Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F78 I0 R1
|
34 |
149.3 |
7471746 |
92.4% |
6903893 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
755,832 |
Δ2 bp |
100% |
coding (273‑274/348 nt) |
sdhD → |
succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 755,832 | 0 | G | . | 92.3%
| 492.3
/ 30.4
| 117 | coding (273/348 nt) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/4); new base . (46/62); total (51/66) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.24e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | NC_000913 | 755,833 | 0 | A | . | 93.2%
| 479.2
/ 24.0
| 117 | coding (274/348 nt) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/3); new base . (46/63); total (51/66) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.89e-01 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAG > NC_000913/755740‑755923
||
cccTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAAc > 2:3329541/1‑100 (MQ=255)
cccTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAAc > 1:3310977/1‑100 (MQ=255)
tgctgGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTgg < 1:635823/100‑1 (MQ=255)
gctgGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGt < 1:3052533/100‑1 (MQ=255)
tgGCGCTGTTTTCTATCTTGTTCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTgg > 1:226075/1‑99 (MQ=255)
tgGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGa > 1:691755/1‑100 (MQ=255)
ggCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGa > 1:1683774/1‑99 (MQ=255)
ggCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCACGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGAt < 1:2033716/100‑1 (MQ=255)
cgcTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTg < 1:3255983/100‑1 (MQ=255)
gcTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGt < 1:1243837/100‑1 (MQ=255)
tGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGATTTGCGC‑‑GTTGCTGCAACTGGTGATTGTCg > 1:896424/1‑100 (MQ=255)
gTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGt > 1:1515161/1‑100 (MQ=255)
gTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGt < 2:823166/100‑1 (MQ=255)
tttCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTg < 1:1251744/100‑1 (MQ=255)
cTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCAc > 2:3611263/1‑100 (MQ=255)
tATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACt > 2:3642490/1‑100 (MQ=255)
tATCTTGATCCATGCCTGGATCGGAATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAACCCGCTGGCTTTGCGACT‑‑TCCTGCAACTGGAGATTGTCGTTgacct > 1:3273173/1‑96 (MQ=255)
aTCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtg > 1:3020934/1‑100 (MQ=255)
aTCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtg > 2:2821366/1‑100 (MQ=255)
tCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtgg > 1:1183519/1‑100 (MQ=255)
cTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtggt < 2:3075617/100‑1 (MQ=255)
ttGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtggtg > 2:935103/1‑100 (MQ=255)
ttGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtggt > 1:716606/1‑99 (MQ=255)
gATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTggtggt > 1:2080588/1‑100 (MQ=255)
gATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTggtggt > 2:1302250/1‑100 (MQ=255)
gATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTggtggt < 2:1383365/100‑1 (MQ=255)
aTCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGtt < 2:292969/100‑1 (MQ=255)
cATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTCCGTTAAACCGCTGGCTTTGCG‑‑TCCTGCTGCACCTGCTGATTGTCGTTGCACTGGTGGttttc > 2:3722446/1‑98 (MQ=255)
cATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGttt > 2:1026455/1‑100 (MQ=255)
tGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGt < 2:1520090/100‑1 (MQ=255)
gCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTg < 2:3181014/100‑1 (MQ=255)
gCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTg < 1:3721003/100‑1 (MQ=255)
ccTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGATTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGCTGCACTGGTGGTTTACGTGa < 1:2290331/100‑1 (MQ=255)
ccTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGa > 2:351224/1‑100 (MQ=255)
ccTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGa > 2:280501/1‑100 (MQ=255)
cTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGAt > 2:974205/1‑100 (MQ=255)
ggATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGAttt < 2:1462340/100‑1 (MQ=255)
gATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCC‑G‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTa < 2:3264052/100‑1 (MQ=255)
aTCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGGCT‑‑TGCTGCAGCTGGAGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTAGGTGActtg > 1:2935445/1‑98 (MQ=255)
aTCGGCATGTGGCAGGTGTTCACCCACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGGGATTGTCGTGGCACCGGTGGTTTACGTGATTTAt > 1:443730/1‑100 (MQ=255)
tCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATg < 1:1479274/100‑1 (MQ=255)
tCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATg < 1:3288669/100‑1 (MQ=255)
tCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATg < 2:81162/100‑1 (MQ=255)
tCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATg < 1:1478497/100‑1 (MQ=255)
cGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTAt < 2:2959102/100‑1 (MQ=255)
cGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATg < 1:1169104/99‑1 (MQ=255)
ggCATGTGGCAGGGGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATgg < 1:2725502/99‑1 (MQ=255)
gCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATg > 1:1238381/1‑97 (MQ=255)
gCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGAt < 2:2409010/100‑1 (MQ=255)
cATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTAAGGAtt > 1:1534420/1‑100 (MQ=255)
tgtgGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCg > 1:2923379/1‑100 (MQ=255)
ggCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtg < 2:702514/100‑1 (MQ=255)
ggCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtg > 2:1744637/1‑100 (MQ=255)
cAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtg < 2:1067996/100‑1 (MQ=255)
cAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtg < 2:2080598/100‑1 (MQ=255)
cAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgt > 1:2860660/1‑99 (MQ=255)
cAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATCTATGGATTCGTtgtg > 2:2998879/1‑100 (MQ=255)
aGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtgg < 1:572204/100‑1 (MQ=255)
aGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtgg < 1:1964748/100‑1 (MQ=255)
aGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtgg < 2:2716316/100‑1 (MQ=255)
aGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtgg < 1:457684/100‑1 (MQ=255)
aGGGGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtgg < 2:3304148/100‑1 (MQ=255)
ggTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggt < 2:3020956/100‑1 (MQ=255)
ggTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtgg < 1:2016643/99‑1 (MQ=255)
gtTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgtg < 2:1591944/100‑1 (MQ=255)
ttGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgtgg < 2:1258771/100‑1 (MQ=255)
gACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTgggg < 1:1062058/100‑1 (MQ=255)
gACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTgggg < 1:1519577/100‑1 (MQ=255)
gACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTgggg < 1:1744630/100‑1 (MQ=255)
aCCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgt < 2:3521671/100‑1 (MQ=255)
ccGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtg < 2:318516/100‑1 (MQ=255)
ccGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtg < 2:716609/100‑1 (MQ=255)
ccGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtg < 2:527183/100‑1 (MQ=255)
ccGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtg > 1:1711845/1‑100 (MQ=255)
ccGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtg > 2:2249323/1‑100 (MQ=255)
gACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtgtg < 2:2054599/100‑1 (MQ=255)
aCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TTCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATTGATTCGTTGTGGTGTGGGgtgtgt < 1:612487/100‑1 (MQ=255)
aCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtgtgt < 2:2472741/100‑1 (MQ=255)
cTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGtgtgtg > 2:2311570/1‑100 (MQ=255)
aCGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgat > 1:3459729/1‑100 (MQ=255)
aCGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgat > 2:1744269/1‑100 (MQ=255)
gTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgatga > 2:2706182/1‑100 (MQ=255)
ttAAACCGCTGGCGTTGCGCCT‑‑TTCTGCAACTGGTTCTTGTCGTTGGACTGGTGAGTTACGTGATTTATGGCTCCGGTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGaa > 1:538118/1‑100 (MQ=255)
aaaCCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAAt > 1:3697966/1‑100 (MQ=255)
aCCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTg < 2:3311000/100‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTg < 1:3571774/100‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTg > 1:246878/1‑100 (MQ=255)
aCCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTg > 1:3416650/1‑100 (MQ=255)
ccGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGc > 2:3100795/1‑100 (MQ=255)
cGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGcc < 2:1893819/100‑1 (MQ=255)
cGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGcc < 2:602534/100‑1 (MQ=255)
cGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGcc < 1:1570201/100‑1 (MQ=255)
cGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGcc < 1:2212789/100‑1 (MQ=255)
cTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGGAACTGGTGATTTTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAg < 1:376810/100‑1 (MQ=255)
cTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAg < 2:932262/100‑1 (MQ=255)
cTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGGGTGTGATGAAATTGCCAg > 1:914628/1‑100 (MQ=255)
ggCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTc < 1:1793117/100‑1 (MQ=255)
ggCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTACGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTc > 2:269162/1‑100 (MQ=255)
tttGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCag < 1:830701/99‑1 (MQ=255)
ttGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCag < 2:3540212/100‑1 (MQ=255)
||
ACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAG > NC_000913/755740‑755923
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
