Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F181 I1 R1
|
66 |
119.2 |
5981814 |
94.9% |
5676741 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,101,728 |
(G)7→8 |
coding (39/984 nt) |
kdgT → |
2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,101,721 | 1 | . | G | 95.7%
| 335.2
/ 8.5
| 94 | coding (32/984 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/3); new base G (54/36); total (55/39) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.04e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.92e-01 |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGG > NC_000913/4101622‑4101814
|
cATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATccc > 1:1021222/1‑100 (MQ=255)
aTCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑g > 2:852784/1‑100 (MQ=255)
cAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggg < 2:1653571/100‑1 (MQ=255)
cAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggg > 2:198320/1‑100 (MQ=255)
cAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggg < 1:1481817/100‑1 (MQ=255)
aaCACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑gggg > 1:2837364/1‑100 (MQ=255)
aaCACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑gggg < 1:2153661/100‑1 (MQ=255)
acacTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg < 1:2247367/100‑1 (MQ=255)
acacTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg < 2:2518555/100‑1 (MQ=255)
acacTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg > 1:1934583/1‑100 (MQ=255)
cacTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg‑g < 1:2054068/100‑1 (MQ=255)
cacTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg‑g < 1:1511622/100‑1 (MQ=255)
cacTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg‑g < 2:2619854/100‑1 (MQ=255)
cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg‑ggg > 2:691407/1‑99 (MQ=255)
tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAATATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg‑ggga < 2:771933/100‑3 (MQ=255)
aTGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg‑gggatg < 2:1916040/100‑5 (MQ=255)
tGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg‑gggatga < 1:497023/100‑6 (MQ=255)
tGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg‑gggatga < 1:2347166/100‑6 (MQ=255)
tGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGACCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggg‑gggatga < 2:1421626/100‑6 (MQ=255)
gCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑Ggatgat > 2:2952951/1‑100 (MQ=255)
cTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGatgatg > 1:2543617/1‑100 (MQ=255)
ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCt < 2:2908815/100‑1 (MQ=255)
ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCt > 2:39290/1‑100 (MQ=255)
cATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTc < 2:2501579/100‑1 (MQ=255)
gAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTcc > 2:2909616/1‑100 (MQ=255)
gAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTcc > 1:425850/1‑100 (MQ=255)
gAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTcc > 1:2930865/1‑100 (MQ=255)
ggAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCg > 2:382071/1‑100 (MQ=255)
aTTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTa > 1:862409/1‑100 (MQ=255)
aCGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTc > 2:1246252/1‑100 (MQ=255)
aCGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTc < 1:1011531/100‑1 (MQ=255)
cGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTcc > 1:1660628/1‑100 (MQ=255)
cGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTcc > 2:2644382/1‑100 (MQ=255)
tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTgg < 1:2205513/100‑1 (MQ=255)
cAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgc < 1:1011878/100‑1 (MQ=255)
aGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcg < 1:2684600/100‑1 (MQ=255)
gCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTAATCCTTGgcgc > 1:697805/1‑100 (MQ=255)
ccTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGCTGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCAc > 2:1068668/1‑100 (MQ=255)
cTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACt > 1:1521632/1‑100 (MQ=255)
ccgatcttGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtgtg < 1:1595402/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTATGGCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtgtg < 2:697802/100‑1 (MQ=255)
aaaaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtgtg > 2:2341297/1‑100 (MQ=255)
aaaaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtgtg < 1:198322/100‑1 (MQ=255)
aaaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGc > 2:459319/1‑100 (MQ=255)
aaaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGc > 1:988176/1‑100 (MQ=255)
aaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGcc < 1:809680/100‑1 (MQ=255)
gCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCt < 1:1027902/100‑1 (MQ=255)
gCCGACAGGGGATGGAAATGCAGGTAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGcc < 2:2183861/94‑1 (MQ=255)
gACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtct < 1:2687528/100‑1 (MQ=255)
gACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtct > 2:2738872/1‑100 (MQ=255)
aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtctc > 2:2193227/1‑100 (MQ=255)
aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCg < 2:1528960/100‑1 (MQ=255)
cAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCg > 1:151992/1‑100 (MQ=255)
ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGcc > 2:797061/1‑100 (MQ=255)
ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGcc > 1:1945038/1‑100 (MQ=255)
ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGcc > 1:1403469/1‑100 (MQ=255)
ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGcc < 1:2568131/100‑1 (MQ=255)
gtggtgGAGTTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTAGTACCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGAGACACCTTCTCGc > 2:1299393/1‑98 (MQ=255)
gTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGGGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGcc < 2:2161212/100‑1 (MQ=255)
gTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCTCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGc > 2:147176/1‑98 (MQ=255)
gTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCg > 2:2241618/1‑100 (MQ=255)
naTGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTACCGCCATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggg > 1:524011/2‑100 (MQ=255)
gATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggg > 2:1622966/1‑100 (MQ=255)
aTGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCgggg > 1:1339729/1‑100 (MQ=255)
tGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggggg > 2:186839/1‑100 (MQ=255)
gAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCg > 2:1583868/1‑100 (MQ=255)
aaaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgg > 1:329983/1‑100 (MQ=255)
aaaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgg < 1:852787/100‑1 (MQ=255)
aaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGAGGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCggg < 1:860492/100‑1 (MQ=255)
aTGCAAATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgggg < 2:2930849/100‑1 (MQ=255)
tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGCTAATGGTAGTCCCGCTATTTCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGa > 1:642960/1‑100 (MQ=255)
gCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaa < 1:1207847/100‑1 (MQ=255)
cAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaaa < 1:39291/100‑1 (MQ=255)
gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAata > 2:1302016/1‑100 (MQ=255)
gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAata > 2:2209935/1‑100 (MQ=255)
tAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAtt > 1:1921402/1‑100 (MQ=255)
aaaaCGCTCGATTGAGAAAAGCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAttt < 2:772664/100‑1 (MQ=255)
aCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTgg < 2:1834538/100‑1 (MQ=255)
aCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTgg < 1:862940/100‑1 (MQ=255)
aCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTgg < 1:120262/100‑1 (MQ=255)
cGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGa < 1:1711747/100‑1 (MQ=255)
cGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGa < 1:2373992/100‑1 (MQ=255)
cGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGTGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCAAACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTg < 2:731586/98‑1 (MQ=255)
gCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGAt > 1:1295299/1‑100 (MQ=255)
cTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATc < 1:397956/100‑1 (MQ=255)
cGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCan < 1:380800/100‑2 (MQ=255)
cGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCAt > 1:200058/1‑100 (MQ=255)
aTTGAGAAAATCCC‑‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCa > 1:422668/1‑100 (MQ=255)
aTTGAGAAAAGCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATGCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTc < 1:685989/100‑1 (MQ=255)
tGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc > 1:2335105/1‑100 (MQ=255)
tGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc < 1:2811261/100‑1 (MQ=255)
tGAGAAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc > 2:2061767/1‑100 (MQ=255)
gagaAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAcc < 2:1682885/100‑1 (MQ=255)
gagaAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAcc > 1:36053/1‑100 (MQ=255)
gagaAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAcc < 2:1021217/100‑1 (MQ=255)
agaAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACGCCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCa > 2:2091358/1‑100 (MQ=255)
agaAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCGTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCa > 2:2565623/1‑100 (MQ=255)
gaAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAcc < 2:1315850/98‑1 (MQ=255)
gaAAATCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCaa > 1:1524870/1‑100 (MQ=255)
aaTCCCG‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACgg < 1:2190970/100‑1 (MQ=255)
|
CATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGG‑GGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGG > NC_000913/4101622‑4101814
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
