Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A16 F258 I1 R1
|
132 |
116.1 |
5785507 |
94.2% |
5449947 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,541,493 |
T→C |
F363L (TTC→CTC) |
feoB → |
ferrous iron transporter protein B and GTP‑binding protein; membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,541,493 | 0 | T | C | 99.0%
| 346.8
/ NA
| 97 | F363L (TTC→CTC) | feoB | ferrous iron transporter protein B and GTP‑binding protein; membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (44/52); minor base G (0/1); total (44/53) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTG > NC_000913/3541397‑3541589
|
ttCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTcc < 2:1025168/100‑1 (MQ=255)
ttCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTcc > 1:345889/1‑100 (MQ=255)
ttCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTcc > 1:1389237/1‑100 (MQ=255)
ttCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTcc > 1:158383/1‑100 (MQ=255)
ccGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCctct < 2:1152325/100‑1 (MQ=255)
ccGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATGAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGctcctc > 1:1745284/1‑99 (MQ=255)
cGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCctctn < 2:1490123/100‑2 (MQ=255)
gACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGctcctctcct > 1:1162965/1‑100 (MQ=255)
ggCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCtccttcct < 1:1446351/100‑1 (MQ=255)
ggCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCtccttcct > 1:171646/1‑100 (MQ=255)
ggCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCtccttcct > 2:371540/1‑100 (MQ=255)
ggCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCtccttcct < 2:322353/100‑1 (MQ=255)
ggCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCtccttcct > 1:1304181/1‑100 (MQ=255)
cTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTg > 2:1033877/1‑100 (MQ=255)
cTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTg < 2:484877/100‑1 (MQ=255)
cTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTg > 2:466096/1‑100 (MQ=255)
tGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGTCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGa < 2:1041691/100‑1 (MQ=255)
tGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGa < 1:482343/100‑1 (MQ=255)
gACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAg < 1:2542467/100‑1 (MQ=255)
gACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAg < 2:1367180/100‑1 (MQ=255)
gACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAg < 1:1235272/100‑1 (MQ=255)
aCTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAgg < 2:457926/100‑1 (MQ=255)
cTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGa > 1:1437935/1‑100 (MQ=255)
cTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTcc > 2:1002013/1‑100 (MQ=255)
cTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTcc > 1:2241624/1‑100 (MQ=255)
ttCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGCTTGGCATGCTGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCg > 1:2314656/1‑100 (MQ=255)
ttCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCg > 1:2727917/1‑100 (MQ=255)
ccTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCggg < 1:2221764/100‑1 (MQ=255)
ccTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCggg < 1:777079/100‑1 (MQ=255)
cTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGt > 2:2838117/1‑100 (MQ=255)
gCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGtata < 1:2408166/100‑1 (MQ=255)
cccAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTatat > 2:1878048/1‑100 (MQ=255)
cccAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTatat > 1:1428512/1‑100 (MQ=255)
agcgCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGgc < 2:686087/97‑1 (MQ=255)
aGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGgc < 2:560523/100‑1 (MQ=255)
gCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGcgcg > 2:598519/1‑100 (MQ=255)
cTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTg > 2:354475/1‑100 (MQ=255)
cTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTg < 2:345888/100‑1 (MQ=255)
tGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgc < 2:335329/100‑1 (MQ=255)
gggTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcg < 1:2216572/100‑1 (MQ=255)
gggTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcg < 1:937050/100‑1 (MQ=255)
ggTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcgg > 1:1019864/1‑100 (MQ=255)
gTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcggc < 2:1236554/100‑1 (MQ=255)
tGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcggcg < 2:1389232/100‑1 (MQ=255)
ggcggcATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCGTGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGt > 1:342346/1‑100 (MQ=255)
ggcggcATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGt > 1:1295271/1‑100 (MQ=255)
gcggcATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGtt > 2:147521/1‑100 (MQ=255)
gcggcATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGtt < 1:2291693/100‑1 (MQ=255)
ggcATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTtg < 1:1070609/100‑1 (MQ=255)
gcATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTtgt < 2:74583/100‑1 (MQ=255)
cATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTtgtg < 1:2474409/100‑1 (MQ=255)
cATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTtgtg > 2:1652082/1‑100 (MQ=255)
tccgatctcGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGa < 1:2222096/92‑1 (MQ=255)
aTTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGa < 1:1137005/100‑1 (MQ=255)
ttAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGAt < 1:2332942/100‑1 (MQ=255)
ttAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGAt < 1:2241962/100‑1 (MQ=255)
ttAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGAt < 1:2169909/100‑1 (MQ=255)
ttAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGAt < 2:1051093/100‑1 (MQ=255)
tAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATg > 2:1593475/1‑100 (MQ=255)
aaCACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATgg < 2:2068207/100‑1 (MQ=255)
aaCACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATgg < 2:2677521/100‑1 (MQ=255)
aaCACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATgg < 1:1486112/100‑1 (MQ=255)
acacCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGa > 2:600642/1‑100 (MQ=255)
cacCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGan < 2:158382/100‑2 (MQ=255)
cacCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGAc > 1:2554303/1‑100 (MQ=255)
ccGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCg > 1:1344546/1‑100 (MQ=255)
ccGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCg > 1:542154/1‑100 (MQ=255)
cGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGaagatcgga > 2:2222083/1‑92 (MQ=255)
gTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTc < 1:167413/100‑1 (MQ=255)
tgctgcCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCt > 1:979054/1‑100 (MQ=255)
ctgcCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGa > 2:164308/1‑100 (MQ=255)
ctgcCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGa < 1:147521/100‑1 (MQ=255)
gcCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATg > 2:859988/1‑100 (MQ=255)
gcCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATAGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATg > 2:2830845/1‑100 (MQ=255)
gcCACTGGTGCCGCAGAGTGGCATGGTGGGCCTGGGCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGGGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGAt < 2:559829/99‑1 (MQ=255)
ccACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGc < 2:2241611/100‑1 (MQ=255)
ccACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGc < 1:2414474/100‑1 (MQ=255)
aCTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAg > 1:995876/1‑100 (MQ=255)
cTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAgg < 2:2727896/100‑1 (MQ=255)
gTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGgcgc > 2:1228408/1‑100 (MQ=255)
tGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGATGACTCCGGGTATATGGCGCCTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGgcgc < 2:773115/99‑1 (MQ=255)
gCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTg > 2:917060/1‑100 (MQ=255)
ccGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTgg < 1:1830563/100‑1 (MQ=255)
cGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTggg > 1:2167956/1‑100 (MQ=255)
gCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGc < 2:2468537/100‑1 (MQ=255)
gATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTg > 1:2487906/1‑100 (MQ=255)
aTTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGc < 1:2208596/100‑1 (MQ=255)
cATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCgggg < 2:2506256/100‑1 (MQ=255)
tgatgTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGaa > 1:2084635/1‑100 (MQ=255)
gTACCTGCTCCTCTCCTTCCTAGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGAGCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGACAt > 2:2699222/1‑98 (MQ=255)
tACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCt > 2:2091549/1‑100 (MQ=255)
tACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCt > 1:1868770/1‑100 (MQ=255)
aCCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCtt < 2:1019862/100‑1 (MQ=255)
aCCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCtt < 2:313586/100‑1 (MQ=255)
aCCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCtt < 1:1593484/100‑1 (MQ=255)
ccTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCttt > 1:2233481/1‑100 (MQ=255)
ccTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCttt < 1:1164896/100‑1 (MQ=255)
cTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTtg < 2:2803248/100‑1 (MQ=255)
cTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTtg > 1:950190/1‑100 (MQ=255)
|
TTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTG > NC_000913/3541397‑3541589
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
