Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F212 I0 R1
|
246 |
122.0 |
6097616 |
93.1% |
5676880 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,358,482 |
T→A |
18.5% |
I46F (ATC→TTC) |
cadA ← |
lysine decarboxylase, acid‑inducible |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,358,482 | 0 | T | A | 18.5%
| 314.8
/ 61.5
| 140 | I46F (ATC→TTC) | cadA | lysine decarboxylase, acid‑inducible |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (52/62); new base A (15/11); total (67/73) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.85e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.69e-01 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ACGGCAGGTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTAAAA > NC_000913/4358383‑4358579
|
aCGGCAGGTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATTCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAt > 2:2651079/1‑100 (MQ=255)
aCGGCAGGTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAt > 1:59382/1‑100 (MQ=255)
gCAGGTTCTCGTTGATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCTAGTCAAAAATAACGCCGCATAGACGCGCATTGTTTTCGATCAg < 2:1332478/100‑1 (MQ=255)
ggTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGttt > 1:2374756/1‑100 (MQ=255)
ttCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTta > 2:2753714/1‑100 (MQ=255)
tctcGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGGCGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTtaa < 1:1847103/100‑1 (MQ=255)
ctcGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTtaat < 1:121469/100‑1 (MQ=255)
tcGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTTGATATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTtaata < 1:2380533/100‑1 (MQ=255)
tcGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTtaata < 1:1048819/100‑1 (MQ=255)
tcGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTtaata < 1:948517/100‑1 (MQ=255)
cGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTtaataa > 1:2340990/1‑100 (MQ=255)
gTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAg > 1:2845492/1‑100 (MQ=255)
gTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCAAGTCAAAAATAACGCCGAACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAg > 2:563500/1‑100 (MQ=255)
ttCATTTTGCTAATTTCTTCGAACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAgt < 2:2585522/100‑1 (MQ=255)
tCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAgtc < 2:1246664/100‑1 (MQ=255)
cATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCCCAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAgtcg < 2:1614120/100‑1 (MQ=255)
cATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAgtcg > 1:2763820/1‑100 (MQ=255)
cATTTTGCTAATTCCTTCGCACAGCTCGAGACTATATTTATCGCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAgtcg > 1:2048184/1‑100 (MQ=255)
tttGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCa < 1:865507/100‑1 (MQ=255)
tttGCTAATTTCTTCACACAGCTCGAGATTATCTCTATCCCAGTAAAAAATAACGTCGAACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGGCGTCa < 2:951112/100‑1 (MQ=255)
ttGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCAc > 2:3004146/1‑100 (MQ=255)
tGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACg > 2:1618688/1‑100 (MQ=255)
cTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGt < 1:2856671/100‑1 (MQ=255)
cTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGt > 1:2439779/1‑100 (MQ=255)
cTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGt > 2:1845321/1‑100 (MQ=255)
tcttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCg < 1:1370483/100‑1 (MQ=255)
ttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCTAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCggg < 1:1202636/100‑1 (MQ=255)
ttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCTTTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTTACGGTCGTTCggg < 1:2049074/100‑1 (MQ=255)
ttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCggg < 1:2714695/100‑1 (MQ=255)
tcGCACAGCTCTAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATATCGCCGTACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTGTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGt < 1:2649959/100‑1 (MQ=255)
tcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGt < 1:742367/100‑1 (MQ=255)
tagCACAGCTCGAGATTATATTTATCCTAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATAGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTAGTCACGGTCGTTCGGGt > 1:2736515/3‑100 (MQ=255)
cacaGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTaaa < 2:514478/100‑1 (MQ=255)
cacaGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTaaa > 1:920350/1‑100 (MQ=255)
cacaGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTaaa > 2:754217/1‑100 (MQ=255)
cacaGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGCTTACGATCATTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTaaa > 2:2131984/1‑100 (MQ=255)
cTCGAGATTATGTTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATc > 2:2175401/1‑100 (MQ=255)
cTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATCAATCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATc > 2:2116247/1‑100 (MQ=255)
cTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATc > 1:1947967/1‑100 (MQ=255)
cTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATc > 1:166004/1‑100 (MQ=255)
tCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCt > 2:355388/1‑100 (MQ=255)
cGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTg < 1:1696864/100‑1 (MQ=255)
cGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACACACGCGCATTGTTTTCGATCAATTTTAATAAGTCGTCACGGACATTCGGGTAAACAATCt > 1:840532/1‑99 (MQ=255)
cgatcttatTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGa < 1:2252037/94‑1 (MQ=255)
agaTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGa < 2:594585/100‑1 (MQ=255)
agaTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGa < 2:1652341/100‑1 (MQ=255)
agaTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATATgca > 2:1928399/1‑98 (MQ=255)
aTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAg > 2:85786/1‑100 (MQ=255)
ttATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGTTCGTACGAGTAAACAATATGGAAGt > 1:1170146/1‑100 (MQ=255)
ttATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGt < 2:1347136/100‑1 (MQ=255)
atatTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTc > 2:1469900/1‑100 (MQ=255)
tatTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAgatcg > 2:2252013/1‑96 (MQ=255)
tatTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCa < 2:2277262/100‑1 (MQ=255)
atTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAATAATCTGGAAGTTCAg < 2:618113/100‑1 (MQ=255)
atTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCAGGTAAAAAATCTAGAATTTCa > 1:1488230/1‑99 (MQ=255)
atTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGATCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAg > 1:2420911/1‑100 (MQ=255)
ttATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGAc < 1:2613857/100‑1 (MQ=255)
ttATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGAc > 2:1275951/1‑100 (MQ=255)
tCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTTTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGt < 1:2132007/99‑1 (MQ=255)
tCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGtt > 2:1019485/1‑100 (MQ=255)
cccAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTc > 1:899637/1‑100 (MQ=255)
cccAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTc > 1:339695/1‑100 (MQ=255)
ccAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCa < 1:2326891/100‑1 (MQ=255)
ccAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCa > 2:2057603/1‑100 (MQ=255)
attCAAAAATAACGACGTATAGACGCGTATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAg < 1:752953/98‑1 (MQ=255)
gTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgc > 1:2558815/1‑100 (MQ=255)
cAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgc > 1:500924/1‑98 (MQ=255)
aaaaTAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAg < 2:1510270/95‑1 (MQ=255)
aaaTAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGcgcgcg < 2:420246/100‑1 (MQ=255)
aaaTAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGcgcgcg < 2:2095989/100‑1 (MQ=255)
aaTAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGa < 2:2472263/100‑1 (MQ=255)
tAACGCCGCACATACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGAt < 1:1092069/99‑1 (MQ=255)
tAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATg < 1:1143666/100‑1 (MQ=255)
aCGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGaa > 1:1491459/1‑100 (MQ=255)
cgccgcACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAg > 1:2735684/1‑100 (MQ=255)
gccgcACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGATCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGt < 1:1845342/100‑1 (MQ=255)
cgcACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTc < 2:2288329/100‑1 (MQ=255)
acaGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACg < 1:570419/100‑1 (MQ=255)
acaGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACg < 1:1795983/100‑1 (MQ=255)
aCGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATg < 2:1694676/100‑1 (MQ=255)
cgcgCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATgg > 1:1608352/1‑100 (MQ=255)
gcgcATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATggg < 2:2827009/100‑1 (MQ=255)
cgcATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGCTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATggg > 2:2232540/1‑99 (MQ=255)
gcATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGtt > 2:1947583/1‑100 (MQ=255)
aTTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttc < 2:1037692/99‑1 (MQ=255)
aTTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttct < 2:1409086/100‑1 (MQ=255)
ttttttCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttcttc < 2:198976/98‑1 (MQ=255)
tGTTTTCGATCAGTTTTAATATGTCGTCAGGGTCGTTCGGGTAAACAATCTTGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttcttc < 2:323024/100‑1 (MQ=255)
tGTTTTCGATCAGTTTTAATACGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAGTCTGGAAGTTGTGAGGTTCAAGCGCGCGATGAGGTTAACGTATGGGttcttc < 2:2468225/100‑1 (MQ=255)
tGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCTCGATGAAGTTCACGGATGGGttcttc < 2:2744987/100‑1 (MQ=255)
gTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttcttc < 2:2606331/99‑1 (MQ=255)
gTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTtcttct < 1:1896397/100‑1 (MQ=255)
gTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTtcttct > 1:100634/1‑100 (MQ=255)
gTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTtcttct > 1:1958929/1‑100 (MQ=255)
ttttCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTcttctt < 1:490015/100‑1 (MQ=255)
ttttCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTcttctt < 2:22904/100‑1 (MQ=255)
tttCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTcttctt < 2:1982206/99‑1 (MQ=255)
ttCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAGGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTa > 1:217198/1‑100 (MQ=255)
tCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTaa < 2:92292/100‑1 (MQ=255)
gATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTaaaa > 1:2411775/1‑100 (MQ=255)
|
ACGGCAGGTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTAAAA > NC_000913/4358383‑4358579
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
