Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F412 I2 R1
|
70 |
105.0 |
5244496 |
94.3% |
4945559 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,174,146 |
C→T |
V417V (GTG→GTA) |
parE ← |
DNA topoisomerase IV, subunit B |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,174,146 | 0 | C | T | 98.4%
| 422.1
/ ‑2.5
| 126 | V417V (GTG→GTA) | parE | DNA topoisomerase IV, subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (66/56); total (68/58) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.01e-01 |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
CTTCCCAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCCACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGCACC > NC_000913/3174049‑3174239
|
ttCCCAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGTGGAGTCACCTTCtaca < 2:2517318/100‑1 (MQ=255)
tCCCAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACaa > 1:2565881/1‑100 (MQ=255)
cccAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAg > 1:625580/1‑100 (MQ=255)
cccAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAg < 1:1483567/100‑1 (MQ=255)
ccAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAgg < 2:1065253/100‑1 (MQ=255)
cAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGa < 2:62417/100‑1 (MQ=255)
cAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGa < 2:1368619/100‑1 (MQ=255)
gggtttAATGCTCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGCTCGCCCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACACGGAAc < 2:306625/96‑1 (MQ=255)
ggTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAAGAAc < 2:1766220/100‑1 (MQ=255)
gtgtTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACACGGcaca > 2:1187788/1‑100 (MQ=255)
gtgtTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACa > 2:914427/1‑100 (MQ=255)
tgtTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAg > 1:158635/1‑100 (MQ=255)
tAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTc > 1:1622699/1‑100 (MQ=255)
aaGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCg > 2:29667/1‑100 (MQ=255)
aaGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCg > 1:1834913/1‑100 (MQ=255)
ggATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGt > 1:1289858/1‑100 (MQ=255)
aTCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTAc < 1:1603631/100‑1 (MQ=255)
cTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACgg > 1:844727/1‑100 (MQ=255)
ttACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGt < 2:742318/100‑1 (MQ=255)
tACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGtt > 2:160260/1‑100 (MQ=255)
tACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATACGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGtt < 2:1706419/100‑1 (MQ=255)
ccTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTaa > 1:2634500/1‑100 (MQ=255)
ccTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTaa > 1:4201/1‑100 (MQ=255)
ccTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTaa > 1:1195978/1‑100 (MQ=255)
ccTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTaa > 1:2380200/1‑100 (MQ=255)
tttCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAgg > 2:1944499/1‑100 (MQ=255)
tttCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAgg > 1:207665/1‑100 (MQ=255)
tttCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAgg < 2:2224075/100‑1 (MQ=255)
tttCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCCCTCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGGACAGCTCGGTCCGGTTAAgg > 2:1649050/1‑100 (MQ=255)
tCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTc < 2:754936/100‑1 (MQ=255)
cAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTcc < 2:1174142/100‑1 (MQ=255)
aGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCt < 1:693523/100‑1 (MQ=255)
gTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTg > 2:2565006/1‑100 (MQ=255)
ggCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGGCTGGGGAGTCACCTTCGACAAGGAACAGCTCGGTACGGCTAGGGTCCTgcg > 1:1727930/1‑100 (MQ=255)
ggCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTgcg < 2:1686091/100‑1 (MQ=255)
gCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTgcgc < 1:847079/100‑1 (MQ=255)
gCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTgcgc > 1:656011/1‑100 (MQ=255)
gCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTgcgc < 1:165348/100‑1 (MQ=255)
cATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGcgcg > 1:1402766/1‑100 (MQ=255)
aTGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCgg < 2:958135/100‑1 (MQ=255)
aTGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCgg < 1:1540455/100‑1 (MQ=255)
tGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGt < 1:1032673/100‑1 (MQ=255)
tGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGt < 1:131725/100‑1 (MQ=255)
tGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGt < 1:155880/100‑1 (MQ=255)
tGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGt < 1:1791903/100‑1 (MQ=255)
tGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGt < 1:1983921/100‑1 (MQ=255)
tGATCGCCTGATATTCGCGACCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGt > 1:2060074/1‑100 (MQ=255)
gATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACCAGGACCCGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTa > 1:373659/1‑100 (MQ=255)
gATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTa < 2:1569447/100‑1 (MQ=255)
aTCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTAc < 2:1676477/100‑1 (MQ=255)
ccTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATc < 1:1484916/100‑1 (MQ=255)
tGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAg < 1:2579436/100‑1 (MQ=255)
tGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAg > 1:2154595/1‑100 (MQ=255)
tGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAg > 1:442869/1‑100 (MQ=255)
atatTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGcc < 1:933744/100‑1 (MQ=255)
tatTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCa > 1:2261204/1‑100 (MQ=255)
tatTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCa > 1:2323810/1‑100 (MQ=255)
atTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAg > 2:2574803/1‑100 (MQ=255)
atTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAg > 1:1489775/1‑100 (MQ=255)
ttCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGt > 1:1047250/1‑100 (MQ=255)
tCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGtt < 1:2268726/100‑1 (MQ=255)
tCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGtt > 1:2231599/1‑100 (MQ=255)
tCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGtt > 2:2582/1‑100 (MQ=255)
cgATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGc > 2:1939813/1‑100 (MQ=255)
cgATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGc > 1:776608/1‑100 (MQ=255)
gATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGcc > 2:2430371/1‑100 (MQ=255)
tCGCGTGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAg < 2:733445/100‑1 (MQ=255)
cgcgcCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCa < 2:1754109/100‑1 (MQ=255)
cTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGcc < 1:35170/100‑1 (MQ=255)
cTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCggg > 1:790109/1‑100 (MQ=255)
cTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCggg < 2:1040481/100‑1 (MQ=255)
tGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGcc < 2:1885365/100‑1 (MQ=255)
tGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGcc < 1:849355/100‑1 (MQ=255)
ggCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCg > 1:1734416/1‑100 (MQ=255)
gCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGc > 2:1863488/1‑100 (MQ=255)
cAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCt < 1:1770463/100‑1 (MQ=255)
cAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCt > 2:1359066/1‑100 (MQ=255)
gATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTgg < 1:547757/100‑1 (MQ=255)
gATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTgg > 2:517763/1‑100 (MQ=255)
gATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTgg > 2:1594361/1‑100 (MQ=255)
gATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTgg < 1:108102/100‑1 (MQ=255)
tCCGCCTGCGGAGTCACCTTCAACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGTTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCACCGCCGGGCCGCTGGTc < 2:1216006/100‑1 (MQ=255)
cGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAg > 2:378238/1‑100 (MQ=255)
cTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCtt > 1:1859030/1‑100 (MQ=255)
tGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCttt > 1:948083/1‑100 (MQ=255)
tGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCttt > 1:284135/1‑100 (MQ=255)
cGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCCGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCttttt > 2:1746982/1‑100 (MQ=255)
cGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCttttt < 1:1724834/100‑1 (MQ=255)
cGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCttttt < 1:157874/100‑1 (MQ=255)
cGGAGTCACCTTCCACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCttttt < 2:1398719/100‑1 (MQ=255)
gAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTAc < 1:2488906/100‑1 (MQ=255)
gTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGc > 1:2453996/1‑100 (MQ=255)
gTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGc < 2:2266972/100‑1 (MQ=255)
gTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGc < 1:336844/100‑1 (MQ=255)
gTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGc > 1:845975/1‑100 (MQ=255)
gTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGc < 1:162651/100‑1 (MQ=255)
gTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGATACAATCAGCCAGTTAGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGc > 2:578299/1‑100 (MQ=255)
cACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGcac < 1:584761/100‑1 (MQ=255)
cACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGcac > 2:908312/1‑100 (MQ=255)
aCCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGcacc > 2:302997/1‑100 (MQ=255)
|
CTTCCCAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCCACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGCACC > NC_000913/3174049‑3174239
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
