Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F256 I1 R1
|
186 |
136.5 |
6958264 |
92.1% |
6408561 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,597,846 |
(T)5→4 |
intergenic (‑286/‑138) |
livK ← / → panM |
leucine transporter subunit/PanD autocleavage accelerator, panothenate synthesis |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,597,842 | 0 | T | . | 99.3%
| 649.9
/ ‑2.7
| 145 | intergenic (‑282/‑142) | livK/panM | leucine transporter subunit/PanD autocleavage accelerator, panothenate synthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base . (81/62); minor base A (0/1); total (81/64) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.38e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAAT > NC_000913/3597744‑3597937
|
tATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAttt > 1:1163407/1‑100 (MQ=255)
aTTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAtttt < 2:3158557/100‑1 (MQ=255)
aTTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAtttt > 2:465314/1‑100 (MQ=255)
aTTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAtttt < 1:1751709/100‑1 (MQ=255)
aTTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAtttt > 2:2530220/1‑100 (MQ=255)
tGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAAAAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAttttca > 1:2442392/1‑98 (MQ=255)
gatagataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAttttcat > 2:1194862/1‑97 (MQ=255)
gatagataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAttttcat > 1:270459/1‑97 (MQ=255)
tagataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtc < 2:1780651/100‑1 (MQ=255)
tagataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtc < 2:2542931/100‑1 (MQ=255)
agataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCCGAATAATTCGCTATCGTTCAGGGGATTATGCTGGACAttttccttct > 1:2341555/1‑94 (MQ=255)
gataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtctc > 2:856788/1‑100 (MQ=255)
gataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtctc > 2:3262640/1‑100 (MQ=255)
gataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtctc > 1:6249/1‑100 (MQ=255)
gataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtctc > 2:2182869/1‑100 (MQ=255)
gataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtcac > 1:2113652/1‑98 (MQ=255)
taacccgcaaaaaGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAAAGGAACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTAAAAGGAATATACTGGACA‑TTTTCATTCTCTa > 1:1575416/9‑100 (MQ=255)
taAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTa > 1:2586456/1‑100 (MQ=255)
taAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTa < 2:2260194/100‑1 (MQ=255)
aaCAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAAt < 2:1757714/100‑1 (MQ=255)
cAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGt > 2:2849758/1‑100 (MQ=255)
aGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGtt > 2:109882/1‑100 (MQ=255)
aGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGtt > 2:1970316/1‑100 (MQ=255)
gAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGttt > 1:1630686/1‑100 (MQ=255)
gAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGttt > 2:2592829/1‑100 (MQ=255)
aaaaaGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTa > 2:1512225/1‑100 (MQ=255)
aaGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAAtt > 1:1888447/1‑100 (MQ=255)
gTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAAtttt > 2:1850021/1‑100 (MQ=255)
tGCCTTTGTCGGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTg > 2:1007549/1‑100 (MQ=255)
tGCCTTTGTCATCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATTATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTg < 1:2727714/100‑1 (MQ=255)
tGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTg < 2:1148753/100‑1 (MQ=255)
tGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTg < 1:776520/100‑1 (MQ=255)
tGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTg > 1:379634/1‑100 (MQ=255)
tGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTg < 2:2403884/100‑1 (MQ=255)
tGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCAAATGTTTTAATTTTg < 1:2417733/100‑1 (MQ=255)
gCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGt < 1:3193852/100‑1 (MQ=255)
gCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGt > 2:2214948/1‑100 (MQ=255)
gCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGt > 1:1177060/1‑100 (MQ=255)
tGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAatta > 1:3040082/1‑100 (MQ=255)
tCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAattatt < 2:852595/100‑1 (MQ=255)
cAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTg > 1:3217381/1‑100 (MQ=255)
cAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTg > 2:1816208/1‑100 (MQ=255)
aGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGc < 2:540680/100‑1 (MQ=255)
aGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGc < 1:2881272/100‑1 (MQ=255)
aGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGc < 2:1879953/100‑1 (MQ=255)
gCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCt < 1:1291528/100‑1 (MQ=255)
gCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCt > 2:3169100/1‑100 (MQ=255)
cATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTg < 2:2885378/100‑1 (MQ=255)
tAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGtt > 2:3433851/1‑100 (MQ=255)
aaTAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTaaa < 2:2530385/100‑1 (MQ=255)
tAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTaaaaa < 2:297770/100‑1 (MQ=255)
aaCGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTaaaaaa < 1:604551/100‑1 (MQ=255)
aCGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGTGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAt < 1:2056802/100‑1 (MQ=255)
aCGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGTGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAt < 1:1551487/100‑1 (MQ=255)
aCGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAt > 2:3400217/1‑100 (MQ=255)
aCGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGAACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAt < 1:1633366/100‑1 (MQ=255)
ggCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAtt > 1:2863795/1‑99 (MQ=255)
gCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTaa > 1:860151/1‑100 (MQ=255)
gCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTa < 1:74504/99‑1 (MQ=255)
cacaAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAAt > 1:1136363/1‑100 (MQ=255)
cacaAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAAt > 1:668165/1‑100 (MQ=255)
acaAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATc < 2:972517/100‑1 (MQ=255)
caAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCa > 2:345685/1‑100 (MQ=255)
aaGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCAcc < 1:1194847/100‑1 (MQ=255)
aaGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCAcc < 2:1040470/100‑1 (MQ=255)
aaGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCAcc > 1:300571/1‑100 (MQ=255)
aaGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCAcc < 1:2592794/100‑1 (MQ=255)
cGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCa > 2:3225277/1‑100 (MQ=255)
gAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCaaa > 2:597529/1‑100 (MQ=255)
ttccgatctcTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCaaaa < 1:3252133/91‑1 (MQ=255)
ataatTCAATATCAGGCAGGAGATTATGATGGA‑AAGTTTCAGATGCTCATGATTTAATTCTGTAATTATTGCTGTAAAAAAATTAATAACATGACaaaa < 1:2950219/99‑1 (MQ=255)
cACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATa < 2:715046/100‑1 (MQ=255)
cACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATaa > 1:1704501/1‑100 (MQ=255)
cACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATaa < 1:1740211/100‑1 (MQ=255)
aCTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATaaa > 1:439896/1‑100 (MQ=255)
cTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATaaaa < 2:1428559/100‑1 (MQ=255)
tATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATaaaaa < 1:2172265/100‑1 (MQ=255)
tATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATaaaaa > 2:627014/1‑100 (MQ=255)
ataaTTCAGGAGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATATTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATaaaaaa < 1:2714718/97‑1 (MQ=255)
aTCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAATAAATTAATCACTTGCCAAAATAAATaaaa > 1:2254798/1‑98 (MQ=255)
aTCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATaaaaaa > 2:2668642/1‑100 (MQ=255)
tCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAag < 1:744875/100‑1 (MQ=255)
tCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAag < 2:3362148/100‑1 (MQ=255)
aTTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAagag > 2:2831359/1‑100 (MQ=255)
aTTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAagag < 1:1107246/100‑1 (MQ=255)
aTTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAagag > 2:1176727/1‑100 (MQ=255)
aTTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAagag > 1:1486695/1‑100 (MQ=255)
ttCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAgaga > 2:1676524/1‑100 (MQ=255)
tCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGaa < 2:1971844/100‑1 (MQ=255)
cAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGaaa > 1:3351889/1‑100 (MQ=255)
aGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAGTGTTTTAATTATGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAg > 2:2349039/1‑100 (MQ=255)
aTTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTct > 2:739488/1‑99 (MQ=255)
aTTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTcc < 1:2685352/100‑1 (MQ=255)
aTGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGAt > 1:1240204/1‑100 (MQ=255)
tGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGAtt > 1:1396657/1‑100 (MQ=255)
tGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGAtt < 2:66626/100‑1 (MQ=255)
gCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTa > 1:782427/1‑100 (MQ=255)
gCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTa > 1:2481099/1‑100 (MQ=255)
tGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCATAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTaaa < 2:3300600/100‑1 (MQ=255)
ggACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAat < 2:1879222/100‑1 (MQ=255)
|
TTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAAT > NC_000913/3597744‑3597937
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
