Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F133 I0 R1
|
200 |
171.4 |
8351354 |
94.3% |
7875326 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,349,085:1 |
+C |
100% |
intergenic (‑341/+230) |
dcuB ← / ← dcuR |
C4‑dicarboxylate transporter, anaerobic; DcuS co‑sensor/response regulator in two‑component regulatory system with DcuS |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,349,082 | 1 | . | C | 69.2%
| 506.4
/ 276.0
| 224 | intergenic (‑338/+233) | dcuB/dcuR | C4‑dicarboxylate transporter, anaerobic; DcuS co‑sensor/response regulator in two‑component regulatory system with DcuS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (39/30); new base C (81/72); total (121/103) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.20e-01 |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
GATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGA > NC_000913/4348984‑4349180
|
tGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑ccc < 1:2590679/100‑1 (MQ=255)
tGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑ccc > 1:635940/1‑100 (MQ=255)
ttAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTACTCTGATCTA‑cccca < 1:1386539/100‑3 (MQ=255)
ttAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑cccca < 2:1220600/100‑3 (MQ=255)
aaTGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTTTTTTTTTTTTATATTTCATTAGGTTTATTGATTAATTTGATCTA‑ctgtatt > 2:2571176/1‑94 (MQ=255)
aTGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑ccccattt > 1:2085833/1‑95 (MQ=255)
tgttttgtttGCTGTTATCTTATTGATATTTATCTGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTtg < 2:2479572/100‑1 (MQ=255)
tgttttgtttGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTtg > 1:31413/1‑100 (MQ=255)
ttttgtttGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTtgtg < 1:690164/100‑1 (MQ=255)
tttgtttgCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATCGATTAAGCGGATCTA‑CCCATTTGTggg < 2:186510/100‑1 (MQ=255)
tttgtttgCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTgg > 1:109065/1‑100 (MQ=255)
tttgtttgCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTgg < 1:1660161/100‑1 (MQ=255)
ttgtttgCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTggg < 1:3108348/100‑1 (MQ=255)
ttgtttgCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTggg < 1:1226047/100‑1 (MQ=255)
gtttgCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTaa > 1:1238016/1‑100 (MQ=255)
tttgCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCGATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAAGCTGATCTACCCCATTTGTGGGt < 2:1150097/98‑1 (MQ=255)
ttgCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTaaa < 1:491359/100‑1 (MQ=255)
cTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAAt > 1:1556789/1‑100 (MQ=255)
cTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAAt > 2:3292244/1‑100 (MQ=255)
tGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATac < 2:2279047/100‑1 (MQ=255)
ttATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATaca < 1:1498355/100‑1 (MQ=255)
aTCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATAcaca < 1:1864790/100‑1 (MQ=255)
tCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACAt > 1:3073144/1‑100 (MQ=255)
ttGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGc < 2:190187/100‑1 (MQ=255)
gATATTTATCGGTCTATTTTTTTTTTTTTTTTCAGATGTAATAAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGc > 2:1553312/1‑98 (MQ=255)
atatTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCggg < 2:4101427/100‑1 (MQ=255)
atatTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCggg > 1:3708931/1‑100 (MQ=255)
atatTTAGCGATCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATAcacagatcggtag > 2:1800979/1‑90 (MQ=255)
tatTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGt > 1:1827471/1‑100 (MQ=255)
tatTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTg < 1:1817374/100‑1 (MQ=255)
atTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTg > 1:2978729/1‑100 (MQ=255)
atTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGa < 1:1361766/100‑1 (MQ=255)
ttATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGAc < 2:3073126/100‑1 (MQ=255)
ttATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGAc < 1:2935185/100‑1 (MQ=255)
tATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACat < 1:951201/100‑1 (MQ=255)
ggTCTATTTTTTTTTTTTTTTTCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTATAAATACACATAATGCGGGTGACattat > 2:2018645/1‑100 (MQ=255)
ggTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACataat < 1:3443641/100‑1 (MQ=255)
ttttttttttGTTCTCAGGTCAGATGTCATTATGTTTATAGATTAATCTTATCTATCTCATTTTTGTGTAAAAATACACATAATGCTTGTGACATAATAg < 2:1352530/96‑1 (MQ=255)
tATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGtt < 1:2439832/100‑1 (MQ=255)
aTTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGtta < 2:706396/100‑1 (MQ=255)
aTTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGttaa > 2:53291/1‑100 (MQ=255)
ttttttGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGttaa > 1:3539400/1‑100 (MQ=255)
ttttttGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGttaat < 1:925916/100‑1 (MQ=255)
tttGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGttaatta < 2:3548866/100‑1 (MQ=255)
gTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACt < 1:3852552/100‑1 (MQ=255)
ttCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACttt > 2:763217/1‑100 (MQ=255)
tctcAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACttt > 2:491541/1‑100 (MQ=255)
tctcAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACttt > 1:4056816/1‑100 (MQ=255)
ctcAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTg > 2:2942815/1‑100 (MQ=255)
tcAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACgtt > 1:2491282/1‑98 (MQ=255)
tcAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTg < 2:283565/100‑1 (MQ=255)
tcAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTg > 2:1540653/1‑100 (MQ=255)
cAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGt > 2:1855459/1‑100 (MQ=255)
cAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGt > 2:3489770/1‑100 (MQ=255)
aGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGtt > 1:2694821/1‑100 (MQ=255)
aGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGtt < 1:1410204/100‑1 (MQ=255)
gggCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTa > 2:3822671/1‑100 (MQ=255)
gggCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTa > 1:732665/1‑100 (MQ=255)
ggCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAg < 2:3371172/100‑1 (MQ=255)
gATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGttt > 1:3670867/1‑100 (MQ=255)
gATGTCAGTAGGTTTATAGATTAATGTGAGCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGttt < 2:1514838/100‑1 (MQ=255)
aTGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGttt > 2:3397152/1‑100 (MQ=255)
aTGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGAGGGCGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGtt > 2:3344594/1‑99 (MQ=255)
gTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTg < 2:4148568/100‑1 (MQ=255)
gTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTg < 1:2645765/100‑1 (MQ=255)
tCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGa < 2:4090758/100‑1 (MQ=255)
cATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCCTTTGTGGGTAAAAATAAACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGaa > 2:1037592/1‑100 (MQ=255)
aTTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGaaa > 2:1788404/1‑100 (MQ=255)
tAGGTTTATAGATTCATCTGCTATC‑ACTCTTTGTGGGTAAACATATTCATAATGTGGGTGAGATAATAGTTAATTATCTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTa < 2:344681/100‑1 (MQ=255)
aGGTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTa < 1:2298512/100‑1 (MQ=255)
ggTTTATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATTCGGGTGACATAATAGTTAATTAACATTTGTTAGCGTTTTGAAATTaa > 2:1243199/1‑100 (MQ=255)
ggTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTTTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGACATTaaa > 2:157549/1‑100 (MQ=255)
tttATAGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTaaaa < 1:2313335/100‑1 (MQ=255)
tataGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATCATACGGGTGACATAATAGTTAATTAACAATTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAac > 2:2633732/1‑100 (MQ=255)
ataGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAaca > 2:1744986/1‑100 (MQ=255)
taGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAacac > 1:2757747/1‑100 (MQ=255)
ngATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAacac > 2:3984229/2‑99 (MQ=255)
aGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGTGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAacac < 2:3748194/99‑1 (MQ=255)
aGATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACAcc < 1:471415/100‑1 (MQ=255)
gATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCg > 1:589307/1‑100 (MQ=255)
gATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCg < 1:3984259/100‑1 (MQ=255)
gATTAATCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAAGTAACTTTTATTAGCGTTTTGAAATTAAAAacac > 2:3683294/1‑98 (MQ=255)
gATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAacac > 2:3691806/1‑97 (MQ=255)
gATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGt > 1:2006704/1‑100 (MQ=255)
tAATCTGATCTA‑CGCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGttn < 2:2838659/99‑2 (MQ=255)
aaTCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCa > 2:4009891/1‑100 (MQ=255)
aaTCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCAc > 1:2367401/1‑100 (MQ=255)
aTCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACGGTTCAc > 2:1394199/1‑100 (MQ=255)
aTCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCAc > 1:3749152/1‑100 (MQ=255)
aTCTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCAc > 1:3398204/1‑100 (MQ=255)
aTCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCAcc > 1:2101662/1‑100 (MQ=255)
aTCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCAc > 2:2776381/1‑99 (MQ=255)
aTCTGATATACCCCATTTGTGAGTAAAAATACACATAAGGCGGTTAACATAATAGTTAATTAACTTATGTTAGCGTTTTGAAAGTtaaaagagcact > 2:3530390/1‑90 (MQ=255)
tCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCt < 2:635936/100‑1 (MQ=255)
cTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCAcc > 2:3140085/1‑99 (MQ=255)
cTGATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCt > 2:208303/1‑100 (MQ=255)
cTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTg > 2:2372764/1‑100 (MQ=255)
tGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGa < 1:53292/100‑1 (MQ=255)
gATCTACCCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGa < 2:2165998/100‑1 (MQ=255)
cTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAagag < 2:2889328/100‑1 (MQ=255)
|
GATGTTAATGTTTTGTTTGCTGTTATCTTATTGATATTTATCGGTCTATTTTTTGTTCTCAGGGCAGATGTCATTAGGTTTATAGATTAATCTGATCTA‑CCCATTTGTGGGTAAAAATACACATAATGCGGGTGACATAATAGTTAATTAACTTTTGTTAGCGTTTTGAAATTAAAAACACCGTTCACCTGAAGAGA > NC_000913/4348984‑4349180
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
