Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F78 I1 R1
|
17 |
139.3 |
7053113 |
93.9% |
6622873 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
755,832 |
Δ2 bp |
coding (273‑274/348 nt) |
sdhD → |
succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 755,832 | 0 | G | . | 99.2%
| 619.1
/ ‑1.8
| 129 | coding (273/348 nt) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base . (70/58); total (70/59) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 |
| * | NC_000913 | 755,833 | 0 | A | . | 99.2%
| 615.4
/ ‑2.0
| 129 | coding (274/348 nt) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base . (70/58); total (70/59) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
ACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGA > NC_000913/755740‑755924
||
aCCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCaa > 1:2448056/1‑100 (MQ=255)
ctgGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTg < 1:2790815/100‑1 (MQ=255)
ctgGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTg > 1:1317176/1‑100 (MQ=255)
tgGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGa < 1:479608/100‑1 (MQ=255)
tgGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGa < 2:1430044/100‑1 (MQ=255)
ggCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGAt < 1:2682441/100‑1 (MQ=255)
ggCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGAt > 1:871379/1‑100 (MQ=255)
ggCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGAt > 2:1079471/1‑100 (MQ=255)
cgcTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTg > 1:1065138/1‑100 (MQ=255)
cgcTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTg > 2:162149/1‑100 (MQ=255)
cgcTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTg > 2:302466/1‑100 (MQ=255)
gcTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGt > 1:3198981/1‑100 (MQ=255)
cTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTc > 2:3408996/1‑100 (MQ=255)
tGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGATCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCg < 1:2436957/100‑1 (MQ=255)
tGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCg > 2:2105940/1‑100 (MQ=255)
tGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCg > 2:3210980/1‑100 (MQ=255)
gTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGt > 2:1636282/1‑100 (MQ=255)
gTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGt > 1:3504587/1‑100 (MQ=255)
tttCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTg < 1:3287167/100‑1 (MQ=255)
tttCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTg < 2:824419/100‑1 (MQ=255)
tccgatctttGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTg < 1:2519922/92‑1 (MQ=255)
ttCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGc < 2:1977037/100‑1 (MQ=255)
tCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCa < 1:29778/100‑1 (MQ=255)
cTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCa > 1:2866760/1‑99 (MQ=255)
cTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCAc < 1:1764527/100‑1 (MQ=255)
aTCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtg > 2:2856214/1‑100 (MQ=255)
aTCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtg > 1:3107081/1‑100 (MQ=255)
tattGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtgg > 1:719063/3‑100 (MQ=255)
tCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGTGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtgg > 1:1856218/1‑100 (MQ=255)
tCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtgg < 2:2448072/100‑1 (MQ=255)
ttGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTgagatcgga > 2:2519939/1‑92 (MQ=255)
ttGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtggtg < 2:383311/100‑1 (MQ=255)
tCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGttt > 1:93345/1‑100 (MQ=255)
tCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGttt < 2:3199002/100‑1 (MQ=255)
tCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGttt > 1:1068581/1‑100 (MQ=255)
gatctccTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTa < 1:3013969/95‑1 (MQ=255)
ccATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTa > 1:503630/1‑100 (MQ=255)
ccATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTa < 2:1233587/100‑1 (MQ=255)
cATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTa > 2:3399098/1‑99 (MQ=255)
cATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTAc > 1:3331175/1‑100 (MQ=255)
cATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTAc < 2:513593/100‑1 (MQ=255)
cATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTAc > 2:3234864/1‑100 (MQ=255)
tGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGt < 1:1660123/100‑1 (MQ=255)
tGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TACTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGt < 1:1847598/100‑1 (MQ=255)
gCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTg < 1:2798465/100‑1 (MQ=255)
ccTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGa > 1:3363175/1‑100 (MQ=255)
ggATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGAttt < 1:2203288/100‑1 (MQ=255)
aTCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTAt > 1:1538462/1‑100 (MQ=255)
tCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATg < 1:831390/100‑1 (MQ=255)
cGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATgg < 1:2274160/100‑1 (MQ=255)
ggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGa < 2:2862915/100‑1 (MQ=255)
ggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTGTACGTGATTTATGGa > 2:3472219/1‑100 (MQ=255)
cATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGAtt > 1:1045929/1‑100 (MQ=255)
cATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGAtt > 1:1993388/1‑100 (MQ=255)
cATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGAtt > 2:406855/1‑100 (MQ=255)
tgtgGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCCCTGGTGGTTTACGTGATTTATGGTTTCg > 1:3498227/1‑100 (MQ=255)
tgtgGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCg < 1:758865/100‑1 (MQ=255)
gtgGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGt < 2:2995649/100‑1 (MQ=255)
gtgGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGt < 2:3470884/100‑1 (MQ=255)
ggCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtg > 2:1280482/1‑100 (MQ=255)
ggCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtg < 2:361159/100‑1 (MQ=255)
cAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtg < 2:2067011/100‑1 (MQ=255)
aGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtgg < 2:138408/100‑1 (MQ=255)
ggTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggt < 1:1079467/100‑1 (MQ=255)
ggTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggt > 2:1492511/1‑100 (MQ=255)
gtgtTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtg < 2:2668581/100‑1 (MQ=255)
tgtTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgt < 1:2665931/100‑1 (MQ=255)
tgtTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgt > 1:626478/1‑100 (MQ=255)
tgtTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgt > 1:626634/1‑100 (MQ=255)
tgtTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgt > 2:3041615/1‑100 (MQ=255)
gtTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGACTCGTtgtggt > 1:1413995/1‑97 (MQ=255)
tGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTggg > 1:2330700/1‑100 (MQ=255)
tGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTggg > 2:3390214/1‑100 (MQ=255)
gACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTgggg < 2:3043815/100‑1 (MQ=255)
gACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTgggg < 1:2710845/100‑1 (MQ=255)
gACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTgggg < 1:3408973/100‑1 (MQ=255)
gACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTgggg > 1:406273/1‑100 (MQ=255)
ccGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTgggg > 2:1072622/1‑98 (MQ=255)
cGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtgt > 2:2339330/1‑100 (MQ=255)
gACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtgtg < 2:2585876/100‑1 (MQ=255)
aCTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgtgtgt > 1:2334376/1‑100 (MQ=255)
cTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGtgtgtg > 1:2622545/1‑100 (MQ=255)
aCGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgat > 1:985225/1‑100 (MQ=255)
aCGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgat > 1:1647018/1‑100 (MQ=255)
aCGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgat < 1:497169/100‑1 (MQ=255)
cGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgatg > 2:2998465/1‑100 (MQ=255)
cGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCAT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgatg > 1:2047463/1‑100 (MQ=255)
gTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGtgatga > 2:365024/1‑100 (MQ=255)
tAAACCGCTTGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGGACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGaaa < 1:832731/100‑1 (MQ=255)
aaCCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAAtt > 2:2683572/1‑100 (MQ=255)
aCCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTg < 2:2047478/100‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTg < 2:406274/100‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTg < 2:760168/99‑1 (MQ=255)
cGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGcc < 1:1616540/100‑1 (MQ=255)
cGCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGcc < 2:2650929/100‑1 (MQ=255)
gCTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCa > 2:3306991/1‑100 (MQ=255)
cTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAg < 2:2245274/100‑1 (MQ=255)
cTGGCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAg < 2:218779/100‑1 (MQ=255)
ggCTTTGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTc < 1:1838995/100‑1 (MQ=255)
tttGCGCCT‑‑TGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCaga < 1:2085629/100‑1 (MQ=255)
||
ACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGA > NC_000913/755740‑755924
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
