Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F50 I2 R1
|
14 |
114.6 |
3558734 |
99.4% |
3537381 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,400,195 |
G→A |
A298V (GCA→GTA) |
mreB ← |
cell wall structural complex MreBCD, actin‑like component MreB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,400,195 | 0 | G | A | 99.0%
| 392.0
/ ‑4.7
| 101 | A298V (GCA→GTA) | mreB | cell wall structural complex MreBCD, actin‑like component MreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (49/51); total (50/51) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CTCTTCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTA > NC_000913/3400047‑3400341
|
ctctTCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTacg > 2:884084/1‑151 (MQ=255)
cGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGccac < 1:1755880/150‑1 (MQ=255)
cTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCcaccac > 1:874208/1‑151 (MQ=255)
tGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCaccacc > 1:688015/1‑151 (MQ=255)
tGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCaccacc > 1:1458665/1‑151 (MQ=255)
gAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCaccacc < 2:1135551/150‑1 (MQ=255)
aCAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGt < 1:692189/151‑1 (MQ=255)
cAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTg > 2:1337286/1‑151 (MQ=255)
cAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTg < 1:449834/151‑1 (MQ=255)
cAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTg < 2:172772/151‑1 (MQ=255)
aGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTg > 1:1182087/1‑150 (MQ=255)
gTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGc < 1:309036/151‑1 (MQ=255)
gTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGc < 1:827981/151‑1 (MQ=255)
cgccgcCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCAc < 1:1514644/151‑1 (MQ=255)
cgccgcCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCAc < 2:1329749/151‑1 (MQ=255)
ccgccgTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCa < 2:1754893/151‑1 (MQ=255)
cgccgTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCAt < 2:249195/151‑1 (MQ=255)
cgTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGcc < 2:216187/151‑1 (MQ=255)
gTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCcg > 1:1235884/1‑151 (MQ=255)
gTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCcg < 1:466738/151‑1 (MQ=255)
gTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCcg > 1:540121/1‑151 (MQ=255)
gCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCcgcg > 1:792205/1‑151 (MQ=255)
gCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCcgcg > 2:1556725/1‑151 (MQ=255)
cATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGGTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCgcgc > 2:180059/1‑151 (MQ=255)
gTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCg > 1:170774/1‑151 (MQ=255)
aTCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCgg > 2:1310468/1‑148 (MQ=255)
tCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCgg > 2:25444/1‑147 (MQ=255)
cATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATg < 2:711915/151‑1 (MQ=255)
cATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTAAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGCGCACCATGCCGCGCTCGGAGATg > 1:746177/1‑151 (MQ=255)
aTTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGt < 1:181157/151‑1 (MQ=255)
tCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCg < 1:21491/150‑1 (MQ=255)
cgcTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGcc < 1:1534136/151‑1 (MQ=255)
ttGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAg < 1:1772829/149‑1 (MQ=255)
tGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTc > 1:620459/1‑151 (MQ=255)
gccgccACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTcc < 1:194365/151‑1 (MQ=255)
cgccACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCcgg > 2:1096081/1‑151 (MQ=255)
cgccACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCcgg < 2:1522571/151‑1 (MQ=255)
cgccACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCcgg < 2:1544261/151‑1 (MQ=255)
gccACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCcggc < 1:995286/151‑1 (MQ=255)
gccACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCcggc < 2:1219521/151‑1 (MQ=255)
gccACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCcggc > 2:1225037/1‑151 (MQ=255)
gccACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCcggc < 2:1268233/151‑1 (MQ=255)
cACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCcggcgg > 2:636186/1‑151 (MQ=255)
cACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCcggcgg < 1:252908/151‑1 (MQ=255)
ccGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGc < 1:1101488/151‑1 (MQ=255)
gcgcgcCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCAc > 1:799554/1‑151 (MQ=255)
acacaGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCa < 2:473400/151‑1 (MQ=255)
caGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTg < 1:1289362/151‑1 (MQ=255)
cAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAAcc > 2:501761/1‑151 (MQ=255)
gCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCAt < 2:1157721/151‑1 (MQ=255)
ggTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTAc < 1:283976/151‑1 (MQ=255)
tCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACcg > 2:634023/1‑151 (MQ=255)
ttCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCCACCATTACcgc > 2:1064395/1‑150 (MQ=255)
tCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACcg < 1:928227/148‑1 (MQ=255)
cAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCt < 1:338878/151‑1 (MQ=255)
aGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTc < 1:905686/151‑1 (MQ=255)
gCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTca < 2:831589/151‑1 (MQ=255)
aacaacGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTcaca < 1:344931/151‑1 (MQ=255)
aacaacGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTcac > 1:1507092/1‑150 (MQ=255)
caacGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAAt < 2:321898/151‑1 (MQ=255)
caacGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAAt > 1:576089/1‑151 (MQ=255)
aacGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAAt > 1:1434429/1‑150 (MQ=255)
aacGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATa < 2:1436943/151‑1 (MQ=255)
gACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCg < 1:1251955/151‑1 (MQ=255)
aCTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCgg < 1:1220862/151‑1 (MQ=255)
cTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGt > 1:805074/1‑151 (MQ=255)
tGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTc > 2:1192633/1‑151 (MQ=255)
ggAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGt < 1:1446786/149‑1 (MQ=255)
ggAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTc < 2:1227631/150‑1 (MQ=255)
tGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCgg > 2:1072359/1‑151 (MQ=255)
tGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCgg > 1:1399575/1‑151 (MQ=255)
ggTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTcc > 2:826367/1‑151 (MQ=255)
ggTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTcc > 2:1227471/1‑151 (MQ=255)
ggTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTcc > 1:597067/1‑151 (MQ=255)
gTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCt < 1:491690/151‑1 (MQ=255)
ttcttcCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTg < 2:453710/150‑1 (MQ=255)
ttcttcCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGc > 2:1089517/1‑151 (MQ=255)
ttcttcCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGc > 2:1647779/1‑151 (MQ=255)
aTTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCtt < 2:175974/151‑1 (MQ=255)
tAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTTCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCg > 1:909586/1‑151 (MQ=255)
tAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTc < 2:1320996/150‑1 (MQ=255)
cAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAgg > 2:339653/1‑151 (MQ=255)
aaaCGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAgg > 2:31561/1‑150 (MQ=255)
aaCGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGAt < 2:1752026/151‑1 (MQ=255)
cGGTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGAttt < 1:1594158/151‑1 (MQ=255)
ggTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGAttt > 2:408882/1‑150 (MQ=255)
ggTCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTc > 2:529190/1‑151 (MQ=255)
tCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCAt > 2:1368838/1‑151 (MQ=255)
tCAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTCCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCAt > 2:1701325/1‑151 (MQ=255)
cAAGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCAt < 1:1595800/150‑1 (MQ=255)
aaGGTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTg > 2:767154/1‑151 (MQ=255)
gTTACGCAGCAGTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTgg > 1:1064984/1‑149 (MQ=255)
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gcagTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAggg > 2:821624/1‑150 (MQ=255)
agTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTa > 2:144152/1‑150 (MQ=255)
agTACGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTa > 2:1621270/1‑150 (MQ=255)
|
CTCTTCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTA > NC_000913/3400047‑3400341
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
