Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F212 I0 R1
|
246 |
122.0 |
6097616 |
93.1% |
5676880 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,058,585 |
C→T |
30.4% |
intergenic (‑175/+81) |
serA ← / ← rpiA |
D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/ribose 5‑phosphate isomerase, constitutive |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,058,585 | 0 | C | T | 30.4%
| 163.6
/ 88.5
| 122 | intergenic (‑175/+81) | serA/rpiA | D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/ribose 5‑phosphate isomerase, constitutive |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (46/37); new base T (24/13); total (72/50) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.23e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.56e-01 |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTT > NC_000913/3058486‑3058683
|
ggCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGAc < 2:1285771/100‑1 (MQ=255)
gCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACa < 2:1913296/100‑1 (MQ=255)
tatGAACGTTTGCGTCGCGATGGTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTg < 2:1716364/100‑1 (MQ=255)
atGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGc > 2:891265/1‑100 (MQ=255)
tGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATAACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATACGGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAAttcc > 2:1351393/1‑97 (MQ=255)
gAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCt < 1:140644/100‑1 (MQ=255)
aaCGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTg < 2:2423249/100‑1 (MQ=255)
cGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGt > 1:1597916/1‑100 (MQ=255)
gTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTa < 2:216613/100‑1 (MQ=255)
tGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTaaaa > 2:1029477/1‑100 (MQ=255)
tGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTaaaa > 2:2363532/1‑100 (MQ=255)
gCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAg < 1:1100447/100‑1 (MQ=255)
cgcgATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTg < 2:1921725/100‑1 (MQ=255)
cgcgATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTg < 2:104254/100‑1 (MQ=255)
gcgATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGa > 1:2187203/1‑100 (MQ=255)
cgATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGac < 2:2141125/100‑1 (MQ=255)
cgATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGac < 1:1208355/100‑1 (MQ=255)
gATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGaca < 2:1558422/100‑1 (MQ=255)
gATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGaca > 2:2955543/1‑100 (MQ=255)
tGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGAcaca > 1:2162710/1‑100 (MQ=255)
gTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATGTGCTGGATTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGAAAATTGCCTGGTAAAAGCGTGAcaca > 2:2555474/1‑99 (MQ=255)
ttGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATg < 1:1414294/100‑1 (MQ=255)
tGAGGAAATATCACGCAACGGTAATTATTGGATGAATATGCTGGTTTATAGGATATATTTAGAGGAATCGACAATTGCGTGGTAAAAGCGTGAAACATg > 2:700293/1‑99 (MQ=255)
tGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGTTGACTCTGTTGTTATAAAGGAAAAATTTAGAAAAATCGACAATTGCCTTGTAAAAGCGTGACACATGt > 1:62501/1‑100 (MQ=255)
tGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGt > 2:1928973/1‑100 (MQ=255)
tGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGt > 1:758536/1‑100 (MQ=255)
tGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGt > 2:767048/1‑100 (MQ=255)
gAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATg > 1:2847308/1‑98 (MQ=255)
ggAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGTAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACAAATGTCAc > 1:982334/1‑100 (MQ=255)
ggAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCAc > 1:2357368/1‑100 (MQ=255)
cACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCAGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTa > 1:454801/1‑100 (MQ=255)
gCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATTGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTaa < 1:2295673/98‑1 (MQ=255)
gCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATg < 2:395568/100‑1 (MQ=255)
gCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATg < 2:1281535/100‑1 (MQ=255)
gCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATg < 2:1718238/100‑1 (MQ=255)
gCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGAAAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTa > 2:745049/1‑97 (MQ=255)
cAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGa > 2:2289306/1‑100 (MQ=255)
ggTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAagag > 1:1747701/1‑100 (MQ=255)
aTTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtt > 2:349928/1‑100 (MQ=255)
tCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTAATTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtttt > 1:2891211/1‑100 (MQ=255)
cTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAttttt < 1:894335/100‑1 (MQ=255)
cTTGGATGAATATGCTGGATTAGAGGATTAATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtttt > 2:1471498/1‑99 (MQ=255)
ttGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtttttn < 1:2369443/100‑2 (MQ=255)
ttGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtttttt < 2:2955693/100‑1 (MQ=255)
ccgatctaaTATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtttttt < 2:375718/93‑1 (MQ=255)
ggATGAATATGCTGGTTTAGAGGAGTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCATGGTAAAAGCGTGACACATGTAACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTa > 2:1422852/1‑100 (MQ=255)
gATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTaa > 2:798607/1‑100 (MQ=255)
aTGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAAc > 1:2220883/1‑100 (MQ=255)
aTGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATATTTTTAAc > 1:1547999/1‑100 (MQ=255)
tGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAAc < 1:2521511/99‑1 (MQ=255)
tGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACg > 2:1642204/1‑100 (MQ=255)
gAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACgg < 1:2104955/100‑1 (MQ=255)
aaTATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACggg > 1:1750942/1‑100 (MQ=255)
tatGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACggggg > 1:1425744/1‑100 (MQ=255)
tatGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACg > 1:515303/1‑96 (MQ=255)
atGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGa > 1:1466605/1‑100 (MQ=255)
tGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAg > 2:1897588/1‑100 (MQ=255)
gCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACTGGGGa > 2:806678/1‑98 (MQ=255)
gCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAg > 1:470247/1‑99 (MQ=255)
gCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAgg > 2:1568236/1‑100 (MQ=255)
cTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAgg > 1:2782384/1‑99 (MQ=255)
tagTTTAGAGGATTTACTTAGAGCAATCGACAATTGCCTCGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAAGt < 2:2121137/97‑1 (MQ=255)
tGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGaacct < 1:2174973/100‑5 (MQ=255)
ttAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTcccc < 1:479031/100‑1 (MQ=255)
tAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTccc > 1:2587346/1‑98 (MQ=255)
tAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTccccc < 2:2043824/100‑1 (MQ=255)
agagGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCg < 1:1159208/100‑1 (MQ=255)
agagGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCg < 1:1133242/100‑1 (MQ=255)
agagGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAAAAATTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCg > 1:1204902/1‑100 (MQ=255)
gagGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGt > 1:2601733/1‑100 (MQ=255)
agGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTc < 2:674030/100‑1 (MQ=255)
ggATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAACCTCCCCCGtta < 2:1273452/100‑3 (MQ=255)
ggATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCa > 1:2971734/1‑100 (MQ=255)
ggATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCa > 2:1468390/1‑100 (MQ=255)
gATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAg < 2:1637418/100‑1 (MQ=255)
gATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAg < 2:2061921/100‑1 (MQ=255)
gATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAg > 1:104212/1‑100 (MQ=255)
gATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAg > 1:1555354/1‑100 (MQ=255)
tttatttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGAt > 2:406975/1‑100 (MQ=255)
atttaGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGAGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAAAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCACCAGTCAGATCAt > 1:2889262/1‑100 (MQ=255)
atttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCAt > 2:287397/1‑100 (MQ=255)
tttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAATCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTGAACGGGGGAACCTCCCCCGttaaaaaaat < 1:1255467/100‑10 (MQ=37)
tttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCAtn < 2:1819685/100‑2 (MQ=255)
taGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTc > 2:1067984/1‑100 (MQ=255)
taGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTc < 1:2759667/100‑1 (MQ=255)
taGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTc < 2:2891179/100‑1 (MQ=255)
agagCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTca < 1:1592796/100‑1 (MQ=255)
agagCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTca > 1:2567732/1‑100 (MQ=255)
agagCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTca < 2:1419983/100‑1 (MQ=255)
gagCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTcac < 2:1709232/100‑1 (MQ=255)
gCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACaa > 2:2156279/1‑100 (MQ=255)
gCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCACCGTCAGATCATTTCACaa > 1:1240492/1‑100 (MQ=255)
gCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGAGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACaa > 2:2156331/1‑100 (MQ=255)
gCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACaa > 1:2450334/1‑100 (MQ=255)
cAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGAGGAGGTTCCCCAGTCAGATCATTTCACAAt > 1:2400833/1‑100 (MQ=255)
cAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAAt < 2:104211/100‑1 (MQ=255)
gACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGttt < 2:2357341/100‑1 (MQ=255)
gACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGttt > 1:2468624/1‑100 (MQ=255)
cAATTGCCTGGTAATAGCGTGACACATGTTACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGtttt < 1:1862234/99‑1 (MQ=255)
cAATTGCCTGGTAAAAGCGTGAAACATATCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGtttt > 2:710158/1‑99 (MQ=255)
|
GGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTT > NC_000913/3058486‑3058683
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
