Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F256 I0 R1
|
328 |
102.7 |
5123138 |
93.4% |
4785010 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,525,135 |
(A)6→5 |
100% |
coding (9/765 nt) |
yfeN → |
putative outer membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,525,130 | 0 | A | . | 95.8%
| 405.5
/ 9.9
| 96 | coding (4/765 nt) | yfeN | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/3); new base . (39/53); total (40/56) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.38e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GGCGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGTG > NC_000913/2525031‑2525225
|
ggCGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGa > 2:122627/1‑100 (MQ=255)
gCGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaa > 2:1696004/1‑100 (MQ=255)
cGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaa > 1:382247/1‑100 (MQ=255)
cGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaa > 2:2032206/1‑100 (MQ=255)
atatTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaa < 2:1014413/99‑1 (MQ=255)
tatTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaac < 2:1155027/100‑2 (MQ=255)
tatTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaac > 1:2287916/1‑99 (MQ=255)
tAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGaaaaacatc > 2:1647352/1‑96 (MQ=255)
aaTTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCt < 2:2131136/100‑1 (MQ=255)
aTTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCtt > 2:130747/1‑100 (MQ=255)
aTTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCtt < 2:1944912/100‑1 (MQ=255)
ttCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCttt < 1:576189/100‑1 (MQ=255)
ttCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCttt < 1:1024490/100‑1 (MQ=255)
ttCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCttt < 1:2178385/100‑1 (MQ=255)
ttCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCttt < 1:1860795/100‑1 (MQ=255)
tCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCtttt < 1:1051943/100‑1 (MQ=255)
ccTTTTCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCtttt < 1:683083/100‑1 (MQ=255)
ccTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTa < 2:2094203/100‑1 (MQ=255)
ccTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTa < 1:456287/100‑1 (MQ=255)
ccTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTa < 1:292218/100‑1 (MQ=255)
ccTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTa < 2:691059/100‑1 (MQ=255)
ccTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGATATG‑AAAAACATCTTTTa < 2:103738/100‑1 (MQ=255)
cTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTaa > 1:2175695/1‑100 (MQ=255)
tGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAActc < 2:423620/100‑1 (MQ=255)
gCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAActct < 2:1098112/100‑1 (MQ=255)
cATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTg > 2:1284614/1‑100 (MQ=255)
aTTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGa > 2:176323/1‑100 (MQ=255)
aTTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGa < 1:130749/100‑1 (MQ=255)
ttAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGa < 1:1210689/100‑1 (MQ=255)
ttAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGac > 1:864635/1‑100 (MQ=255)
tAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGaca > 2:870085/1‑100 (MQ=255)
tAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGaca < 2:234498/100‑1 (MQ=255)
aaCAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTGATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGacac > 1:1334050/1‑100 (MQ=255)
aaCAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGacac < 2:1761591/100‑1 (MQ=255)
aaCAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGacac < 1:1686724/100‑1 (MQ=255)
aaCAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGacac < 1:808474/100‑1 (MQ=255)
tatGTCGTTTTTAGCAAGCCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTcc > 2:2521753/1‑100 (MQ=255)
tatGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTcn < 1:2231914/100‑2 (MQ=255)
tatGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTcc < 2:540342/100‑1 (MQ=255)
tGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTccac > 2:1552048/1‑98 (MQ=255)
tGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCctc < 2:1867633/100‑1 (MQ=255)
gTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCctct > 2:46053/1‑100 (MQ=255)
gTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCctct > 2:907880/1‑100 (MQ=255)
gTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCctct > 1:1445678/1‑100 (MQ=255)
gTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCctct < 1:1371844/100‑1 (MQ=255)
gTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCtata < 1:1423652/100‑1 (MQ=255)
gTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCtat > 1:1959276/1‑99 (MQ=255)
ttttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTAT‑AAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTatat > 1:2435057/1‑99 (MQ=255)
ttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAg < 2:751385/100‑1 (MQ=255)
ttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAg > 2:349413/1‑100 (MQ=255)
ttAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAg < 1:1691390/100‑1 (MQ=255)
tAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGc < 1:627797/100‑1 (MQ=255)
aGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCg < 2:536405/100‑1 (MQ=255)
gCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGa > 2:1254883/1‑100 (MQ=255)
cAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGAt > 2:2000130/1‑100 (MQ=255)
cAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGAt > 2:1696863/1‑100 (MQ=255)
cAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGAt > 2:1072519/1‑100 (MQ=255)
cAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGAt > 1:2314709/1‑100 (MQ=255)
aaaCCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATa < 2:2212007/100‑1 (MQ=255)
aaCCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATAc < 2:693252/100‑1 (MQ=255)
ccACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCt > 2:514989/1‑100 (MQ=255)
cACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtg > 2:400142/1‑100 (MQ=255)
aCTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgt > 2:254843/1‑100 (MQ=255)
tttATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTACCTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgttg < 2:1338912/100‑1 (MQ=255)
tttATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgttg < 2:2320832/100‑1 (MQ=255)
ttattaAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCtgttgt < 1:2373749/100‑1 (MQ=255)
ttaAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTAtc < 1:2446669/100‑1 (MQ=255)
aaGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTAtctc > 1:2220131/1‑100 (MQ=255)
aGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCa < 1:959388/100‑1 (MQ=255)
aGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCa < 1:1587342/100‑1 (MQ=255)
cAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATg > 2:274736/1‑100 (MQ=255)
cAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATg > 1:1421787/1‑100 (MQ=255)
cAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATg > 2:2495796/1‑100 (MQ=255)
aTCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCa < 2:58409/100‑1 (MQ=255)
ctactaATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGa < 2:297365/100‑1 (MQ=255)
tactaATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGa > 2:408291/1‑99 (MQ=255)
tactaATAACGATCGACATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGaa > 1:966365/1‑100 (MQ=255)
actaATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGaa < 1:1815935/100‑1 (MQ=255)
cGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATTTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAgg > 2:390275/1‑99 (MQ=255)
cGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGc < 1:223067/100‑1 (MQ=255)
cGATCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGc < 2:302666/100‑1 (MQ=255)
tCGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGt < 2:1701355/100‑1 (MQ=255)
cGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGtt < 2:1182243/100‑1 (MQ=255)
cGGCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGtt < 1:2000144/100‑1 (MQ=255)
ggCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGttt > 1:342335/1‑100 (MQ=255)
gCATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGtttt > 1:2320486/1‑100 (MQ=255)
cATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTg < 2:560581/100‑1 (MQ=255)
cATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTg < 2:2130196/100‑1 (MQ=255)
cATAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTg > 2:2416075/1‑100 (MQ=255)
aTAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGc < 1:1402498/100‑1 (MQ=255)
tAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCa < 2:1410642/100‑1 (MQ=255)
tAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCa < 1:1338146/100‑1 (MQ=255)
tAGGGAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATAGTAGCGATACCTGTGGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCa < 2:630638/100‑1 (MQ=255)
aGGGAATTATGCTATG‑AAAAGCATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCCTGCAGAATTTAAAGGAGGTTTTGCAg > 2:1564151/1‑100 (MQ=255)
ggAATTATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAACGCGGTTTTGAAGat > 2:1169265/1‑100 (MQ=255)
gAATTATGCGATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTTACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGata < 1:384986/100‑1 (MQ=255)
tATGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCgg > 1:454978/1‑100 (MQ=255)
aTGCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGc > 1:2043719/1‑100 (MQ=255)
gCTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGt < 1:749815/100‑1 (MQ=255)
cTATG‑AAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGTg > 1:1764212/1‑100 (MQ=255)
|
GGCGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGTG > NC_000913/2525031‑2525225
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
