Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F70 I1 R1
|
13 |
113.0 |
5677813 |
94.3% |
5354177 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,187,550 |
C→T |
A734V (GCG→GTG) |
rpoC → |
RNA polymerase, beta prime subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,187,550 | 0 | C | T | 99.1%
| 387.1
/ ‑5.3
| 112 | A734V (GCG→GTG) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (53/57); total (54/58) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
AAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGA > NC_000913/4187454‑4187643
|
aaaCTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGc > 1:865997/1‑100 (MQ=255)
aaaCTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGc < 1:434170/100‑1 (MQ=255)
aCTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGcac < 2:202593/100‑1 (MQ=255)
cTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGcaca > 2:1008668/1‑100 (MQ=255)
cTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGcaca > 2:759815/1‑100 (MQ=255)
cTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGcaca < 2:2263880/100‑1 (MQ=255)
cTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGcaca > 1:2263054/1‑100 (MQ=255)
tGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAg > 2:773182/1‑100 (MQ=255)
aaCCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGAt > 1:665269/1‑99 (MQ=255)
ccGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGGGTGGTTCTGTGGCACAGATTCg < 2:1644126/100‑1 (MQ=255)
gTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTc < 2:1509837/100‑1 (MQ=255)
gTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTc < 2:2237117/100‑1 (MQ=255)
gTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGt > 2:926299/1‑99 (MQ=255)
tGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCa < 1:1562586/100‑1 (MQ=255)
aTTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGc < 1:1281133/100‑1 (MQ=255)
aTTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGc > 2:2510897/1‑100 (MQ=255)
aaCCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTg > 2:1763117/1‑100 (MQ=255)
aaCCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTg > 2:737497/1‑100 (MQ=255)
ccGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCt < 2:2802740/100‑1 (MQ=255)
ccGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCt > 1:360763/1‑100 (MQ=255)
gACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTa < 2:919143/100‑1 (MQ=255)
cGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATg < 1:1421790/100‑1 (MQ=255)
gTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTTCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGcn < 2:602083/100‑2 (MQ=255)
gTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCg < 2:2038642/100‑1 (MQ=255)
gTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCg < 2:2302418/100‑1 (MQ=255)
ggAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGt > 2:2193136/1‑100 (MQ=255)
ggAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGt > 2:537413/1‑100 (MQ=255)
ggAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGt > 1:2383896/1‑100 (MQ=255)
gAAGAGAAGCAGGTTTCCTTAAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTc > 2:1735526/1‑100 (MQ=255)
aaGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCt > 2:1231535/1‑100 (MQ=255)
aaGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCt < 1:773186/100‑1 (MQ=255)
agagAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTg < 2:670151/100‑1 (MQ=255)
gaAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATTTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATg < 1:771472/100‑1 (MQ=255)
gaAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATg > 2:1981433/1‑100 (MQ=255)
gaAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATg > 1:1934272/1‑100 (MQ=255)
gaAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATg > 2:239867/1‑100 (MQ=255)
aGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATgg > 2:565599/1‑99 (MQ=255)
aGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGc > 2:571366/1‑100 (MQ=255)
aGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGc > 2:565551/1‑100 (MQ=255)
aGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGc > 2:1346594/1‑100 (MQ=255)
aGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCAGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGc > 2:1554113/1‑100 (MQ=255)
aGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGGCTTCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGaa < 1:820310/100‑1 (MQ=255)
ttCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCg < 1:1928087/100‑1 (MQ=255)
ccTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGa < 1:2052641/100‑1 (MQ=255)
acTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCgag > 1:1493513/2‑98 (MQ=255)
cTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGAt < 1:2767708/100‑1 (MQ=255)
cTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGAt > 1:2110946/1‑100 (MQ=255)
ttCAACAGCATCTACATGTTGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGAt < 1:759819/99‑1 (MQ=255)
ttCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATg < 1:348626/100‑1 (MQ=255)
ttCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATg < 1:1573165/100‑1 (MQ=255)
tCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATgg > 2:2487800/1‑100 (MQ=255)
tCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATg < 2:2399450/99‑1 (MQ=255)
cAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGc > 2:2462570/1‑100 (MQ=255)
aaCAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCt < 2:2727280/100‑1 (MQ=255)
aCAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCTCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTc < 2:2473934/100‑1 (MQ=255)
aCAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTc < 1:2462584/100‑1 (MQ=255)
cAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTcc < 1:1981442/100‑1 (MQ=255)
cATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCcatc < 1:217962/100‑1 (MQ=255)
cATCTACATGAAGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTAGGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCcatc > 2:1485906/1‑100 (MQ=255)
aTCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCcatca < 1:1079307/100‑1 (MQ=255)
aTCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGATTCTGAGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCcatca < 2:1903728/100‑1 (MQ=255)
cTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCatcatc < 1:1107724/100‑1 (MQ=255)
cTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCatcatc < 1:215671/100‑1 (MQ=255)
cTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCatcatc > 2:2694271/1‑100 (MQ=255)
tACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCg > 1:2295545/1‑100 (MQ=255)
tACATGATGGCCGACCCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCg > 2:1240662/1‑100 (MQ=255)
aCATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGa < 1:1500915/100‑1 (MQ=255)
aCATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGa > 2:2261719/1‑100 (MQ=255)
cATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGaa > 2:369647/1‑100 (MQ=255)
atgatgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGaaa > 1:1645620/1‑100 (MQ=255)
atgatgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGaaa < 1:2777076/100‑1 (MQ=255)
tgatgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAAc > 2:2048898/1‑100 (MQ=255)
tgatgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAAc < 1:803276/100‑1 (MQ=255)
tgatgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAAc > 1:1060600/1‑100 (MQ=255)
gatgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCTAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACg < 2:1180869/100‑1 (MQ=255)
gatgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACg > 2:1342656/1‑100 (MQ=255)
gatgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACg < 1:2148298/100‑1 (MQ=255)
tgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGcc < 2:74237/100‑1 (MQ=255)
tgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGcc < 2:665265/100‑1 (MQ=255)
ggCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCa > 2:2134009/1‑100 (MQ=255)
gACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCa > 1:579475/1‑100 (MQ=255)
gACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCa < 1:1531338/100‑1 (MQ=255)
aCTCCGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCa < 2:1273825/99‑1 (MQ=255)
ccGGTGCGCGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACcgc > 1:2251699/1‑100 (MQ=255)
gatGCGCGTGGTTATGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGa > 1:1907376/3‑100 (MQ=255)
gcgcGTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACt > 2:2149137/1‑100 (MQ=255)
gcgTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTc < 1:2657431/100‑1 (MQ=255)
cgTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTcc > 1:387164/1‑100 (MQ=255)
gTGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCg < 1:2048908/100‑1 (MQ=255)
tGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCCCCGCGAACTTCCGt > 1:1140839/1‑100 (MQ=255)
tGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGt < 1:1973087/100‑1 (MQ=255)
tGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGt < 1:1562021/100‑1 (MQ=255)
tGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGt < 1:1556253/100‑1 (MQ=255)
tGGTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGt < 1:1554121/100‑1 (MQ=255)
ggTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTg < 1:16195/100‑1 (MQ=255)
ggTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTg < 1:2021838/100‑1 (MQ=255)
ggTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTg < 2:1007122/100‑1 (MQ=255)
ggTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTg > 2:1939068/1‑100 (MQ=255)
gTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGa > 1:73818/1‑100 (MQ=255)
gTTCTGTGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGa > 1:1082813/1‑100 (MQ=255)
|
AAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGA > NC_000913/4187454‑4187643
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
