GLU: BOP27-M9-NC_000913_3gb-log-37-Glucose2-NH4Cl1-KH2PO43-MgSO4024-O2
Stats |
Metadata |
Mutations |
Converged Mutations |
Fixed Mutations |
Filter
Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A7 F236 I1 R1 | 155 | 93.2 | 2393300 | 97.8% | 2340647 | 180.9 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,616,561 | T→G | V127G (GTT→GGT) | nikC → | nickel ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,616,561 | 0 | T | G | 100.0% | 186.7 / NA | 51 | V127G (GTT→GGT) | nikC | nickel ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (17/34); total (17/34) | |||||||||||
TGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGAT > NC_000913/3616328‑3616792 | tGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGc < 1:706048/238‑1 (MQ=255) ccGATCCCGTAGGTCGCGGTATTTTCGCGCGGCTGATGGCAGCGGCCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGAcc < 2:666338/239‑1 (MQ=255) gcgATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGGTGATCAGGCCACCCTGCGGGCCGCCGCGATGTTTATTACCCTCCCGCACCCGGTTCTGTCGGTCTTTATGGGGTGCGTGCGCGGGACCCGGCCGGCCCACgctaatattgc > 2:32108/1‑228 (MQ=255) ttttCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTatcgccatcgcc < 2:1018411/239‑1 (MQ=255) cgcgGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGGGCGTTGATCAAGGCACCCTGCGCGCCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTTTGTCGTTCTTTTTGGGTGGGGGGCTCGGCACCGGGCTGACCCACGCAAATtttgccatcgc > 2:756504/1‑232 (MQ=255) 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1:756504/238‑1 (MQ=255) gATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTggg < 1:139285/239‑1 (MQ=255) aTGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGc < 1:290453/183‑1 (MQ=255) cggcgTGTCGC‑CGGGTCGGGAAGGGGCGTGCTGCTTCGTGTGCTGACATTAGGGTTGGTTATTGGCGGCAGGGCTGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGACCACCTTGCGCGGCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCAc < 2:900623/236‑1 (MQ=255) 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aaTGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGa < 2:244116/239‑1 (MQ=255) ggCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGAttt < 1:32108/239‑1 (MQ=255) cctgcTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGGTGATCCGGCCACCCTGCGCGGCGCCGAGATGTTTATGACCTTCCCCACCTCGATTCTGGCGCTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAAAGTAATTATCGCCCTCGCCCCGTTGCACTGGGCGGGGGATGCACCCCTGGTGCGCAGCCTCGTGGttttccta > 2:809853/1‑233 (MQ=255) 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tGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGGTGATCAGGCCCCCCTGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCCTCCCGACCTCGGTTCTGTCGGTCTTTATGGGGGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCCACGTAATTATCGCCCTCGCCCTGTCGCCCTGGGCGTGGGATGCACGCCTGGTGCGCCGCCTGGGGATTTCACTACCCCAACGCGAGCTTGTGCTGGGGTc > 2:883948/1‑238 (MQ=255) gTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGc < 2:433861/114‑1 (MQ=255) gTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGc > 1:433861/1‑114 (MQ=255) gcCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTg < 1:69500/235‑1 (MQ=255) ccGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGCCCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCggg < 2:878971/238‑1 (MQ=255) ggggTTGATTGGCGGGCGTGTTGATCGGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGcc < 1:809853/238‑1 (MQ=255) gggTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTTTGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGa > 2:904832/1‑115 (MQ=255) gggTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGa < 1:904832/115‑1 (MQ=255) gATTGGGGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCTATATGGTTATGGCCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCAtgtg < 1:867863/238‑1 (MQ=255) gggcgCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGgtgt < 1:603609/238‑1 (MQ=255) tGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTATGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCATGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGat < 1:962777/238‑1 (MQ=255) 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tCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCa > 2:560555/1‑239 (MQ=255) tCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCa > 2:646800/1‑239 (MQ=255) tCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCa > 1:203891/1‑239 (MQ=255) 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tCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCa > 2:1093616/1‑239 (MQ=255) tCGTTCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCa > 2:1040181/1‑239 (MQ=255) ttCTTTATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGAc < 1:189685/35‑1 (MQ=255) ttATGGGTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATatgat > 2:56025/1‑238 (MQ=255) | TGCGCAGCACTGGCTGGGCACCGATCACTTAGGTCGCGATATTTTCTCGCGGCTGATGGCAGCGACCCGCGTGTCGCTCGGTTCGGTAATGGCCTGCCTGCTGCTGGTGCTGACATTAGGGCTGGTTATTGGCGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTTCGCTGCTGGTGCTGGCAACGCTGGATATCGGCCATATGAT > NC_000913/3616328‑3616792 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |