Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F204 I0 R1
|
247 |
174.3 |
8556966 |
94.2% |
8060661 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,360,916 |
(A)6→5 |
100% |
intergenic (+300/‑260) |
gltD → / → gltF |
glutamate synthase, 4Fe‑4S protein, small subunit/periplasmic protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,360,911 | 0 | A | . | 50.3%
| 319.2
/ inf
| 173 | intergenic (+295/‑265) | gltD/gltF | glutamate synthase, 4Fe‑4S protein, small subunit/periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/44); new base . (44/43); total (86/87) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.80e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
ATTACTTGTTAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCA > NC_000913/3360812‑3361009
|
aTTACTTGTTAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAAtata > 2:1463664/1‑100 (MQ=255)
cTTGTTAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATaaaaa > 1:110734/1‑100 (MQ=255)
cTTGTTAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATaaaaa < 1:1386919/100‑1 (MQ=255)
cTTGTTAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATaaaaa > 2:1347192/1‑100 (MQ=255)
cTTGTTAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATaaaaa > 1:3432454/1‑100 (MQ=255)
tGTTAACACTTCTGACAATACCGATTCTACAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCAATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATaaaaaa > 1:2257173/1‑99 (MQ=255)
tGTTAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAAc > 1:3569937/1‑100 (MQ=255)
tGTTAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAAc < 1:3517097/100‑1 (MQ=255)
tGTTAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTAAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAAc < 1:1945792/100‑1 (MQ=255)
gTTAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATaaaaac < 2:1655020/98‑2 (MQ=255)
ttAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCa < 1:1074315/100‑1 (MQ=255)
tAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCaa > 2:3515027/1‑100 (MQ=255)
acacCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAata > 1:398551/1‑100 (MQ=255)
cacCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAatata > 1:526798/1‑100 (MQ=255)
acCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAatata < 1:3175597/100‑1 (MQ=255)
tGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATc < 2:166783/100‑1 (MQ=255)
tGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATcc < 1:573456/100‑1 (MQ=255)
gACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATcc < 1:773654/100‑1 (MQ=255)
aaTACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTa > 1:2977066/1‑100 (MQ=255)
aTACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAAt < 2:2830949/100‑1 (MQ=255)
ccGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTAt > 1:3431535/1‑100 (MQ=255)
cGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTAt > 2:600514/1‑100 (MQ=255)
cGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTAt > 1:1557151/1‑100 (MQ=255)
gATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATc > 1:2423123/1‑100 (MQ=255)
gATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATc < 2:495462/100‑1 (MQ=255)
aTTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCtg < 2:4260183/100‑2 (MQ=255)
ttCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTGATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTa < 1:2367703/96‑1 (MQ=255)
ttCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCtat < 2:339954/100‑1 (MQ=255)
taaaaacTATTAAATCTTTTAATTCCATATAAATTCTCTCGATATTAATATATAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCtat < 1:3153202/92‑1 (MQ=255)
tGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCtatata > 2:3759812/1‑100 (MQ=255)
cAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATAtt > 2:2304761/1‑100 (MQ=255)
aaGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATAtt < 1:331414/100‑1 (MQ=255)
aaGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATAttt > 1:3672617/1‑100 (MQ=255)
gCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑ATACACCAATATATTTTCCTTAATTATCCATATAttt > 1:1903061/1‑98 (MQ=255)
tATTCAGTCTCTTCATTCCATGTAAATTGTCACGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTcc < 2:2987818/100‑1 (MQ=255)
aTTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCt > 1:1849637/1‑100 (MQ=255)
ttCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTAt > 2:2824582/1‑100 (MQ=255)
tCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTAtt < 2:3744810/100‑1 (MQ=255)
tCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTATAGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAAACAATATATTATCCTTAATTATTTATATATTTTcat > 1:3778692/1‑96 (MQ=255)
agacTTTTCATACCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTAtttt < 1:1062075/97‑1 (MQ=255)
aGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTAttt > 2:3186330/1‑100 (MQ=255)
gTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTAtttt > 2:3235828/1‑100 (MQ=255)
gTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTAttttt > 2:1856054/1‑100 (MQ=255)
gTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTAtttt < 1:1928039/99‑1 (MQ=255)
cTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCa > 2:107490/1‑100 (MQ=255)
ttttCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTAttttttt > 1:2002523/1‑98 (MQ=255)
ttttCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCa < 1:1642781/99‑1 (MQ=255)
tCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAgcgc < 1:1758910/100‑1 (MQ=255)
aTTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCa > 1:252206/1‑100 (MQ=255)
aTTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTAACTATATATTTTCCTATTTTTAAgcg > 1:1980957/1‑98 (MQ=255)
aTTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCATTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCa > 1:254720/1‑100 (MQ=255)
ccATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAAc < 2:2955101/100‑1 (MQ=255)
ccATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACa < 1:2793728/100‑1 (MQ=255)
cATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACa > 2:1337688/1‑100 (MQ=255)
cATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACa < 2:1738291/100‑1 (MQ=255)
cATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACAt > 1:4252670/1‑100 (MQ=255)
tGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTc > 1:2212472/1‑100 (MQ=255)
tGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTc > 1:3939740/1‑100 (MQ=255)
gTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCa < 1:655543/100‑1 (MQ=255)
aaaTTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCa < 2:538509/99‑1 (MQ=255)
aaaTTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCAt > 2:3672969/1‑100 (MQ=255)
aaaTTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATg > 2:3798923/1‑100 (MQ=255)
aaaTTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATg < 1:2133114/100‑1 (MQ=255)
ttGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTaa < 2:404344/100‑1 (MQ=255)
ttGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTaa < 1:2304755/100‑1 (MQ=255)
tctcGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAAt > 1:839081/1‑99 (MQ=255)
ctcGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGaa > 2:2195160/1‑100 (MQ=255)
ctcGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGaa > 1:3357909/1‑100 (MQ=255)
ctcGATATTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGa > 1:2070723/1‑99 (MQ=255)
cGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGaat < 2:4132734/100‑1 (MQ=255)
cGATAATAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTCTTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGaat < 2:1868348/100‑1 (MQ=255)
atatTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATg < 1:978212/89‑1 (MQ=255)
atatTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGaataat < 2:3131176/100‑1 (MQ=255)
atTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTa > 2:1173645/1‑100 (MQ=255)
atTAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTa < 2:3567996/100‑1 (MQ=255)
ttAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTa > 2:676071/1‑100 (MQ=255)
ttAATATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTAt > 2:2754353/1‑100 (MQ=255)
aaTATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAGACATTCATGTAATGAATAATTATc < 1:1461629/100‑1 (MQ=255)
aaTATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTAGCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATTACATGaatgtttgcg < 1:4051356/100‑8 (MQ=255)
aaTATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATca > 2:389765/1‑100 (MQ=255)
aaTATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATca < 2:2225273/100‑1 (MQ=255)
aaTATACAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATca > 2:759421/1‑100 (MQ=255)
tataCAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATcac < 2:1078116/100‑1 (MQ=255)
gatctaaaTATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATcacc < 2:2633708/95‑1 (MQ=255)
ataCAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATTAATAATTATcacc < 2:2106647/99‑1 (MQ=255)
taCAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATcacca > 2:1524156/1‑100 (MQ=255)
cAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTTATCTTAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACcaca > 1:3039212/1‑100 (MQ=255)
cAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACcaca > 2:484111/1‑100 (MQ=255)
cAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATAGATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACcaca > 2:1917615/1‑100 (MQ=255)
cAAAATATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCGTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACaa > 2:3330578/1‑100 (MQ=255)
aaaTATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTGTCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATcaccagatc > 1:2633699/1‑96 (MQ=255)
aaTATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAacc < 1:4092956/100‑1 (MQ=255)
aaTATGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAacc > 2:3701417/1‑100 (MQ=255)
tatGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAacca < 2:1559192/100‑1 (MQ=255)
tatGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAaccac < 2:3650966/100‑1 (MQ=255)
atGAATAT‑AAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAaccacc < 2:902757/100‑1 (MQ=255)
tGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAaccacc < 1:1833568/100‑1 (MQ=255)
aaTATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTc > 2:2386067/1‑100 (MQ=255)
tataAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCAc > 2:3102973/1‑100 (MQ=255)
taAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCa > 1:2751856/1‑100 (MQ=255)
|
ATTACTTGTTAACACCTCTGACAATACCGATTCTGCAAGCTATTCAGTCTTTTCATTCCATGTAAATTGTCTCGATATTAATATACAAAATATGAATATAAAAAACCAATATATTATCCTTAATTATCTATATATTTTCCTATTTTTCAGCGCAAACATTCATGTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCA > NC_000913/3360812‑3361009
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
