Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A16 F48 I0 R1
|
252 |
171.1 |
8397611 |
93.1% |
7818175 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,078,996 |
G→T |
100% |
intergenic (+558/‑301) |
yiiD → / → yiiE |
GNAT family putative N‑acetyltransferase/CopG family putative transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,078,996 | 0 | G | T | 98.7%
| 528.5
/ ‑2.0
| 155 | intergenic (+558/‑301) | yiiD/yiiE | GNAT family putative N‑acetyltransferase/CopG family putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base T (71/81); total (72/83) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
TAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATAT > NC_000913/4078901‑4079091
|
tAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTa < 1:1885329/100‑1 (MQ=255)
aGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATAttca < 1:2847124/100‑3 (MQ=255)
aGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTaa < 1:272069/100‑1 (MQ=255)
aGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTaa > 1:407241/1‑100 (MQ=255)
aaaaCAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAAttt > 1:3142939/1‑100 (MQ=255)
aaaCAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTc > 1:2632972/1‑100 (MQ=255)
acaacTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCAc > 1:4036461/1‑100 (MQ=255)
caacTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCAcc < 1:1567770/100‑1 (MQ=255)
cTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTa > 2:1770973/1‑100 (MQ=255)
cTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTa < 2:1176005/100‑1 (MQ=255)
tCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAAt < 2:2771921/100‑1 (MQ=255)
ccGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATcc > 1:1731442/1‑100 (MQ=255)
cGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCt > 1:1627144/1‑100 (MQ=255)
aaCTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTgg < 2:4022440/100‑1 (MQ=255)
aaCTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGCTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTgg < 2:346871/100‑1 (MQ=255)
cTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTg > 2:674998/1‑100 (MQ=255)
tGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGc < 1:1860772/100‑1 (MQ=255)
gTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCt > 1:1116968/1‑100 (MQ=255)
gTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCt > 1:494812/1‑100 (MQ=255)
gTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCt > 1:1739714/1‑100 (MQ=255)
tACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGt > 2:2790115/1‑100 (MQ=255)
aCCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTAATGAAGTATTAATTGCACCTTAAATCCTGGTGCTGtt > 2:2828610/1‑100 (MQ=255)
ccAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTa > 1:3994686/1‑100 (MQ=255)
ccAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTa < 2:2611742/100‑1 (MQ=255)
ccAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTa < 1:2281664/100‑1 (MQ=255)
caacaaAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAg > 1:3488292/1‑100 (MQ=255)
aacaaAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTggagatcgga > 2:3993201/1‑90 (MQ=255)
aacaaAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAgg > 2:2404437/1‑100 (MQ=255)
caaAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGAt > 1:1678114/1‑100 (MQ=255)
aaaaTTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATg < 1:2684908/100‑1 (MQ=255)
aaaaTTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATg > 1:3199968/1‑100 (MQ=255)
aaTTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCt < 2:3022024/100‑1 (MQ=255)
aTTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTg < 1:1545986/100‑1 (MQ=255)
ataACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACg < 2:3649881/100‑1 (MQ=255)
ataACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATGAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACg > 2:2947206/1‑100 (MQ=255)
taACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGt > 2:574301/1‑100 (MQ=255)
taACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGt < 1:195307/100‑1 (MQ=255)
aCGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGttt < 1:1372009/100‑1 (MQ=255)
aCGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGttt > 2:715206/1‑100 (MQ=255)
cGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTCATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACg > 2:3183801/1‑96 (MQ=255)
cGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGtttt < 2:1145087/100‑1 (MQ=255)
cGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGtttt > 2:1579420/1‑100 (MQ=255)
gagtatgTAAATACTGGGTGGTGGCTGTATTTACTGGTCTGTGATGAAATATTAATTTTACCTTAGTTCCTGTTGTTTTTAGGATGCTGACGtttt < 2:2657990/90‑1 (MQ=255)
gAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCgg < 2:1010491/100‑1 (MQ=255)
aGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGc < 2:3339631/100‑1 (MQ=255)
gCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCt < 1:2350217/100‑1 (MQ=255)
gCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCt > 2:180603/1‑100 (MQ=255)
gCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGACTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCt > 2:3338004/1‑100 (MQ=255)
cAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTa < 1:359411/100‑1 (MQ=255)
cAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTa > 2:3049351/1‑100 (MQ=255)
cAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTa < 1:3324660/100‑1 (MQ=255)
cAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGGCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTCGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTa < 1:6646/100‑1 (MQ=255)
aaGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTac > 1:1399053/1‑100 (MQ=255)
aGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTaca < 1:574302/100‑1 (MQ=255)
aGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTaca > 1:3695892/1‑100 (MQ=255)
gTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTacac < 1:4104230/100‑1 (MQ=255)
gTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTacac < 1:3909921/100‑1 (MQ=255)
tAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACAcc > 1:2208902/1‑100 (MQ=255)
tAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTAAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTaccc > 2:2681673/1‑97 (MQ=255)
aCCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTc > 2:3477247/1‑99 (MQ=255)
aCCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCa > 1:1458805/1‑100 (MQ=255)
aCCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCa < 1:2488076/100‑1 (MQ=255)
ccGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAg < 2:1514697/100‑1 (MQ=255)
ccGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAg > 2:3915200/1‑100 (MQ=255)
cGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGa < 2:3277309/100‑1 (MQ=255)
cGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGa < 1:1604524/100‑1 (MQ=255)
ggTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGAt < 1:3818406/100‑1 (MQ=255)
ggTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGAt < 1:3048820/100‑1 (MQ=255)
gTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGAtt < 1:674999/100‑1 (MQ=255)
gTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGAtt < 1:2751810/100‑1 (MQ=255)
gTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGAt < 1:4089122/99‑1 (MQ=255)
ggtggCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATg < 1:1453903/100‑1 (MQ=255)
ggtggCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATg > 2:2969320/1‑100 (MQ=255)
gtggCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTAt > 1:796246/1‑98 (MQ=255)
tggCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCa < 1:2249520/100‑1 (MQ=255)
gCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCaaa > 2:2076439/1‑100 (MQ=255)
cAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCaaat < 1:2336356/100‑1 (MQ=255)
aGTACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCaaata < 1:2486197/100‑1 (MQ=255)
tACTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCaaataaa < 2:3199954/100‑1 (MQ=255)
aCTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCaaataaat > 1:2967165/1‑100 (MQ=255)
ctgaaaggTCAGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTAACGTTTTTCGTCTACACCATTCAGATTATGCaaacaaat < 2:3969573/93‑1 (MQ=255)
cTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAaataaata > 2:2719443/1‑100 (MQ=255)
cTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAaataaata < 1:694447/100‑1 (MQ=255)
cTGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAaataaata > 1:3002362/1‑100 (MQ=255)
tGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAatat > 1:2265112/1‑100 (MQ=255)
tGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAatat > 2:1423562/1‑100 (MQ=255)
tGACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAatat < 1:2016453/100‑1 (MQ=255)
gACCGGTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATAtc > 2:162486/1‑100 (MQ=255)
ggTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTg < 1:1319400/100‑1 (MQ=255)
ggTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTg < 2:1286614/100‑1 (MQ=255)
ggTCTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTg < 1:2176558/100‑1 (MQ=255)
cTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGaat > 2:2125110/1‑100 (MQ=255)
cTGTGATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGaat < 1:3492118/100‑1 (MQ=255)
gtgATGAAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGaatat > 2:783489/1‑100 (MQ=255)
tgatgaAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGaatata < 1:3701660/100‑1 (MQ=255)
tgaAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGaatataata < 2:529375/100‑1 (MQ=255)
tgaAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGaatataat < 1:888130/99‑1 (MQ=255)
gaAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGaatataatat > 2:3184643/1‑100 (MQ=255)
gaAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGaatataatat < 2:165622/100‑1 (MQ=255)
gaAATATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGaatataatat > 1:416366/1‑100 (MQ=255)
|
TAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATAT > NC_000913/4078901‑4079091
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
