Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F133 I0 R1
|
200 |
171.4 |
8351354 |
94.3% |
7875326 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,310,728 |
T→C |
78.6% |
I85V (ATT→GTT) |
alsA ← |
D‑allose ABC transporter ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,310,728 | 0 | T | C | 78.6%
| 412.7
/ 103.2
| 205 | I85V (ATT→GTT) | alsA | D‑allose ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (22/22); new base C (74/85); total (98/107) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.35e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.41e-01 |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
CGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCG > NC_000913/4310629‑4310825
|
cGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCACTATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGataaat > 2:3367566/1‑100 (MQ=255)
taataTTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAaacaat < 2:2677564/100‑1 (MQ=255)
taataTTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTCTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAaacaat > 2:20391/1‑100 (MQ=255)
aataTTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATc < 1:3879484/100‑1 (MQ=255)
atatTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATcc < 1:2214425/100‑1 (MQ=255)
tatTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATccc < 2:1866663/100‑1 (MQ=255)
cGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATAcc < 1:1607249/100‑1 (MQ=255)
gCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCg < 2:2147094/100‑1 (MQ=255)
cacaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGCTTCCCTGATAAATAATCCCAATAccaa > 1:3826128/1‑97 (MQ=255)
cacaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAg > 1:4083030/1‑100 (MQ=255)
cacaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAg > 1:315797/1‑100 (MQ=255)
acaGATTTTTTTTTTTTTTTGTCGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCgtgt > 2:1049882/1‑100 (MQ=255)
acaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGt < 2:1134243/100‑1 (MQ=255)
aGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATATATTTTCCATTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTACCTGACAAACAATCCCGATACCAAGtt < 2:3031216/99‑1 (MQ=255)
aGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTtg > 1:1040955/1‑100 (MQ=255)
aGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTtg < 1:999083/100‑1 (MQ=255)
gATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTtgt > 1:3253236/1‑100 (MQ=255)
tttttttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTtgtg < 2:579045/99‑1 (MQ=255)
ttttttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATACCGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGcc < 1:2921700/100‑1 (MQ=255)
ttttttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGcc < 1:1575588/100‑1 (MQ=255)
tttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCt < 2:2338869/100‑1 (MQ=255)
tttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACACTGAGTTCTTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGc > 2:4021166/1‑99 (MQ=255)
gTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAAtt < 1:3547538/100‑1 (MQ=255)
gTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAAAAATCCCGATACAGAGTTATGCCGCTAAtt > 1:2033225/1‑100 (MQ=255)
tCAGATGACGACCAATGTATTTATTTTACAGTACGGTTAATTCATAAATACCACTGAGTTGGTGATAAACAATCCCGATGCCGAGTTGTGACGAGAAttt < 2:201925/100‑1 (MQ=255)
aGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTAt < 1:1730071/100‑1 (MQ=255)
aGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTAt < 2:795674/100‑1 (MQ=255)
gATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATg < 2:163815/100‑1 (MQ=255)
gATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATg > 2:1349650/1‑100 (MQ=255)
gATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATg < 2:1589873/100‑1 (MQ=255)
tGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGAt > 1:1775687/1‑100 (MQ=255)
gacgacCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATc < 2:2764109/100‑1 (MQ=255)
acgacCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATcc < 2:1296970/100‑1 (MQ=255)
acgacCAATATATAAATTTTCCAGTACAGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATcc < 2:2544495/100‑1 (MQ=255)
cgacCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCa < 1:1761875/100‑1 (MQ=255)
cgacCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAAGCCCGATACCGATTTGTGCCGCTAATTTATGATCCa > 2:1802543/1‑100 (MQ=255)
acCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGc > 2:448182/1‑100 (MQ=255)
ccAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCt < 2:1820951/100‑1 (MQ=255)
ccAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCTCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCt > 2:1911206/1‑100 (MQ=255)
ccAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCt < 2:694174/100‑1 (MQ=255)
cAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATGCCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCtt > 2:3570171/1‑100 (MQ=255)
atatatAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGt < 2:1953583/100‑1 (MQ=255)
atataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTta > 2:3130383/1‑100 (MQ=255)
tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtat > 1:1944160/1‑100 (MQ=255)
tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtat < 2:240330/100‑1 (MQ=255)
tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtat > 1:2302129/1‑100 (MQ=255)
tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtat > 1:1169540/1‑100 (MQ=255)
tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtat > 1:3528532/1‑100 (MQ=255)
ataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtata < 2:928435/100‑1 (MQ=255)
ataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtata > 2:116556/1‑100 (MQ=255)
taAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAg > 1:2867484/1‑100 (MQ=255)
aaaTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGc < 2:4064661/100‑1 (MQ=255)
aaaTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGc < 1:57751/100‑1 (MQ=255)
ccAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGtt > 1:1990250/1‑100 (MQ=255)
cAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGtta < 1:708095/100‑1 (MQ=255)
cAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGtta > 2:515389/1‑100 (MQ=255)
gTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGttatt < 2:3670229/100‑1 (MQ=255)
gTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGttatt > 1:2535668/1‑100 (MQ=255)
aCGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaa > 2:2114204/1‑100 (MQ=255)
aCGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaa < 1:781160/100‑1 (MQ=255)
cGGTTAATNCATCAATAACGCTGCGTNCATGNTANACAATCCCGATACCGAGTTGTGGCGCTATTTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTNATtcat > 1:3379483/1‑100 (MQ=255)
ggTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatg > 2:242833/1‑100 (MQ=255)
gTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatgg > 1:1372027/1‑100 (MQ=255)
ttAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggt < 2:1144533/100‑1 (MQ=255)
tAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACATTCCCGATACCGAGTTGTGCAGCTAATTTAAGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggta < 2:2271443/100‑1 (MQ=255)
aaTTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTACAGCTAATGTTATtaatgctaa > 2:15186/1‑100 (MQ=255)
ttCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatg > 1:813337/1‑100 (MQ=255)
ttCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatg < 2:383099/100‑1 (MQ=255)
ttCATCAANAACGCTGAGTTCCTGATNAATANTCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtagtngtaatg > 1:3423322/1‑100 (MQ=255)
catcaATAACGCTGAGTTCCTGATACATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatgg > 2:841061/1‑99 (MQ=255)
catcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTaatggtaatggt < 1:106184/100‑1 (MQ=255)
catcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCAGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTCTtaatggtaatgg > 2:3327957/1‑99 (MQ=255)
atcaATACCGCAGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTg > 2:2188541/1‑100 (MQ=255)
atcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTg > 1:2597325/1‑100 (MQ=255)
tcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGc > 1:420191/1‑100 (MQ=255)
tcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTCTAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGc > 2:3038518/1‑100 (MQ=255)
caATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGcc > 2:2788372/1‑100 (MQ=255)
caATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATAATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGcc > 2:4170744/1‑100 (MQ=255)
aaTAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCt > 2:3053893/1‑100 (MQ=255)
aTAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCtt > 1:3616247/1‑100 (MQ=255)
tAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCttt < 2:1852653/100‑1 (MQ=255)
aCGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTgg < 2:3905146/100‑1 (MQ=255)
cTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTc < 1:1189592/99‑1 (MQ=255)
cTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCg < 2:2361755/100‑1 (MQ=255)
cTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCg < 1:1668827/100‑1 (MQ=255)
gAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGTCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc < 2:226067/100‑1 (MQ=255)
gAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc < 2:3264389/100‑1 (MQ=255)
gAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc < 1:2059851/100‑1 (MQ=255)
gTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTc > 1:2451249/1‑100 (MQ=255)
ccTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg < 1:1105963/100‑1 (MQ=255)
ccTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg < 2:2973496/100‑1 (MQ=255)
cTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGt < 1:3947572/100‑1 (MQ=255)
cTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGt > 2:3342245/1‑100 (MQ=255)
cTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGt > 2:3155744/1‑100 (MQ=255)
cTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGt < 1:2707386/100‑1 (MQ=255)
tGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTa < 2:740147/100‑1 (MQ=255)
gATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTAt > 1:461640/1‑100 (MQ=255)
gATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTAt > 2:2578065/1‑100 (MQ=255)
taaataaTCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTAtt > 2:3220665/1‑99 (MQ=255)
aataatCCCGATACCGTGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCg < 1:1022740/100‑1 (MQ=255)
|
CGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCG > NC_000913/4310629‑4310825
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
