Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F125 I1 R1
|
45 |
113.1 |
5779376 |
92.5% |
5345922 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,101,728 |
(G)7→8 |
coding (39/984 nt) |
kdgT → |
2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,101,721 | 1 | . | G | 96.4%
| 404.2
/ 9.2
| 112 | coding (32/984 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/2); new base G (54/54); total (56/56) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.44e-01 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGA > NC_000913/4101622‑4101816
|
cATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAGTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATccc < 1:929637/100‑1 (MQ=255)
cATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATccc > 1:403499/1‑100 (MQ=255)
cATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATccc > 2:2492408/1‑100 (MQ=255)
cATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGCGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATccc > 2:2321362/1‑100 (MQ=255)
aTCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑g > 2:2586389/1‑100 (MQ=255)
aTCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCAACAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑g > 1:1905901/1‑100 (MQ=255)
cAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggg > 1:1160444/1‑100 (MQ=255)
cacTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑gggggg < 1:1321432/100‑1 (MQ=255)
cacTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑gggggg < 2:2345828/100‑1 (MQ=255)
cacTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑gggggg > 2:609223/1‑100 (MQ=255)
tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑gggggggga < 1:1514038/100‑3 (MQ=255)
gATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggggggat > 2:2750506/1‑97 (MQ=255)
tGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggggggatgn < 1:2088840/100‑6 (MQ=255)
gCTCCATTGATGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGgatgat > 2:2460484/1‑100 (MQ=255)
gCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGgatgat > 1:1466288/1‑100 (MQ=255)
cTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGatgatg > 2:414240/1‑100 (MQ=255)
ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCt > 2:1693431/1‑100 (MQ=255)
ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCt > 2:1907152/1‑100 (MQ=255)
ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCt < 2:728078/100‑1 (MQ=255)
aTTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCg < 2:1402813/100‑1 (MQ=255)
aTTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCg < 1:147551/100‑1 (MQ=255)
tGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTc > 1:412895/1‑100 (MQ=255)
gAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTcc > 1:441863/1‑100 (MQ=255)
aGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTccc < 2:2710443/100‑1 (MQ=255)
aGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTccc < 1:240841/100‑1 (MQ=255)
aGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTccc < 2:108160/100‑1 (MQ=255)
ggAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCg > 2:1853444/1‑100 (MQ=255)
tACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAtt > 1:221849/1‑100 (MQ=255)
aCGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTc < 1:1672033/100‑1 (MQ=255)
aCGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGCGTTGGGAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTc > 2:2807392/1‑99 (MQ=255)
cGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTcc > 2:1782126/1‑100 (MQ=255)
cGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTcc > 1:713480/1‑100 (MQ=255)
cATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCtt > 2:1310732/1‑100 (MQ=255)
cATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTg > 2:181038/1‑100 (MQ=255)
tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTgg > 1:592569/1‑100 (MQ=255)
cAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgc < 1:2586367/100‑1 (MQ=255)
cccTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcgc > 1:2020901/1‑99 (MQ=255)
cccTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCa < 1:466450/100‑1 (MQ=255)
tcTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCAc < 2:488061/99‑1 (MQ=255)
ccTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCAc < 2:1008775/100‑1 (MQ=255)
ccTTAAAAATATGCCAACAGGTGATGGAAAGGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCAc < 2:2820867/100‑1 (MQ=255)
cTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGACAATCCCGGGGGGGGGATGATGCTCGTCGCGGTATTCCTTGgcg > 1:2632610/1‑97 (MQ=255)
cTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCAca > 1:488059/1‑99 (MQ=255)
cTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACt > 2:1891638/1‑100 (MQ=255)
tAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtgt > 1:2421399/1‑100 (MQ=255)
aaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGcc < 2:1160449/100‑1 (MQ=255)
atatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCcac < 2:885027/100‑1 (MQ=255)
tatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCcaca > 2:1297194/1‑100 (MQ=255)
tGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACAcc > 2:312444/1‑100 (MQ=255)
tGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACAcc < 2:2751829/100‑1 (MQ=255)
tGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACAcc < 1:1891624/100‑1 (MQ=255)
cGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtc < 2:594770/100‑1 (MQ=255)
ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGcc > 1:1079981/1‑100 (MQ=255)
tGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCgg > 2:2845302/1‑100 (MQ=255)
gATGGAAATGCGGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggg > 2:1452998/1‑100 (MQ=255)
gATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggg < 1:1093470/100‑1 (MQ=255)
gATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggg < 2:1106168/100‑1 (MQ=255)
tGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggggg > 2:2479496/1‑100 (MQ=255)
tGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggggg > 2:282869/1‑100 (MQ=255)
aaaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgg < 2:2542925/100‑1 (MQ=255)
aaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCggg < 1:2368450/100‑1 (MQ=255)
aaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCggg > 1:112063/1‑100 (MQ=255)
aaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCggg < 1:312443/100‑1 (MQ=255)
aTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgggg > 1:36675/1‑100 (MQ=255)
aTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgggg < 2:1441367/100‑1 (MQ=255)
tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGTGGCgggg > 2:1978323/1‑100 (MQ=255)
tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgggg > 1:2604333/1‑99 (MQ=255)
tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGa < 2:537894/100‑1 (MQ=255)
tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGa < 2:1060632/100‑1 (MQ=255)
tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGa > 1:137813/1‑100 (MQ=255)
tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaa < 2:2422263/100‑1 (MQ=255)
cAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaaa > 2:762675/1‑100 (MQ=255)
cAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaaa > 1:1622240/1‑100 (MQ=255)
gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAata > 2:1267160/1‑100 (MQ=255)
tAAAACGCTCNATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACCCCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAata > 2:1130883/1‑98 (MQ=255)
tAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAtt < 2:2125837/100‑1 (MQ=255)
aaaaCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAttt < 1:1738923/100‑1 (MQ=255)
aaaCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAtttt > 1:447319/1‑100 (MQ=255)
aaCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTg < 2:2248591/100‑1 (MQ=255)
aaCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTg < 2:1547122/100‑1 (MQ=255)
aCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTgg < 2:1151480/100‑1 (MQ=255)
gCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGGTGATGCTCGTACCGCTATACCTCGGCGTCATATGCCAACCCTTCTTGGCGGGGGCGTGGAGat > 1:2678497/1‑91 (MQ=255)
gCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGAt < 1:695428/100‑1 (MQ=255)
cGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCAt > 2:511139/1‑100 (MQ=255)
gATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCAtt > 1:2298536/1‑100 (MQ=255)
ttGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCa > 1:2850549/1‑100 (MQ=255)
tGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc < 2:2152749/100‑1 (MQ=255)
tGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc > 1:210728/1‑100 (MQ=255)
tGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc > 1:2881865/1‑100 (MQ=255)
tGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc > 1:498900/1‑100 (MQ=255)
tGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc < 2:2113752/100‑1 (MQ=255)
gagaAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAcc > 1:1027265/1‑100 (MQ=255)
gagaAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAcc < 2:1723165/100‑1 (MQ=255)
agaAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCa > 1:2167416/1‑100 (MQ=255)
agaAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTACACGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCa < 2:323211/100‑1 (MQ=255)
aaaTCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACg < 2:2663627/100‑1 (MQ=255)
aaTCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACgn < 2:904786/100‑2 (MQ=255)
aaTCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACgg > 2:1374720/1‑100 (MQ=255)
aTCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACggg > 1:1277442/1‑100 (MQ=255)
aTCCC‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGga < 1:1706821/100‑1 (MQ=255)
|
CATCAACACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGGGA > NC_000913/4101622‑4101816
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
