Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
160 |
117.2 |
4331776 |
85.4% |
3699336 |
149.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,315,727 |
G→A |
G747D (GGC→GAC) |
rcsD → |
phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,315,727 | 0 | G | A | 99.1%
| 430.1
/ NA
| 113 | G747D (GGC→GAC) | rcsD | phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (65/47); total (65/48) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.25e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGGCTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGAATCGCC > NC_000913/2315579‑2315874
|
gtggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGact > 3:461255/1‑151 (MQ=255)
ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGacttg > 2:643548/1‑151 (MQ=255)
gATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGacttgc > 2:174354/1‑151 (MQ=255)
aTGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGacttgct < 2:898349/151‑1 (MQ=255)
aTGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGacttgct > 2:259641/1‑151 (MQ=255)
tGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGacttgctt > 1:317851/1‑151 (MQ=255)
tACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCtttt < 4:752414/150‑1 (MQ=255)
ttCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGc > 4:789540/1‑151 (MQ=255)
cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCg > 1:184153/1‑150 (MQ=255)
cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCg < 4:283143/150‑1 (MQ=255)
cAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCgatg > 4:989583/1‑150 (MQ=255)
gAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGatgatg > 1:123569/1‑151 (MQ=255)
aaaTTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGatgatg > 4:815819/1‑150 (MQ=255)
aaaTTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGatgatg > 2:1276030/1‑150 (MQ=255)
aaaTTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGAtgatga < 4:392667/151‑1 (MQ=255)
aaaTTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGAtgatga < 4:700672/151‑1 (MQ=255)
cGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCt < 2:1289629/150‑1 (MQ=255)
cGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTg < 4:394595/151‑1 (MQ=255)
tgAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTgg > 2:966043/2‑151 (MQ=255)
aaTATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCg < 4:814401/151‑1 (MQ=255)
atatTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGt > 4:521501/1‑151 (MQ=255)
tatTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGt > 2:1542243/1‑150 (MQ=255)
atTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTAc > 1:313101/1‑151 (MQ=255)
atTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAACGATGATGAGTCTGGCGTAc > 2:1068951/1‑151 (MQ=255)
tGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACg < 1:271019/150‑1 (MQ=255)
gTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACggg < 4:50516/151‑1 (MQ=255)
cGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAAtt < 4:1130811/150‑1 (MQ=255)
cGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTg < 1:467604/151‑1 (MQ=255)
ccAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTggg > 2:548919/1‑151 (MQ=255)
cAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGc > 2:1577005/1‑151 (MQ=255)
aGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGcc > 2:758029/1‑151 (MQ=255)
aGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGACGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGcc > 4:246287/1‑151 (MQ=255)
aGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTgg < 2:177217/150‑1 (MQ=255)
aaaaTTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTc < 2:727509/150‑1 (MQ=255)
ttGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATtg > 3:268081/1‑151 (MQ=255)
gTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGt < 4:201065/151‑1 (MQ=255)
tGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTc > 4:610085/1‑151 (MQ=255)
tGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTc > 4:1556462/1‑151 (MQ=255)
gCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCa < 2:1475739/151‑1 (MQ=255)
cAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATGAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTACTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGATCAATTGTGCGTCaa < 3:133634/151‑1 (MQ=255)
aaCCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAAc > 1:152333/1‑151 (MQ=255)
gTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCa > 3:405800/1‑150 (MQ=255)
aTCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAat > 4:635697/1‑150 (MQ=255)
aTCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAat > 3:326060/1‑150 (MQ=255)
acacCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATg > 2:1359306/1‑150 (MQ=255)
cacCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAg < 3:276816/151‑1 (MQ=255)
acCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGc < 3:313118/151‑1 (MQ=255)
cccGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCa < 2:1325148/151‑1 (MQ=255)
ccGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCaa < 4:536652/151‑1 (MQ=255)
gATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACg > 4:401472/1‑151 (MQ=255)
gATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACg > 4:607431/1‑151 (MQ=255)
gAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTa < 1:461235/151‑1 (MQ=255)
aaaGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTAt > 4:1306700/1‑151 (MQ=255)
aaGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATg > 2:1605994/1‑151 (MQ=255)
aGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGc > 4:1660474/1‑151 (MQ=255)
attaattaGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGc > 2:492649/1‑149 (MQ=255)
attaattaGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAg < 2:1311192/151‑1 (MQ=255)
attaattaGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAg < 2:402740/151‑1 (MQ=255)
ttaGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGc > 2:267105/1‑151 (MQ=255)
taGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCg > 1:436123/1‑151 (MQ=255)
aGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCgg < 4:827259/151‑1 (MQ=255)
aGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCgg > 4:856349/1‑151 (MQ=255)
tCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTc > 3:46731/1‑151 (MQ=255)
cAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTc < 3:448625/150‑1 (MQ=255)
cAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCt < 2:1657549/151‑1 (MQ=255)
cAAGATTATGATATATTTTTAACGGCTAATGCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGACATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTc > 1:200665/1‑150 (MQ=255)
aaGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCtt > 2:184748/1‑151 (MQ=255)
gATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTAc > 4:1630890/1‑151 (MQ=255)
gATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTAc > 2:948246/1‑151 (MQ=255)
tGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACaatt > 2:27353/1‑150 (MQ=255)
gATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACaatta > 2:1277560/1‑150 (MQ=255)
atCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACaattaatt < 3:218305/150‑1 (MQ=255)
ttttTACGGATAATCCCTCTAATCTTAATGGCTCTGGCTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGCGGGTCAACTTTAATATTAGCAACGCTATGCAGGAAGCTGTCTTACAATTAATTGAAg < 4:1644655/150‑1 (MQ=255)
ttttAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAg > 4:487216/1‑150 (MQ=255)
ttttAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGt > 2:1481184/1‑151 (MQ=255)
ttAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTg < 2:1414933/150‑1 (MQ=255)
ttAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGc > 2:315239/1‑151 (MQ=255)
aaCGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCa < 2:922394/150‑1 (MQ=255)
aCGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAAc > 2:1380667/1‑151 (MQ=255)
aTAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGgc < 4:942654/151‑1 (MQ=255)
aaTCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGgcgc < 4:48880/151‑1 (MQ=255)
ccGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAg < 4:644418/150‑1 (MQ=255)
cGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGACAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGa < 2:1186978/151‑1 (MQ=255)
gTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGaa < 4:174641/151‑1 (MQ=255)
tAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAag > 2:408136/1‑149 (MQ=255)
aaTCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAagag < 3:439742/150‑1 (MQ=255)
aaTCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAgg > 1:255050/1‑151 (MQ=255)
aTCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGt > 4:108880/1‑151 (MQ=255)
tCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTg > 1:161641/1‑151 (MQ=255)
tCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTg > 2:798876/1‑151 (MQ=255)
tACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGAc > 1:304244/1‑150 (MQ=255)
aCTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACa < 2:424127/150‑1 (MQ=255)
aCTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACa < 4:1035187/150‑1 (MQ=255)
cTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGAc > 1:437828/1‑148 (MQ=255)
tGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGAGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGa > 4:935734/1‑150 (MQ=255)
gCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGaa < 4:1310970/150‑1 (MQ=255)
gCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGAAt < 2:254465/151‑1 (MQ=255)
gCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGAAt > 4:1032708/1‑151 (MQ=255)
ccTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGAATc > 4:385883/1‑151 (MQ=255)
ctGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGAATCGcc > 1:413460/1‑151 (MQ=255)
|
GTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGGCTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGAATCGCC > NC_000913/2315579‑2315874
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
