Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A16 F258 I0 R1
|
432 |
103.0 |
5191697 |
92.7% |
4812703 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,541,493 |
T→C |
82.6% |
F363L (TTC→CTC) |
feoB → |
ferrous iron transporter protein B and GTP‑binding protein; membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,541,493 | 0 | T | C | 82.6%
| 278.2
/ 40.5
| 120 | F363L (TTC→CTC) | feoB | ferrous iron transporter protein B and GTP‑binding protein; membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (12/9); new base C (50/49); total (62/58) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.36e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTT > NC_000913/3541397‑3541588
|
ttCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTcc < 1:1886588/100‑1 (MQ=255)
tCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGTATTAACGCCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTcc < 1:1973278/99‑1 (MQ=255)
tCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCct > 1:981777/1‑100 (MQ=255)
tCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCct > 1:252657/1‑100 (MQ=255)
cccGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGctcctc > 1:508552/1‑100 (MQ=255)
ccGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCctct > 2:427678/1‑100 (MQ=255)
cGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCtctc > 2:1701796/1‑100 (MQ=255)
cGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCtctc < 1:1944697/100‑1 (MQ=255)
gACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGctcctctcct < 2:1924281/100‑1 (MQ=255)
gACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGctcctctcct < 2:1727140/100‑1 (MQ=255)
aCTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCtcctt < 2:1014686/100‑1 (MQ=255)
ggCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCtccttcct > 2:2526502/1‑100 (MQ=255)
ggCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCtccttcct > 2:146920/1‑100 (MQ=255)
tcaCTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGTGTTGCGGCATTAACACCGTGCTGTCACTGGTGCCGCAGTTTGGCATTATGTACCTGCTCCTGTCCGTCCTTg < 1:736637/97‑1 (MQ=255)
tGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGa < 2:1652835/100‑1 (MQ=255)
tGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGa < 1:1865620/100‑1 (MQ=255)
gACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACCGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAg > 1:605298/1‑100 (MQ=255)
aCTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAgg < 1:829952/100‑1 (MQ=255)
aCTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAgg < 2:1013560/100‑1 (MQ=255)
aCTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAgg < 2:735858/100‑1 (MQ=255)
cTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAgg > 1:1152338/1‑99 (MQ=255)
cTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAgg > 1:105521/1‑99 (MQ=255)
tCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTc > 1:766110/1‑100 (MQ=255)
tCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTc > 2:593290/1‑100 (MQ=255)
cTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTcc > 1:1453135/1‑100 (MQ=255)
ccTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCggg < 2:132701/100‑1 (MQ=255)
ccTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCggg < 1:2482271/100‑1 (MQ=255)
cTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGt < 2:1295245/100‑1 (MQ=255)
cTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGt > 1:337901/1‑100 (MQ=255)
tCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGta < 2:1498546/100‑1 (MQ=255)
tCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGta < 1:2221513/100‑1 (MQ=255)
cGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGtat > 1:244449/1‑100 (MQ=255)
gCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGtata < 2:725490/100‑1 (MQ=255)
cccAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTatat > 2:686564/1‑100 (MQ=255)
cccAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTatat > 1:261960/1‑100 (MQ=255)
cccAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTatat < 1:1190358/100‑1 (MQ=255)
cccAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTatat > 2:735856/1‑100 (MQ=255)
cAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATgg < 2:1601310/100‑1 (MQ=255)
aGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGgc < 2:1876507/100‑1 (MQ=255)
gggCCTGGCAGGCGGCATTAACATCGTGCGGCCACTGGGGTCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGGCTCCGGGTATATg < 1:2020162/97‑1 (MQ=255)
gCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGcgcg < 2:809813/100‑1 (MQ=255)
ccTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGt > 1:2253045/1‑100 (MQ=255)
cTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGGTTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCGTGAGGACTCCGGGTATATGgcg > 1:160185/1‑96 (MQ=255)
cTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTg > 1:1130776/1‑100 (MQ=255)
tGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgn < 2:48/100‑2 (MQ=255)
tGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgc < 2:1491742/100‑1 (MQ=255)
gggTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcg > 1:1007242/1‑100 (MQ=255)
gggTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcg < 1:1057501/100‑1 (MQ=255)
ggTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcg > 1:2584566/1‑99 (MQ=255)
ggTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcgg > 1:726942/1‑100 (MQ=255)
ggTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCACGTgcgg < 2:252660/100‑1 (MQ=255)
ntGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCTGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcggc > 2:1823614/2‑100 (MQ=255)
tGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcggcg > 2:724652/1‑100 (MQ=255)
ggcggcATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGt < 2:1614731/100‑1 (MQ=255)
cggcATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGttt > 1:1851224/1‑100 (MQ=255)
cggcATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGttt > 2:2029246/1‑100 (MQ=255)
cATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTtgtg > 2:116799/1‑100 (MQ=255)
aTTAACACCGTGCTGCCACTGGAGCCGCAGATTGGCATGACGTACCTGCTCCTCTGCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGa > 1:1501154/1‑100 (MQ=255)
ttAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGAt < 2:2340870/100‑1 (MQ=255)
ttAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGAt > 2:2303336/1‑100 (MQ=255)
ttAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATAATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGAt < 2:883397/100‑1 (MQ=255)
aaCACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATgg < 1:1774176/100‑1 (MQ=255)
cacCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGAc < 2:1608513/100‑1 (MQ=255)
cacCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGAc > 1:1865051/1‑100 (MQ=255)
cacCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGAc > 1:1431790/1‑100 (MQ=255)
ccGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCg > 1:1903938/1‑100 (MQ=255)
ccGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCg > 2:2574709/1‑100 (MQ=255)
cGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGt > 1:1979373/1‑100 (MQ=255)
gTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGAcc > 2:2334919/1‑97 (MQ=255)
gTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTc < 1:2499269/100‑1 (MQ=255)
tgctgcCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCt < 1:314504/100‑1 (MQ=255)
ctgcCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGa < 2:1098959/100‑1 (MQ=255)
tgcCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGAt > 1:1028504/1‑100 (MQ=255)
tGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGgc < 2:1888977/100‑1 (MQ=255)
ggTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCaagat > 1:417325/1‑96 (MQ=255)
ggTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGgcg > 1:672525/1‑100 (MQ=255)
tGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCt < 1:911785/100‑1 (MQ=255)
gCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTg < 1:412305/100‑1 (MQ=255)
ccGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTgg < 2:1177033/100‑1 (MQ=255)
cGCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTGCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTggg < 2:805853/100‑1 (MQ=255)
gCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGc < 2:1562818/100‑1 (MQ=255)
gCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGc < 2:1560939/100‑1 (MQ=255)
gCAGATTGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGc < 1:1174178/100‑1 (MQ=255)
cAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCt > 1:1017417/1‑100 (MQ=255)
aTTGGCATGTTGTACATGCTCCTCTCGTTCCTTGCGGATTCAGGGAATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATTGTCCGTCTGGTGCAGGCGCGTGGCTTGc > 1:2468120/1‑100 (MQ=255)
aTTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGc < 2:1869417/100‑1 (MQ=255)
ttGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGcc > 2:160998/1‑100 (MQ=255)
ttGGCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGcc < 1:1995394/100‑1 (MQ=255)
gCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCggg > 2:2272843/1‑100 (MQ=255)
gCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCggg > 2:461510/1‑100 (MQ=255)
gCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCggg > 1:913890/1‑100 (MQ=255)
gCATGATGTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCggg > 1:1459044/1‑100 (MQ=255)
gatgTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGaaa < 1:732132/100‑1 (MQ=255)
atgTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAAt > 1:1258669/1‑100 (MQ=255)
tgTACCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCACTGGGCTTGCCGGGGAAATc < 2:105522/100‑1 (MQ=255)
aCCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCtt > 2:2485154/1‑100 (MQ=255)
aCCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCtt > 1:2228406/1‑100 (MQ=255)
aCCTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCtt > 2:944456/1‑100 (MQ=255)
ccTGCTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCttt < 1:2212453/100‑1 (MQ=255)
cTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCttt < 1:1908320/99‑1 (MQ=255)
|
TTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTT > NC_000913/3541397‑3541588
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
