Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F142 I0 R1
|
175 |
91.2 |
4812830 |
94.5% |
4548124 |
99.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,434,437 |
T→A |
40.8% |
W109R (TGG→AGG) |
ytfH → |
DUF24 family HxlR‑type putative transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,434,437 | 0 | T | A | 40.8%
| 68.6
/ 121.5
| 103 | W109R (TGG→AGG) | ytfH | DUF24 family HxlR‑type putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/30); new base A (17/25); total (48/55) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.22e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.28e-01 |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGC > NC_000913/4434341‑4434534
|
aaCCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCCGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGa > 2:1524847/1‑100 (MQ=255)
aaCCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGa > 1:2160744/1‑100 (MQ=255)
aCCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGAt < 2:1629183/100‑1 (MQ=255)
ccGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGAtt < 1:1297484/100‑1 (MQ=255)
cGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTg < 2:471966/100‑1 (MQ=255)
cGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTAACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTg < 2:450574/100‑1 (MQ=255)
cGTATCGCGTATCCGGTGGTGAAGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAAAGGATTg > 2:472543/1‑100 (MQ=255)
tATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAg < 1:515241/100‑1 (MQ=255)
tATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAg < 1:1054814/100‑1 (MQ=255)
aTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGt < 2:685194/100‑1 (MQ=255)
cgcgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTg < 1:503076/100‑1 (MQ=255)
gcgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGa > 2:2139197/1‑100 (MQ=255)
gTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAAt < 2:2168815/100‑1 (MQ=255)
tATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAAtt > 2:1770176/1‑100 (MQ=255)
tATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAAtt < 1:522407/100‑1 (MQ=255)
tATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAAtt < 1:1645722/100‑1 (MQ=255)
tATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAAtt < 1:2118446/100‑1 (MQ=255)
aTCCGGTGGTGCCGCCGCATGTTGAATATAGCTTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCTAATATGTTTCTTCACTGTTTGACTGGATTGAGTTGAAttt < 2:1049113/100‑1 (MQ=255)
aTCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAAttt > 1:374892/1‑100 (MQ=255)
tCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTg < 2:2237936/100‑1 (MQ=255)
ccGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGc > 2:1849885/1‑100 (MQ=255)
nggtggtGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGcc > 1:1915316/2‑100 (MQ=255)
cGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAACAGGTTGCTGCCCTGGCGGACTGCATTGAGTTGAATTTGcc > 1:1107041/1‑100 (MQ=255)
cGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGcc < 1:1499794/100‑1 (MQ=255)
cGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGCTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGcc < 2:1283024/100‑1 (MQ=255)
ggtgCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAg > 1:639136/1‑100 (MQ=255)
ggtgCCACCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAg > 2:1568021/1‑100 (MQ=255)
cgccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGtt > 1:1262999/1‑100 (MQ=255)
cgccgcATGTGAAGTATAGTCTCACGCCGCTCGGCCAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTCCACTGCCTGACTGGATTCAGTTGact < 2:2228248/86‑3 (MQ=255)
gccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTg > 1:373996/1‑100 (MQ=255)
gccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTAtt > 1:64631/1‑99 (MQ=255)
gccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTg > 1:1502663/1‑100 (MQ=255)
gccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTg < 2:1390788/100‑1 (MQ=255)
ccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTgg < 1:2012239/100‑1 (MQ=255)
cgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGc > 1:1697000/1‑100 (MQ=255)
cgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGc > 2:331147/1‑100 (MQ=255)
cgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGc < 1:529963/100‑1 (MQ=255)
cATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCgg < 2:1096482/100‑1 (MQ=255)
aTGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGATTTGAATTTGTCCGAGGTGTTTGCgt < 2:331003/99‑2 (MQ=255)
aTGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCG‑AAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTg < 2:734914/100‑1 (MQ=255)
tgtgGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTATTAGCGGt > 1:692729/1‑99 (MQ=255)
gtgGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGc > 2:516619/1‑100 (MQ=255)
gtgGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGc > 2:689229/1‑100 (MQ=255)
tgGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCg > 1:1144588/1‑100 (MQ=255)
ggAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAACGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCgg > 1:896583/1‑100 (MQ=255)
ggAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCgg > 2:387734/1‑100 (MQ=255)
ggAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCgg < 1:1700376/100‑1 (MQ=255)
gAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCggg < 2:1865557/100‑1 (MQ=255)
aaTATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCggg < 2:2104709/99‑1 (MQ=255)
aaTATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGa < 2:417276/100‑1 (MQ=255)
atatAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGAt < 1:910519/100‑1 (MQ=255)
agataGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGAt < 2:2298608/98‑1 (MQ=255)
ataGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGAGTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGa < 2:2260950/100‑1 (MQ=255)
ataGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGa < 2:1922228/100‑1 (MQ=255)
gCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACg > 2:467643/1‑100 (MQ=255)
gCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACg > 1:182564/1‑100 (MQ=255)
gCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACg < 2:317205/100‑1 (MQ=255)
cACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGTTTGAGTTGAATTTGCCCTATGTGTTGGTGGTGCGGGATGAACGTGc < 2:2134237/99‑1 (MQ=255)
aCGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCg > 1:58744/1‑99 (MQ=255)
cgccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGGACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGc < 2:800996/100‑1 (MQ=255)
ccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCAt > 1:27617/1‑100 (MQ=255)
ccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCAt > 2:846951/1‑100 (MQ=255)
ccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCAt > 2:847387/1‑100 (MQ=255)
ccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTGGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCAt < 1:1928707/100‑1 (MQ=255)
cgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATa < 2:799854/100‑1 (MQ=255)
cgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATa > 1:1024137/1‑100 (MQ=255)
gcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGATGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATaa > 2:1784409/1‑100 (MQ=255)
tGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTAGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAATGTGCGGCATAAc < 2:257698/99‑1 (MQ=255)
gCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGATGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGTGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGc < 2:2027111/99‑1 (MQ=255)
cGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCg < 1:1942876/100‑1 (MQ=255)
cGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCg > 1:630702/1‑100 (MQ=255)
cAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATg < 1:1352475/100‑1 (MQ=255)
cAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATg > 2:1629626/1‑100 (MQ=255)
aGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgc > 2:2007994/1‑100 (MQ=255)
aGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgc < 2:391717/100‑1 (MQ=255)
ggTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcg > 1:2121941/1‑100 (MQ=255)
ggTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcg > 2:765232/1‑100 (MQ=255)
ggTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcg > 2:1120628/1‑100 (MQ=255)
gTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcgc < 1:1656941/100‑1 (MQ=255)
tGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCt < 1:172345/100‑1 (MQ=255)
gCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAg > 1:229066/1‑100 (MQ=255)
cGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGc > 1:249/1‑100 (MQ=255)
gAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCt < 2:1271662/100‑1 (MQ=255)
gAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCt > 1:194004/1‑100 (MQ=255)
gAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCt < 1:1731565/100‑1 (MQ=255)
ggTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCt > 1:1935473/1‑100 (MQ=255)
gTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTg < 2:2076337/100‑1 (MQ=255)
ttGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTgg < 1:994677/100‑1 (MQ=255)
gctgcACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTc > 2:2322981/1‑100 (MQ=255)
gctgcACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTc < 1:1943248/100‑1 (MQ=255)
ctgcACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCt > 2:115077/1‑100 (MQ=255)
gcACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCTGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTAc > 1:712341/1‑100 (MQ=255)
aCTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTTCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGTGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACgg < 2:1382737/100‑1 (MQ=255)
aCTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACgg < 1:2156296/100‑1 (MQ=255)
tGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAGCGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTg < 1:295343/100‑1 (MQ=255)
ggCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGc < 1:1706134/100‑1 (MQ=255)
ggCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGc > 1:1183684/1‑100 (MQ=255)
ggACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATg > 1:504920/1‑100 (MQ=255)
aCTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGc < 1:2309416/100‑1 (MQ=255)
aCTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGc < 2:1584726/100‑1 (MQ=255)
|
AACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGC > NC_000913/4434341‑4434534
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
