Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F204 I0 R1
|
247 |
174.3 |
8556966 |
94.2% |
8060661 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,310,728 |
T→C |
53.6% |
I85V (ATT→GTT) |
alsA ← |
D‑allose ABC transporter ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,310,728 | 0 | T | C | 53.6%
| 33.8
/ 183.3
| 141 | I85V (ATT→GTT) | alsA | D‑allose ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/33); new base C (38/37); total (71/70) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.20e-01 |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGA > NC_000913/4310632‑4310827
|
taataTTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCATTCCGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAaacaat > 1:1067213/1‑100 (MQ=255)
atatTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATcc < 1:684625/100‑1 (MQ=255)
atTGACGCCACAGCTTTTTTTCGTCAGATTACGACCAATATATAAATTTACCAGTCCGGTTAATTCATCAATAACGCTGAATTCCTGATAAACAATcc > 1:3228803/1‑98 (MQ=255)
atTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCg > 2:2014507/1‑100 (MQ=255)
atTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCg < 2:3721921/100‑1 (MQ=255)
ttGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGa > 2:1997566/1‑100 (MQ=255)
tGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGAt < 1:3745280/100‑1 (MQ=255)
gACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGAt > 1:3770959/1‑99 (MQ=255)
gACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATa > 2:79109/1‑100 (MQ=255)
gCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATAcc > 2:4237695/1‑99 (MQ=255)
cacaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAg > 2:4102982/1‑100 (MQ=255)
cacaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAg > 1:552799/1‑100 (MQ=255)
gATTTTTTTCGTCAGATGACGCCCAATATATCCATTTTCCAGTACGGTTACTTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCTATACCTAGTtg < 1:3998443/99‑1 (MQ=255)
gATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATCCCGAGtt > 1:3692364/1‑98 (MQ=255)
gATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTtgt < 1:1575772/100‑1 (MQ=255)
ttttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGc > 1:784125/1‑100 (MQ=255)
ttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCgn < 1:3500428/98‑2 (MQ=255)
gTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATCCCGAGTTGTGCGGCTAAt > 2:3046319/1‑99 (MQ=255)
gTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAAtt > 2:67985/1‑100 (MQ=255)
gTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAAtt > 1:3133475/1‑100 (MQ=255)
tCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAAttt < 1:1766776/100‑1 (MQ=255)
cAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTa > 2:3796855/1‑100 (MQ=255)
cAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTa > 2:3982880/1‑100 (MQ=255)
cAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGCTAATTCACCAATAACGCTTACTTCCTGATAAATAATCCACATACCAACTTGTAGCGCTAAttac > 1:4178131/1‑98 (MQ=255)
aGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTa < 2:3352024/99‑1 (MQ=255)
aGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTAt < 2:2536095/100‑1 (MQ=255)
tGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGAt < 2:3376472/100‑1 (MQ=255)
tGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGAt > 1:19789/1‑100 (MQ=255)
tGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGAt < 2:3341792/100‑1 (MQ=255)
acgacCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATcc < 1:1685837/100‑1 (MQ=255)
gacCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAg < 1:3987219/100‑1 (MQ=255)
acCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAAGAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGc < 1:1923551/100‑1 (MQ=255)
ccAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCt > 1:2201722/1‑100 (MQ=255)
aaTATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTg > 1:3373986/1‑100 (MQ=255)
aaTATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTg < 2:1589772/100‑1 (MQ=255)
aaTATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTg < 1:79109/100‑1 (MQ=255)
atatatAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGt < 1:2350550/100‑1 (MQ=255)
tatataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGtt < 1:4218879/100‑1 (MQ=255)
tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGCGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGCta > 1:1302797/1‑99 (MQ=255)
tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtat > 2:1292366/1‑100 (MQ=255)
tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATCCCGAGTTGTGCCGCAAATTTATGATcc > 1:1115685/1‑90 (MQ=255)
ataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtata < 2:3119517/100‑1 (MQ=255)
ataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtata > 2:3031819/1‑100 (MQ=255)
taAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAg > 2:1484427/1‑100 (MQ=255)
taAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAg > 1:1464938/1‑100 (MQ=255)
taAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAg > 2:272112/1‑100 (MQ=255)
aaaTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGc > 2:942890/1‑100 (MQ=255)
aaaTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGc < 2:583442/100‑1 (MQ=255)
aaaTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGc < 1:14608/100‑1 (MQ=255)
aTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTa > 1:2928986/1‑100 (MQ=255)
aTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTa > 2:497934/1‑100 (MQ=255)
aTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTa < 1:1331485/100‑1 (MQ=255)
tttCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTTATAAACAATCCCGATACCGAGGTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAAt < 1:3005389/100‑1 (MQ=255)
tttCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAAt > 1:2667156/1‑100 (MQ=255)
ttCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATg > 2:1711709/1‑100 (MQ=255)
ccAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGtt > 2:3820964/1‑100 (MQ=255)
cAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGtta > 1:2203297/1‑100 (MQ=255)
aGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGttat < 1:1930587/100‑1 (MQ=255)
aGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGttat > 1:724810/1‑100 (MQ=255)
gTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGttatt > 2:215362/1‑100 (MQ=255)
tACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGttatta > 2:2012571/1‑100 (MQ=255)
cGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaat < 1:3308575/100‑1 (MQ=255)
cGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaat > 2:461586/1‑100 (MQ=255)
ggTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatg > 1:985280/1‑100 (MQ=255)
aaTTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaa > 1:666744/1‑100 (MQ=255)
ttCATCAATAACGCTGAGTTCCTTATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatg < 1:134669/100‑1 (MQ=255)
tcatcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatgg < 2:4175862/100‑1 (MQ=255)
tcatcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatgg > 1:3206327/1‑100 (MQ=255)
tcatcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatgg > 2:3480851/1‑100 (MQ=255)
atcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTg > 2:703906/1‑100 (MQ=255)
caATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGcc < 2:2859200/100‑1 (MQ=255)
caATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGcc < 2:1749578/100‑1 (MQ=255)
aaTAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCt > 2:1074918/1‑100 (MQ=255)
aaTAACGCTGAGTTCCTGATAAAAAATCCCGATACCGAGATGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTGATTaatggtaatggt > 1:4146473/1‑96 (MQ=255)
aTAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCtt > 2:2209345/1‑100 (MQ=255)
tAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCttt < 1:648025/100‑1 (MQ=255)
gCTGAGTTCCTGATATACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTc < 2:4214169/100‑1 (MQ=255)
gCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTc < 2:814326/100‑1 (MQ=255)
gCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTc < 1:865386/100‑1 (MQ=255)
tGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCgg > 2:2471925/1‑100 (MQ=255)
gAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc < 2:4178153/100‑1 (MQ=255)
gAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc < 2:2386552/100‑1 (MQ=255)
gAGGTCCTGATAAATAATCCGGATACCGAGTTGTGCCGGTAATGTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGGTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc < 1:3015641/100‑1 (MQ=255)
gTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGGTCCAGCTTGTTATAGCTGATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTc < 1:4070177/100‑1 (MQ=255)
gTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc > 1:2318567/1‑98 (MQ=255)
tCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCAt > 2:3922552/1‑100 (MQ=255)
ccTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg < 1:2729269/100‑1 (MQ=255)
ccTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg < 1:2862295/100‑1 (MQ=255)
ccTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg > 1:3297325/1‑100 (MQ=255)
ccTGATAAACAATCCCGATACAGAGGTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg > 1:3585396/1‑100 (MQ=255)
cTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTTTGCCGCTAATTTATGTTCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg < 1:1845516/99‑1 (MQ=255)
cTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGt > 1:482620/1‑100 (MQ=255)
cTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGt > 2:1339130/1‑100 (MQ=255)
tGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTa > 1:3872909/1‑100 (MQ=255)
gATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTAt > 2:2218918/1‑100 (MQ=255)
gATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGATAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg < 1:3869746/97‑1 (MQ=255)
ataaacaaTCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTAtt > 2:3989993/1‑100 (MQ=255)
taaataaTCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTc > 2:2819408/1‑100 (MQ=255)
ataatCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCgg > 2:2263478/1‑100 (MQ=255)
taatCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGa < 1:448037/100‑1 (MQ=255)
|
TAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGA > NC_000913/4310632‑4310827
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
