Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A16 F258 I0 R1
|
432 |
103.0 |
5191697 |
92.7% |
4812703 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,499,708 |
(C)5→4 |
100% |
intergenic (+93/‑202) |
yhfL → / → frlA |
small lipoprotein/putative fructoselysine transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,499,704 | 0 | C | . | 86.3%
| 318.0
/ 48.1
| 95 | intergenic (+89/‑206) | yhfL/frlA | small lipoprotein/putative fructoselysine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/6); new base . (46/36); total (52/43) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.62e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.12e-01 |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTC > NC_000913/3499605‑3499799
|
cTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGc > 1:841857/1‑100 (MQ=255)
tGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGcc < 2:1203028/100‑1 (MQ=255)
tGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGcc > 1:2595042/1‑100 (MQ=255)
tGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGcc < 2:2200805/100‑1 (MQ=255)
gCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGccc > 2:96632/1‑100 (MQ=255)
gCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGccc > 1:2180936/1‑100 (MQ=255)
gCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGcc < 1:1631428/99‑1 (MQ=255)
caGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGGCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGccccg < 1:2115203/99‑2 (MQ=255)
aGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGTTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGccccgcc < 1:1685465/100‑4 (MQ=255)
aGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGccccgcc < 2:1335387/100‑4 (MQ=255)
gTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGccccgccc > 2:2110655/1‑96 (MQ=255)
tAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑Ccccgcccg < 2:192565/100‑1 (MQ=255)
tAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑Ccccgcccg < 1:617206/100‑1 (MQ=255)
aGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTa < 1:170889/100‑1 (MQ=255)
gTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCCCTGGATTTTCCGACGGCGTATTTGTTTCCATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGtca > 1:1546810/1‑98 (MQ=255)
tctcTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTaa < 1:519225/100‑1 (MQ=255)
tctcTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaaa < 1:1405062/100‑1 (MQ=255)
tctcTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaaa < 2:2034993/100‑1 (MQ=255)
ctctGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaaaa > 1:1478738/1‑100 (MQ=255)
ctctGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaaaa > 2:433647/1‑100 (MQ=255)
ctctGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaaaa > 2:1350418/1‑100 (MQ=255)
ctctGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaaaa < 2:1444634/100‑1 (MQ=255)
tctGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaaaaa > 1:1487162/1‑100 (MQ=255)
tGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaaaaaca < 2:1745174/100‑3 (MQ=255)
gACAGAATTCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAatat > 2:1355519/1‑100 (MQ=255)
gACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAatat > 2:1320681/1‑100 (MQ=255)
aCAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATAtt > 2:1102033/1‑100 (MQ=255)
aCAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATAtt < 2:644519/100‑1 (MQ=255)
aCAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATAtt < 2:1061673/100‑1 (MQ=255)
cAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATAtt > 2:2317073/1‑100 (MQ=255)
cAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATAttt < 2:2180951/100‑1 (MQ=255)
gAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTc > 2:148264/1‑100 (MQ=255)
gAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTc > 1:481365/1‑100 (MQ=255)
aaaTCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGAAGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAACAATATTTTCa > 1:1704030/1‑100 (MQ=255)
aaTCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCAc < 2:1375389/100‑1 (MQ=255)
aTCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACt > 2:608939/1‑100 (MQ=255)
cGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCTTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACttt < 1:1549696/100‑1 (MQ=255)
cGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACttt < 1:894939/100‑1 (MQ=255)
ggCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTa < 2:1478747/100‑1 (MQ=255)
ggCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTa > 2:1063678/1‑100 (MQ=255)
gCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCAAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTaa > 1:1415728/1‑100 (MQ=255)
cTAACACCGGTTTAATTGCCCGCCGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTaaa < 1:650975/100‑1 (MQ=255)
tAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTaaa < 1:1504532/100‑1 (MQ=255)
tAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATCTTTTCACTTTCAAt > 1:1077186/1‑100 (MQ=255)
tAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAAt < 2:1057923/100‑1 (MQ=255)
tAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAAt < 1:2035725/100‑1 (MQ=255)
ccGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAAt > 2:1021066/1‑100 (MQ=255)
ccGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAAt > 2:659252/1‑100 (MQ=255)
ccGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAAt < 1:1660939/100‑1 (MQ=255)
ccGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAAt > 2:346174/1‑100 (MQ=255)
ggTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAAttt > 2:684521/1‑100 (MQ=255)
ggTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAAttt > 1:393547/1‑100 (MQ=255)
aaTTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATaa > 2:509964/1‑100 (MQ=255)
aTTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATaa > 2:2568432/1‑100 (MQ=255)
aTTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAAc > 2:212949/1‑100 (MQ=255)
aTTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTCGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAAc > 1:525349/1‑100 (MQ=255)
cccGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACa < 2:2335169/100‑1 (MQ=255)
cccTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCAtt < 1:1281446/100‑1 (MQ=255)
cccTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTa > 2:544634/1‑100 (MQ=255)
cccTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTa < 2:1269026/100‑1 (MQ=255)
ctctGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGc > 1:332592/1‑100 (MQ=255)
tctGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGcc < 1:1063674/100‑1 (MQ=255)
tctGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGcc < 2:841860/100‑1 (MQ=255)
tctGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGcc < 2:1988091/100‑1 (MQ=255)
ctGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTGTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGcc < 1:2476289/99‑1 (MQ=255)
tGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCcac < 2:1478562/100‑1 (MQ=255)
ggATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCcaca > 2:730539/1‑100 (MQ=255)
gATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAg > 2:728256/1‑100 (MQ=255)
aTTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAgc > 2:544566/1‑100 (MQ=255)
ttttCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAgcg > 2:957401/1‑100 (MQ=255)
tttCCGAGGTGGTATTTGTGTCTATGTCCTTCTTGCCCAC‑TCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATATGTACATTCATTAGCCATAgcg < 1:2196616/99‑1 (MQ=255)
tttCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAgcgc > 1:703054/1‑100 (MQ=255)
tttCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAgcgc > 2:366916/1‑100 (MQ=255)
ttCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGcgcg < 1:1909639/100‑1 (MQ=255)
tctcGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGcgcg < 1:2017844/97‑1 (MQ=255)
cGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGaga > 2:2017856/1‑98 (MQ=255)
gAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATcc < 2:1785689/100‑1 (MQ=255)
gggCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCtg > 2:1362950/1‑100 (MQ=255)
gCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCtgtg > 1:2303670/1‑100 (MQ=255)
gCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑ACCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCtgtg > 2:1572689/1‑100 (MQ=255)
cGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGc > 2:2157592/1‑100 (MQ=255)
aTTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGa > 1:709468/1‑100 (MQ=255)
aTTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGaa > 2:681914/1‑100 (MQ=255)
ttGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAAt < 2:200964/100‑1 (MQ=255)
tGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAAtt > 2:2352802/1‑100 (MQ=255)
gTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAAttt < 2:948747/100‑1 (MQ=255)
gTTTCTATGTCCTTCCTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAAttt < 2:2552775/100‑1 (MQ=255)
tttCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAAttt > 1:38355/1‑100 (MQ=255)
tttCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAAtttt > 1:551436/1‑100 (MQ=255)
ttCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtg < 1:2082594/100‑1 (MQ=255)
tCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtgt < 2:2595061/100‑1 (MQ=255)
tCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtgt > 1:2459703/1‑100 (MQ=255)
tCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtgt < 1:1984961/100‑1 (MQ=255)
cTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtgt < 2:489803/100‑1 (MQ=255)
aTGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGAt > 2:1867529/1‑100 (MQ=255)
gttcttcttGG‑CCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCATAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCt < 1:1704504/97‑1 (MQ=255)
gTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCt < 1:131035/100‑1 (MQ=255)
gTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCACGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCt > 1:955811/1‑100 (MQ=255)
ttcttG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCTCAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTtcc < 2:779848/99‑1 (MQ=255)
tcttGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCAATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTtcct > 1:521562/1‑100 (MQ=255)
|
CTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTC > NC_000913/3499605‑3499799
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
