Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F56 I0 R1
|
215 |
141.2 |
6785521 |
95.3% |
6466601 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,525,135 |
(A)6→5 |
100% |
coding (9/765 nt) |
yfeN → |
putative outer membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,525,130 | 0 | A | . | 69.7%
| 155.5
/ 136.0
| 99 | coding (4/765 nt) | yfeN | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (13/17); new base . (36/33); total (49/50) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.13e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GGCGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGTG > NC_000913/2525031‑2525225
|
ggCGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAATCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGa < 2:288153/100‑1 (MQ=255)
ggCGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGa < 1:2504952/100‑1 (MQ=255)
ggCGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGa > 2:2178757/1‑100 (MQ=255)
gCGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaa > 2:1863114/1‑100 (MQ=255)
cGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaa > 2:110825/1‑100 (MQ=255)
gATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaa < 2:285007/100‑1 (MQ=255)
tatTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaac > 2:1734690/1‑99 (MQ=255)
tatTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaac < 1:1511211/100‑2 (MQ=255)
tatTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaaa > 2:791523/1‑100 (MQ=255)
atTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaaca > 2:2770506/1‑98 (MQ=255)
ttAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACa < 1:2440129/100‑1 (MQ=255)
aaTTCCTTTTCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATc < 2:517868/100‑1 (MQ=255)
aaTTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAACAAACCACTTTATTAAACAATCTACCAATAACAATCGCCATAGGGAATTATGATAT‑ACAAAACATCt > 1:3201399/1‑100 (MQ=255)
ttCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCtt > 2:616653/1‑100 (MQ=255)
ttCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCttt < 2:657963/100‑1 (MQ=255)
cTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTa > 2:1219078/1‑100 (MQ=255)
tttGCAATAACAATATGTCGTTTTTAGGAAACCACTTTATTAAGCAACCTACGAATAACGATCGGCCTAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAAc < 1:2240037/100‑1 (MQ=255)
tGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAActc > 2:579679/1‑100 (MQ=255)
cATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAActct > 1:544508/1‑100 (MQ=255)
aTTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTg < 1:819267/100‑1 (MQ=255)
ttAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGac < 1:877046/100‑1 (MQ=255)
ttAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGac > 1:1807138/1‑100 (MQ=255)
aaCAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGaca < 1:2789999/100‑1 (MQ=255)
aaCAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGacac > 1:1580424/1‑100 (MQ=255)
aaTATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACtt > 2:3273049/1‑100 (MQ=255)
aaTATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACttt > 1:2594220/1‑100 (MQ=255)
atatGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTc > 1:2523990/1‑100 (MQ=255)
tatGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTcc < 2:2942306/100‑1 (MQ=255)
tGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCctc < 1:1690987/100‑1 (MQ=255)
gTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑GAAAACATCTTTTAACTCTGATACTTTCCTCtata < 2:2299101/100‑1 (MQ=255)
gTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCtata > 2:2744087/1‑100 (MQ=255)
gTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGAGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCctct < 1:1337299/98‑1 (MQ=255)
tttttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTatat < 2:1943303/100‑1 (MQ=255)
ttttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTatat > 1:2299434/1‑100 (MQ=255)
ttttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTatat < 1:1737829/100‑1 (MQ=255)
ttttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATAtt > 1:504338/1‑100 (MQ=255)
tttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATAtt > 2:3029122/1‑99 (MQ=255)
tttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTa > 2:19745/1‑100 (MQ=255)
ttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAg > 2:454344/1‑100 (MQ=255)
tAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGc < 2:2756169/100‑1 (MQ=255)
aGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATATCGATCGGCATAGGGAATTATGCAATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCg < 1:625501/100‑1 (MQ=255)
aGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCg < 1:1152787/100‑1 (MQ=255)
gCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGa > 1:1700851/1‑100 (MQ=255)
cAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑CAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCTTCTATATTAGCGAt > 1:1217173/1‑100 (MQ=255)
cAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGAt < 1:763552/100‑1 (MQ=255)
aaaCCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATa > 1:1612779/1‑100 (MQ=255)
aaaCCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATa < 2:2702515/100‑1 (MQ=255)
aaCCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATa > 1:107529/1‑100 (MQ=255)
ccACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCt > 1:2270264/1‑100 (MQ=255)
aCTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgt < 2:1829936/100‑1 (MQ=255)
aCTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgt > 2:809971/1‑100 (MQ=255)
aCTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgt < 1:1734679/100‑1 (MQ=255)
tttATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgttg < 1:2923590/100‑1 (MQ=255)
tattaAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTa > 1:107508/1‑100 (MQ=255)
tattaAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTa < 1:3254987/100‑1 (MQ=255)
ttaAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATAGCGGTTGTagc < 1:868163/100‑3 (MQ=255)
ttaAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTAtc > 2:2962842/1‑100 (MQ=255)
taAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTAtct > 1:1455164/1‑100 (MQ=255)
aaGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTAtctc > 2:2947781/1‑100 (MQ=255)
aGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGTGAATTATGCTATG‑AAAATCATCTTTTATCTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCa < 1:3282876/100‑1 (MQ=255)
aGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATTCCTGTTGTAtcac < 2:2300210/100‑3 (MQ=255)
gCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTAtctc < 1:877073/99‑1 (MQ=255)
gCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCa < 1:1063694/100‑1 (MQ=255)
cAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCa < 1:1962547/99‑1 (MQ=255)
cAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATg > 2:183418/1‑100 (MQ=255)
aaTCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGc < 2:1197466/100‑1 (MQ=255)
aaTCTACACAGAACGATCTGGGTAGGGAATTATCCTATGAAAAAACATTTTTTAACTCTGACACTTTCCGCTATATTAGCTATACCTGTTGTATCTCa < 1:3176496/98‑1 (MQ=255)
aTCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGc < 1:2101787/100‑1 (MQ=255)
aTCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCa < 2:2699602/100‑1 (MQ=255)
tactaATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGaa > 2:2672318/1‑100 (MQ=255)
ctaATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAAtt > 1:3244291/1‑100 (MQ=255)
taataaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAAttt < 2:554087/100‑1 (MQ=255)
aataaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAAttt > 1:576326/1‑100 (MQ=255)
aataaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAAttt > 1:1580047/1‑100 (MQ=255)
aataaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATAGCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTa < 1:2672506/100‑1 (MQ=255)
taaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTaaa > 1:2977700/1‑100 (MQ=255)
aaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAg < 1:840261/100‑1 (MQ=255)
aaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAg < 1:1642145/100‑1 (MQ=255)
aCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAgg > 1:1789414/1‑100 (MQ=255)
cGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAgg < 2:2970302/100‑1 (MQ=255)
cGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGc < 2:2792397/100‑1 (MQ=255)
naTCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCg > 2:443454/2‑100 (MQ=255)
gATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGc > 2:2924992/1‑100 (MQ=255)
gATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCg > 1:2484498/1‑100 (MQ=255)
cGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGt < 2:767815/100‑1 (MQ=255)
ggCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGttt > 1:2450706/1‑100 (MQ=255)
gCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGtttt > 1:3174496/1‑100 (MQ=255)
aTAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGc < 1:691248/100‑1 (MQ=255)
tAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCa > 1:1795612/1‑100 (MQ=255)
aGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAg < 1:419408/100‑1 (MQ=255)
aGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAACGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAg > 1:1661344/1‑100 (MQ=255)
gggAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAg < 2:3276713/100‑1 (MQ=255)
gggAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAg < 2:1919431/100‑1 (MQ=255)
gggAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGa > 1:430104/1‑100 (MQ=255)
gggAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGa < 2:1648357/100‑1 (MQ=255)
ggAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGa < 1:110825/100‑1 (MQ=255)
gAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGat > 2:1571033/1‑100 (MQ=255)
aTGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGc > 2:407866/1‑100 (MQ=255)
cTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGTg > 2:2887535/1‑100 (MQ=255)
tATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGTg > 2:3271270/1‑100 (MQ=255)
|
GGCGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGTG > NC_000913/2525031‑2525225
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
