Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F212 I0 R1
|
246 |
122.0 |
6097616 |
93.1% |
5676880 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,597,846 |
(T)5→4 |
100% |
intergenic (‑286/‑138) |
livK ← / → panM |
leucine transporter subunit/PanD autocleavage accelerator, panothenate synthesis |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,597,842 | 0 | T | . | 97.1%
| 452.8
/ 5.4
| 103 | intergenic (‑282/‑142) | livK/panM | leucine transporter subunit/PanD autocleavage accelerator, panothenate synthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base . (63/37); total (64/39) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.55e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.33e-01 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAAT > NC_000913/3597743‑3597937
|
tttATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAt > 1:243689/1‑100 (MQ=255)
ttATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAtt > 1:2165018/1‑100 (MQ=255)
tATTGATAGTTAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGAGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAttt > 1:2524691/1‑100 (MQ=255)
aTTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTAACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAtttt > 1:464396/1‑100 (MQ=255)
tGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAttttca < 2:2029102/100‑3 (MQ=255)
gatagataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAttttcat < 1:1157807/100‑4 (MQ=255)
gatagataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAttttcat < 2:1835024/100‑4 (MQ=255)
tagataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtc < 1:445628/100‑1 (MQ=255)
gataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtctc > 1:2280507/1‑100 (MQ=255)
gataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtctc > 1:2319892/1‑100 (MQ=255)
gataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtctc > 1:1418246/1‑100 (MQ=255)
gataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtctc > 1:696221/1‑100 (MQ=255)
gataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATtct > 2:2147408/1‑99 (MQ=255)
ataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTctct > 1:1469335/1‑100 (MQ=255)
ataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTctct < 1:192752/100‑1 (MQ=255)
ataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTctct > 1:1897683/1‑100 (MQ=255)
ataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTctct > 2:1605645/1‑100 (MQ=255)
ataAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTctct > 1:1016328/1‑100 (MQ=255)
aaCAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAAt > 1:601429/1‑100 (MQ=255)
aaCAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAAt < 1:777117/100‑1 (MQ=255)
aaCAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAAt > 2:2746084/1‑100 (MQ=255)
aaCAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAAt < 2:601425/100‑1 (MQ=255)
aCAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATg > 1:1117113/1‑100 (MQ=255)
cAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGt > 1:2254454/1‑100 (MQ=255)
gAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGttt < 2:2096210/100‑1 (MQ=255)
gAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGttt > 1:2948126/1‑100 (MQ=255)
aaaaaaGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGtttt < 2:3016648/100‑1 (MQ=255)
aaaaaGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTa > 2:1276210/1‑100 (MQ=255)
aaaaGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTa > 1:2331210/1‑100 (MQ=255)
gTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAAtttt > 2:90692/1‑100 (MQ=255)
gCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGAGATAATGCTGAACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGt > 1:493732/1‑100 (MQ=255)
ccTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTa > 2:265939/1‑100 (MQ=255)
cTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTa < 1:1856516/100‑1 (MQ=255)
gCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGCATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCt > 1:1851346/1‑100 (MQ=255)
gCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCCCTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCt > 2:404179/1‑100 (MQ=255)
gCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTACTGTTTTAATTTTGTAATTATTGCt > 2:1891047/1‑100 (MQ=255)
gCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCt < 2:1064146/100‑1 (MQ=255)
gCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCt < 2:2652566/100‑1 (MQ=255)
gCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCt < 2:456770/100‑1 (MQ=255)
gCATAAAATAACGGCACAAAGAGCGGAATACTTCACTATAATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATCATCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGc > 2:569833/1‑99 (MQ=255)
cATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTg > 1:2033160/1‑100 (MQ=255)
tAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGtt > 2:3024720/1‑100 (MQ=255)
tAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGtt > 1:1821966/1‑100 (MQ=255)
tAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGt > 2:1507443/1‑99 (MQ=255)
tAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TATTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGtt > 1:314453/1‑100 (MQ=255)
aaaTAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTATAATTTTGTAATTATTGCTGTTaa > 1:1532257/1‑100 (MQ=255)
aaTAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGTACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTa > 2:68416/1‑98 (MQ=255)
aaTAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCAGTCTCTCATGTTTTACTTTTGTAATTATTGCTGTTaaa > 2:2042662/1‑100 (MQ=255)
tAACGGCTCAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTa < 1:656830/96‑1 (MQ=255)
aaCGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTaaaaaa < 1:2444873/100‑1 (MQ=255)
aaCGGAACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTTAGGGGATTATTCTTAACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTTTAATTATTGCTGTTaaaaaa < 2:848466/100‑1 (MQ=255)
aCGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAt < 2:2017284/100‑1 (MQ=255)
aCGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAt > 1:2219187/1‑100 (MQ=255)
cGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGTTATTATGCTGGATA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAtt < 1:449260/100‑1 (MQ=255)
cGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAtt < 1:1218126/100‑1 (MQ=255)
cGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAtt < 2:243686/100‑1 (MQ=255)
gCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTaa > 2:2817832/1‑100 (MQ=255)
cacaAATGGCGCAATAATTCACTATCATTCAGGGTATTATGCTGGACA‑TTTTCATTTTCTAATGTTTTAATTTTTTAATTATTGCTGTTAAAAAAt < 2:2606654/96‑1 (MQ=255)
aaaGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCAc < 1:1374650/100‑1 (MQ=255)
aaGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCAcc > 1:2263767/1‑100 (MQ=255)
gggCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTg > 2:1258984/1‑100 (MQ=255)
ggCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGCTTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCt > 1:817368/1‑98 (MQ=255)
cGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCa > 1:527832/1‑100 (MQ=255)
cGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCa > 1:1169955/1‑100 (MQ=255)
taatTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGa < 1:566108/100‑1 (MQ=255)
taatTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGa > 1:1283508/1‑100 (MQ=255)
atTCACTATCATTCAGGGGATTATGATGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATAGTTGTGGTTAAAAAATTAATTACCAACTAAAAGa > 2:2712729/1‑98 (MQ=255)
tCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATa < 2:639311/100‑1 (MQ=255)
tCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATa < 2:852419/100‑1 (MQ=255)
tCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATa < 2:852753/100‑1 (MQ=255)
tCAATATCACTCAGTGCATTATGTTTGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGTTGTTAATTTTTTAATCACCTGCCAAAAGAAATa < 2:353379/100‑1 (MQ=255)
aCTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATaaa > 2:184262/1‑100 (MQ=255)
cTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCTAAAAGAAATaaaa > 2:2061627/1‑100 (MQ=255)
aTCATTCAGGTGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATaaaaaa < 1:679796/100‑1 (MQ=255)
tCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAATTTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAag < 1:337625/100‑1 (MQ=255)
tCATTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAag < 1:394032/100‑1 (MQ=255)
aTTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAagag < 1:2201256/100‑1 (MQ=255)
aTTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAagag > 2:228405/1‑100 (MQ=255)
aTTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAagag < 2:1723770/100‑1 (MQ=255)
aTTCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAagag > 2:1434604/1‑100 (MQ=255)
tCAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGaa > 2:2532427/1‑100 (MQ=255)
cAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTCATCACCTGCCAAACGAAATAAAAAAGAGaaa > 2:2390362/1‑100 (MQ=255)
cAGGGGATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGaaa > 2:2895922/1‑100 (MQ=255)
agaggATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAAAg < 2:1093577/97‑1 (MQ=255)
ggggATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGc > 1:608816/1‑100 (MQ=255)
ggggATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGc > 1:1568419/1‑100 (MQ=255)
ggggATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAAATAATCACATACAAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAg > 1:988401/1‑99 (MQ=255)
gggATTATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGcc < 1:2792735/100‑1 (MQ=255)
tATGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGa < 1:1457322/100‑1 (MQ=255)
tGCTGGATA‑TTTTCATTCTCTAATTTTTTAATTTTGTAATTATGGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCg < 2:508424/97‑1 (MQ=255)
tGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGAtt > 1:386511/1‑100 (MQ=255)
tGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGAtt > 1:697082/1‑100 (MQ=255)
tGCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGAtt > 1:567356/1‑100 (MQ=255)
gCTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTa > 1:20180/1‑100 (MQ=255)
cTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTaa > 2:608667/1‑100 (MQ=255)
cTGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTaa < 1:81597/100‑1 (MQ=255)
tGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTaaa < 1:1293831/100‑1 (MQ=255)
tGGACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTa < 1:3016860/98‑1 (MQ=255)
ggACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAat > 1:1287664/1‑100 (MQ=255)
ggACA‑TTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAat > 2:2952316/1‑100 (MQ=255)
|
TTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTCTCTAATGTTTTAATTTTGTAATTATTGCTGTTAAAAAATTAATCACCTGCCAAAAGAAATAAAAAAGAGAAAGCCTCCGATTAAAT > NC_000913/3597743‑3597937
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
