Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F256 I1 R1
|
186 |
136.5 |
6958264 |
92.1% |
6408561 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,358,482 |
T→A |
I46F (ATC→TTC) |
cadA ← |
lysine decarboxylase, acid‑inducible |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,358,482 | 0 | T | A | 96.1%
| 420.8
/ 2.2
| 129 | I46F (ATC→TTC) | cadA | lysine decarboxylase, acid‑inducible |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/1); new base A (64/59); total (68/61) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GCAGGTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTAAA > NC_000913/4358386‑4358578
|
gCAGGTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAg < 2:1197858/100‑1 (MQ=255)
gCAGGTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAg < 2:85004/100‑1 (MQ=255)
ggTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAGATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGttt > 1:1891540/1‑100 (MQ=255)
ggTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGttt < 1:337469/100‑1 (MQ=255)
ggTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGttt > 1:2656759/1‑100 (MQ=255)
ggTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGttt > 2:1143981/1‑100 (MQ=255)
gTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGtttt < 2:1488894/100‑1 (MQ=255)
gTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGtttt < 2:2097170/100‑1 (MQ=255)
ttCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGAGTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTta > 2:1739754/1‑100 (MQ=255)
tctcGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTtaa > 2:1312571/1‑100 (MQ=255)
ctcGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTtaat < 1:818923/100‑1 (MQ=255)
cGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTtaataa > 1:1349805/1‑100 (MQ=255)
cGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTtaataa > 1:1564686/1‑100 (MQ=255)
cGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTtaataa > 1:2041575/1‑100 (MQ=255)
gTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAg > 1:84515/1‑100 (MQ=255)
gTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAg > 2:3100161/1‑100 (MQ=255)
tCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATGATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAgtc > 1:2097103/1‑100 (MQ=255)
aTTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAgtcgt > 2:2993308/1‑100 (MQ=255)
tttGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCa > 2:2847155/1‑100 (MQ=255)
gCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACgg < 2:1973654/100‑1 (MQ=255)
cTAATTTCTTCTCACAGCTCTATATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTTTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGt < 1:1227949/100‑1 (MQ=255)
cTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTTAAAAATAACGCCACACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGATATAATAAGTCGACACGGt > 1:2423925/1‑100 (MQ=255)
cTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGt > 1:3143354/1‑100 (MQ=255)
tAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTc > 2:441524/1‑100 (MQ=255)
tAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTc < 2:2837727/100‑1 (MQ=255)
ccgatctttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTc < 2:2655908/93‑1 (MQ=255)
tttATTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGtt > 1:2746758/1‑100 (MQ=255)
ttcttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTc > 1:1242430/1‑100 (MQ=255)
tcttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCg < 1:748665/100‑1 (MQ=255)
cttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCgg > 1:3421594/1‑100 (MQ=255)
cttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCgg > 1:3275101/1‑100 (MQ=255)
ttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTcagatcgg > 1:2655870/1‑93 (MQ=255)
ttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCggg < 2:1294733/100‑1 (MQ=255)
cGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTa < 2:359107/100‑1 (MQ=255)
gCACAGCTCGATATTATATTTATCCCAGTCAAAGATAATGACGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTTACGGTCGTTCGGGt < 1:801265/98‑1 (MQ=255)
gCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTaa > 2:2152895/1‑100 (MQ=255)
gCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTaa > 2:1839240/1‑100 (MQ=255)
cacaGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTaaa > 1:478361/1‑100 (MQ=255)
acaGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAAc < 2:524460/100‑1 (MQ=255)
aGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACaa > 1:136277/1‑100 (MQ=255)
gCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAAt > 1:723596/1‑100 (MQ=255)
cTCGAGATTATATTTATCCCTGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATc > 1:2129434/1‑100 (MQ=255)
cTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATc < 1:617965/100‑1 (MQ=255)
tCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCt < 2:1803413/100‑1 (MQ=255)
tCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCt > 1:469890/1‑100 (MQ=255)
cGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTg < 2:1598749/100‑1 (MQ=255)
cGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTg > 2:3457873/1‑100 (MQ=255)
agaTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGa < 2:1619814/100‑1 (MQ=255)
agaTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGa > 2:1226528/1‑100 (MQ=255)
aTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAg < 2:525790/100‑1 (MQ=255)
aTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAg < 2:1938932/100‑1 (MQ=255)
aTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAg < 2:2436624/100‑1 (MQ=255)
aTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAg < 2:3231179/100‑1 (MQ=255)
ttATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGAGGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACagatcggaaga > 2:2444832/1‑90 (MQ=255)
atatTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTc < 2:1930157/100‑1 (MQ=255)
atTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAg > 1:829680/1‑100 (MQ=255)
tttATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGa > 2:769047/1‑100 (MQ=255)
tATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACg > 2:863112/1‑100 (MQ=255)
aTCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGt > 1:942528/1‑100 (MQ=255)
cccAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTc > 1:440781/1‑100 (MQ=255)
cccAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTc > 2:1427761/1‑100 (MQ=255)
cccAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTc > 1:1194637/1‑100 (MQ=255)
ccAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCa < 1:2465408/100‑1 (MQ=255)
aGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAg < 1:1086663/100‑1 (MQ=255)
aGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAg < 1:2880410/100‑1 (MQ=255)
gTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgc > 2:1841338/1‑100 (MQ=255)
gTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgc > 2:329144/1‑100 (MQ=255)
tCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgcg < 1:1143966/100‑1 (MQ=255)
cAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgcgc > 1:2243661/1‑100 (MQ=255)
cAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgcgc > 2:2715361/1‑100 (MQ=255)
cAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgcgc > 2:3041842/1‑100 (MQ=255)
cAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgcgc > 2:2572780/1‑100 (MQ=255)
aaaaaTAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACCTTCAAgcgcg > 2:3099850/1‑100 (MQ=255)
aaaTAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGACCAGTTTTACTAAGTCGACACAGTCGTTCCGGTAAACAATCTTGAAGTTCAGACGTTCatacccgcg < 1:2598454/100‑9 (MQ=255)
aTAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGAt < 1:1275756/100‑1 (MQ=255)
cgccgcACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAg > 2:3360491/1‑100 (MQ=255)
cgccgcACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAg < 2:136279/100‑1 (MQ=255)
cgccgcACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAg > 2:2533064/1‑100 (MQ=255)
acaGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACg < 1:1739729/100‑1 (MQ=255)
caGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACgg < 1:3065127/100‑1 (MQ=255)
gtggcgcATTGGTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCTTCACGGTCGGTAGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGAGCGCGATGAAGTTCACGGAt < 1:1561158/97‑1 (MQ=255)
gACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGAt > 1:1085113/1‑100 (MQ=255)
aCGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATg < 2:354320/100‑1 (MQ=255)
aCGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATg < 1:2459562/100‑1 (MQ=255)
cgcATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGt > 2:2473506/1‑100 (MQ=255)
gcATTGTTTTCTAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGTAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATggg < 1:3470664/98‑1 (MQ=255)
gcATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGtt > 2:2171126/1‑100 (MQ=255)
aTTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttct > 2:2331495/1‑100 (MQ=255)
aTTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttct < 2:3246832/100‑1 (MQ=255)
ttGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttctt < 1:2418095/100‑1 (MQ=255)
tGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttcttc < 2:3001975/100‑1 (MQ=255)
tGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttcttc < 1:2355074/100‑1 (MQ=255)
gTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTtcttct > 1:1028118/1‑100 (MQ=255)
gTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTtcttct < 2:1564708/100‑1 (MQ=255)
gTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTtcttct > 1:3050041/1‑100 (MQ=255)
ttttCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTcttctt > 1:996538/1‑100 (MQ=255)
ttttCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTcttctt > 1:291848/1‑100 (MQ=255)
ttCGAACAGTTTTTTTAAGTCGTTACGGTGGTGTGGGTAAACAATCTGGAAGGTCAGACGTTTAAGCGCGTGATGAAGTGAACGGATGGGTACTTCTTTa < 1:1019299/100‑1 (MQ=255)
tCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTaa < 1:2871453/100‑1 (MQ=255)
cGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTaaa > 1:2273480/1‑100 (MQ=255)
|
GCAGGTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTAAA > NC_000913/4358386‑4358578
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
