQ=255)
tACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGtt > 2:930578/1‑100 (MQ=255)
cAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTaa > 1:3514824/1‑100 (MQ=255)
cAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTaa > 2:1448083/1‑100 (MQ=255)
cAGAAGTTAAATAATCTACCGAAGTTAAACAATATACAGGGGTGAAAAAATCCTATGGAGATAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTTAGGTGTTaa < 2:948800/100‑1 (MQ=25)
gAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTaaan < 1:2681371/100‑2 (MQ=255)
gTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAAc > 1:3974108/1‑100 (MQ=255)
ttAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACt > 1:901345/1‑100 (MQ=255)
aaaTAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCg < 2:3307980/100‑1 (MQ=255)
aaaTAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCg > 2:1229958/1‑100 (MQ=255)
ataatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCCTTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCgaa > 2:2516285/1‑98 (MQ=255)
ataatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCa < 1:1027146/100‑1 (MQ=255)
ataatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCa > 1:2514164/1‑100 (MQ=255)
taatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAg > 2:2094956/1‑100 (MQ=255)
aatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAgg < 1:2463570/100‑1 (MQ=255)
aatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAgg < 1:833625/100‑1 (MQ=255)
tACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAAtt > 2:44024/1‑100 (MQ=255)
tACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAAtt > 2:3927883/1‑100 (MQ=255)
aCTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTa > 1:3559518/1‑100 (MQ=255)
cTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaa > 2:336346/1‑100 (MQ=255)
tGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaaa > 2:3451802/1‑100 (MQ=255)
gAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt < 2:3674107/100‑1 (MQ=255)
gAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt > 2:1982111/1‑100 (MQ=255)
gAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt > 1:988201/1‑100 (MQ=255)
gAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCACAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt > 1:3350774/1‑100 (MQ=255)
aGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAg < 1:744825/100‑1 (MQ=255)
aGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAg < 1:1168143/100‑1 (MQ=255)
aGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAg > 1:3285568/1‑100 (MQ=255)
gTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGt > 1:2317301/1‑100 (MQ=255)
gTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGt > 1:413301/1‑100 (MQ=255)
gTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAAGTAAATAGt > 2:269416/1‑100 (MQ=255)
ttAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTc < 2:2927618/100‑1 (MQ=255)
tAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTcc < 1:1376565/100‑1 (MQ=255)
aataatATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCcac > 1:2933377/1‑100 (MQ=255)
taataTACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAg > 2:2389303/1‑100 (MQ=255)
atatACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGa > 1:1028117/1‑100 (MQ=255)
tataCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAg < 1:3555192/100‑1 (MQ=255)
tataCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAg < 2:2585819/100‑1 (MQ=255)
tataCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAg < 2:2859528/100‑1 (MQ=255)
ataCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGt < 1:425190/100‑1 (MQ=255)
taCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGtt > 1:1140550/1‑100 (MQ=255)
taCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGtt > 2:3311869/1‑100 (MQ=255)
cAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTaa > 1:919627/1‑100 (MQ=255)
cAGGGGTTAAATAATCCTCAAGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTaa < 1:1114592/100‑1 (MQ=255)
aGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTaaa < 1:1497086/100‑1 (MQ=255)
ggggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAAt > 1:1841449/1‑100 (MQ=255)
ggggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAAt > 1:3407358/1‑100 (MQ=255)
gggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATg < 2:32353/100‑1 (MQ=255)
gcgTTAACTCATCCTCCGGAGTTAAATAAATCGCAGCAATTACATGATTCTCAGGAGTTAAACAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGCTAAATg < 2:3391840/98‑1 (MQ=255)
ggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGa > 2:1806596/1‑100 (MQ=255)
ggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGa < 2:1755821/100‑1 (MQ=255)
ggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGa < 1:225111/100‑1 (MQ=255)
gTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTGAATGATTCCCAGAAGTTAAATAACTCAAAGGAATTTAATAGCCCACAGGACTTAAATGaa > 2:3072662/1‑99 (MQ=25)
ttAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGAtg > 1:4080891/1‑99 (MQ=255)
tAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATcc < 2:1376361/100‑1 (MQ=255)
tAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATcc < 2:870731/100‑1 (MQ=255)
tAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATcc < 1:1942386/100‑1 (MQ=255)
aaaTAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCg < 1:1659145/100‑1 (MQ=255)
aaaTAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCg > 2:679971/1‑100 (MQ=255)
aataatCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGc > 2:906733/1‑100 (MQ=255)
aatCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAgg < 1:318297/100‑1 (MQ=255)
atCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGa < 1:1661337/100‑1 (MQ=255)
tcctccGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAg < 2:3171241/100‑1 (MQ=255)
tCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAg < 1:1497909/100‑1 (MQ=255)
cTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGtt > 2:483145/1‑100 (MQ=255)
tCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTa < 2:2823938/100‑1 (MQ=255)
aGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaaa > 1:1676251/1‑100 (MQ=255)
aGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaaa < 2:3162514/100‑1 (MQ=255)
ggAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTNTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaaan < 2:3013976/100‑2 (MQ=255)
ggAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAaat < 1:3664407/100‑1 (MQ=255)
tAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCGACAGGAGTTATATGATCCGCAGGAGTTAAATAATtc > 2:3786117/1‑100 (MQ=255)
tAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATtc > 1:47216/1‑100 (MQ=255)
aaaTAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATtct > 2:1533301/1‑100 (MQ=255)
ataatCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCa < 2:910224/100‑1 (MQ=255)
taatCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAg < 2:1558266/100‑1 (MQ=255)
taatCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAg < 2:1808894/100‑1 (MQ=255)
aatCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAgg < 1:3229007/100‑1 (MQ=255)
cGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACtt > 2:1172638/1‑100 (MQ=255)
gcagcaTTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTa > 2:536405/1‑100 (MQ=255)
gcagcaTTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTa < 2:3527695/100‑1 (MQ=255)
cAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTaa > 2:3217202/1‑100 (MQ=255)
|
TCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAA > NC_000913/4476018‑4476211
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
