Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F212 I0 R1
|
246 |
122.0 |
6097616 |
93.1% |
5676880 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,525,135 |
(A)6→5 |
100% |
coding (9/765 nt) |
yfeN → |
putative outer membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,525,130 | 0 | A | . | 97.9%
| 425.8
/ 0.4
| 95 | coding (4/765 nt) | yfeN | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base . (39/54); total (40/55) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.26e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGT > NC_000913/2525035‑2525224
|
atatTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaa < 2:2622653/100‑1 (MQ=255)
tatTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATTTTCATAGGGAATTATGCTATGaaaaac < 2:1468066/100‑2 (MQ=255)
tatTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaac > 1:2609325/1‑99 (MQ=255)
tatTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaac < 1:2551240/100‑2 (MQ=255)
tatTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaac < 2:1487538/100‑2 (MQ=255)
atTAATTCTTTTTCATTAATTTTATGTCTTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATGTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaaca < 1:1240445/100‑3 (MQ=255)
atTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaaca < 1:2509601/100‑3 (MQ=255)
atTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaaca < 1:482911/100‑3 (MQ=255)
atTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaaca > 2:2664810/1‑98 (MQ=255)
ttAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaacat > 2:334971/1‑97 (MQ=255)
tAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaacatc > 1:3030229/1‑96 (MQ=255)
tAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAACAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaacatc > 2:545225/1‑96 (MQ=255)
aaTTCCTTTGCATTAACAATATGTTGTTTTTAGCAAACCGCTTTATTAAGCAATCGACAAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCt < 1:205819/100‑1 (MQ=255)
aaTTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCt < 1:2736688/100‑1 (MQ=255)
aaTTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAAAGATCGGAATAGGTAATTATGCTATG‑AAAAACATCt < 2:1272706/100‑1 (MQ=255)
ccTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATAAACTAATAACAATCAGCATAAGGAATTATGCTATGAAAAAACATCtttt > 1:799687/1‑100 (MQ=255)
cTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAAGCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGCAATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTATTaa > 2:202763/1‑100 (MQ=255)
tttttaTTAACAATATGTTGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGATATG‑AAAAACATCTTTTAAc < 2:2869409/95‑1 (MQ=255)
tttGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAAc < 2:2693475/100‑1 (MQ=255)
tttGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGAAATG‑AAAAACATCTTTTAAc < 2:1195365/100‑1 (MQ=255)
tGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAAc < 2:2934997/98‑1 (MQ=255)
gCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAActct > 1:1896794/1‑100 (MQ=255)
gCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAActct < 1:2355205/100‑1 (MQ=255)
cATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAAACACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTg < 2:2718923/100‑1 (MQ=255)
tgtGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTcc < 2:2836194/98‑1 (MQ=255)
tatGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATTTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTcc < 1:307466/100‑1 (MQ=255)
tatGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACttt < 1:1895773/98‑1 (MQ=255)
tGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCctc < 1:1065561/100‑1 (MQ=255)
tGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCctc < 2:2742311/100‑1 (MQ=255)
gTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCctcg < 2:1472474/100‑2 (MQ=255)
tCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCta < 1:1260623/100‑1 (MQ=255)
cGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCtat > 2:1483591/1‑100 (MQ=255)
cGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCtat < 2:2033397/100‑1 (MQ=255)
cGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCta > 1:646005/1‑99 (MQ=255)
gTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCtata < 1:1170249/100‑1 (MQ=255)
gTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCtata > 1:2235833/1‑100 (MQ=255)
ttttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATAtt < 2:2235810/100‑1 (MQ=255)
tttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATACGAAATTATGCTATG‑AAAAACATCATTAAACTCTGACACTTTCCTCTATATTa > 1:2540263/1‑100 (MQ=255)
tAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGc > 2:1669089/1‑100 (MQ=255)
gCAAACCACTTTATTAAGAAATCGACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGa > 2:815973/1‑100 (MQ=255)
aaaCCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATa > 1:668661/1‑100 (MQ=255)
aaaCCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATATTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAAAGATa > 1:1765052/1‑100 (MQ=255)
aCCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATAcc < 1:513369/100‑1 (MQ=255)
ccACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATAcc < 2:360438/99‑1 (MQ=255)
ccACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCt > 1:2479215/1‑100 (MQ=255)
aCTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgt < 1:1259815/100‑1 (MQ=255)
aCTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGAGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtg > 2:2302606/1‑99 (MQ=255)
cTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgtt < 1:896418/100‑1 (MQ=255)
cTTTATTAAGCAATCTACTAATAAAGATCGGAATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATAAGCTATACCtgtt > 2:2689061/1‑100 (MQ=255)
tttATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgttg < 2:2939809/100‑1 (MQ=255)
ttattaAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgttgt > 2:655124/1‑100 (MQ=255)
ttattaAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgttgt > 2:1335493/1‑100 (MQ=255)
tattaAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTa < 1:190939/100‑1 (MQ=255)
tattaAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTa > 1:34530/1‑100 (MQ=255)
aaGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTAtctc < 2:2259783/100‑1 (MQ=255)
aaGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTAtctc > 1:3043956/1‑100 (MQ=255)
aGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCa < 1:2691845/100‑1 (MQ=255)
gCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCAt < 2:413943/100‑1 (MQ=255)
aaTCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGc < 2:2486541/100‑1 (MQ=255)
aaTCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGc < 1:2624185/100‑1 (MQ=255)
aaTCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTAT‑TAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGc < 1:142449/100‑1 (MQ=255)
tCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCAt < 1:665926/96‑1 (MQ=255)
tCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAg < 2:2632418/100‑1 (MQ=255)
ctactaATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGa < 2:1782102/100‑1 (MQ=255)
tactaATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGaa > 2:1811899/1‑100 (MQ=255)
actaATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAAt > 1:2466597/1‑100 (MQ=255)
actaATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTATGACAATTTCCTCTATATTAGCGATAAATGTTGTAACTCATCCAGAAt > 2:3044767/1‑100 (MQ=255)
taataaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAAttt < 1:1483607/100‑1 (MQ=255)
taataaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAAttt < 1:1399264/100‑1 (MQ=255)
taataaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAAttt < 2:1227800/100‑1 (MQ=255)
aataaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTa > 2:1399251/1‑100 (MQ=255)
aataaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTa > 2:2761857/1‑100 (MQ=255)
taaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTaaa > 2:1438139/1‑100 (MQ=255)
taaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTaaa < 1:225292/100‑1 (MQ=255)
aaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAg < 2:2898626/100‑1 (MQ=255)
aaCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAg > 2:2488708/1‑100 (MQ=255)
aCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAgg < 2:1236641/100‑1 (MQ=255)
aCGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAgg > 1:909222/1‑100 (MQ=255)
cGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACTTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGc > 2:2483121/1‑100 (MQ=255)
cGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAgg > 1:2456178/1‑99 (MQ=255)
cGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGAATCTCATGCAGAATTTaaaag > 1:2471806/1‑97 (MQ=255)
gATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCg > 2:2061828/1‑100 (MQ=255)
aTCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCgg > 1:2811999/1‑100 (MQ=255)
tCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAACGATACCTGTTGTATCTCATGCAGCATTTAAAGGCGGt < 2:1868091/100‑1 (MQ=255)
ggCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGttt > 2:1177005/1‑100 (MQ=255)
ggCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGttt > 2:1582310/1‑100 (MQ=255)
ggCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTAATGCAGAATTTAAAGGCGGtt > 1:548155/1‑99 (MQ=255)
gCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACCTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGtttt > 1:434014/1‑100 (MQ=255)
aTAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGc < 2:909216/100‑1 (MQ=255)
aTAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGc > 2:254214/1‑100 (MQ=255)
tAGGGAATTATGTTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCa < 1:2065881/100‑1 (MQ=255)
tAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCa < 2:1738406/100‑1 (MQ=255)
tAGGGAAGTATTCTATG‑AAAAACATCTTTTAACACTTACCCTTTCCTTTATATTAGCGATGCCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGAGGTTTTGc < 2:1013322/99‑1 (MQ=255)
tAGCGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCTATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCa < 2:1362631/100‑1 (MQ=255)
gggAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTTACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTTTATCTCATGCATAATTTAAAAGCGGTTTTGCAg > 1:2905159/1‑99 (MQ=255)
gggAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAg < 1:1389136/99‑1 (MQ=255)
gggAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGa < 1:2676620/100‑1 (MQ=255)
gAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGata > 1:2318334/1‑100 (MQ=255)
aTGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTTACACTTGCCTCTATATTAGCGATACCCGTTGTCTTTCATGCATAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCTGc > 2:1499938/1‑100 (MQ=255)
gCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGt < 1:1847309/100‑1 (MQ=255)
|
ATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGT > NC_000913/2525035‑2525224
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
