Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F50 I2 R1
|
173 |
150.8 |
4954114 |
96.5% |
4780720 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,772,863 |
C→T |
L118L (CTG→TTG) |
ydiN → |
putative MFS transporter, membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,772,863 | 0 | C | T | 100.0%
| 558.8
/ NA
| 141 | L118L (CTG→TTG) | ydiN | putative MFS transporter, membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (75/66); total (75/66) |
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GGTGTGATCTCCGATAAGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGCTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTAC > NC_000913/1772716‑1773009
|
ggTGTGATCTCCGATAAGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTgg > 2:147124/1‑151 (MQ=255)
tgtgATCTCCGATAAGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGAt > 1:1584783/1‑151 (MQ=255)
gtgATCTCCGATAAGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGTTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGAt < 4:1735296/150‑1 (MQ=255)
tgATCTCCGATAAGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATAc > 4:271498/1‑151 (MQ=255)
tcCGATAAGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTg > 4:951301/1‑151 (MQ=255)
ccGATAAGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACggg < 4:1346447/148‑1 (MQ=255)
ccGATAAGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACgg < 4:1437864/147‑1 (MQ=255)
ccGATAAGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTgg > 1:1126114/1‑151 (MQ=255)
gATAAGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCt > 4:1128714/1‑151 (MQ=255)
gATAAGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCt < 3:395140/151‑1 (MQ=255)
aGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTAccc > 1:1609188/1‑151 (MQ=255)
tttGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCcg > 4:1266981/1‑151 (MQ=255)
ttGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCcg < 1:1628799/150‑1 (MQ=255)
tGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCcgcg > 4:1714975/1‑151 (MQ=255)
gtcgtcGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCt < 2:42533/151‑1 (MQ=255)
gtcgGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTc < 4:1644200/149‑1 (MQ=255)
tcgGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATg > 4:561028/1‑151 (MQ=255)
tcgGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATg > 1:500319/1‑151 (MQ=255)
cgGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATgg > 4:1554764/1‑151 (MQ=255)
ggCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTATCTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATg < 3:235974/148‑1 (MQ=255)
ggTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATg > 3:516178/1‑150 (MQ=255)
gATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCttt < 4:1198717/151‑1 (MQ=255)
gATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCttt < 2:175561/151‑1 (MQ=255)
gATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCtt < 1:261014/150‑1 (MQ=255)
atTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTcc < 4:1779018/150‑1 (MQ=255)
atTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCg < 1:727552/151‑1 (MQ=255)
tAATGCCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGa > 1:1737421/1‑150 (MQ=255)
aaTGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGaa < 4:1503733/150‑1 (MQ=255)
aTGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGaa > 4:1071372/1‑149 (MQ=255)
aataatGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTgg < 2:384711/150‑1 (MQ=255)
aataatGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGt > 4:1112558/1‑151 (MQ=255)
taatGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTc > 4:443455/1‑151 (MQ=255)
aatGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTcg > 4:1013181/1‑151 (MQ=255)
aatGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTcg > 4:26494/1‑151 (MQ=255)
aatGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTc < 1:268221/150‑1 (MQ=255)
atGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTcgg > 1:1485017/1‑151 (MQ=255)
gTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTcggcg > 1:1512897/1‑151 (MQ=255)
tCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTc > 1:121012/1‑151 (MQ=255)
cTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTcggcgg > 1:774262/1‑148 (MQ=255)
gCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGt < 4:199661/147‑1 (MQ=255)
gCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATa < 4:342324/151‑1 (MQ=255)
tATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACt > 1:1057907/1‑151 (MQ=255)
cttcttTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGtt > 1:1267844/1‑151 (MQ=255)
cttcttTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGtt > 3:248692/1‑151 (MQ=255)
ttcttTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGtt > 3:403769/1‑150 (MQ=255)
tcttTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGtt < 4:1835888/149‑1 (MQ=255)
tcttTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGt < 4:1384083/148‑1 (MQ=255)
tcttTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTa < 1:803779/150‑1 (MQ=255)
ccttGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTGTCGCTAACTCAGCGTTGGATGCGGGTGGCTAGCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGGAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTaa < 1:1637892/148‑1 (MQ=255)
tttGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTaa > 1:1517904/1‑149 (MQ=255)
tttGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTaa > 4:100292/1‑149 (MQ=255)
ttGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGGCATACTGGTTAAAg > 1:1659547/1‑150 (MQ=255)
tGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGc < 2:448918/150‑1 (MQ=255)
ggTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGa < 1:1254036/151‑1 (MQ=255)
agTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCg > 1:30490/2‑150 (MQ=255)
tATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCg > 4:115307/1‑148 (MQ=255)
ttCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATgg > 1:391798/1‑150 (MQ=255)
tCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTGCGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGgtg > 1:1000151/1‑151 (MQ=255)
cGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCa < 4:750566/151‑1 (MQ=255)
cGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGGGTc > 1:1013718/1‑150 (MQ=255)
gCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCAt > 1:248852/1‑151 (MQ=255)
tGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCAttt > 3:143855/1‑150 (MQ=255)
tGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCAttt > 1:599153/1‑150 (MQ=255)
tGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCAttt < 2:210824/150‑1 (MQ=255)
gCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTg < 1:1888552/150‑1 (MQ=255)
cccGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGGGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGACGTACTGGTTAAAAAGGTGGGGTCCTTTggg > 1:1878657/1‑151 (MQ=255)
cGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGc > 1:1221519/1‑150 (MQ=255)
gAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCaa < 1:735585/151‑1 (MQ=255)
aaTTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCaa > 3:94929/1‑150 (MQ=255)
aTTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAAt < 1:99559/151‑1 (MQ=255)
tttAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAAt > 1:425983/1‑150 (MQ=255)
tttAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATg > 4:1210767/1‑151 (MQ=255)
aaCTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGtt < 4:1698792/150‑1 (MQ=255)
aaCTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGtt > 4:1240916/1‑150 (MQ=255)
aCTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCt < 4:749488/151‑1 (MQ=255)
aCTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCt > 2:256487/1‑151 (MQ=255)
cGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGGTGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTAccc > 2:258289/1‑150 (MQ=255)
cGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCa < 4:1315480/151‑1 (MQ=255)
cGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCa < 1:1112081/151‑1 (MQ=255)
cGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGGGTCATTTGGGCAAAAGTTCTAtcc > 4:103556/1‑150 (MQ=255)
gCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCaa < 1:333275/151‑1 (MQ=255)
cTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATg > 4:568941/1‑151 (MQ=255)
aCGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATg < 3:225830/149‑1 (MQ=255)
aCGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATg < 2:228805/149‑1 (MQ=255)
cGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTg < 1:606336/151‑1 (MQ=255)
cGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTg < 2:488914/151‑1 (MQ=255)
ggTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTTCCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTgg < 1:297407/151‑1 (MQ=255)
cTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGgtggtg > 1:1353450/1‑150 (MQ=255)
cTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGCTAAAGAGATGGGGTCATTTGGGGCAATGTTCTACCCAATGCTgg > 4:1610274/1‑148 (MQ=255)
gCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTg < 4:1564079/147‑1 (MQ=255)
gCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCt > 4:991339/1‑151 (MQ=255)
cAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCta < 2:536496/151‑1 (MQ=255)
gCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGtt < 2:48284/151‑1 (MQ=255)
gTAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGc > 4:1254016/1‑151 (MQ=255)
tAGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCt > 1:1642253/1‑151 (MQ=255)
aGGTATCGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCt < 2:25547/150‑1 (MQ=255)
cGCTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCaataat < 4:598255/151‑1 (MQ=255)
cTAACTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAataata > 1:321290/1‑150 (MQ=255)
aCTCAGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTg < 4:1126598/151‑1 (MQ=255)
aGCGTTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTAc < 1:616992/151‑1 (MQ=255)
|
GGTGTGATCTCCGATAAGTTTGGTCGTCGGGCGGTGATATTAATGGCAGTAATAATGTATCTGCTATTCTTCTTTGGTATTCCCGCTTGCCCGAATTTAACTCTCGCCTACGGTCTGGCAGTGTGCGTAGGTATCGCTAACTCAGCGCTGGATACGGGTGGCTACCCCGCGCTCATGGAATGCTTTCCGAAAGCCTCTGGTTCGGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTAC > NC_000913/1772716‑1773009
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
